CLK1 - CLK1

CLK1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1Z57, 2VAG, 5J1V, 5J1W
Identifikátory
Aliasy	CLK1, CLK, CLK / STY, STY, CDC jako kináza 1
Externí ID	OMIM: 601951 MGI: 107403 HomoloGene: 101535 Genové karty: CLK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	200,864,744 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	58,424,066 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinu serin / threonin / tyrosin kináza; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita proteinkinázy; • aktivita protein tyrosinkinázy; • aktivita membránové proteinové tyrosinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • kinázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• autofosforylace; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • regulace sestřihu RNA; • fosforylace bílkovin; • buněčná proliferace; • peptidyl-threoninová fosforylace; • peptidyl-serinová fosforylace; • fosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1195
	12747
	ENSG00000013441
	ENSMUSG00000026034
	P49759
	P22518
	NM_001024646; NM_001162407; NM_004071
	NM_001042634; NM_009905
	NP_001155879; NP_004062
	NP_001036099
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dvojí specificita protein kinázy CLK1 je enzym že u lidí je kódován CLK1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny podobné CDC2 (nebo LAMMER) proteinové kinázy dvojí specificity. V buněčné jádro, kódovaný protein fosforyluje serin /arginin - bohaté proteiny zapojené do zpracování pre-mRNA, uvolňující je do nukleoplazma. Výběr míst sestřihu během zpracování pre-mRNA může být regulován koncentrací transakčních faktorů, včetně proteinů bohatých na serin / arginin. Proto může kódovaný protein hrát nepřímou roli při řízení výběru místa sestřihu.^[6]

Interakce

CLK1 bylo prokázáno komunikovat s ASF / SF2.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000013441 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026034 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (prosinec 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Hum Genet. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501. S2CID 40593571.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLK1 CDC-like kinase 1“.
^ Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (říjen 1996). „Proteinové kinázy SRPK1 a Clk / Sty vykazují odlišné substrátové specificity pro sestřihové faktory bohaté na serin / arginin“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24569–75. doi:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID 8798720.
^ Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (únor 2003). „Účinek léčby cisplatinou na skvrnitou distribuci jaderného proteinu CROP / Luc7A bohatého na serin / arginin“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 324–9. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID 12565863.

