SR protein - SR protein

Struktura řešení z RRM doména myšího proteinu SR Sfrs9 na základě 4wg4​.

SR proteiny jsou konzervované rodina proteinů zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho Sestřih RNA. SR proteiny jsou pojmenovány, protože obsahují a proteinová doména s dlouhými opakováními serin a arginin aminokyselina zbytky, jehož standardní zkratky jsou „S“ a „R“. SR proteiny jsou dlouhé ~ 200-600 aminokyselin a skládají se ze dvou domén, RNA rozpoznávací motiv (RRM) region a doména RS.[1] SR proteiny se běžněji vyskytují v jádře než v cytoplazmě, ale je známo, že několik SR proteinů se pohybuje mezi jádrem a cytoplazmou.

SR proteiny byly objeveny v 90. letech v Drosophila a v obojživelných oocytech a později u lidí. Obecně, metazoans Zdá se, že mají SR proteiny a jednobuněčné organismy postrádají SR proteiny.

SR proteiny jsou důležité při konstitutivním a alternativním sestřihu pre-mRNA, exportu mRNA, stabilizaci genomu, nesmyslem zprostředkovaném rozpadu a translaci. SR proteiny alternativně sestřihávají pre-mRNA přednostním výběrem různých sestřihových míst na pre-mRNA řetězcích, aby se vytvořilo více mRNA transkriptů z jednoho pre-mRNA transkriptu. Jakmile je sestřih dokončen, protein SR může nebo nemusí zůstat připojený, aby pomohl přesunout řetězec mRNA z jádra. Tak jako RNA polymeráza II přepisuje DNA na RNA, proteiny SR se připojují k nově vyrobené pre-mRNA, aby se zabránilo vazbě pre-mRNA na kódující řetězec DNA, aby se zvýšila stabilizace genomu. Topoizomeráza I a SR proteiny také interagují za účelem zvýšení stabilizace genomu. SR proteiny mohou řídit koncentrace specifické mRNA, která je úspěšně přeložena do proteinu výběrem pro nesmyslem zprostředkované rozpadové kodony během alternativního sestřihu. SR proteiny mohou alternativně sestřihnout NMD kodony do vlastního transkriptu mRNA, aby autoregulovaly koncentraci SR proteinů. Prostřednictvím dráhy mTOR a interakcí s polyribozomy mohou proteiny SR zvýšit translaci mRNA.

Ataxia telangiectasia „Neurofibromatóza typu 1, několik druhů rakoviny, HIV-1 a spinální svalová atrofie byly spojeny s alternativním sestřihem pomocí proteinů SR.

Dějiny

SR proteiny byly objeveny nezávisle pomocí dvou různých monoklonální protilátky. První protilátka mAb104 našla proteiny SR v jádře obojživelných oocytů. Protilátka mAb104 se váže na fosfoepitop na C-terminální doméně SR proteinů. mAb104 se také váže na aktivní místa transkripce RNA polymerázy II.[2] Tato protilátka umožňovala identifikaci čtyř proteinů SR (SRp20, SRp40, SRp55 a SRp75 ) a prokázali jejich ochranu u obratlovců a bezobratlých.[1] Druhá protilátka, B52, byla použita v Drosophila. B52 úzce souvisí s faktorem sestřihu SF2 / ASF a navázané na RNA i DNA v Drosophila. Objev proteinů SR v Drosophila odhalily tři SR proteiny, SWAP (potlačovač bílé-meruňky), Tra a Tra-2 (transformátor a transformátor-2).[3][4][5]

Příklady genů

Následuje seznam 14 lidských genů kódujících proteiny SR zapojených do sestřihu:

GenAliasyProteinMísto
SRSF1SFRS1; ASF; SF2; SF2p33; SFRS1; SRp30aFaktor sestřihu bohatý na serin / arginin 117q22
SRSF2SFRS2; PR264; SC-35; SC35; SFRS2; SFRS2A; SRp30bFaktor sestřihu bohatý na serin / arginin 217q25
SRSF3SFRS3; SRp20Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 36p21
SRSF4SFRS4; SRP75Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 41p35
SRSF5HRS; SFRS5; SRP40Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 514q24
SRSF6B52; SFRS6; SRP55Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 620q13
SRSF79G8; AAG3; SFRS7Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 72p22
SRSF8SFRS2B; SRp46 (pouze člověk)Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 811q21
SRSF9SFRS9; SRp30cFaktor sestřihu bohatý na serin / arginin 912q24
SRSF10TASR1; SRp38; SRrp40; SFRS13AFaktor sestřihu bohatý na serin / arginin 101p36.11
SRSF11NET2; SFRS11; dJ677H15.2; p54Faktor sestřihu bohatý na serin / arginin 111p31
SRSF12SRrp35; SFRS13BFaktor sestřihu bohatý na serin / arginin 126q15
TRA2AAWMS1; HSU53209Transformátor 2 Alpha Homolog7p15.3
TRA2BPPP1R156; SFRS10; SRFS10; TRAN2BTransformátor 2 Beta homolog3q27.2

[6]

Struktura

SR proteiny jsou charakterizovány RS doménou a alespoň jednou RNA rozpoznávací motiv (RRM). RRM se obvykle nachází v blízkosti N-konec. Doména RS se nachází v blízkosti C-terminál konec proteinu SR. RS domény regulují protein-proteinové interakce proteinů SR. Na základě sekvenční analýzy existuje podezření, že proteiny SR jsou skutečně narušené proteiny, které vedou k nestrukturované doméně RS. Osm nefosforylovaných opakování argininu a serinu v doméně RS má spirálovitou formu s argininem na vnější straně, aby se snížil náboj, a ve fosforylovaném stavu tvoří osm opakování argininu a serinu tvar „drápu“.[1][7][8]

SR proteiny mohou mít více než jednu RRM doménu. Druhá RRM doména se nazývá rozpoznávání RNA motiv homolog (RRMH). Domény RRM jsou umístěny poblíž N-konce SR proteinů. Doména RRM zprostředkovává interakce RNA proteinů SR vazbou na sekvence zesilovače sestřihu exonu. RRMH má obvykle slabší interakce s RNA ve srovnání s doménou RRM. Z NMR RRM doména SRSF1, SR protein, má RNA vazebnou skládací strukturu. Doména RRM může také chránit fosforylovanou doménu RS, což naznačuje, že doména RS zapadá do domény RRM.[3][7][9]

SR proteiny translokační z jádra pomocí TAP

Umístění a přemístění

SR proteiny lze nalézt v obou cytosol a v jaderné tečky v jádro. SR proteiny se většinou nacházejí v jádře. Lokalizace závisí na fosforylaci RS domény proteinu SR. Fosforylace RS domény způsobuje, že SR proteiny vstupují a zůstávají v jádře. Částečná defosforylace RS domény způsobuje, že SR proteiny opouštějí jádro a SR proteiny s nefosforylovanými RS doménami se nacházejí v cytosolu.[10][11][12]

SR proteiny jsou umístěny ve dvou různých typech jaderných skvrn, shluky interchromatinových granulí a perichromatinové fibrily. Klastry interchromatinových granulí slouží k ukládání a opětovnému sestavování proteinů sestřihu pre-mRNA. Perichromatinové fibrily jsou oblasti genové transkripce a kde se SR proteiny spojují s RNA polymerázou II pro ko-transkripční sestřih.[1][12]

