COX4I2 - COX4I2

COX4I2
Identifikátory
AliasyCOX4I2, COX4, COX4-2, COX4B, COX4L2, COXIV-2, dJ857M17.2, cytochrom c oxidáza podjednotka 4I2
Externí IDOMIM: 607976 MGI: 2135755 HomoloGene: 13082 Genové karty: COX4I2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 20 (lidský)
Chr.Chromozom 20 (lidský)[1]
Chromozom 20 (lidský)
Genomické umístění pro COX4I2
Genomické umístění pro COX4I2
Kapela20q11.21Start31,637,912 bp[1]
Konec31,645,006 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE COX4I2 gnf1h00848 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

84701

84682

Ensembl

ENSG00000131055

ENSMUSG00000009876

UniProt

Q96KJ9

Q91W29

RefSeq (mRNA)

NM_032609

NM_053091

RefSeq (protein)

NP_115998

NP_444321

Místo (UCSC)Chr 20: 31,64 - 31,65 MbChr 2: 152,75 - 152,77 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Cytochrom c oxidáza podjednotka 4 izoforma 2, mitochondriální je enzym že u lidí je kódován COX4I2 gen.[5][6] COX4I2 je jaderný -kódováno izoforma z cytochrom c oxidáza (KORMIDELNÍK) podjednotka 4. Cytochrom c oxidáza (komplex IV ) je komplex více podjednotkových enzymů, který spojuje přenos elektrony z cytochrom c na molekulární kyslík a přispívá k proton elektrochemický gradient přes vnitřní mitochondriální membrána, působící jako terminální enzym mitochondriální dýchací řetězec. Mutace v COX4I2 byly spojeny s exokrinní nedostatečnost pankreatu, dyserytropoetická anémie, a kalvariální hyperostóza (EPIDACH).[7][8]

Struktura

COX4I2 se nachází na q rameno z chromozom 20 na pozici 11,21 a má 6 exony.[7] The COX4I2 gen produkuje 20 kDa protein složený ze 171 aminokyseliny.[9][10] Protein kódovaný COX4I2 patří do rodiny cytochrom c oxidázy IV. COX4I2 má tranzitní peptid doména a disulfidová vazba modifikace aminokyselin.[11][12] A Glu 138 zbytku, což odpovídá zbytku Glu136 v COX4I1, je věřil být vysoce konzervativní a strukturálně důležité pro mitochondriální COX reakci na hypoxie.[8]

Funkce

Cytochrom c oxidáza (COX), terminální enzym mitochondriální dýchací řetězec, katalyzuje přenos elektronů z redukovaného cytochrom c na kyslík. Je to heteromerní komplex skládající se ze 3 katalytické podjednotky kódované mitochondriální geny a více strukturních podjednotek kódovaných jaderné geny. Mitochondriálně kódované podjednotky fungují v elektronový přenos a jaderně kódované podjednotky mohou být zapojeny do regulace a montáže komplexu. The COX4I2 nukleární gen kóduje izoformu 2 podjednotky IV. Izoforma 1 podjednotky IV je kódován jiným genem, oba geny však vykazují podobnou strukturní organizaci. Podjednotka IV je největší jaderně kódovanou podjednotkou, která hraje klíčovou roli v regulaci COX. Nachází se na vnitřní mitochondriální membrána na matice boční. Vyjádření COX4I2 je nejvyšší v placenta a plíce.[7][11][12] Navíc výraz COX4I2, spolu s COX4I1, mohou být regulovány hladinami kyslíku, přičemž snížené hladiny kyslíku vedou ke zvýšení COX4I2 exprese a degradace COX4I1. To naznačuje roli COX4I2 při optimalizaci elektronový přenosový řetězec za různých podmínek.[13]

Klinický význam

Mutace v COX4I2 byly spojeny s exokrinní nedostatečnost pankreatu, dyserythropoeitická anémie, a kalvariální hyperostóza (EPIDACH). Mezi charakteristiky tohoto onemocnění patří střevní nedostatečnost pankreatu malabsorpce, selhání prosperovat, a anémie brzy po narození. Byly zahrnuty další příznaky steatorea, splenomegalie a hepatomegalie, pankreatické atrofie, generalizovaný sval hypotonie, hyperostóza, nažloutlý bělmo spojené s mírnou nepřímou hyperbilirubinemií, zhoršenou koagulace funkce, zvýšené LDH, alanin, a bilirubin a snížena vitamin E. úrovně. A homozygotní mutace Bylo zjištěno, že E138K má za následek snížení COX4I2 výraz (25% v fibroblasty ) a zhoršená reakce na hypoxie. Funkční COX4I2 Předpokládá se, že výraz pod 40% normální úrovně bude rychlost omezující s mutací E138K vyskytující se v domnělém a vysoce konzervativní zbytek podjednotky IV.[11][12][8]

