RAB9A - RAB9A

RAB9A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 WMS
Identifikátory
Aliasy	RAB9A, RAB9, člen rodiny onkogenů RAS
Externí ID	OMIM: 300284 MGI: 1890695 HomoloGene: 20900 Genové karty: RAB9A
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	13,710,504 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	166,479,867 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba na HDP; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• endozom; • pozdní endosom; • membrána fagocytických vezikul; • Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • fagocytární váček; • endoplazmatické retikulum; • lysozom; • extracelulární exosom; • cytoplazmatický váček; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • trans-Golgiho síťová membrána; • cytosol; • transportní váček; • melanosom;
Biologický proces	• negativní regulace hostitelem molekulární funkce symbiontu; • regulace lokalizace proteinů; • retrográdní transport, endosom do Golgi; • transport bílkovin; • pozitivní regulace exocytózy; • doprava; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9367
	56382
	ENSG00000123595
	ENSMUSG00000079316
	P51151
	Q9R0M6
	NM_004251; NM_001195328
	NM_019773
	NP_001182257; NP_004242
	NP_062747
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-9A je protein že u lidí je kódován RAB9A gen.^[5]^[6]

Interakce

RAB9A bylo prokázáno komunikovat s RABEPK,^[7] TIP47^[8] a Biogeneze komplexu organel souvisejících s lysozomy 3.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123595 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079316 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Davies JP, Cotter PD, Ioannou YA (květen 1997). "Klonování a mapování lidských sekvencí cDNA Rab7 a Rab9 a identifikace pseudogenu Rab9". Genomika. 41 (1): 131–4. doi:10.1006 / geno.1997.4644. PMID 9126495.
^ „Entrez Gene: RAB9A RAB9A, člen onkogenní rodiny RAS“.
^ Díaz E, Schimmöller F, Pfeffer SR (červenec 1997). „K přenosu endosomu k TGN je zapotřebí nový efektor Rab9“. J. Cell Biol. 138 (2): 283–90. doi:10.1083 / jcb.138.2.283. PMC 2138197. PMID 9230071.
^ Carroll KS, Hanna J, Simon I, Krise J, Barbero P, Pfeffer SR (květen 2001). "Úloha GTPázy Rab9 při usnadňování náboru receptorů pomocí TIP47". Věda. 292 (5520): 1373–6. doi:10.1126 / science.1056791. PMID 11359012.
^ Kloer DP, Rojas R, Ivan V, Moriyama K, van Vlijmen T, Murthy N, Ghirlando R, van der Sluijs P, Hurley JH, Bonifacino JS (březen 2010). „Sestavení biogeneze komplexu 3 organel souvisejících s lysozomy (BLOC-3) a jeho interakce s Rab9“. J. Biol. Chem. 285 (10): 7794–7804. doi:10.1074 / jbc.M109.069088. PMC 2844223. PMID 20048159.