Dva proteiny kinázy Předpokládá se, že hrají roli při lokalizaci proteinů SR v jádře. SR protein kináza 1 (SRPK1) se váže na a fosforyluje 10-12 serinových zbytků na N-koncové části RS domény SR proteinů umístěných v cytosolu. SR proteiny se mohou translokovat do jádra poté, co jsou seriny fosforylovány. Fosforylovaný protein SR se přesune do jádra a přemístí se do jaderné skvrny. Druhá proteinová kináza, CLK1, poté fosforyluje zbývající seriny na RS doméně proteinu SR, což způsobí, že se translokuje z jaderné skvrny a stane se spojenou s RNA polymerázou II pro ko-transkripční sestřih RNA.[3][7]

Pohyb proteinů SR z jádra je řízen jiným mechanismem. SR proteiny, které neopouštějí jádro, se nazývají neohraničující SR proteiny a ty, které opouštějí jádro, se nazývají Shutting SR proteiny. SRp20 (SFRS3 ) a 9G8 (SFRS7 ) jsou dva příklady savčích raketoplánových proteinů SR. Oba rozpoznávají a váží poly-A RNA na transportní RNA. Většina SR proteinů, které se z transkriptu RNA nevyplouvají z jádra, má signály retence jader. Shuttling SR proteiny se spojují s nukleárním exportním faktorem TAP pro export z jádra. Methylace argininových zbytků v RRM může také přispět k exportu proteinů SR z jádra.[9][11]

Funkce

Bylo prokázáno, že proteiny SR mají roli v alternativním a konstitutivním sestřihu, což vede k diferenciální genové expresi, a také hrají roli při exportu mRNA, stabilizaci genomu, ne-sense zprostředkovaném rozpadu a překlad.[1][2]

Sestřih

Prvním krokem pro SR proteiny k zahájení alternativního sestřihu transkriptu RNA je to, aby se proteiny SR navázaly na karboxy-terminální doménu (CTD) největší podjednotky RNA polymerázy II. CTD je vyroben ze konzervované opakující se heptapeptidové sekvence YSPTSPS. Různé kroky transkripce mají různé úrovně fosforylace CTD RNA polymerázy II. Před zahájením transkripce má CTD nízké hladiny fosforylace, ale následně je hyperfosforylována během zahájení a prodloužení. RS doména SR proteinů interaguje s hyperfosforylovaným CTD během prodloužení transkripce.[2][12]

RNA polymeráza II se jednou pohybuje od iniciace k prodloužení P-TEFb kináza fosforyluje Ser5 a Ser2 RNA polymeráza II. SR proteiny interagují s CDK9, kinázová složka P-TEFb vedoucí k fosforylaci Ser2. SR proteiny se vážou na fosforylovaný Ser2 na CTD. Umístění proteinů SR na RNA polymerázu II umožňuje proteinům SR nejprve „vidět“ nový transkript RNA. SR proteiny pak přecházejí z RNA polymerázy II do transkriptu pre-mRNA.[1][2]

Jakmile jsou na novém transkriptu RNA, mohou SR proteiny stimulovat tvorbu spliceosome. SR proteiny podporují vazbu U1 snRNP a U2AF snRNP do nového transkriptu RNA a zahájit tak tvorbu spliceosomu. Pomáhají také proteiny SR U2 rozpoznat a vázat se na pobočku webu intron to má být vyříznuto. Později při tvorbě spliceosomu pomáhají proteiny SR s náborem U4 /U6 a U5 snRNP.[8][12]

SR proteiny jsou důležité pro výběr spojovacích míst pro alternativní sestřih. SR proteiny rozpoznávají zesilovače a tlumiče intronu a exonu. SR proteiny se kombinují s proteiny podobnými SR, aby se vybraly zesilovače sestřihu exonu na transkriptech RNA, které způsobují, že se U2 snRNP váže na upstream, přilehlé místo větve, což způsobuje sestavu spliceosomu na specifickém 3 'místě vybraném proteiny SR.[12][13]

Aktivity podporující alternativní sestřih proteinů SR jsou na rozdíl od aktivit hnRNP. hnRNP se vážou exonové spojovací tlumiče, ESS, a inhibují inkluzi exonů, takže hnRNP jsou sestřihové represory. SR proteiny a hnRNP soutěží o vazbu na ESE a ESS sekvence v exonech. Vazba je založena na koncentracích SR proteinů a hnRNP v buňkách. Pokud má buňka vysokou koncentraci SR proteinů, pak se SR proteiny pravděpodobněji vážou na ESE ve srovnání s hnRNP vázajícími se na ESS. Pokud má buňka vysokou koncentraci hnRNP, pak hnRNP mohou překonat SR proteiny pro ESS ve srovnání s ESE.[14][15]

SR proteiny mohou fungovat antagonistickým způsobem a navzájem si konkurovat o vazbu exonické zesilovače sestřihu. Některé důkazy naznačují, že výběr varianty sestřihu mRNA závisí na relativních poměrech SR proteinů. SR proteiny se zdají být nadbytečné. Pokusy ukázaly, že srážení proteinů SR pomocí RNAi nevykazuje žádné zjistitelné fenotyp v C. elegans. Po srazení jednoho specifického proteinu SR může jiný SR protein kompenzovat ztracenou funkci proteinu SR, který byl sražen. Specifické aktivity proteinů SR jsou důležité pro specifické tkáně a vývojová stadia.[13][16]

Role závislé na exonu

SR proteiny vybírají alternativní upstream 3 'sestřihová místa náborem U2AF35 a U2AF65 na konkrétní ESE pyrimidinové sekvence v exonu transkriptu pre-mRNA.[8][17]

SR proteiny mohou také alternativně vybrat různá downstream 5 'místa sestřihu vazbou na ESE upstream od místa sestřihu. Předpokládá se, že alternativní 5 'sestřihová místa jsou zvolena, když se SR proteiny váží na upstream ESE a interagují s U1-70K a společně získávají U1 na 5' sestřihové místo.[8][17]

V konstitutivním sestřihu se proteiny SR vážou na U2AF a U1-70K, aby překlenuly mezeru mezi dvěma složkami spliceosome k označení 3 'a 5' spojovacích míst. Konstitutivně sestříhané exony mají mnoho různých sekvencí vázajících protein SR, které působí jako zesilovače konstitutivního sestřihu. Rozdíl mezi alternativním a konstitutivním sestřihem spočívá v tom, že během alternativní sestřih výběr místa sestřihu je regulován.[8][17]

Exon nezávislé role

Role nezávislé na exonu SR proteinů se nazývají nezávislé na exonu, protože není známo, zda se SR proteiny musí vázat na exony, aby mohly vykonávat aktivity nezávislé na exonu. SR proteiny se mohou vázat na U1 a U2AF, zatímco jsou navázány na 3 'a 5' místa sestřihu současně bez vazby na transkript pre-mRNA. SR protein tak vytváří můstek napříč intronem v tzv. Cross-intronové interakci. SR proteiny také přijímají molekulu tri-snRNP U4 / U6 · U5 do zralého spliceosomového komplexu interakcí s doménami RS v tri-snRNP. SR proteiny by mohly být schopné vázat se přímo na 5 'místo sestřihu a rekrutovat komplex U1 spliceosomu.[8][17]

export mRNA

SR proteiny mohou být buď převáděním SR proteinů, nebo neohraničujícími SR proteiny. Některé proteiny SR se sdružují s RNA exportním faktorem TAP, nukleárním exportním faktorem, aby dopravovaly RNA z jádra. Shuttlingová vlastnost proteinu SR je určena stavem fosforylace RS domény. Když jsou hyperfosforylované, SR proteiny se vážou na pre-mRNA transkripty, ale SR proteiny se během transkripce částečně defosforylovají, což jim umožňuje interakci s NXF1. Fosforylace RS domény tedy určuje, zda SR proteiny zůstanou s transkriptem RNA po sestřihu transkripce a zatímco mRNP zraje. Pokud RS doména zůstane fosforylovaná, pak SR protein nebude přecházet z jádra do cytosolu. Fosforylovaný SR protein bude tříděn pryč od mRNA transkriptu, což dále zabrání převodu fosforylovaných SR proteinů. Pokud se RS doména stane částečně defosforylovanou, pak se SR protein dostane z jádra do cytosolu. Metylace a náboj argininových zbytků v RRM doméně také přispívají k exportu SR proteinů spojených s mRNA.[9][10][11]

