RNA specifická pro malé tělo Cajal 8 - Small Cajal body specific RNA 8

RNA specifická pro malé tělo Cajal 8
RF00286.jpg
Identifikátory
SymbolSCARNA8
Alt. SymbolyU92
RfamRF00286
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000275
PDB strukturPDBe

RNA specifická pro malé tělo Cajal 8 (také známý jako SCARNA8 nebo U92) je malá nukleolární RNA nalezen v Cajalská těla a předpokládá se, že je zapojen do pseudouridylace (izomerizace z uridin na pseudouridin ) z U2 spliceozomální RNA.

scaRNA jsou specifickou třídou malé nukleolární RNA že lokalizovat do Cajalská těla a řídit úpravy RNA polymeráza II přepsal spliceosomální RNA U1, U2, U4, U5 a U12.[1]

U92 patří do H / ACA box třída naváděcích RNA, protože má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas, konzervované motivy boxu H / ACA a je spojena s GAR1.[1] Předpokládá se, že povede pseudouridylaci zbytků U44 v U2 snRNA.[1] Tato snoRNA souvisí s myší H / ACA box snoRNA MBI-57.[2]

Reference

  1. ^ A b C Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (červen 2002). „Cajalovo tělo specifické malé jaderné RNA: nová třída 2'-O-methylace a pseudouridylace vodicích RNA“. Časopis EMBO. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy