SFRS11 - SFRS11

SRSF11
Identifikátory
Aliasy	SRSF11, NET2, SFRS11, dJ677H15.2, p54, spojovací faktor bohatý na serin / arginin 11, spojovací faktor bohatý na serin a arginin 11
Externí ID	OMIM: 602010 MGI: 1916457 HomoloGene: 36164 Genové karty: SRSF11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	70,253,052 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	158,036,639 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • Zpracování mRNA 3'-end; • export mRNA z jádra; • Sestřih RNA; • Export RNA z jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9295
	69207
	ENSG00000116754
	ENSMUSG00000055436
	Q05519; Q5T757
	n / a
NM_001190987; NM_004768; NM_001350605; NM_001350606; NM_001350607;
	NM_001350608; NM_001350609; NM_001350610; NM_001350611; NM_001350612; NM_001350613; NM_001350614; NM_001350615; NM_001350616
	NM_001093752; NM_001093753; NM_026989; NM_001356997
NP_001177916; NP_004759; NP_001337534; NP_001337535; NP_001337536;
	NP_001337537; NP_001337538; NP_001337539; NP_001337540; NP_001337541; NP_001337542; NP_001337543; NP_001337544; NP_001337545
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor sestřihu, bohatý na arginin / serin 11 je protein že u lidí je kódován SFRS11 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje 54-kD jaderný protein, který obsahuje oblast bohatou na arginin / serin podobnou segmentům nalezeným v pre-mRNA sestřihových faktorech. Ačkoli funkce tohoto proteinu ještě není známa, údaje o struktuře a imunolokalizaci naznačují, že může hrát roli při zpracování pre-mRNA.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že SFRS11 komunikovat s U2AF2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116754 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055436 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chaudhary N; McMahon C; Blobel G (říjen 1991). „Primární struktura jaderného proteinu bohatého na lidský arginin, který se kolokalizuje složkami spliceosomu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (18): 8189–93. Bibcode:1991PNAS ... 88.8189C. doi:10.1073 / pnas.88.18.8189. PMC 52472. PMID 1896467.
^ ^A ^b „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS11, bohatý na arginin / serin 11“.
^ Zhang, WJ; Wu J Y (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Mol. Buňka. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. ISSN 0270-7306. PMC 231539. PMID 8816452.

Další čtení

Zhang WJ; Wu JY (1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. PMC 231539. PMID 8816452.
Straub T, Grue P, Uhse A a kol. (1998). „Faktor sestřihu RNA PSF / p54 řídí aktivitu DNA-topoizomerázy I přímou interakcí“. J. Biol. Chem. 273 (41): 26261–4. doi:10.1074 / jbc.273.41.26261. PMID 9756848.
Page-McCaw PS; Amonlirdviman K; Sharp PA (2000). „PUF60: nová spojovací aktivita související s U2AF65“. RNA. 5 (12): 1548–60. doi:10.1017 / S1355838299991938. PMC 1369877. PMID 10606266.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Sakashita E, Tatsumi S, Werner D a kol. (2004). „Lidský RNPS1 a související faktory: univerzální alternativní regulátor sestřihu pre-mRNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 24 (3): 1174–87. doi:10.1128 / MCB.24.3.1174-1187.2004. PMC 321435. PMID 14729963.
Wu JY, Kar A, Kuo D a kol. (2006). „SRp54 (SFRS11), regulátor pro alternativní sestřih tau exonu 10 identifikovaný strategií klonování exprese“. Mol. Buňka. Biol. 26 (18): 6739–47. doi:10.1128 / MCB.00739-06. PMC 1592875. PMID 16943417.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116754 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055436 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1896467-5] Chaudhary N; McMahon C; Blobel G (říjen 1991). „Primární struktura jaderného proteinu bohatého na lidský arginin, který se kolokalizuje složkami spliceosomu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 88 (18): 8189–93. Bibcode:1991PNAS ... 88.8189C. doi:10.1073 / pnas.88.18.8189. PMC 52472. PMID 1896467.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: spojovací faktor SFRS11, bohatý na arginin / serin 11“.

[pmid8816452-7] Zhang, WJ; Wu J Y (říjen 1996). „Funkční vlastnosti p54, nového proteinu SR aktivního v konstitutivním a alternativním sestřihu“. Mol. Buňka. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 16 (10): 5400–8. doi:10.1128 / MCB.16.10.5400. ISSN 0270-7306. PMC 231539. PMID 8816452.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]