Genomická stabilizace

SR proteiny mohou zvýšit stabilitu genomu tím, že zabrání tvorbě R smyček v DNA vlákno, které se aktivně přepisuje během transkripce. SR protein SC35 má schopnost vázat se na největší podjednotku RNA polymeráza II na fosforylované C-koncová doména. Jakmile RNA polymeráza II začne vyrábět nový řetězec RNA, proteiny SR se přesunou z C-koncové domény RNA polymerázy II do nového řetězce RNA. Pohyb proteinů SR z RNA polymerázy II do nového řetězce RNA brání novému řetězci RNA, který je komplementární k řetězci DNA templátu, ve vazbě na řetězec DNA templátu, čímž brání vzniku R smyček.[2][11]

SR proteiny mohou také stabilizovat DNA během transkripce prostřednictvím interakce s Topoizomeráza I. Když topoizomeráza I, Topo I, snižuje nadšroubovici způsobenou transkripcí, když je vázána na DNA. Pokud není Topo I vázán na DNA, může fosforylovat SR protein SF2 / ASF. Topo I a SF2 / ASF interagují, když je SF2 / ASF během prodlužování transkripce hypofosforylován. SR proteiny se mohou během elongace hypofosforylovat a snížit tak jejich afinitu k RNA polymeráze II, což způsobí přesun proteinů SR na Topo I. Když se Topo I komplexuje s SF2 / ASF, nemůže již zrušit supercoiling DNA způsobující prodloužení. Topo I fosforyluje S2F / ASF zvyšující afinitu proteinů SR k RNA poly II pohybující se S2F / ASF z Topo I zpět na RNA poly II, což umožňuje prodloužení.[2]

Nesmysl zprostředkovaný úpadek

SR proteiny mohou alternativně sestřihnout pre-mRNA transkripty, aby zahrnovaly nesmysl zprostředkovaný úpadek (NMD) kodony v mRNA. Nejběžnější metodou reakce NMD v buňkách je alternativní sestřih. Pokud má pre-mRNA transkript duplikované 5 'místo sestřihu a SR proteiny jsou nadměrně exprimovány, pak může být NMD upregulován. Varianta sestřihu s kodonem NMD je volena častěji během sestřihu a buňka je citlivější na NMD dále po proudu během translace. Odhaduje se, že téměř 30% alternativně sestřižené mRNA je degradováno NMD. Koncentrace SR proteinu v buňkách mohou být autoregulovány kodony NMD v SR proteinech pre-mRNA. Například protein SC35 SR může alternativně spojovat a SC35 pre-mRNA tak, aby zahrnoval NMD kodon do mRNA. Umístění vazby proteinu SR na vlákno pre-mRNA a které proteiny SR se vážou, určují aktivitu NMD buňky.[9][18]

Překlad

SR proteiny mohou nepřímo a přímo ovlivňovat translaci. SR proteiny SF2 / ASF alternativně spojují transkript MNK2. MNK2 je kináza, která iniciuje translaci. Vysoké hladiny SF2 / ASF produkují izoformu MNK2, která zvyšuje translaci závislou na čepici podporou fosforylace MAPK -nezávislý eIF4E. SF2 / ASF rekrutuje komponenty mTOR konkrétně cesta S6K1. SF2 / ASF vytváří onkogenní formu S6K1 ke zvýšení prevalence translace závislé na čepici. SF2 / ASF může také interagovat s polyribozomy, aby přímo ovlivnil translaci mRNA do proteinu náborem složky dráha mTOR. SF2 / ASF zvyšuje fosforylaci rpS6 a eIF4B podle S6K1. 9G8 zvyšuje translaci nesestříhané mRNA s konstitutivní transportní sekvencí.[1][3]

Nemoci

Genetická diverzita je zvýšena alternativními sestřihovými aktivitami SR proteinů, ale sestřih může také vést k mutacím v řetězcích mRNA. Mutace v pre-mRNA mohou ovlivnit správný výběr místa sestřihu pro proteiny SR.[1] Byly spojeny mutace v mRNA z důvodu změněného sestřihu proteinů SR spojeného s nesmysly ataxie telangiektázie, neurofibromatóza typu 1, několik rakoviny, HIV -1 a spinální svalová atrofie.

Rakovina

Několik proteinů SR se podílí na rakovině. Všechny zvýšené hladiny SF2 / ASF, SC35 a SRp20 byly spojeny s vývojem rakoviny prsu a vaječníků.[1] SF2 / ASF je také upregulován v nádorech plic, ledvin a jater. SFRS1, gen, který kóduje SF2 / ASF, je známý protoonkogen. Mutace v ESE sekvenci BRCA1 byly spojeny s nepravidelným přeskakováním exonu, protože SF2 / ASF nemůže rozpoznat ESE.[8]

HIV

Byly zahrnuty tři proteiny SR HIV-1, SRp75, SF2 / ASF a SRp40.[1] Všechny tři proteiny SR jsou důležité pro alternativní sestřih virové pre-mRNA. HIV může také změnit koncentrace specifických proteinů SR v buňce. Nové způsoby léčby infekcí HIV se zaměřují na specifické proteiny SR, aby se zabránilo replikaci viru v buňkách. Jedno ošetření funguje tak, že blokuje proteiny SR z výběru 3 'spojovacích míst pro důležitý regulační protein HIV-1.

