Systém klasifikace Cavalier-Smiths - Cavalier-Smiths system of classification - Wikipedia
Biologický klasifikační systém života zavedený britským zoologem Thomas Cavalier-Smith zahrnuje systematické uspořádání všech forem života na Zemi. Sledování a zdokonalování klasifikačních systémů zavedených Carl Linné, Ernst Haeckel, Robert Whittaker, a Carl Woese, Cavalier-Smithova klasifikace se pokouší začlenit nejnovější vývoj v taxonomii.[1][2] Jeho klasifikace byla významným základem v moderní taxonomii, zejména při revizích a reorganizacích království a kmenů.[Citace je zapotřebí ]
Cavalier-Smith rozsáhle publikoval na internetu klasifikace z protistů. Jedním z jeho hlavních příspěvků k biologii byl jeho návrh nového království života: Chromista, ačkoli užitečnost seskupení je sporná vzhledem k tomu, že se obecně souhlasí s libovolným (polyfyletickým) seskupením taxonů. Navrhl také, aby všechny chromisty a alveolata sdílejí stejného společného předka, toto tvrzení později vyvrátili studie morfologických a molekulárních důkazů jiných laboratoří. Tuto novou skupinu pojmenoval Chromalveoláty. Navrhl a pojmenoval také mnoho dalších vysoce postavených taxonů Opisthokonta (1987), Rhizaria (2002) a Excavata (2002), ačkoli sám důsledně nezahrnuje Opisthonkonta jako formální taxon do svých schémat. Spolu s Chromalveolata, Amébozoa (jejich popis změnil v roce 1998) a Archaeplastida (kterou nazýval Plantae od roku 1981) šest tvořilo základ taxonomie eukaryoty v polovině 2000. Vydal také báječně o otázkách, jako je původ různých buněčný organely (včetně jádro, mitochondrie ), velikost genomu vývoj, a endosymbióza. Ačkoli je docela dobře známo, mnoho z jeho tvrzení bylo kontroverzních a nezískalo široké přijetí v USA vědecká společnost k datu. V poslední době publikoval článek citující parafylově jeho bakteriální království, původ Neomura z Aktinobakterie a taxonomie prokaryoty.
Podle Palaeos.com:
Cavalier-Smith z Oxfordské univerzity vytvořil mnoho práce, která je dobře hodnocena. Přesto je kontroverzní způsobem, který je trochu obtížné popsat. Problém může být ve stylu psaní. Cavalier-Smith má tendenci vydávat prohlášení, kde by ostatní používali deklarativní věty, používat deklarativní věty, kde by ostatní vyjádřili názor, a vyjadřovat názory, kde by se andělé báli šlapat. Kromě toho může znít arogantně, reakčně a dokonce zvráceně. Na druhou stranu má dlouhou historii, kdy měl pravdu, když se všichni ostatní mýlili. Pro náš způsob myšlení je to všechno zastíněno jednou nesrovnatelnou ctností: skutečností, že on vůle zápasit s detaily. To dělá velmi dlouhé a velmi složité papíry a způsobuje všechny druhy temného mumlání, trhání vlasů a skřípání zubů mezi těmi, kteří se snaží vysvětlit jeho pohledy na časný život. Viz například [Zrzavý (2001)[3] [a] Patterson (1999).[4][5][6] Přesto se zabývá všemi relevantními fakty.[7]
Model osmi království
První dvě království života: Plantae a Animalia
Použití slova „království „popsat živý svět se datuje již od roku Linné (1707–1778), který rozdělil přírodní svět na tři království: zvíře, zeleninový, a minerální.[8][9] Klasifikace "zvířecí říše" (nebo království) Animalia ) a „rostlinná říše“ (nebo království Plantae ) zůstávají používány moderními evoluční biologové. Prvoky byly původně klasifikovány jako členové zvířecí říše.[10] Nyní jsou klasifikovány jako několik samostatných skupin.
Třetí království: Protista
V polovině devatenáctého století mikroskopické organismy byly obecně rozděleny do čtyř skupin:
- Prvoci (primitivní zvířata),
- Protophyta (primitivní rostliny),
- Phytozoa (rostliny podobné zvířatům a rostlinám podobná zvířata) a
V roce 1858 Richard Owen (1804–1892) navrhl, aby byl zvířecí kmen Protozoa povýšen do stavu království.[11] V roce 1860 John Hogg (1800–1869) navrhl, aby se prvoky a protofyty seskupily do nového království, které nazval „Regnum Primigenum“ (primitivní království). Podle Hogga toto nové klasifikační schéma zabraňovalo „zbytečným problémům sporu o jejich domnělou povahu a zbytečné snaze odlišit Protozoa od Protophyta“. V roce 1866 Ernst Haeckel (1834–1919) navrhl název „Protista „pro prapůvodní království a zahrnoval bakterie do tohoto třetího království života.[9]
Čtvrté království: Houby
Do roku 1959, Robert Whittaker navrhl, aby houby, které byly dříve klasifikovány jako rostliny, dostaly své vlastní království. Proto rozdělil život na čtyři království, například:
- Protista (nebo jednobuněčné organismy);
- Plantae, (nebo mnohobuněčné rostliny);
- Houby; a
- Animalia (nebo mnohobuňečný zvířata).
Whittaker rozdělil Protistu na dva subkdomény:
Páté království: Bakterie (Monera)
Bakterie se zásadně liší od bakterií eukaryoty (rostliny, zvířata, houby, amebas, prvoky a chromista ). Eukaryoty mají buněčná jádra bakterie ne. V roce 1969 Whittaker povýšil bakterie na status království. Jeho nový klasifikační systém rozdělil živý svět do pěti království:
- Plantae,
- Animalia,
- Protista (Eunucleata),
- Houby a
- Monera (bakterie království).[13]
Šesté království: Archaebacteria
Království Monera lze rozdělit do dvou odlišných skupin: eubakterie (pravé bakterie) a archaebakterie (archaea ). V roce 1977 Carl Woese a George E. Fox zjistili, že archaebakterie (v jejich případě methanogeny) se geneticky liší (na základě jejich genů ribozomální RNA) od bakterií, takže život lze rozdělit do tří základních linií, a to:
- Eubacteria (všechny typické bakterie),
- Archaebacteria (methanogeny) a
- Urkaryoty (všechny eukaryoty).[15]
V roce 1990 představil Woese vytvořením domény nad královstvím třídoménový systém jako:
- Bakterie,
- Archaea a
- Eukarja.[14]
Ale Cavalier-Smith považoval Archaebacteria za království.[16]
Sedmé království: Chromista
Do roku 1981 rozdělil Cavalier-Smith všechny eukaryoty do devíti království.[17] V něm vytvořil Chromistu pro samostatné království některých protistů.[18]
Většina chromistů je fotosyntetický. To je odlišuje od většiny ostatních protistů, kterým chybí fotosyntéza. U rostlin i chromistů probíhá fotosyntéza chloroplasty. V rostlinách se však chloroplasty nacházejí v cytosol zatímco v chromistech jsou chloroplasty umístěny v lumen Jejich hrubé endoplazmatické retikulum. To odlišuje chromisty od rostlin.[11]
Na základě přidání Chromisty jako království navrhl, že i se svými devíti královstvími eukaryot je „nejlepším pro obecné vědecké použití systém sedmi království“,[17] který zahrnuje:
Osmé království: Archezoa
V roce 1983 představil Cavalier-Smith Archezoa pro (které nazýval) primitivními protisty, kterým chybí mitochondrie.[19] Původně to považoval za subkulturu, ale do roku 1989, kdy byl Chromista založen jako samostatné království, s ním zacházel jako s královstvím.[16]
Archezoa je nyní zaniklý.[20] Nyní přiřazuje bývalé členy království Archezoa kmenům Amoebozoa.[21]
