Acyl-CoA thioesteráza 9 - Acyl-CoA thioesterase 9

ACOT9
Identifikátory
Aliasy	ACOT9, ACATE2, MT-ACT48, MTACT48, CGI-16, Acyl-CoA thioesteráza 9
Externí ID	OMIM: 300862 MGI: 1928939 HomoloGene: 8206 Genové karty: ACOT9
Umístění genu (člověk) Chr. X chromozom (lidský)[1] Kapela Xp22.11 Start 23,701,055 bp[1] Konec 23,766,475 bp[1]
Umístění genu (myš) Chr. X chromozom (myš)[2] Kapela X | X F3 Start 155,262,443 bp[2] Konec 155,297,654 bp[2]
Genová ontologie Molekulární funkce • aktivita acetyl-CoA hydrolázy • aktivita hydrolázy • GO: Aktivita hydrolázy esteru karboxylového esteru • aktivita acyl-CoA hydrolázy Buněčná složka • mitochondriální matice • mitochondrie Biologický proces • metabolický proces acyl-CoA Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
Druh	Člověk	Myš
Entrez	23597	56360
Ensembl	ENSG00000123130	ENSMUSG00000025287
UniProt	Q9Y305	Q9R0X4
RefSeq (mRNA)	NM_001033583 NM_001037171 NM_001330259	NM_019736 NM_001313718
RefSeq (protein)	NP_001028755 NP_001032248 NP_001317188	NP_001300647 NP_062710
Místo (UCSC)	Chr X: 23,7 - 23,77 Mb	Chr X: 155,26 - 155,3 Mb
PubMed Vyhledávání	[3]	[4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka Zobrazit / upravit myš

Acyl-CoA thioesteráza 9 je protein který je zakódován člověkem ACOT9 gen. Je členem acyl-CoA thioesteráza superrodina, což je skupina enzymy že hydrolyzovat Koenzym A estery. Není známa žádná funkce, nicméně bylo prokázáno, že působí jako thioesteráza s dlouhým řetězcem při nízkých koncentracích a thioesteráza s krátkým řetězcem při vysokých koncentracích.^[5]

Gen

Zobrazení genu ACOT9

Místo

Gen ACOT9 je umístěn na p22.11 dále chromozom X. Nachází se na minusovém řetězci chromozomu, start je 23 721 777 bp a konec je 23 761 407 bp, což je rozpětí 39 631 základní páry.^[6]

Umístění ACOT9 na lidském chromozomu X

Aliasy

Gen ACOT9 je známý především pro kódování proteinu Acyl-CoA thioesterázy 9. Jiné, méně běžně používané názvy genu jsou ACATE2,^[7] a MT-ACT48.^[8]

Funkce

Protein kódovaný genem ACOT9 je součástí rodiny Acyl-CoA thioesterázy, které katalyzují hydrolýza různých Koenzym A estery různých molekul na volnou kyselinu plus CoA. Tyto enzymy byly v literatuře také označovány jako acyl-CoA hydrolázy, acyl-CoA thioester hydrolázy a palmitoyl-CoA hydrolázy. Reakce prováděná těmito enzymy je následující:

CoA ester + H₂O → volná kyselina + koenzym A

Tyto enzymy používají totéž substráty jako acyl-CoA syntetázy s dlouhým řetězcem, ale mají jedinečný účel v tom, že generují volnou kyselinu a CoA, na rozdíl od acyl-CoA syntetáz s dlouhým řetězcem, které ligují mastné kyseliny na CoA, za vzniku esteru CoA.^[9] Úloha rodiny enzymů ACOT není dobře známa; bylo však navrženo, že hrají klíčovou roli při regulaci intracelulárních hladin CoA esterů, koenzymu A a volných mastných kyselin. Nedávné studie ukázaly, že estery Acyl-CoA mají mnohem více funkcí než jen zdroj energie. Mezi tyto funkce patří alosterická regulace enzymů, jako je acetyl-CoA karboxyláza,^[10] hexokináza IV,^[11] a citrátový kondenzující enzym. Acyl-CoA s dlouhým řetězcem také regulují otevírání ATP-citlivé draslíkové kanály a aktivace Vápníkové ATPázy, čímž reguluje inzulín vylučování.^[12] Řada dalších buněčných událostí je také zprostředkována prostřednictvím acyl-CoA, například transdukce signálu skrz protein kináza C., inhibice kyselina retinová indukovaná apoptóza a účast na pučení a fúzi endomembránový systém.^[13][14][15] Acyl-CoAs také zprostředkovávají cílení proteinů na různé membrány a regulaci G Protein α podjednotky, protože jsou substráty pro acylaci proteinů.^[16] V mitochondrie, acyl-CoA estery se účastní acylace mitochondriálních NAD + závislých dehydrogenázy; protože tyto enzymy jsou zodpovědné za aminokyselinový katabolismus, díky této acylaci je celý proces neaktivní. Tento mechanismus může poskytovat přeslechy v metabolismu a regulovat NADH / NAD + poměr za účelem udržení optimálního mitochondrií beta oxidace mastných kyselin.^[17] Role esterů CoA v metabolismus lipidů a řada dalších intracelulárních procesů je dobře definována, a proto se předpokládá, že ACOT- enzymy hrají roli v modulaci procesů, na kterých se tyto metabolity podílejí.^[18]

Homologie / evoluce

Divergence sekvenční identity (%) vs. čas (MYA) v ACOT9

Ortology

Je jich mnoho ortology ACOT9, domácí myš (Mus musculus) je jedním z nejpodobnějších, kde se gen ACOT9 nachází na 72,38 cM na chromozomu X.^[19] Škála ortologů se rozšiřuje na savce, ptáky, obojživelníky, anamorfní houby a další.^{[Citace je zapotřebí ]}

Zachování genu ACOT9 mezi H. sapiens, G. lozoyensis, a C. capitata

Paralogy

U myší, což je jeden z nejbližších ortologů, je ACOT10 známý paralog genu ACOT9.^[20]

Výraz

ACOT9 výrazový graf

Vyjádření ACOT9 je všudypřítomný v tkáních u lidí. Tkáně s hodnotou nad 500 ve velké analýze lidského transkriptomu byly globus pallidus a kolorektální adenokarcinom.^[21] Také se zobrazí profil četnosti exprimované sekvenční značky (nebo EST) všudypřítomný / téměř všudypřítomný, exprese v lidských tkáních.^[22]

Transkripční faktory

Je jich mnoho transkripční faktory v celé promotorové sekvenci ACOT9. Některé z významných faktorů jsou faktory tepelného šoku a transkripční faktor II B (TFIIB) rozpoznávací prvky.^{[Citace je zapotřebí ]}

Sekundární struktura

V sekvenci genu ACOT9 existují dvě oblasti, které jsou označeny jako oblasti BFIT (Brown Fat Inducible Thioesterase) a BACH (Brain Acyl CoA Hydrolase). Tyto oblasti jsou součástí párek v rohlíku nadčeleď, u kterého bylo zjištěno, že se používá v různých rolích buněk.^[23] Předpovědi ukazují, že budou různé alfa-šroubovice v celé struktuře,^[24] což naznačuje, že je transmembránový protein.

Interakce

Místo mitochondrií štěpení lze nalézt na aminokyselině 30 v sekvenci ACOT9 a pravděpodobnost exportu do mitochondrie je 0,9374.^[25] Protein Acyl-CoA thioesterázy 9 se odhaduje na 60,9% mitochondriálních, 21,7% cytoplazmatický, 8,7% jaderná energie, 4,3% v EU plazmatická membrána a 4,3% v endoplazmatické retikulum.^[26]

Bylo zjištěno, že protein ACOT9 interaguje s následujícími proteiny experimentálně nebo prostřednictvím společné exprese:^[27]

• C1orf151
• MCTS1
• C1GALT1C1
• FBXW12
• RLIM
• RPS6KA3
• RAB9A
• UBC
• CXorf26
• HCCS

Reference

externí odkazy

• Člověk ACOT9 umístění genomu a ACOT9 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.