Spinální svalová atrofie

Svalová atrofie spiny je způsobena přechodem z cytosin na tymin. The přechod Výsledkem mutace je přeskočení exonu 7 během sestřihu. Exon mohl být přeskočen ze dvou důvodů. První je, že mutace brání SF2 / ASF v rozpoznání správného ESE. Druhým je to, že mutace vytvoří ESS pro hnRNP pro vazbu a blokování sestřihu exonu.[1]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C d E F G h i j k Long JC, Caceres JF (leden 2009). "Rodina proteinů SR sestřihových faktorů: hlavní regulátory genové exprese". The Biochemical Journal. 417 (1): 15–27. doi:10.1042 / BJ20081501. PMID  19061484.
  2. ^ A b C d E F Zhong XY, Wang P, Han J, Rosenfeld MG, Fu XD (červenec 2009). "SR proteiny ve vertikální integraci genové exprese z transkripce do zpracování RNA do translace". Molekulární buňka. 35 (1): 1–10. doi:10.1016 / j.molcel.2009.06.016. PMC  2744344. PMID  19595711.
  3. ^ A b C d Shepard PJ, Hertel KJ (2009). „Rodina proteinů SR“. Genome Biology. 10 (10): 242. doi:10.1186 / gb-2009-10-10-242. PMC  2784316. PMID  19857271.
  4. ^ Roth MB, Murphy C, Gall JG (prosinec 1990). „Monoklonální protilátka, která rozpoznává fosforylovaný epitop, barví smyčky chromozomů kartáčku na lampu a malé granule v zárodečném vezikulu obojživelníka“. The Journal of Cell Biology. 111 (6 Pt 1): 2217–23. doi:10.1083 / jcb.111.6.2217. PMC  2116404. PMID  1703534.
  5. ^ Zahler AM, Lane WS, Stolk JA, Roth MB (květen 1992). „SR proteiny: konzervovaná rodina faktorů sestřihu pre-mRNA“. Geny a vývoj. 6 (5): 837–47. doi:10,1101 / gad. 6.5.837. PMID  1577277.
  6. ^ Manley JL, Krainer AR (červen 2010). „Racionální nomenklatura pro faktory sestřihu proteinů bohatých na serin / arginin (proteiny SR)“. Geny a vývoj. 24 (11): 1073–4. doi:10.1101 / gad.1934910. PMC  2878644. PMID  20516191.
  7. ^ A b C Ghosh G, Adams JA (únor 2011). "Fosforylační mechanismus a struktura serin-argininových proteinových kináz". Časopis FEBS. 278 (4): 587–97. doi:10.1111 / j.1742-4658.2010.07992.x. PMC  3079193. PMID  21205204.
  8. ^ A b C d E F G Hastings ML, Krainer AR (červen 2001). „Spojování pre-mRNA v novém tisíciletí“. Současný názor na buněčnou biologii. 13 (3): 302–9. doi:10.1016 / s0955-0674 (00) 00212-x. PMID  11343900.
  9. ^ A b C d Huang Y, Steitz JA (březen 2005). "SRejde na cestě posla". Molekulární buňka. 17 (5): 613–5. doi:10.1016 / j.molcel.2005.02.020. PMID  15749011.
  10. ^ A b Tenenbaum SA, Aguirre-Ghiso J (listopad 2005). „Defosforylace ukazuje SR proteiny cestu ven“. Molekulární buňka. 20 (4): 499–501. doi:10.1016 / j.molcel.2005.11.005. PMC  2517054. PMID  16307914.
  11. ^ A b C d Twyffels L, Gueydan C, Kruys V (září 2011). "Shuttling SR bílkoviny: více než spojovací faktory". Časopis FEBS. 278 (18): 3246–55. doi:10.1111 / j.1742-4658.2011.08274.x. PMID  21794093.
  12. ^ A b C d E Blencowe BJ, Bowman JA, McCracken S, Rosonina E (1999). "Proteiny související se SR a zpracování prekurzorů messengerové RNA". Biochemie a buněčná biologie. 77 (4): 277–91. doi:10.1139 / o99-048. PMID  10546891.
  13. ^ A b Sanford JR, Gray NK, Beckmann K, Cáceres JF (duben 2004). „Nová role při převodu proteinů SR při translaci mRNA“. Geny a vývoj. 18 (7): 755–68. doi:10,1101 / gad.286404. PMC  387416. PMID  15082528.
  14. ^ Talukdar I, Sen S, Urbano R, Thompson J, Yates JR, Webster NJ (2011). „hnRNP Al a hnRNP F modulují alternativní sestřih exonu 11 genu pro inzulinový receptor“. PLOS ONE. 6 (11): e27869. Bibcode:2011PLoSO ... 627869T. doi:10.1371 / journal.pone.0027869. PMC  3223206. PMID  22132154.
  15. ^ Wang Z, Burge CB (květen 2008). „Regulace spojování: od kusovníku regulačních prvků k integrovanému kódu spojování“. RNA. 14 (5): 802–13. doi:10,1261 / rna.876308. PMC  2327353. PMID  18369186.
  16. ^ Tacke R, Manley JL (červen 1999). "Determinanty SR proteinové specificity". Současný názor na buněčnou biologii. 11 (3): 358–62. doi:10.1016 / s0955-0674 (99) 80050-7. PMID  10395560.
  17. ^ A b C d Graveley BR (září 2000). „Řešení složitosti funkcí proteinů SR“. RNA. 6 (9): 1197–211. doi:10.1017 / S1355838200000960. PMC  1369994. PMID  10999598.
  18. ^ Lejeune F, Maquat LE (červen 2005). "Mechanické vazby mezi nesmyslem zprostředkovaným rozpadem mRNA a sestřihem pre-mRNA v buňkách savců". Současný názor na buněčnou biologii. 17 (3): 309–15. doi:10.1016 / j.ceb.2005.03.002. PMID  15901502.