Království Protozoa Sensu Cavalier-Smith
Cavalier-Smith označil to, co zbylo z protistického království, poté, co odstranil království Archezoa a Chromista, jako „království Protozoa“. V roce 1993 toto království obsahovalo 18 kmenů, jak je shrnuto v následující tabulce:[11]
# | Kmen | Přiřazen: | Vlastnosti | Osud |
---|---|---|---|---|
1 | Percolozoa | subkingdom Adictyozoa | chybí Golgiho diktyozomy | |
2 | Parabasalia | poddomovství Dictyozoa pobočka Parabasalia | má Golgiho diktyozomy chybí mitochondrie | |
3 | Euglenozoa | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Euglenozoa | má Golgiho diktyozomy většinou s mitochondrie s trans-sestřih z | |
4 | Opalozoa (bičíky ) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Ciliomyxa nadkmen Opalomyxa | má Golgiho diktyozomy tubulární mitochondriální cristae se spojením cis introny převážně řasený, žádné kortikální alveoly | |
5 | Mycetozoa (slizové formy) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Ciliomyxa nadkmen Opalomyxa | má Golgiho diktyozomy tubulární mitochondriální cristae se spojením cis introny převážně řasený, | |
6 | Choanozoa (choanoflagellates) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Ciliomyxa nadčeleď Choanozoa | má Golgiho diktyozomy zploštělý mitochondriální cristae se spojením cis introny převážně řasený, žádné kortikální alveoly | |
7 | Dinozoa (Dinoflagellata a Protalveolata ) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Alveolata nadkmen Miozoa | má Golgiho diktyozomy tubulární mitochondriální cristae se spojením cis introny s kortikálními alveoly | Přidělen Miozoovi v Alveolatě.[22] |
8 | Apicomplexa | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Alveolata nadkmen Miozoa | má Golgiho diktyozomy tubulární mitochondriální cristae se spojením cis introny s kortikálními alveoly | Přidělen Miozoovi v Alveolatě.[22] |
9 | Ciliophora | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Alveolata nadčeleď Heterokaryota | má Golgiho diktyozomy tubulární mitochondriální cristae se spojením cis introny s kortikálními alveoly | Přeřazeno Alveolatě.[22] |
10 | Rhizopoda (loose a filose améby ) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Neosarcodina | má Golgiho diktyozomy obvykle s trubkovitými cristae se spojením cis introny | |
11 | Retikulosa (foraminifera; retikulopodiální améby) | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Neosarcodina | má Golgiho diktyozomy obvykle s trubkovitými cristae se spojením cis introny | |
12 | Heliozoa | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Actinopoda | má Golgiho diktyozomy většinou s mitochondrie se spojením cis introny má axopodie | |
13 | Radiozoa | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Actinopoda | má Golgiho diktyozomy většinou s mitochondrie se spojením cis introny má axopodie | |
14 | Entamoebia | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Entamoebia | má Golgiho diktyozomy se spojením cis introny žádné mitochondrie, peroxisomy, hydrogenosomy nebo řasinky přechodné intranukleární centrosomy | |
15 | Myxosporidia | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Myxozoa | má Golgiho diktyozomy se spojením cis introny endoparazitické, mnohobuněčné spory, mitochondrie, a žádné řasinky | Reklasifikováno jako zvíře v roce 1998.[23] |
16 | Haplosporidie | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Myxozoa | má Golgiho diktyozomy se spojením cis introny endoparazitické, mnohobuněčné spory, mitochondrie, a žádné řasinky | Reklasifikováno jako zvíře v roce 1998.[23] |
17 | Paramyxie | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Myxozoa | má Golgiho diktyozomy se spojením cis introny endoparazitické, mnohobuněčné spory, mitochondrie, a žádné řasinky | Reklasifikováno jako zvíře v roce 1998.[23] |
18 | Druhohor | poddomovství Dictyozoa pobočka Bikonta infrakingdom Neozoa parvkingdom Mesozoa | má Golgiho diktyozomy se spojením cis introny tubulární mitochondriální cristae mnohobuněčné bez kolagenní pojivové tkáně | Reklasifikováno jako zvíře v roce 1998.[23] |
Kmen Opalozoa založil Cavalier-Smith v roce 1991.[24]
Modely šesti království
Do roku 1998 Cavalier-Smith snížil celkový počet království z osmi na šest: Animalia, Protozoa, Fungi, Plantae (včetně Červené a zelené řasy ), Chromista a Bacteria.[23]
Pět království Cavalier-Smith je klasifikováno jako eukaryoty jak je znázorněno v následujícím schématu:
- Eubakterie
- Neomura
- Archeobakterie
- Eukaryoty
- Království Protozoa
- Unikonts (heterotrofy )
- Kingdom Animalia
- Královské houby
- Bikonty (především fotosyntetický )
- Kingdom Plantae (včetně červených a zelených řas)
- Kingdom Chromista
Eukaryoty se dělí do dvou hlavních skupin: Unikont a Bikont. Uniciliates jsou buňky pouze s jedním bičík a unikonty pocházejí z uniciliates. Buňky Unikont mají často pouze jednu centriole také. Biciliate buňky mají dva bičíky a bikonty pocházejí z bicilátů. Biciliates podstoupit řasnatý transformace přeměnou mladšího předního bičíku na odlišný starší zadní bičík. Zvířata a houby jsou unikony, zatímco rostliny a chromisty jsou bikonty. Některé prvoky jsou unikonty, jiné bikonty.
Bakterie (= prokaryoty) se dále dělí na eubakterie a archaebakterie. Podle Cavalier-Smith je Eubacteria nejstarší skupinou pozemských organismů, která stále žije. Skupiny, které považuje za mladší (archaebakterie a eukaryoty), klasifikuje jako Neomura.
Model z roku 1998
Kingdom Animalia
V roce 1993 klasifikoval Cavalier-Smith Myxozoa jako prvok parvkingdom. Do roku 1998 jej překlasifikoval na subkulturu zvířat. Myxozoa obsahuje tři kmeny, Myxosporidia, Haplosporidie, a Paramyxie, které byly spolu s Myxozoa překlasifikovány na zvířata. Podobně Cavalier-Smith překlasifikoval kmen prvoků Druhohor jako zvířecí subkingdom.
V jeho schématu z roku 1998 byla zvířecí říše rozdělena do čtyř subkultur:
- Radiata (phyla Porifera, Cnidaria, Placozoa, a Ctenophora ),
- Myxozoa,
- Druhohor, a
- Bilateria (všechny ostatní živočišné kmeny).
Vytvořil pět nových zvířecích kmenů:
- Acanthognatha (vířníky, acanthocephalans, gastrotrichs, a gnathostomulids ),
- Brachiozoa (brachiopody a foronidy ),
- Lobopoda (onychophorany a tardigrades ),
- Kamptozoa (Entoprocta a Symbion ), a
- Nemathelminthes (Nematoda, Nematomorpha, Loricifera, Priapulida, a Kinorhyncha )
a poznal celkem 23 zvířecích kmenů, jak je znázorněno zde:
- Království Animaia
- Subkingdom Radiata
- Infrakingdom Spongiaria
- Kmen Porifera
- Infrakingdom Coelenterata
- Kmen Cnidaria
- Kmen Ctenophora
- Infrakingdom Placozoa
- Kmen Placozoa
- Infrakingdom Spongiaria
- Subkingdom Myxozoa
- Kmen Myxosporidia
- Subkingdom Bilateria
- Větev Protostomie
- Infrakingdom Lophozoa
- Superphylum Polyzoa
- Kmen Bryozoa
- Kmen Kamptozoa (Entoprocta a Cycliophora )
- Superphylum Conchozoa