Interakce

Bylo prokázáno, že COX4I2 komunikovat s Cytochrom c (CYCS ).[14][15][16][17] Navíc, APP, COA3 a KRAS Bylo zjištěno, že mají interakce protein-protein s COX4I2.[18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131055 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009876 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Hüttemann M, Kadenbach B, Grossman LI (duben 2001). "Savčí podjednotka IV izoformy cytochrom c oxidázy". Gen. 267 (1): 111–23. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00385-7. PMID  11311561.
  6. ^ Hüttemann M, Lee I, Liu J, Grossman LI (listopad 2007). „Transkripce savčí podjednotky cytochrom c oxidázy IV-2 je řízena novým konzervativním prvkem reagujícím na kyslík“. FEBS Journal. 274 (21): 5737–48. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.06093.x. PMID  17937768. S2CID  46455551.
  7. ^ A b C "Entrez Gene: COX4I2 cytochrom c oxidáza podjednotka IV izoforma 2 (plíce)". Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  8. ^ A b C Shteyer E, Saada A, Shaag A, Al-Hijawi FA, Kidess R, Revel-Vilk S, Elpeleg O (březen 2009). „Exokrinní nedostatečnost pankreatu, dyserytropoeitická anémie a kalvariální hyperostóza jsou způsobeny mutací genu COX4I2“. American Journal of Human Genetics. 84 (3): 412–7. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.02.006. PMC  2668012. PMID  19268275.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ Jao, Danieli. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Archivovány od originál dne 7. 8. 2018. Citováno 2018-08-06.
  11. ^ A b C „COX4I2 - cytochrom c oxidáza podjednotka 4 izoforma 2, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen COX4I2 a protein“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-06. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
  12. ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  13. ^ Fukuda R, Zhang H, Kim JW, Shimoda L, Dang CV, Semenza GL (duben 2007). „HIF-1 reguluje podjednotky cytochromoxidázy pro optimalizaci účinnosti dýchání v hypoxických buňkách“. Buňka. 129 (1): 111–22. doi:10.1016 / j.cell.2007.01.047. PMID  17418790. S2CID  2331820.
  14. ^ Michel B, Bosshard HR (srpen 1984). "Spektroskopická analýza interakce mezi cytochromem c a cytochromem c oxidázou". The Journal of Biological Chemistry. 259 (16): 10085–91. PMID  6088481.
  15. ^ Wiedemann FR, Vielhaber S, Schröder R, Elger CE, Kunz WS (březen 2000). „Hodnocení metod pro stanovení aktivity enzymů mitochondriálních dýchacích řetězců ve vzorcích lidských kosterních svalů“. Analytická biochemie. 279 (1): 55–60. doi:10.1006 / abio.1999.4434. PMID  10683230.
  16. ^ Sampson V, Alleyne T (prosinec 2001). "Interakce cytochromu c / cytochromu c oxidázy. Přímý strukturální důkaz konformačních změn během přeměny enzymu". European Journal of Biochemistry. 268 (24): 6534–44. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02608.x. PMID  11737208.
  17. ^ Lynch SR, Sherman D, Copeland RA (leden 1992). „Vazba cytochromu c ovlivňuje konformaci cytochromu a v cytochrom c oxidáze“. The Journal of Biological Chemistry. 267 (1): 298–302. PMID  1309738.
  18. ^ Laboratoř, Mike Tyers. "Souhrn výsledků COX4I2 | BioGRID". thebiogrid.org. Citováno 2018-08-06.

externí odkazy

Další čtení

  • Garber EA, Margoliash E (únor 1990). „Interakce cytochromu c s cytochromem c oxidázou: porozumění přechodu z vysoké na nízkou afinitu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1015 (2): 279–87. doi:10.1016 / 0005-2728 (90) 90032-Y. PMID  2153405.
  • Bolli R, Nałecz KA, Azzi A (leden 1985). „Interkonverze mezi monomerním a dimerním bovinním srdcem cytochrom c oxidázy“. Biochimie. 67 (1): 119–28. doi:10.1016 / S0300-9084 (85) 80237-6. PMID  2986725.
  • Michel B, Bosshard HR (srpen 1984). "Spektroskopická analýza interakce mezi cytochromem c a cytochromem c oxidázou". The Journal of Biological Chemistry. 259 (16): 10085–91. PMID  6088481.
  • Hare JF, Ching E, Attardi G (květen 1980). "Izolace, složení podjednotky a místo syntézy lidské cytochrom c oxidázy". Biochemie. 19 (10): 2023–30. doi:10.1021 / bi00551a003. PMID  6246917.
  • Papadopoulou LC, Tsiftsoglou AS (září 1996). „Účinky heminu na apoptózu, potlačení exprese genu pro cytochrom c oxidázu a toxicita pro kostní dřeň vyvolaná doxorubicinem (adriamycinem)“. Biochemická farmakologie. 52 (5): 713–22. doi:10.1016/0006-2952(96)00349-8. PMID  8765469.
  • Vizirianakis IS, Pappas IS, Tsiftsoglou AS (březen 2002). „Diferenciačně závislá represi genů c-myc, B22, COX II a COX IV v buňkách myší erytroleukémie (MEL)“. Biochemická farmakologie. 63 (5): 1009–17. doi:10.1016 / S0006-2952 (01) 00937-6. PMID  11911854.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.