SFRS9 - SFRS9

SRSF9

Protein SFRS9 PDB 1wg4.png

Identifikátory

SRSF9, SFRS9, SRp30c, spojovací faktor bohatý na serin / arginin 9, spojovací faktor bohatý na serin a arginin 9

Externí ID

OMIM: 601943 MGI: 104896 HomoloGene: 20819 Genové karty: SRSF9

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 12 (lidský)^[1]

Kapela	12q24.31	Start	120,461,672 bp^[1]
Kapela	12q24.31	Konec	120,469,748 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 5 (myš)^[2]

Kapela	5 \| 5 F.	Start	115,327,177 bp^[2]
Kapela	5 \| 5 F.	Konec	115,333,080 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba nukleové kyseliny • Vazba RNA • specifické vazby na proteinovou doménu
Buněčná složka	• jádro • buněčné jádro • nukleoplazma • jaderná skvrna
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu • ukončení transkripce RNA polymerázy II • Zpracování mRNA • negativní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu • Výběr místa sestřihu mRNA • export mRNA z jádra • Zpracování mRNA 3'-end • reakce na alkaloid • Export RNA z jádra • Sestřih RNA • reakce na toxickou látku • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu • mRNA cis sestřih, prostřednictvím spliceosomu
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


8683


108014


ENSG00000111786


ENSMUSG00000029538


Q13242


Q9D0B0

RefSeq (mRNA)


NM_003769


NM_025573

RefSeq (protein)


NP_003760


NP_079849

Místo (UCSC)

Chr 12: 120,46 - 120,47 Mb

Chr 5: 115,33 - 115,33 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 9, také známý jako SFRS9, je člověk gen kódování SR protein podílí se na výběru spojovacího místa ve Windows alternativní sestřih.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že SFRS9 komunikovat s Y box vázající protein 1^[6] a NOL3.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111786 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029538 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS9, bohatý na arginin / serin 9“.
^ Raffetseder, Ute; Frye Björn; Rauen Thomas; Jürchott Karsten; Royer Hans-Dieter; Jansen Petra Lynen; Mertens Peter R (květen 2003). „Interakce spojovacího faktoru SRp30c s proteinem Y-box-1 propůjčuje jadernou přepravu YB-1 a výběr alternativního místa sestřihu“. J. Biol. Chem. 278 (20): 18241–8. doi:10,1074 / jbc.M212518200. ISSN 0021-9258. PMID 12604611.
^ Stoss, O; Schwaiger F W; Cooper TA; Stamm S (duben 1999). „Alternativní sestřih určuje intracelulární lokalizaci nového jaderného proteinu Nop30 a jeho interakci s sestřihovým faktorem SRp30c“. J. Biol. Chem. 274 (16): 10951–62. doi:10.1074 / jbc.274.16.10951. ISSN 0021-9258. PMID 10196175.

Další čtení

Screaton GR, Cáceres JF, Mayeda A, et al. (1995). „Identifikace a charakterizace tří členů lidské rodiny SR faktorů sestřihu pre-mRNA“. EMBO J.. 14 (17): 4336–49. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00108.x. PMC 394518. PMID 7556075.
Nayler O, Strätling W, Bourquin JP a kol. (1998). „Protein SAF-B spojuje transkripci a sestřih pre-mRNA s prvky SAR / MAR“. Nucleic Acids Res. 26 (15): 3542–9. doi:10.1093 / nar / 26.15.3542. PMC 147731. PMID 9671816.
Yuan Y; Li DM; Sun H (1998). „PIR1, nová fosfatáza, která vykazuje vysokou afinitu k RNA. Ribonukleoproteinové komplexy“. J. Biol. Chem. 273 (32): 20347–53. doi:10.1074 / jbc.273.32.20347. PMID 9685386.
Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C a kol. (1999). „Protein asociovaný s faktorem sestřihu, p32, reguluje sestřih RNA inhibicí vazby a fosforylace ASF / SF2 RNA“. EMBO J.. 18 (4): 1014–24. doi:10.1093 / emboj / 18.4.1014. PMC 1171193. PMID 10022843.
Stoss O; Schwaiger FW; Cooper TA; Stamm S (1999). „Alternativní sestřih určuje intracelulární lokalizaci nového jaderného proteinu Nop30 a jeho interakci s sestřihovým faktorem SRp30c“. J. Biol. Chem. 274 (16): 10951–62. doi:10.1074 / jbc.274.16.10951. PMID 10196175.
Elliott DJ, Bourgeois CF, Klink A a kol. (2000). „Protein vázající RNA specifický pro zárodečné buňky savců interaguje s všudypřítomně exprimovanými proteiny zapojenými do výběru místa sestřihu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (11): 5717–22. Bibcode:2000PNAS ... 97.5717E. doi:10.1073 / pnas.97.11.5717. PMC 18499. PMID 10823932.
Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM a kol. (2001). „Protein rodiny STAR / GSG rSLM-2 reguluje výběr alternativních spojovacích míst“. J. Biol. Chem. 276 (12): 8665–73. doi:10,1074 / jbc.M006851200. PMID 11118435.
Denegri M, Chiodi I, Corioni M a kol. (2002). „Stresem indukovaná jaderná těla jsou místa akumulace faktorů zpracování pre-mRNA“. Mol. Biol. Buňka. 12 (11): 3502–14. doi:10,1091 / mbc. 12.11.3502. PMC 60271. PMID 11694584.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Young PJ, DiDonato CJ, Hu D a kol. (2002). „SRp30c-dependentní stimulace přežití motorického neuronu (SMN) exonu 7 je usnadněna přímou interakcí s hTra2 beta 1“. Hučení. Mol. Genet. 11 (5): 577–87. doi:10,1093 / hmg / 11,5,577. PMID 11875052.
Simard MJ; Chabot B (2002). „SRp30c je represorem 3 'využití spojovacího místa“. Mol. Buňka. Biol. 22 (12): 4001–10. doi:10.1128 / MCB.22.12.4001-4010.2002. PMC 133842. PMID 12024014.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Raffetseder U, Frye B, Rauen T a kol. (2003). „Spojovací faktor SRp30c interakce s Y-box protein-1 propůjčuje nukleární YB-1 pendlování a alternativní výběr spojovacího místa“. J. Biol. Chem. 278 (20): 18241–8. doi:10,1074 / jbc.M212518200. PMID 12604611.
Xu Q; Leung DY; Kisich KO (2003). „Protein bohatý na serin-arginin p30 řídí alternativní sestřih pre-mRNA glukokortikoidního receptoru s glukokortikoidovým receptorem beta v neutrofilech“. J. Biol. Chem. 278 (29): 27112–8. doi:10,1074 / jbc.M300824200. PMID 12738786.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD a kol. (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Kondo S, Yamamoto N, Murakami T a kol. (2004). „Tra2 beta, SF2 / ASF a SRp30c modulují funkci zesilovače sestřihu exonů v exonu 10 pre-mRNA tau“. Geny buňky. 9 (2): 121–30. doi:10.1111 / j.1356-9597.2004.00709.x. PMID 15009090. S2CID 22248867.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wang Y, Wang J, Gao L a kol. (2005). „Tau exony 2 a 10, které jsou nesprávně regulovány u neurodegenerativních onemocnění, jsou částečně regulovány tlumiči, které vážou komplex SRp30c.SRp55, který buď rekrutuje nebo antagonizuje htra2beta1“. J. Biol. Chem. 280 (14): 14230–9. doi:10,1074 / jbc.M413846200. PMID 15695522.
Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ a kol. (2006). „Hotová sekvence DNA lidského chromozomu 12“. Příroda. 440 (7082): 346–51. Bibcode:2006 Natur.440..346S. doi:10.1038 / nature04569. PMID 16541075.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.