- Kmen Měkkýš
- Kmen Brachiozoa sensu lato (Brachiozoa a Phoronida )
- Superphylum Sipuncula
- Kmen Sipuncula
- Superphylum Vermizoa
- Superphylum Polyzoa
- Infrakingdom Chaetognathi
- Kmen Chaetognatha
- Infrakingdom Ecdysozoa
- Superphylum Nemathelminthes
- Kmen Nemathelminthes (Nematoda a Nematomorpha; Priapozoa, Kinorhyncha a Loricifera )
- Superphylum Haemopoda
- Kmen Lobopodia (Onychophora a Tardigrada )
- Kmen Arthropoda
- Superphylum Nemathelminthes
- Infrakingdom Platyzoa
- Kmen Platyhelminthes (vč. Xenacoelomorpha )
- Kmen Acanthognatha (vč. Rotifera, Acanthocephala, Gnathostomulida, Gastrotricha )
- Infrakingdom Lophozoa
- Větev Deuterostomie
- Infrakingdom Coelomopora
- Kmen Ostnokožci
- Kmen Hemichordata
- Infrakingdom Chordonia
- Infrakingdom Coelomopora
- Větev Protostomie
- Subkingdom Druhohor
- Subkingdom Radiata
Království Protozoa
Podle navrhovaného klasifikačního systému Cavalier-Smith mají prvoky společné následující rysy:
- mají nebo pocházejí z organismů s mitochondriemi
- mají nebo pocházejí z organismů s peroxisomy
- chybí jim kolagenní pojivová tkáň
- postrádají epikiliární retronemy (tuhé tubulární řasnaté chloupky reverzující tah)
- postrádají dvě další membrány mimo jejich chloroplastový obal
Organismy, které tato kritéria nesplňují, byl Cavalier-Smithem převelen do jiných království.
Model z roku 2003
Království Protozoa
V roce 1993 rozdělil Cavalier-Smith království Prvoci na dva subkdomény a 18 kmenů.[11] Do roku 2003 použil fylogenní důkazy o revizi celkového počtu navrhovaných kmenů na 11: Amoebozoa, Choanozoa, Cercozoa, Retaria, Loukozoa, Metamonada, Euglenozoa, Percolozoa, Apusozoa, Alveolata, Ciliophora a Miozoa.[22]
Unikonty a bikonty
Amébozoa nemají bičíky a je obtížné je klasifikovat jako unikont nebo bikont na základě morfologie. Ve svém klasifikačním schématu z roku 1993 Cavalier-Smith nesprávně klasifikoval améby jako bikonty. Výzkum genové fúze později ukázal, že clade Amoebozoa, byl předky uniciliate. Ve svém klasifikačním schématu z roku 2003 Cavalier-Smith převedl Amoebozoa do kladu unikont spolu se zvířaty, houbami a kmenem prvoka Choanozoa. Rostliny a všichni ostatní protisti, kteří byli přiděleni k kladu Bikont Cavalier-Smith.[22]
Klasifikační schéma Cavalier-Smitha z roku 2003:
- Unikonts
- kmen prvoků Amoebozoa (předky uniciliate)
- opisthokonts
- uniciliate protozoan kmen Choanozoa
- království Houby
- království Animalia
- Bikonty
- protozoan infrakingdom Rhizaria
- kmen Cercozoa
- kmen Retaria (Radiozoa a Foraminifera )
- protozoan infrakingdom Excavata
- kmen Loukozoa
- kmen Metamonada
- kmen Euglenozoa
- kmen Percolozoa
- kmen prvoků Apusozoa (Thecomonadea a Diphylleida )
- the chromalveolát clade
- království Chromista (Kryptista, Heterokonta, a Haptophyta )
- protozoan infrakingdom Alveolata
- kmen Ciliophora
- kmen Miozoa (Protalveolata, Dinozoa, a Apicomplexa )
- království Plantae (Viridaeplantae, Rhodophyta a Glaucophyta )
- protozoan infrakingdom Rhizaria
Kladogram života
V září 2003 vypadal strom života Cavalier-Smitha takto:[25]
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ve výše uvedeném stromu jsou tradiční rostlinná, zvířecí a houbová království, stejně jako Cavalier-Smithovo navrhované království Chromista, zobrazeny jako listy. Listy Eubacteria a Archaebacteria společně tvoří království Bacteria. Všechny zbývající listy společně tvoří království Protozoa.
