SFRS4 - SFRS4

SRSF4
Identifikátory
Aliasy	SRSF4, SFRS4, SRP75, spojovací faktor bohatý na serin / arginin 4, spojovací faktor bohatý na serin a arginin 4
Externí ID	OMIM: 601940 MGI: 1890577 HomoloGene: 25624 Genové karty: SRSF4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	29,181,900 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	131,901,706 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifické vázání mRNA; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • vazba nukleotidů;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • negativní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Zpracování mRNA 3'-end; • export mRNA z jádra; • Sestřih RNA; • Export RNA z jádra; • reakce na inzulín; • regulace alternativního mRNA sestřihu pomocí spliceosomu; • mRNA cis sestřih, prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6429
	57317
	ENSG00000116350
	ENSMUSG00000028911
	Q08170
	Q8VE97
	NM_005626
	NM_020587
	NP_005617
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 4 je protein že u lidí je kódován SFRS4 gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že SFRS4 komunikovat s Pinin.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116350 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028911 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zahler AM; Neugebauer KM; Stolk JA; Roth MB (červenec 1993). "Lidské SR proteiny a izolace cDNA kódující SRp75". Mol Cell Biol. 13 (7): 4023–8. doi:10.1128 / MCB.13.7.4023. PMC 359951. PMID 8321209.
^ „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS4, bohatý na arginin / serin 4“.
^ Zimowska, Grazyna; Shi Jia; Munguba Gustavo; Jackson Moira R; Alpatov Roman; Simmons Matthew N; Shi Yujiang; Sugrue Stephen P (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.

Další čtení

Zahler AM; Lane WS; Stolk JA; Roth MB (1992). „SR proteiny: konzervovaná rodina faktorů sestřihu pre-mRNA“. Genes Dev. 6 (5): 837–47. doi:10,1101 / gad. 6.5.837. PMID 1577277.
Ramchatesingh J, Zahler AM, Neugebauer KM a kol. (1995). „Podskupina proteinů SR aktivuje sestřih alternativního exonu srdečního troponinu T přímými interakcemi s exonickým zesilovačem“. Mol. Buňka. Biol. 15 (9): 4898–907. doi:10.1128 / MCB.15.9.4898. PMC 230736. PMID 7651409.
Marujama K; Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Gui JF; Lane WS; Fu XD (1994). „Serinkináza reguluje intracelulární lokalizaci sestřihových faktorů v buněčném cyklu“. Příroda. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994 Natur.369..678G. doi:10.1038 / 369678a0. PMID 8208298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Zhang WJ; Wu JY (1998). „Sip1, nový protein s obsahem domény RS, nezbytný pro spojování pre-mRNA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (2): 676–84. doi:10.1128 / MCB.18.2.676. PMC 108778. PMID 9447963.
Blencowe BJ; Vydavatel R; Nickerson JA; Sharp PA (1998). „Koaktivátor sestřihu pre-mRNA“. Genes Dev. 12 (7): 996–1009. doi:10,1101 / gad 12. 7. 996. PMC 316672. PMID 9531537.
Papoutsopoulou S, Nikolakaki E, Chalepakis G a kol. (1999). „SR proteinově specifická kináza 1 je vysoce exprimována ve varlatech a fosforyluje protamin 1“. Nucleic Acids Res. 27 (14): 2972–80. doi:10.1093 / nar / 27.14.2972. PMC 148514. PMID 10390541.
Monsalve M, Wu Z, Adelmant G a kol. (2000). "Přímá vazba transkripce a zpracování mRNA pomocí termogenního koaktivátoru PGC-1". Mol. Buňka. 6 (2): 307–16. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00031-9. PMID 10983978.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Meissner M, Lopato S, Gotzmann J a kol. (2003). „Proto-onkoprotein TLS / FUS je spojen s jadernou matricí a komplexován s sestřihovými faktory PTB, SRm160 a SR proteiny“. Exp. Cell Res. 283 (2): 184–95. doi:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID 12581738.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD a kol. (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interakčních proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Zimowska G, Shi J, Munguba G a kol. (2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.
de Graaf K, Hekerman P, Spelten O a kol. (2004). „Charakterizace cyklinu L2, nového cyklinu s doménou bohatou na arginin / serin: fosforylace pomocí DYRK1A a kolokalizace pomocí sestřihových faktorů“. J. Biol. Chem. 279 (6): 4612–24. doi:10,1074 / jbc.M310794200. PMID 14623875.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006 Natur.441..315G. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116350 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028911 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8321209-5] Zahler AM; Neugebauer KM; Stolk JA; Roth MB (červenec 1993). "Lidské SR proteiny a izolace cDNA kódující SRp75". Mol Cell Biol. 13 (7): 4023–8. doi:10.1128 / MCB.13.7.4023. PMC 359951. PMID 8321209.

[entrez-6] „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS4, bohatý na arginin / serin 4“.

[pmid14578391-7] Zimowska, Grazyna; Shi Jia; Munguba Gustavo; Jackson Moira R; Alpatov Roman; Simmons Matthew N; Shi Yujiang; Sugrue Stephen P (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]