SFRS2 - SFRS2 - Wikipedia

SRSF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KN4, 2LEA, 2LEB, 2LEC
Identifikátory
Aliasy	SRSF2, PR264, SC-35, SC35, SFRS2, SFRS2A, SRp30b, spojovací faktor 2 bohatý na serin / arginin, spojovací faktor 2 bohatý na serin a arginin
Externí ID	OMIM: 600813 MGI: 98284 HomoloGene: 37721 Genové karty: SRSF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	76,737,374 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	116,853,094 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • vazba protein kinázy C.; • pre-mRNA vazba;
Buněčná složka	• Tělo PML; • jaderná skvrna; • nukleoplazma; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytosol; • spliceosomální komplex; • interchromatinová granule; • cytoplazma;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • export mRNA z jádra; • Sestřih RNA; • Zpracování mRNA 3'-end; • Export RNA z jádra; • negativní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu; • reakce na vitamin E.; • regulace sestřihu RNA; • mRNA cis sestřih, prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6427
	20382
	ENSG00000161547
	ENSMUSG00000034120
	Q01130
	Q62093
	NM_001195427; NM_003016
	NM_011358
	NP_001182356; NP_003007
	NP_035488
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 2 je protein že u lidí je kódován SFRS2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že SFRS2 komunikovat s CDC5L^[8] a ASF / SF2.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161547 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034120 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bermingham JR, Arden KC, Naumova AK, Sapienza C, Viars CS, Fu XD, Khotz J, Manley JL, Rosenfeld MG (září 1995). "Chromozomální lokalizace myších a lidských genů kódujících sestřihové faktory ASF / SF2 (SFRS1) a SC-35 (SFRS2)". Genomika. 29 (1): 70–9. doi:10.1006 / geno.1995.1216. PMID 8530103.
^ Fu XD, Maniatis T (duben 1992). "Izolace komplementární DNA, která kóduje savčí sestřihový faktor SC35". Věda. 256 (5056): 535–8. doi:10.1126 / science.1373910. PMID 1373910.
^ „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS2, bohatý na arginin / serin 2“.
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
^ Zhang WJ, Wu JY (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. PMC 231539. PMID 8816452.

Další čtení

Sureau A, Soret J, Vellard M, Crochet J, Perbal B (prosinec 1992). „Spojení PR264 / c-myb: vyjádření sestřihového faktoru modulovaného jaderným protoonkogenem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 89 (24): 11683–7. doi:10.1073 / pnas.89.24.11683. PMC 50620. PMID 1465383.
Vellard M, Sureau A, Soret J, Martinerie C, Perbal B (duben 1992). „Potenciální spojovací faktor je kódován opačným vláknem trans-sestříhaného exonu c-myb“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 89 (7): 2511–5. doi:10.1073 / pnas.89.7.2511. PMC 48691. PMID 1557353.
Zahler AM, Lane WS, Stolk JA, Roth MB (květen 1992). „SR proteiny: konzervovaná rodina faktorů sestřihu pre-mRNA“. Geny a vývoj. 6 (5): 837–47. doi:10,1101 / gad. 6.5.837. PMID 1577277.
DuBridge RB, Tang P, Hsia HC, Leong PM, Miller JH, Calos MP (leden 1987). „Analýza mutací v lidských buňkách pomocí kyvadlového systému pro virus Epstein-Barr“. Molekulární a buněčná biologie. 7 (1): 379–87. doi:10,1128 / mcb.7.1.379. PMC 365079. PMID 3031469.
Tacke R, Manley JL (červenec 1995). „Lidské sestřihové faktory ASF / SF2 a SC35 mají odlišné, funkčně významné RNA vazebné specificity“. Časopis EMBO. 14 (14): 3540–51. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07360.x. PMC 394422. PMID 7543047.
Luznik L, Martone ME, Kraus G, Zhang Y, Xu Y, Ellisman MH, Wong-Staal F (červenec 1995). "Lokalizace viru lidské imunodeficience Rev v transfekovaných a virem infikovaných buňkách". Výzkum AIDS a lidské retroviry. 11 (7): 795–804. doi:10.1089 / podpora.1995.11.795. PMID 7546906.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Kohtz JD, Jamison SF, Will CL, Zuo P, Lührmann R, Garcia-Blanco MA, Manley JL (březen 1994). "Interakce protein-protein a rozpoznávání 5'-místa sestřihu v savčích mRNA prekurzorech". Příroda. 368 (6467): 119–24. doi:10.1038 / 368119a0. PMID 8139654. S2CID 4283089.
Wu JY, Maniatis T (prosinec 1993). "Specifické interakce mezi proteiny zapojenými do výběru místa sestřihu a regulovaného alternativního sestřihu". Buňka. 75 (6): 1061–70. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90316-I. PMID 8261509. S2CID 22951690.
Sureau A, Perbal B (únor 1994). "Několik mRNA s variabilními 3 'nepřekládanými oblastmi a odlišnou stabilitou kóduje lidský PR264 / SC35 sestřihový faktor". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (3): 932–6. doi:10.1073 / pnas.91.3.932. PMC 521427. PMID 8302870.
Fu XD (září 1993). "Specifický závazek různých pre-mRNA k sestřihu pomocí jednotlivých proteinů SR". Příroda. 365 (6441): 82–5. doi:10.1038 / 365082a0. PMID 8361546. S2CID 4332012.
Zhang WJ, Wu JY (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. PMC 231539. PMID 8816452.
Tronchère H, Wang J, Fu XD (červenec 1997). „Protein související s faktorem sestřihu U2AF35, který interaguje s proteiny U2AF65 a SR při sestřihu pre-mRNA“. Příroda. 388 (6640): 397–400. doi:10.1038/41137. PMID 9237760. S2CID 4386808.
Sureau A, Soret J, Guyon C, Gaillard C, Dumon S, Keller M, Crisanti P, Perbal B (listopad 1997). "Charakterizace více alternativních RNA, které jsou výsledkem antisense transkripce genu faktoru sestřihu PR264 / SC35". Výzkum nukleových kyselin. 25 (22): 4513–22. doi:10.1093 / nar / 25.22.4513. PMC 147067. PMID 9358160.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Zhang WJ, Wu JY (únor 1998). „Sip1, nový protein obsahující RS doménu nezbytný pro sestřih pre-mRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (2): 676–84. doi:10,1128 / mcb.18.2.676. PMC 108778. PMID 9447963.
Imai Y, Matsuo N, Ogawa S, Tohyama M, Takagi T (leden 1998). „Klonování genu, YT521, pro nový protein spojený s RNA sestřihem indukovaný hypoxií / reoxygenací“. Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 53 (1–2): 33–40. doi:10.1016 / S0169-328X (97) 00262-3. PMID 9473574.
Parfenov VN, Davis DS, Pochukalina GN, Kostyuchek D, Murti KG (duben 1998). "Dynamika distribuce sestřihových složek vzhledem k transkripčnímu stavu lidských oocytů z antrálních folikulů". Journal of Cellular Biochemistry. 69 (1): 72–80. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980401) 69: 1 <72 :: AID-JCB8> 3.0.CO; 2-S. PMID 9513048.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q01130 (Spojovací faktor 2 bohatý na serin / arginin) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161547 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034120 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8530103-5] Bermingham JR, Arden KC, Naumova AK, Sapienza C, Viars CS, Fu XD, Khotz J, Manley JL, Rosenfeld MG (září 1995). "Chromozomální lokalizace myších a lidských genů kódujících sestřihové faktory ASF / SF2 (SFRS1) a SC-35 (SFRS2)". Genomika. 29 (1): 70–9. doi:10.1006 / geno.1995.1216. PMID 8530103.

[pmid1373910-6] Fu XD, Maniatis T (duben 1992). "Izolace komplementární DNA, která kóduje savčí sestřihový faktor SC35". Věda. 256 (5056): 535–8. doi:10.1126 / science.1373910. PMID 1373910.

[entrez-7] „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS2, bohatý na arginin / serin 2“.

[pmid11101529-8] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

[pmid8816452-9] Zhang WJ, Wu JY (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. PMC 231539. PMID 8816452.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]