TRA2B - TRA2B

TRA2B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CQC, 2KXN, 2RRA, 2RRB
Identifikátory
Aliasy	TRA2B, Htra2-beta, PPP1R156, SFRS10, SRFS10, TRA2-BETA, TRAN2B, transformátor 2 beta homolog (Drosophila), transformátor 2 beta homolog
Externí ID	OMIM: 602719 MGI: 106016 HomoloGene: 20965 Genové karty: TRA2B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	185,938,103 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	22,266,005 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • mRNA vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba poly-purinového traktu; • Vazba RNA; • specifické vazby na proteinovou doménu; • pre-mRNA vazba; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • jaderná vnitřní membrána; • nukleoplazma; • spliceosomální komplex; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Sestřih RNA; • regionalizace mozkové kůry; • Zpracování mRNA; • negativní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • embryonální vývoj mozku; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • pozitivní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu; • regulace sestřihu RNA; • oligomerizace proteinu; • buněčná odpověď na stimul glukózy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6434
	20462
	ENSG00000136527
	ENSMUSG00000022858
	P62995
	P62996
	NM_001243879; NM_004593
	NM_009186; NM_001330554; NM_001330555
	NP_001230808; NP_004584
	NP_001317483; NP_001317484; NP_033212
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog beta proteinu transformátoru-2, také známý jako TRA2B dříve známé jako faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 10 (transformátor 2 homolog, Drosophila) (SFRS10), je protein že u lidí je kódován TRA2B gen.^[5]^[6]

Interakce

Ukázalo se, že TRA2B komunikovat s RBMX.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136527 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022858 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SFRS10 splicing factor, arginin / serine rich 10 (transformátor 2 homolog, Drosophila)“.
^ Nayler O, Cap C, Stamm S (říjen 1998). „Gen lidského transformátoru-2-beta (SFRS10): kompletní nukleotidová sekvence, chromozomální lokalizace a tvorba tkáňově specifické izoformy“. Genomika. 53 (2): 191–202. doi:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.
^ Hofmann, Yvonne; Wirth Brunhilde (srpen 2002). „hnRNP-G podporuje zahrnutí exonu 7 motorického neuronu přežití (SMN) prostřednictvím přímé interakce s Htra2-beta1“. Hučení. Mol. Genet. 11 (17): 2037–49. doi:10,1093 / hmg / 11.17.2037. ISSN 0964-6906. PMID 12165565.

