COQ7 - COQ7
Mitochondriální 5-demethoxyubichinon hydroxyláza (DMQ hydroxyláza), také známý jako koenzym Q7, hydroxyláza, je enzym že u lidí je kódován COQ7 gen. The clk-1 (hodiny-1) gen to kóduje protein to je nezbytné pro ubichinon biosyntéza u červa Caenorhabditis elegans a další eukaryoty. The myš nazývá se verze genu mclk-1 a homolog člověka, ovocné mušky a kvasinek COQ7 (protein biosyntézy koenzymu Q 7).[5][6]
CLK-1 nelze zaměňovat s nepříbuzným lidským proteinem CLK1 který hraje roli v Sestřih RNA.
Struktura
Protein má dvě opakování, přibližně 90 aminokyseliny, které obsahují dva konzervované motivy, o nichž se předpokládá, že jsou důležité pro koordinaci železa. Struktura a funkce genu jsou u různých druhů vysoce konzervativní.[7]
The C. elegans protein obsahuje 187 aminokyselinových zbytků (20 kilodaltonů ), lidský homolog 217 aminokyselinových zbytků (24 kilodaltonů, gen sestávající ze šesti exony o délce 11 kB a umístěný na chromozom 16 ).[8]
Mitochondriální funkce
Ubichinon je malý redox aktivní lipid který se nachází ve většině buněčných membrán, kde působí jako a kofaktor v mnoha buněčných redoxních procesech, včetně mitochondriální transport elektronů. Jako kofaktor je ubichinon často zapojen do procesů, které produkují reaktivní formy kyslíku (ROS). Ubichinon je navíc jedním z hlavních endogenních antioxidantů buňky. Enzym CLK-1 je zodpovědný za hydroxylaci 5-demethoxyubichinonu na 5-hydroxyubichinon.
Bylo prokázáno, že mutace v genu jsou spojeny se zvýšenou životnost.[5][7] Vady genu zpomalují řadu vývojových a fyziologických procesů, včetně buněčného cyklu, embryogeneze, postembryonálního růstu, rytmického chování a stárnutí.[9]
Jaderná funkce
CLK-1 a COQ7 se převážně lokalizují do mitochondrií, aby se účastnily biosyntetické dráhy ubichinonu, která se tam nachází. Malá skupina CLK-1 a COQ7 se však přemisťuje do jádra v reakci na produkci ROS normálně fungujícími mitochondriemi jak u červů, tak u lidských buněk.[10] Translokace CLK-1 a COQ7 představuje mitochondriální až jadernou retrográdní signální cestu, která působí na potlačení mitochondriálních stresových odpovědí. Předpokládá se, že mitochondriální a jaderná skupina CLK-1 přispívají nezávisle k regulaci životnosti červů. Předpokládá se, že jaderná forma CLK-1 a COQ7 reguluje genovou expresi neidentifikovaným mechanismem.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167186 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030652 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Ewbank JJ, Barnes TM, Lakowski B, Lussier M, Bussey H, Hekimi S (únor 1997). "Strukturální a funkční ochrana časovacího genu clk-1 Caenorhabditis elegans". Věda. 275 (5302): 980–3. doi:10.1126 / science.275.5302.980. PMID 9020081. S2CID 32191959.
- ^ "Entrez Gene: COQ7 koenzym Q7 homolog, ubichinon (kvasinky)".
- ^ A b Liu X, Jiang N, Hughes B, Bigras E, Shoubridge E, Hekimi S (říjen 2005). „Evoluční zachování mechanismu dlouhověkosti závislého na clk-1: ztráta mclk1 zvyšuje buněčnou zdatnost a životnost myší“. Genes Dev. 19 (20): 2424–34. doi:10.1101 / gad.1352905. PMC 1257397. PMID 16195414.
- ^ Asaumi S, Kuroyanagi H, Seki N, Shirasawa T (červen 1999). "Ortology Caenorhabditis elegans genu dlouhověkosti clk-1 u myší a lidí". Genomika. 58 (3): 293–301. doi:10.1006 / geno.1999.5838. PMID 10373327.
- ^ Felkai S, Ewbank JJ, Lemieux J, Labbé JC, Brown GG, Hekimi S (duben 1999). „CLK-1 reguluje dýchání, chování a stárnutí u hlístice Caenorhabditis elegans“. EMBO J.. 18 (7): 1783–92. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1783. PMC 1171264. PMID 10202142.
- ^ Monaghan RM, Barnes RG, Fisher K, Andreou T, Rooney N, Poulin GB, Whitmarsh AJ (červen 2015). „Jaderná role pro respirační enzym CLK-1 při regulaci mitochondriálních stresových reakcí a dlouhověkosti“. Přírodní buněčná biologie. 17 (6): 782–92. doi:10.1038 / ncb3170. PMC 4539581. PMID 25961505.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Jonassen T, Proft M, Randez-Gil F a kol. (1998). „Homolog Clk-1 homolog (Coq7 / Cat5) je mitochondriální protein při syntéze koenzymu Q“. J. Biol. Chem. 273 (6): 3351–7. doi:10.1074 / jbc.273.6.3351. PMID 9452453.
- Asaumi S, Kuroyanagi H, Seki N, Shirasawa T (1999). "Ortology Caenorhabditis elegans genu dlouhověkosti clk-1 u myší a lidí". Genomika. 58 (3): 293–301. doi:10.1006 / geno.1999.5838. PMID 10373327.
- Vajo Z, King LM, Jonassen T a kol. (2000). „Zachování načasovacího genu clk-1 z kvasinek na člověka Caenorhabditis elegans: gen potřebný pro biosyntézu ubichinonu s možnými důsledky pro stárnutí“. Mamm. Genom. 10 (10): 1000–4. doi:10,1007 / s003359901147. PMID 10501970. S2CID 13800512.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Stenmark P, Grünler J, Mattsson J a kol. (2001). „Nový člen rodiny di-železitých karboxylátových proteinů. Coq7 (clk-1), membránově vázaná hydroxyláza podílející se na biosyntéze ubichinonu“. J. Biol. Chem. 276 (36): 33297–300. doi:10,1074 / jbc.C100346200. PMID 11435415.
- Takahashi M, Asaumi S, Honda S a kol. (2001). „Myš coq7 / clk-1 ortholog zachránil zpomalené rytmické chování a prodlouženou životnost mutantu dlouhověkosti clk-1 u Caenorhabditis elegans“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (3): 534–40. doi:10.1006 / bbrc.2001.5439. PMID 11511092.
- Rea S (2002). „CLK-1 / Coq7p je DMQ mono-oxygenáza a nový člen rodiny proteinů karboxylátu se železem“. FEBS Lett. 509 (3): 389–94. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03099-X. PMID 11749961. S2CID 28650687.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
externí odkazy
- COQ7 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
- COQ7 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |