Imidazoleglycerol-fosfát dehydratáza - Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase

imidazoleglycerol-fosfát dehydratáza
4lom.jpg
Identifikátory
EC číslo4.2.1.19
Číslo CAS9024-35-5
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO
Imidazoleglycerol-fosfát dehydratáza
PDB 1rhy EBI.jpg
krystalová struktura imidazol glycerol fosfát dehydratázy
Identifikátory
SymbolIGPD
PfamPF00475
Pfam klanCL0329
InterProIPR000807
STRÁNKAPDOC00738
SCOP21rhy / Rozsah / SUPFAM

v enzymologie, an imidazoleglycerol-fosfát dehydratáza (ES 4.2.1.19 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

D-erythro-l- (imidazol-4-yl) glycerol 3-fosfát 3- (imidazol-4-yl) -2-oxopropylfosfát + H2Ó

Tento enzym tedy jeden má Podklad, D-erythro-l- (imidazol-4-yl) glycerol 3-fosfát, a dva produkty, 3- (imidazol-4-yl) -2-oxopropylfosfát a H2Ó. Tato reakce je šestým krokem v biosyntéza z histidin v bakterie, houby a rostliny.

Tento enzym patří do rodiny lyázy, konkrétně hydrolyázy, které štěpí vazby uhlík-kyslík. The systematické jméno této třídy enzymů je D-erythro-l- (imidazol-4-yl) glycerol-3-fosfáthydrolyáza [tvořící 3- (imidazol-4-yl) -2-oxopropylfosfát]. Mezi další běžně používaná jména patří IGP dehydratáza, a D-erythro-l- (imidazol-4-yl) glycerol-3-fosfáthydrolyáza. Tento enzym se účastní metabolismus histidinu protože je zapojen do 6. kroku biosyntézy histidinu jako součást devítikrokové cyklické dráhy.

Existují dvě izoformy IGPD; IGPD1 a IGPD2. Různé izoformy jsou vysoce konzervativní, pouze 8 aminokyselin se mezi nimi liší. Tyto jemné rozdíly však ovlivňují jejich aktivitu, ale zatím není známo, jak.

Ve většině organismy IGPD je monofunkční protein asi 22 až 29 kD. U některých bakterií, jako je Escherichia coli, to je C-terminál doména bifunkčního proteinu, který zahrnuje a histidinol-fosfatáza doména.[1] v E-coli, to je protein kódovaný hisB gen.[2]

Inhibice

Určité sloučeniny, které inhibují IGPD, byly použity jako herbicidy protože zvířata tento protein nemají. Jedním z těchto inhibitorů je 3-Amino-l, 2,4-triazol (3-AT), který byl také použit jako kompetitivní inhibitor produktu z droždí JEHO 3 gen (další IGPD), např. v kvasnicový dvouhybridní systém.[3][4]

Strukturální studie

Ke konci roku 2007, 3 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1RHY, 2AE8, a 2F1D.[5]

Reference

  1. ^ Carlomagno MS, Chiariotti L, Alifano P, Nappo AG, Bruni CB (říjen 1988). "Struktura a funkce operonů histidinu Salmonella typhimurium a Escherichia coli K-12". J. Mol. Biol. 203 (3): 585–606. doi:10.1016/0022-2836(88)90194-5. PMID  3062174.
  2. ^ Brilli, M .; Fani, R. (2004). "Molekulární vývoj hisB genů". Journal of Molecular Evolution. 58 (2): 225–237. Bibcode:2004JMolE..58..225B. doi:10.1007 / s00239-003-2547-x. PMID  15042344. S2CID  1684458.
  3. ^ Brennan, M. B .; Struhl, K. (1980-01-25). "Mechanismy zvyšování exprese genu kvasinek v Escherichia coli". Journal of Molecular Biology. 136 (3): 333–338. doi:10.1016/0022-2836(80)90377-0. ISSN  0022-2836. PMID  6990004.
  4. ^ Cagney, G .; Uetz, P .; Fields, S. (2000). „Vysoce výkonný screening interakcí protein-protein pomocí dvouhybridního testu“. Metody v enzymologii. 328: 3–14. doi:10.1016 / s0076-6879 (00) 28386-9. ISBN  9780121822293. ISSN  0076-6879. PMID  11075334.
  5. ^ Glynn SE, Baker PJ, Sedelnikova SE, Davies CL, Eadsforth TC, Levy CW, Rodgers HF, Blackburn GM, Hawkes TR, Viner R, Rice DW (2005). "Struktura a mechanismus imidazoleglycerol-fosfát dehydratázy". Struktura. 13 (12): 1809–17. doi:10.1016 / j.str.2005.08.012. PMID  16338409.

Další čtení

  • AMES BN (1957). "Biosyntéza histidinu; D-erythro-imidazoleglycerol fosfát dehydráza". J. Biol. Chem. 228 (1): 131–43. PMID  13475302.