externí odkazy

Člověk CLK1 umístění genomu a CLK1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Johnson KW, Smith KA (1991). "Molekulární klonování nové lidské kinázy podobné cdc2 / CDC28". J. Biol. Chem. 266 (6): 3402–7. PMID 1704889.
Ben-David Y, Letwin K, Tannock L, Bernstein A, Pawson T (1991). „Savčí proteinová kináza s potenciálem pro fosforylaci serinu / threoninu a tyrosinu souvisí s regulátory buněčného cyklu“. EMBO J.. 10 (2): 317–25. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07952.x. PMC 452648. PMID 1825055.
Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (1995). "Charakterizace klonováním cDNA dvou nových lidských proteinových kináz. Důkaz porovnáním sekvencí nové rodiny savčích proteinových kináz". J. Mol. Biol. 244 (5): 665–72. doi:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID 7990150.
Colwill K, Pawson T, Andrews B, Prasad J, Manley JL, Bell JC, Duncan PI (1996). „Proteinová kináza Clk / Sty fosforyluje SR sestřihové faktory a reguluje jejich intranukleární distribuci“. EMBO J.. 15 (2): 265–75. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00357.x. PMC 449941. PMID 8617202.
Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (1996). „Proteinové kinázy SRPK1 a Clk / Sty vykazují odlišné substrátové specificity pro sestřihové faktory bohaté na serin / arginin“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24569–75. doi:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID 8798720.
Nestel FP, Colwill K, Harper S, Pawson T, Anderson SK (1997). „RS cyklofiliny: identifikace cyklofilinu souvisejícího s NK-TR1“. Gen. 180 (1–2): 151–5. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00436-2. PMID 8973360.
Moeslein FM, Myers MP, Landreth GE (1999). „Rodina kináz CLK, CLK1 a CLK2, fosforyluje a aktivuje tyrosin fosfatázu, PTP-1B“. J. Biol. Chem. 274 (38): 26697–704. doi:10.1074 / jbc.274.38.26697. PMID 10480872.
Menegay HJ, Myers MP, Moeslein FM, Landreth GE (2000). "Biochemická charakterizace a lokalizace duální specificity kinázy CLK1". J. Cell Sci. 113 (18): 3241–53. PMID 10954422.
Kojima T, Zama T, Wada K, Onogi H, Hagiwara M (2001). „Klonování lidského PRP4 odhaluje interakci s Clk1“. J. Biol. Chem. 276 (34): 32247–56. doi:10,1074 / jbc.M103790200. PMID 11418604.
Hartmann AM, Rujescu D, Giannakouros T, Nikolakaki E, Goedert M, Mandelkow EM, Gao QS, Andreadis A, Stamm S (2001). "Regulace alternativního sestřihu lidského tau exonu 10 fosforylací sestřihových faktorů". Mol. Buňka. Neurosci. 18 (1): 80–90. doi:10.1006 / mcne.2001.1000. PMID 11461155. S2CID 18388526.
Lai MC, Lin RI, Tarn WY (2003). „Diferenciální účinky hyperfosforylace na spojovací faktor SRp55“. Biochem. J. 371 (Pt 3): 937–45. doi:10.1042 / BJ20021827. PMC 1223332. PMID 12549978.
Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (2003). „Účinek léčby cisplatinou na skvrnitou distribuci jaderného proteinu CROP / Luc7A bohatého na serin / arginin“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 324–9. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID 12565863.
Kantham L, Kerr-Bayles L, Godde N, Quick M, Webb R, Sunderland T, Bond J, Walder K, Augert G, Collier G (2003). "Maják interaguje s kinázami podobnými cdc2 / cdc28". Biochem. Biophys. Res. Commun. 304 (1): 125–9. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00549-7. PMID 12705895.
Prasad J, Manley JL (2003). „Regulace a substrátová specificita proteinkinázy SR Clk / Sty“. Mol. Buňka. Biol. 23 (12): 4139–49. doi:10.1128 / MCB.23.12.4139-4149.2003. PMC 156123. PMID 12773558.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Muraki M, Ohkawara B, Hosoya T, Onogi H, Koizumi J, Koizumi T, Sumi K, Yomoda J, Murray MV, Kimura H, Furuichi K, Shibuya H, Krainer AR, Suzuki M, Hagiwara M (2004). „Manipulace s alternativním sestřihem nově vyvinutým inhibitorem Clks“. J. Biol. Chem. 279 (23): 24246–54. doi:10,1074 / jbc.M314298200. PMID 15010457.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Velazquez-Dones A, Hagopian JC, Ma CT, Zhong XY, Zhou H, Ghosh G, Fu XD, Adams JA (2006). „Hmotnostní spektrometrická a kinetická analýza fosforylace ASF / SF2 pomocí SRPK1 a Clk / Sty“. J. Biol. Chem. 280 (50): 41761–8. doi:10,1074 / jbc.M504156200. PMID 16223727.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000013441 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026034 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9856501-5] Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (prosinec 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Hum Genet. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501. S2CID 40593571.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CLK1 CDC-like kinase 1“.

[pmid8798720-7] Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (říjen 1996). „Proteinové kinázy SRPK1 a Clk / Sty vykazují odlišné substrátové specificity pro sestřihové faktory bohaté na serin / arginin“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24569–75. doi:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID 8798720.

[pmid12565863-8] Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (únor 2003). „Účinek léčby cisplatinou na skvrnitou distribuci jaderného proteinu CROP / Luc7A bohatého na serin / arginin“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 324–9. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID 12565863.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]