SFRS3 - SFRS3

SRSF3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2I38
Identifikátory
Aliasy	SRSF3, SFRS3, SRp20, spojovací faktor 3 bohatý na serin / arginin, spojovací faktor 3 bohatý na serin a arginin
Externí ID	OMIM: 603364 MGI: 98285 HomoloGene: 55708 Genové karty: SRSF3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	36,605,600 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	29,043,373 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • sekvenčně specifické vázání mRNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • cytoplazma; • nukleoplazma; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA 3'-end; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • export mRNA z jádra; • transport mRNA; • Zpracování mRNA; • Sestřih RNA; • regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Export RNA z jádra; • doprava; • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu; • mRNA cis sestřih, prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6428
	20383
	ENSG00000112081
	ENSMUSG00000071172
	P84103
	P84104
	NM_003017
	NM_013663
	NP_003008
	NP_038691
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 3 je protein že u lidí je kódován SFRS3 gen.^[5]^[6]

Zobrazení prohlížeče

Zobrazení prohlížeče UCSC genomu

Stránka s podrobnostmi o genu UCSC

Interakce

Bylo prokázáno, že SFRS3 komunikovat s RBM7.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112081 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071172 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zahler AM; Lane WS; Stolk JA; Roth MB (červen 1992). „SR proteiny: konzervovaná rodina faktorů sestřihu pre-mRNA“. Genes Dev. 6 (5): 837–47. doi:10,1101 / gad. 6.5.837. PMID 1577277.
^ „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS3, bohatý na arginin / serin 3“.
^ Guo, Taylor B; Boros Laszlo G; Chan Kam C; Hikim Amiya P Sinha; Hudson Alan P; Swerdloff Ronald S; Mitchell Aaron P; Salameh Wael A (2003). „Spermatogenetická exprese RNA-vazebného motivového proteinu 7, proteinu, který interaguje s sestřihovými faktory“. J. Androl. 24 (2): 204–14. doi:10.1002 / j.1939-4640.2003.tb02664.x. ISSN 0196-3635. PMID 12634307.

Další čtení

Ayane M; Preuss U; Köhler G; Nielsen PJ (1991). „Diferenciálně exprimovaná myší RNA kódující protein se podobnostmi se dvěma typy motivů vázajících nukleové kyseliny“. Nucleic Acids Res. 19 (6): 1273–8. doi:10.1093 / nar / 19.6.1273. PMC 333853. PMID 2030943.
Gui JF; Lane WS; Fu XD (1994). „Serinkináza reguluje intracelulární lokalizaci sestřihových faktorů v buněčném cyklu“. Příroda. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994 Natur.369..678G. doi:10.1038 / 369678a0. PMID 8208298. S2CID 4275539.
Cáceres JF; Screaton GR; Krainer AR (1998). „Specifická podmnožina proteinů SR se pohybuje nepřetržitě mezi jádrem a cytoplazmou“. Genes Dev. 12 (1): 55–66. doi:10.1101 / gad.12.1.55. PMC 316398. PMID 9420331.
Zhang WJ; Wu JY (1998). „Sip1, nový protein obsahující RS doménu nezbytný pro sestřih pre-mRNA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (2): 676–84. doi:10.1128 / MCB.18.2.676. PMC 108778. PMID 9447963.
Tripodis N, Mason R, Humphray SJ a kol. (1999). „Fyzická mapa člověka 6p21.2-6p21.3: oblast lemující centromerický konec hlavního histokompatibilního komplexu“. Genome Res. 8 (6): 631–43. doi:10,1101 / gr. 8.6.631. PMC 310739. PMID 9647638.
Papoutsopoulou S, Nikolakaki E, Chalepakis G a kol. (1999). „SR proteinově specifická kináza 1 je vysoce exprimována ve varlatech a fosforyluje protamin 1“. Nucleic Acids Res. 27 (14): 2972–80. doi:10.1093 / nar / 27.14.2972. PMC 148514. PMID 10390541.
Barnard DC; Patton JG (2000). "Identifikace a charakterizace nového sestřihu regulačního proteinu bohatého na serin-arginin". Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3049–57. doi:10.1128 / MCB.20.9.3049-3057.2000. PMC 85584. PMID 10757789.
Shnyreva M, Schullery DS, Suzuki H a kol. (2000). „Interakce dvou multifunkčních proteinů. Heterogenní jaderný ribonukleoprotein K a protein vázající Y-box“. J. Biol. Chem. 275 (20): 15498–503. doi:10.1074 / jbc.275.20.15498. PMID 10809782.
Elliott DJ, Bourgeois CF, Klink A a kol. (2000). „Protein vázající RNA specifický pro zárodečné buňky savců interaguje s všudypřítomně exprimovanými proteiny zapojenými do výběru místa sestřihu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (11): 5717–22. Bibcode:2000PNAS ... 97.5717E. doi:10.1073 / pnas.97.11.5717. PMC 18499. PMID 10823932.
Huang Y; Steitz JA (2001). „Splicingové faktory SRp20 a 9G8 podporují nukleocytoplazmatický export mRNA“. Mol. Buňka. 7 (4): 899–905. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00233-7. PMID 11336712.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Barnard DC; Li J; Peng R; Patton JG (2002). „Regulace alternativního sestřihu SRrp86 prostřednictvím koaktivace a represe specifických proteinů SR“. RNA. 8 (4): 526–33. doi:10.1017 / S1355838202029928. PMC 1370273. PMID 11991645.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Guo TB, Boros LG, Chan KC a kol. (2003). „Spermatogenetická exprese RNA-vazebného motivového proteinu 7, proteinu, který interaguje se spojovacími faktory“. J. Androl. 24 (2): 204–14. doi:10.1002 / j.1939-4640.2003.tb02664.x. PMID 12634307.
Tai HH, Geisterfer M, Bell JC a kol. (2003). „CHD1 se asociuje s NCoR a histon-deacetylázou i s proteiny sestřihu RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308 (1): 170–6. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01354-8. PMID 12890497.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD a kol. (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S a kol. (2005). „Zřetelné motivy sekvence v podjednotce 68 kDa štěpného faktoru Im zprostředkovávají vazbu RNA, interakce protein-protein a subcelulární lokalizaci“ (PDF). J. Biol. Chem. 279 (34): 35788–97. doi:10,1074 / jbc.M403927200. PMID 15169763. S2CID 39752996.
Lehner B; Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112081 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071172 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1577277-5] Zahler AM; Lane WS; Stolk JA; Roth MB (červen 1992). „SR proteiny: konzervovaná rodina faktorů sestřihu pre-mRNA“. Genes Dev. 6 (5): 837–47. doi:10,1101 / gad. 6.5.837. PMID 1577277.

[entrez-6] „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS3, bohatý na arginin / serin 3“.

[pmid12634307-7] Guo, Taylor B; Boros Laszlo G; Chan Kam C; Hikim Amiya P Sinha; Hudson Alan P; Swerdloff Ronald S; Mitchell Aaron P; Salameh Wael A (2003). „Spermatogenetická exprese RNA-vazebného motivového proteinu 7, proteinu, který interaguje s sestřihovými faktory“. J. Androl. 24 (2): 204–14. doi:10.1002 / j.1939-4640.2003.tb02664.x. ISSN 0196-3635. PMID 12634307.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]