Další čtení

Matsuo N, Ogawa S, Imai Y a kol. (1996). „Klonování nového RNA vázajícího polypeptidu (RA301) indukovaného hypoxií / reoxygenací“. J. Biol. Chem. 270 (47): 28216–22. doi:10.1074 / jbc.270.47.28216. PMID 7499316.
Lennon G, Auffray C, Polymeropoulos M, Soares MB (1996). „Konsorcium I.M.A.G.E.: integrovaná molekulární analýza genomů a jejich exprese“. Genomika. 33 (1): 151–2. doi:10.1006 / geno.1996.0177. PMID 8617505.
Beil B, Screaton G, Stamm S (1997). "Molekulární klonování htra2-beta-1 a htra2-beta-2, dva lidské homology tra-2 generované alternativním sestřihem". DNA Cell Biol. 16 (6): 679–90. doi:10.1089 / dna.1997.16.679. PMID 9212162.
Imai Y, Matsuo N, Ogawa S a kol. (1998). „Klonování genu, YT521, pro nový protein spojený s RNA sestřihem indukovaný hypoxií / reoxygenací“. Brain Res. Mol. Brain Res. 53 (1–2): 33–40. doi:10.1016 / S0169-328X (97) 00262-3. PMID 9473574.
Tacke R, Tohyama M, Ogawa S, Manley JL (1998). „Lidské proteiny Tra2 jsou sekvenčně specifické aktivátory sestřihu pre-mRNA“. Buňka. 93 (1): 139–48. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81153-8. PMID 9546399. S2CID 15384749.
Nayler O, Cap C, Stamm S (1998). „Gen lidského transformátoru-2-beta (SFRS10): kompletní nukleotidová sekvence, chromozomální lokalizace a tvorba tkáňově specifické izoformy“. Genomika. 53 (2): 191–202. doi:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). „Spojovací koaktivátor SRm160 / 300 je vyžadován pro funkci zesilovače exonu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (11): 6125–30. Bibcode:1999PNAS ... 96.6125E. doi:10.1073 / pnas.96.11.6125. PMC 26846. PMID 10339552.
Lai MC, Lin RI, Huang SY a kol. (2000). „Lidský protein rodiny importin-beta, transportin-SR2, interaguje s fosforylovanou RS doménou proteinů SR“. J. Biol. Chem. 275 (11): 7950–7. doi:10.1074 / jbc.275.11.7950. PMID 10713112.
Venables JP, Elliott DJ, Makarova OV a kol. (2000). „RBMY, pravděpodobný lidský faktor spermatogeneze, a další hnRNP G proteiny interagují s Tra2beta a ovlivňují sestřih“. Hučení. Mol. Genet. 9 (5): 685–94. doi:10,1093 / hmg / 9,5,685. PMID 10749975.
Helmken C, Wirth B (2001). „Vyloučení Htra2-beta1, regulátoru transkriptu SMN2 v plné délce, jako modifikujícího genu pro spinální svalovou atrofii“. Hučení. Genet. 107 (6): 554–8. doi:10,1007 / s004390000409. PMID 11153908. S2CID 30528707.
Young PJ, DiDonato CJ, Hu D a kol. (2002). „SRp30c-dependentní stimulace přežití motorického neuronu (SMN) exonu 7 je usnadněna přímou interakcí s hTra2 beta 1“. Hučení. Mol. Genet. 11 (5): 577–87. doi:10,1093 / hmg / 11,5,577. PMID 11875052.
Hofmann Y, Wirth B (2003). „hnRNP-G podporuje zahrnutí exonu 7 motorického neuronu přežití (SMN) prostřednictvím přímé interakce s Htra2-beta1“. Hučení. Mol. Genet. 11 (17): 2037–49. doi:10,1093 / hmg / 11.17.2037. PMID 12165565. % 3Aidid% 2Fen.wikipedia.org% 3ATRA2B" class="Z3988">
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Tran Q, Coleman TP, Roesser JR (2003). „Lidský transformátor 2beta a SRp55 interagují s kalcitoninově specifickým zesilovačem sestřihu“. Biochim. Biophys. Acta. 1625 (2): 141–52. doi:10.1016 / S0167-4781 (02) 00600-0. PMID 12531473.
El Yazidi-Belkoura I, Adriaenssens E, Dollé L a kol. (2003). „Proteinový protein smrti spojené s receptorem faktoru nekrotizující faktor tumoru je zapojen do antiapoptotické aktivity nervového růstového faktoru zprostředkovaného receptorem neurotrofinu v buňkách rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 278 (19): 16952–6. doi:10,1074 / jbc.M300631200. PMID 12604596.
Jiang Z, Tang H, Havlioglu N a kol. (2003). „Mutace v exonu 10 genu tau spojené s FTDP-17 mění aktivitu zesilovače exonového sestřihu k interakci s Tra2 beta“. J. Biol. Chem. 278 (21): 18997–9007. doi:10,1074 / jbc.M301800200. PMC 2140226. PMID 12649279.
Chen X, Guo L, Lin W, Xu P (2004). „Exprese izoforem Tra2beta je vývojově regulována v tkáňově a časově specifickém vzoru“. Cell Biol. Int. 27 (6): 491–6. doi:10.1016 / S1065-6995 (03) 00072-6. PMID 12798777. S2CID 44758770.
Helmken C, Hofmann Y, Schoenen F a kol. (2004). „Důkazy pro modifikační cestu v nesourodých rodinách SMA: snížená úroveň SMN snižuje množství jeho interagujících partnerů a Htra2-beta1“. Hučení. Genet. 114 (1): 11–21. doi:10.1007 / s00439-003-1025-2. PMID 14520560. S2CID 19872246.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD a kol. (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136527 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022858 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SFRS10 splicing factor, arginin / serine rich 10 (transformátor 2 homolog, Drosophila)“.

[pmid9790768-6] Nayler O, Cap C, Stamm S (říjen 1998). „Gen lidského transformátoru-2-beta (SFRS10): kompletní nukleotidová sekvence, chromozomální lokalizace a tvorba tkáňově specifické izoformy“. Genomika. 53 (2): 191–202. doi:10.1006 / geno.1998.5471. PMID 9790768.

[pmid12165565-7] Hofmann, Yvonne; Wirth Brunhilde (srpen 2002). „hnRNP-G podporuje zahrnutí exonu 7 motorického neuronu přežití (SMN) prostřednictvím přímé interakce s Htra2-beta1“. Hučení. Mol. Genet. 11 (17): 2037–49. doi:10,1093 / hmg / 11.17.2037. ISSN 0964-6906. PMID 12165565.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]