Do roku 2006 bude mikrobiální strom Cavalier-Smith vypadat takto:
Do roku 2010 se objevily nové údaje, které ukázaly, že Unikonts a Bikonts, původně považované za oddělené kvůli zjevně odlišné organizaci řasinek a cytoskeletu, jsou ve skutečnosti podobnější, než se dříve myslelo. V důsledku toho Cavalier-Smith revidoval výše uvedený strom a navrhl přesunout jeho kořen tak, aby pobýval mezi královstvími Excavata a Euglenozoa.[26]
Model sedmi království
V roce 1987 zavedl Cavalier-Smith klasifikaci rozdělenou do dvou superkingdomů (Prokaryota a Eukaryota) a sedmi království, dvou prokaryotických království (Eubacteria a Archaebacteria) a pěti eukaryotických království (Protozoa, Chromista, Fungi, Plantae a Animalia).[27]
Cavalier-Smith a jeho spolupracovníci revidovali klasifikaci v roce 2015 a publikovali ji v PLOS ONE. V tomto schématu znovu zavedli klasifikaci s rozdělením prokaryotů superkingdom do dvou království, Bacteria (= Eubacteria) a Archaea (= Archaebacteria). To je založeno na konsensu v EU Taxonomický obrys bakterií a archaeí (TOBA) a Katalog života.[28]
Reference
- ^ Blackwell, Will H. (2004). „Jsou to království nebo domény? Zmatek a řešení“. Americký učitel biologie. 66 (4): 268–276. doi:10.2307/4451669. JSTOR 4451669.
- ^ Scamardella, Joseph M. (1999). „Ne rostliny ani zvířata: krátká historie původu protozoí, protistů a protoctistů království“. Mezinárodní mikrobiologie. 2 (4): 207–216. PMID 10943416. S2CID 16939886.
- ^ Zrzavý, J (2001). „Vzájemné vztahy parazitů metazoanů: přehled hypotéz kmenů a vyšších úrovní z nedávných morfologických a molekulárních fylogenetických analýz“. Folia Parasitologica. 48 (2): 81–103. doi:10.14411 / fp.2001.013. PMID 11437135.
- ^ Patterson, David J. (1999). „Rozmanitost eukaryotů“. Americký přírodovědec. 154 (S4): S96 – S124. doi:10.1086/303287. PMID 10527921.
- ^ „Apusomonadida“. Archivovány od originál dne 07.09.2008. Citováno 2016-02-11.
- ^ Eukarya Archivováno 2010-12-20 na Wayback Machine.
- ^ „Počátky Eukaryi“. Archivovány od originál 20. prosince 2010. Citováno 9. února 2009.
- ^ Dan H. Nicolson. Živočišná, rostlinná nebo minerální?. Sborník mini-symposia o biologické nomenklatuře 21. století, které se konalo na University of Maryland dne 4. listopadu 1996. Editoval James L. Reveal
- ^ A b Scamardella, JM (1999). „Ne rostliny ani zvířata: Stručná historie původu protozoí, protistů a protoctistů království“. Mezinárodní mikrobiologie. 2 (4): 207–16. PMID 10943416.
- ^ Penny, Douglas A .; Waern, Regina (1965). Biologie. Úvod do aspektů moderní biologické vědy. Vancouver Calgary Toronto Montreal: Pitman Publishing. 626–40.
- ^ A b C d Cavalier-Smith, T (1993). „Prvoky království a jejich 18 kmenů“. Mikrobiologické recenze. 57 (4): 953–94. doi:10.1128 / mmbr. 57.4.953-994.1993. PMC 372943. PMID 8302218.
- ^ Whittaker, R. H. (1959). „O široké klasifikaci organismů“. Čtvrtletní přehled biologie. 34 (3): 210–26. doi:10.1086/402733. JSTOR 2816520. PMID 13844483.
- ^ Weeks, Benjamin S .; Alcamo, I.Edward (2008). Mikroby a společnost (2. vyd.). Jones & Bartlett Learning. str.32. ISBN 978-0-7637-4649-0.
Robert Whittaker (1969) pět království.
- ^ A b Woese, Carl R .; Kandler, Otto; Wheelis, Mark L. (1990). „Směrem k přirozenému systému organismů: návrh pro oblasti Archaea, Bacteria a Eucarya“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS ... 87,4576 W.. doi:10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744.
- ^ Woese CR, Fox GE (listopad 1977). "Fylogenetická struktura prokaryotické domény: primární království". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 74 (11): 5088–90. Bibcode:1977PNAS ... 74,5088W. doi:10.1073 / pnas.74.11.5088. PMC 432104. PMID 270744.
- ^ A b Cavalier-Smith, T. (1989). "Archaebacteria and Archezoa". Příroda. 339 (6220): 100–101. Bibcode:1989 Natur.339..100C. doi:10.1038 / 339100a0. PMID 2497352. S2CID 30405691.
- ^ A b Cavalier-Smith, T (1981). „Království Eukaryote: Sedm nebo devět?“. Bio systémy. 14 (3–4): 461–81. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.
- ^ Cavalier-Smith, T. (1986). „Království Chromista: Původ a systematika“. Pokrok ve fykologickém výzkumu. 4: 309–347.
- ^ Cavalier-Smith, T. (1987). „Eukaryota bez mitochondrií“. Příroda. 326 (6111): 332–333. Bibcode:1987 Natur.326..332C. doi:10.1038 / 326332a0. PMID 3561476.
- ^ Cavalier-Smith, T .; Chao, E. E. (1996). „Molekulární fylogeneze volně žijícího archezoana Trepomonas agilis a povaha prvního eukaryotu “. Journal of Molecular Evolution. 43 (6): 551–62. Bibcode:1996JMolE..43..551C. doi:10.1007 / BF02202103. PMID 8995052. S2CID 28992966.
- ^ Cavalier-Smith, T. (2004). „Pouze šest království života“. Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy. 271 (1545): 1251–62. doi:10.1098 / rspb.2004.2705. PMC 1691724. PMID 15306349.
- ^ A b C d E Cavalier-Smith, Thomas (2003). „Protistova fylogeneze a klasifikace prvoků na vysoké úrovni“. European Journal of Protistology. 39 (4): 338–348. doi:10.1078/0932-4739-00002.
- ^ A b C d E F Cavalier-Smith, T. (2007). „Revidovaný systém života se šesti královstvími“. Biologické recenze. 73 (3): 203–66. doi:10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID 9809012.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas (1993). „Protozoan Phylum Opalozoa“. The Journal of Eukaryotic Microbiology. 40 (5): 609–15. doi:10.1111 / j.1550-7408.1993.tb06117.x.
- ^ Stechmann, Alexandra; Cavalier-Smith, Thomas (2003). "Kořen stromu eukaryotů byl přesně stanoven". Aktuální biologie. 13 (17): R665–6. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00602-X. PMID 12956967.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas (2010). "Původ buněčného jádra, mitóza a pohlaví: Role intracelulární koevoluce". Biology Direct. 5: 7. doi:10.1186/1745-6150-5-7. PMC 2837639. PMID 20132544.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas (1987). "Původ eukaryotických a archebakteriálních buněk". Annals of the New York Academy of Sciences. 503 (1): 17–54. Bibcode:1987NYASA.503 ... 17C. doi:10.1111 / j.1749-6632.1987.tb40596.x. PMID 3113314.
- ^ Ruggiero, Michael A .; Gordon, Dennis P .; Orrell, Thomas M .; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C .; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D .; Kirk, Paul M .; Thuesen, Erik V. (2015). „Vyšší klasifikace všech živých organismů“. PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371 / journal.pone.0119248. PMC 4418965. PMID 25923521.