PRMT1 - PRMT1 - Wikipedia

PRMT1
Protein PRMT1 PDB 1or8.png
Identifikátory
AliasyPRMT1, ANM1, HCP1, HRMT1L2, IR1B4, protein arginin methyltransferáza 1
Externí IDOMIM: 602950 MGI: 107846 HomoloGene: 21477 Genové karty: PRMT1
EC číslo2.1.1.321
Umístění genu (člověk)
Chromozom 19 (lidský)
Chr.Chromozom 19 (lidský)[1]
Chromozom 19 (lidský)
Genomic location for PRMT1
Genomic location for PRMT1
Kapela19q13.33Start49,675,786 bp[1]
Konec49,689,029 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PRMT1 206445 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

3276

15469

Ensembl

ENSG00000126457

ENSMUSG00000109324

UniProt

Q99873

Q9JIF0

RefSeq (mRNA)

NM_001207042
NM_001536
NM_198318
NM_198319

NM_001252476
NM_001252477
NM_019830

RefSeq (protein)

NP_001193971
NP_001527
NP_938074

NP_001239405
NP_001239406
NP_062804

Místo (UCSC)Chr 19: 49,68 - 49,69 MbChr 7: 44,98 - 44,99 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein arginin N-methyltransferáza 1 je enzym že u lidí je kódován PRMT1 gen.[5] Gen HRMT1L2 kóduje protein arginin methyltransferáza který funguje jako a histon methyltransferáza specifické pro histon H4.[6]

Funkce

Gen PRMT1 kóduje protein arginin methyltransferáza který funguje jako a histon methyltransferáza specifické pro histon H4 v eukaryotických buňkách.[6] Specifická změna histonu H4 v eukaryotech mu dává schopnost remodelovat chromatin, který působí jako posttranslační modifikátor.[7]

Regulací genové exprese regulují argininmethyltransferázy buněčný cyklus a smrt eukaryotických buněk.[7]

Reakční cesta

Zatímco všechny enzymy PRMT katalyzují methylaci argininových zbytků v proteinech, PRMT1 je jedinečný v tom, že katalyzuje tvorbu asymetricky dimethylovaného argininu na rozdíl od PRMT2, který katalyzuje tvorbu symetricky dimethylovaného argininu.[8] Individuální využití PRMT S-adenosyl-L-methionin (SAM) jako donor methylu a katalyzují přenos methylové skupiny na ω-dusík zbytku argininu.[8]

Klinický význam

U lidí tyto enzymy regulují genovou expresi, a proto se podílejí na patogenezi mnoha lidských onemocnění.[9] Pomocí inhibitorů enzymů pro arginin methyltransferázu 1 byly studie schopny demonstrovat potenciál enzymu jako časný katalyzátor různých druhů rakoviny.[9][8][10]

Interakce

PRMT1 bylo prokázáno komunikovat s:

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity ke studiu funkce a struktury PRMT1.

Podmíněný knockout myš linka, tzv Prmt1tm1a (EUCOMM) Wtsi[24][25] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům.[26][27][28]

Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[22][29] Bylo provedeno 23 testů mutant myši a byly pozorovány tři významné abnormality.[22] Ne homozygotní mutant embrya byla identifikována během těhotenství, a tak žádná nepřežila až do odstavení. Zbývající testy byly provedeny dne heterozygotní mutantní dospělé myši a samice vykazovaly zvýšenou cirkulaci kreatinin úrovně.[22]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126457 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000109324 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Scott HS, Antonarakis SE, Lalioti MD, Rossier C, Silver PA, Henry MF (červen 1998). "Identifikace a charakterizace dvou domnělých humánních argininmethyltransferáz (HRMT1L1 a HRMT1L2)". Genomika. 48 (3): 330–40. doi:10.1006 / geno.1997.5190. PMID  9545638.
  6. ^ A b „Entrez Gene: PRMT1 protein arginin methyltransferáza 1“.
  7. ^ A b Qian K, Zhen G (01.01.2016). „Kapitola 8 - Současný vývoj inhibitorů protein arginin methyltransferázy“. In Medina-Franco JL (ed.). Epi-informatika. Boston: Academic Press. 231–256. doi:10.1016 / b978-0-12-802808-7.00008-3. ISBN  978-0-12-802808-7.
  8. ^ A b C Obianyo O, Osborne TC, Thompson PR (září 2008). "Kinetický mechanismus protein arginin methyltransferázy 1". Biochemie. 47 (39): 10420–7. doi:10,1021 / bi800904m. PMC  2933744. PMID  18771293.
  9. ^ A b Zeng H, Xu W (01.01.2015). „Kapitola 16 - Enzymatické testy enzymů histonmethyltransferázy“. V Zheng YG (ed.). Epigenetické technologické aplikace. Boston: Academic Press. 333–361. doi:10.1016 / b978-0-12-801080-8.00016-8. ISBN  978-0-12-801080-8.
  10. ^ Carbone F, Montecucco F, Xu S, Banach M, Jamialahmadi T, Sahebkar A (srpen 2020). „Epigenetika u aterosklerózy: klíčové rysy a terapeutické důsledky“. Znalecký posudek na terapeutické cíle. 24 (8): 719–721. doi:10.1080/14728222.2020.1764535. PMID  32354276.
  11. ^ A b Lin WJ, Gary JD, Yang MC, Clarke S, Herschman HR (červen 1996). „Savčí bezprostřední časný protein TIS21 a protein BTG1 asociovaný s leukémií interagují s protein-arginin N-methyltransferázou“. J. Biol. Chem. 271 (25): 15034–44. doi:10.1074 / jbc.271.25.15034. PMID  8663146.
  12. ^ A b Berthet C, Guéhenneux F, Revol V, Samarut C, Lukaszewicz A, Dehay C, Dumontet C, Magaud JP, Rouault JP (leden 2002). "Interakce PRMT1 s proteiny BTG / TOB v buněčné signalizaci: molekulární analýza a funkční aspekty". Geny buňky. 7 (1): 29–39. doi:10.1046 / j.1356-9597.2001.00497.x. PMID  11856371. S2CID  15016952.
  13. ^ Smith WA, Schurter BT, Wong-Staal F, David M (květen 2004). „Argininová methylace RNA helikázy a určuje její subcelulární lokalizaci“. J. Biol. Chem. 279 (22): 22795–8. doi:10,1074 / jbc.C300512200. PMID  15084609.
  14. ^ A b Lee J, Bedford MT (březen 2002). „PABP1 identifikován jako substrát arginin methyltransferázy pomocí proteinových polí s vysokou hustotou“. EMBO Rep. 3 (3): 268–73. doi:10.1093 / embo-reports / kvf052. PMC  1084016. PMID  11850402.
  15. ^ A b C Wada K, Inoue K, Hagiwara M (srpen 2002). "Identifikace methylovaných proteinů proteinem arginin N-methyltransferázou 1, PRMT1, s novou strategií klonování exprese". Biochim. Biophys. Acta. 1591 (1–3): 1–10. doi:10.1016 / s0167-4889 (02) 00202-1. PMID  12183049.
  16. ^ A b Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
  17. ^ A b Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (leden 2003). „Protein vázající RNA Sam68 je in vivo substrát pro protein arginin N-methyltransferázu 1“. Mol. Biol. Buňka. 14 (1): 274–87. doi:10,1091 / mbc.E02-08-0484. PMC  140244. PMID  12529443.
  18. ^ Abramovich C, Yakobson B, Chebath J, Revel M (leden 1997). „Protein-arginin methyltransferáza se váže na intracytoplazmatickou doménu řetězce IFNAR1 v interferonovém receptoru typu I“. EMBO J.. 16 (2): 260–6. doi:10.1093 / emboj / 16.2.260. PMC  1169633. PMID  9029147.
  19. ^ Tang J, Kao PN, Herschman HR (červen 2000). „Protein-arginin methyltransferáza I, převládající protein-arginin methyltransferáza v buňkách, interaguje s a je regulována vazebným faktorem zesilovače interleukinu 3“. J. Biol. Chem. 275 (26): 19866–76. doi:10,1074 / jbc.M000023200. PMID  10749851.
  20. ^ Kwak YT, Guo J, Prajapati S, Park KJ, Surabhi RM, Miller B, Gehrig P, Gaynor RB (duben 2003). „Methylace SPT5 reguluje jeho interakci s RNA polymerázou II a vlastnosti prodloužení transkripce“. Mol. Buňka. 11 (4): 1055–66. doi:10.1016 / s1097-2765 (03) 00101-1. PMID  12718890.
  21. ^ "Data klinické chemie pro Prmt1". Wellcome Trust Sanger Institute.
  22. ^ A b C d Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  23. ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
  24. ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
  25. ^ "Myší genomová informatika".
  26. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  27. ^ Dolgin E (2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  28. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). „Myš ze všech důvodů“. Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  29. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q99873 (Protein arginin N-methyltransferáza 1) na PDBe-KB.