Neomura - Neomura
Neomura je možné clade složený ze dvou oblasti života z Archaea a Eukaryota. Skupinu pojmenoval Thomas Cavalier-Smith v roce 2002.[1] Její název znamená „nové zdi“, což odráží jeho hypotézu, že to vyvinul z Bakterie a jednou z hlavních změn bylo nahrazení peptidoglykan buněčné stěny s ostatními glykoproteiny. Jak srpna 2017[Aktualizace]„hypotéza o neomuranu většina pracovníků nepřijímá; molekulární fylogeneze naznačují, že eukaryoty jsou nejblíže příbuzné jedné skupině archaeanů a vyvinuly se z nich, spíše než aby vytvořily clade se všemi archaeans.
Morfologie
Neomura, považovaná za clade, je velmi různorodá skupina, která obsahuje všechny mnohobuněčné druhy a také všechny extremofilní druhy, ale všechny sdílejí určité molekulární charakteristiky. Všichni neomurani to mají histony pomoci chromozóm balení a většina z nich má introny. Všichni používají molekulu methionin jako iniciátor aminokyselina pro proteosyntéza (použití bakterií formylmethionin ). Nakonec všichni neomurani používají několik druhů RNA polymeráza zatímco bakterie používají pouze jeden.
Fylogeneze
Existuje několik hypotéz o fylogenetických vztazích mezi archaeany a eukaryoty.
Zobrazení tří domén
Když Carl Woese nejprve publikoval jeho třídoménový systém[když? ], to bylo věřil, že domény Bakterie, Archaea a Eukaryota byli na stromě života stejně staří a stejně příbuzní. Určité důkazy však začaly naznačovat, že Eukaryota a Archaea jsou si navzájem bližší než s bakteriemi. Tyto důkazy zahrnovaly běžné používání cholesterolu a proteazomy, což jsou složité molekuly, které se nenacházejí ve většině bakterií, což vede k závěru, že kořen života ležel mezi bakteriemi na jedné straně a Archaea a Eukaryota na straně druhé, tj. že následovaly dvě primární větve života LUCA - Bakterie a Neomura (pak se tímto jménem nenazývají).
| |||||||||||||
Scénář „tří primárních domén“ (3D) byl jednou ze dvou hypotéz, které byly v přehledu o původu eukaryot z roku 2010 považovány za přijatelné.[2]
Odvozený pohled clade
V článku z roku 2002 a v dalších dokumentech Thomas Cavalier-Smith a spolupracovníci vyhlásili hypotézu, že Neomura byla clade hluboce vnořená Eubacteria s Aktinobakterie jako její sesterská skupina. Napsal: „Eukaryoty a archaebakterie tvoří clad neomura a jsou sestrami, jak rozhodně ukazují geny fragmentované pouze v archebakteriích a mnoho sekvenčních stromů. Toto sesterství vyvrací všechny teorie, které eukaryoty vznikly sloučením archaebakteria a α-proteobakteria, které také nezohledňují řadu funkcí sdílených konkrétně eukaryoty a aktinobakteriemi. “[1]
Patří mezi ně přítomnost cholesterolu a proteazomy u aktinobakterií i u Neomury. Funkce této složitosti je nepravděpodobné vyvíjet více než jednou v samostatných větvích, takže buď existovala a horizontální přenos z těchto dvou cest nebo se Neomura vyvinula z této konkrétní větve bakteriálního stromu.
| LUCA |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zobrazení dvou domén
Již v roce 2010 byl hlavním konkurentem scénáře tří domén pro původ eukaryot scénář „dvě domény“ (2D), ve kterém se eukaryoty vynořily z archaea.[2] Objev hlavní skupiny v Archaei, Lokiarchaeota, kterému jsou eukaryota geneticky podobnější než jiným archaeanům, neodpovídá hypotéze Neomura. Místo toho podporuje hypotézu, že eukaryoty se vynořily z jedné skupiny archaeanů:[3]
| Archaea |
Studie z roku 2016 využívající 16 všeobecně konzervovaných ribozomální proteiny podporuje 2D pohled. Jeho „nový pohled na strom života“ ukazuje eukaryoty jako malou skupinu vnořenou v Archeai, zejména v PŘIPÍNÁČEK nadkmen. Původ eukaryot však zůstává nevyřešen a scénáře dvou domén a tří domén zůstávají životaschopnými hypotézami.[4]
Viz také
Reference
- ^ A b Cavalier-Smith T (březen 2002). „Fagotropní původ eukaryot a fylogenetická klasifikace prvoků“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.
- ^ A b Gribaldo, Simonetta; Poole, Anthony M .; Daubin, Vincent; Forterre, Patrick & Brochier-Armanet, Céline (01.10.2010). „Původ eukaryot a jejich vztah s Archeaou: jsme ve fylogenomické slepé uličce?“. Příroda Recenze Mikrobiologie. 8 (10): 743–752. doi:10.1038 / nrmicro2426. PMID 20844558.
- ^ López-García, Purificación & Moreira, David (2015). „Otevřené otázky o původu eukaryot“. Trendy v ekologii a evoluci. 30 (11): 697–708. doi:10.1016 / j.tree.2015.09.005. PMC 4640172. PMID 26455774.
- ^ Hug, Laura A .; Baker, Brett J .; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T .; Probst, Alexander J .; Castelle, Cindy J .; Butterfield, Cristina N .; Hernsdorf, Alex W .; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Nataša; Relman, David A .; Finstad, Kari M .; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C. & Banfield, Jillian F. (2016-04-11). „Nový pohled na strom života“. Přírodní mikrobiologie. 1 (5): 16048. doi:10.1038 / nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647.
Další čtení
- Cavalier-Smith T (1987). "Původ eukaryotických a archebakteriálních buněk". Ann. N. Y. Acad. Sci. 503: 17–54. doi:10.1111 / j.1749-6632.1987.tb40596.x. PMID 3113314.
- Cavalier-Smith T (leden 2002). „Neomuranský původ archebakterií, negibakteriální kořen univerzálního stromu a bakteriální megaklasifikace“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.
- Cavalier-Smith T (2006). „Zakořenění stromu života analýzou přechodu“. Biol. Přímo. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776.
- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA (srpen 2007). „Důkaz grampozitivního eubakteriálního kořene stromu života“. Mol. Biol. Evol. 24 (8): 1761–8. doi:10,1093 / molbev / msm096. PMID 17513883.
- Cox, C. J .; Foster, P. G .; Hirt, R. P .; Harris, S. R .; Embley, T. M. (10. prosince 2008). „Archeobakteriální původ eukaryot“ (PDF). Sborník Národní akademie věd. 105 (51): 20356–20361. doi:10.1073 / pnas.0810647105. PMC 2629343. PMID 19073919.
- Cavalier-Smith, T. (2. září 2014). „Neomuranová revoluce a fagotrofní původ eukaryot a řasinek ve světle intracelulární koevoluce a revidovaného stromu života“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 6 (9): a016006. doi:10.1101 / cshperspect.a016006. PMC 4142966. PMID 25183828.