Další čtení

Shapiro AD, Pfeffer SR (1995). „Kvantitativní analýza interakcí mezi prenyl Rab9, inhibitorem disociace GDP-alfa a guaninovými nukleotidy“. J. Biol. Chem. 270 (19): 11085–90. doi:10.1074 / jbc.270.19.11085. PMID 7744738.
Soldati T, Riederer MA, Pfeffer SR (1993). „Rab GDI: solubilizační a recyklační faktor pro protein rab9“. Mol. Biol. Buňka. 4 (4): 425–34. doi:10,1091 / mbc.4.4.425. PMC 300943. PMID 8389620.
Díaz E, Schimmöller F, Pfeffer SR (1997). „K přenosu endosomu k TGN je zapotřebí nový efektor Rab9“. J. Cell Biol. 138 (2): 283–90. doi:10.1083 / jcb.138.2.283. PMC 2138197. PMID 9230071.
de Leeuw HP, Koster PM, Calafat J, Janssen H, van Zonneveld AJ, van Mourik JA, Voorberg J (1998). „Malé proteiny vázající GTP v lidských endoteliálních buňkách“. Br. J. Haematol. 103 (1): 15–9. doi:10.1046 / j.1365-2141.1998.00965.x. PMID 9792283.
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (1999). „Obecná role inhibitoru disociace GDP 2 v membránovém uvolňování proteinů Rab: modulace jeho funkčních interakcí strukturálními modifikacemi in vitro a in vivo“. Biochemie. 38 (36): 11711–21. doi:10.1021 / bi990200r. PMID 10512627.
Carroll KS, Hanna J, Simon I, Krise J, Barbero P, Pfeffer SR (2001). "Úloha GTPázy Rab9 při usnadňování náboru receptorů pomocí TIP47". Věda. 292 (5520): 1373–6. doi:10.1126 / science.1056791. PMID 11359012.
Orzaez D, de Jong AJ, Woltering EJ (2001). „Rajčatový homolog lidského proteinu PIRIN je indukován během programované buněčné smrti“. Plant Mol. Biol. 46 (4): 459–68. doi:10.1023 / A: 1010618515051. PMID 11485202.
Michel F, Soler-Lopez M, Petosa C, Cramer P, Siebenlist U, Müller CW (2002). „Krystalová struktura ankyrinové repetiční domény Bcl-3: jedinečný člen rodiny proteinů IkappaB“. EMBO J.. 20 (22): 6180–90. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6180. PMC 125740. PMID 11707390.
Barbero P, Bittova L, Pfeffer SR (2002). „Vizualizace transportu vezikul zprostředkovaného Rab9 z endosomů do trans-Golgi v živých buňkách“. J. Cell Biol. 156 (3): 511–8. doi:10.1083 / jcb.200109030. PMC 2173336. PMID 11827983.
Hanna J, Carroll K, Pfeffer SR (2002). "Identifikace reziduí v TIP47 nezbytných pro vazbu Rab9". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (11): 7450–4. doi:10.1073 / pnas.112198799. PMC 124251. PMID 12032303.
Walter M, Davies JP, Ioannou YA (2004). "Telomerázová imortalizace zvyšuje regulaci exprese Rab9 a obnovuje odchod LDL cholesterolu z pozdních endosomů Niemann-Pick C1". J. Lipid Res. 44 (2): 243–53. doi:10.1194 / ml. M200230-JLR200. PMID 12576506.
Seaman MN (2004). „Nákladově selektivní endozomální třídění pro získání na Golgi vyžaduje retromer“. J. Cell Biol. 165 (1): 111–22. doi:10.1083 / jcb.200312034. PMC 2172078. PMID 15078902.
Chen L, DiGiammarino E, Zhou XE, Wang Y, Toh D, Hodge TW, Meehan EJ (2004). „Krystalová struktura lidské GTPázy Rab9 s vysokým rozlišením: nový cíl antivirového léčiva“. J. Biol. Chem. 279 (38): 40204–8. doi:10,1074 / jbc.M407114200. PMID 15263003.
Ganley IG, Carroll K, Bittova L, Pfeffer S (2005). „Rab9 GTPáza reguluje velikost pozdního endozomu a pro svou stabilitu vyžaduje interakci efektoru“. Mol. Biol. Buňka. 15 (12): 5420–30. doi:10,1091 / mbc.E04-08-0747. PMC 532021. PMID 15456905.
Ganley IG, Pfeffer SR (2006). „Akumulace cholesterolu izoluje Rab9 a narušuje funkci pozdního endozomu v buňkách s nedostatkem NPC1“. J. Biol. Chem. 281 (26): 17890–9. doi:10,1074 / jbc.M601679200. PMC 3650718. PMID 16644737.
Aivazian D, Serrano RL, Pfeffer S (2006). „TIP47 je klíčový efektor pro lokalizaci Rab9“. J. Cell Biol. 173 (6): 917–26. doi:10.1083 / jcb.200510010. PMC 2063917. PMID 16769818.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123595 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079316 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9126495-5] Davies JP, Cotter PD, Ioannou YA (květen 1997). "Klonování a mapování lidských sekvencí cDNA Rab7 a Rab9 a identifikace pseudogenu Rab9". Genomika. 41 (1): 131–4. doi:10.1006 / geno.1997.4644. PMID 9126495.

[entrez-6] „Entrez Gene: RAB9A RAB9A, člen onkogenní rodiny RAS“.

[pmid9230071-7] Díaz E, Schimmöller F, Pfeffer SR (červenec 1997). „K přenosu endosomu k TGN je zapotřebí nový efektor Rab9“. J. Cell Biol. 138 (2): 283–90. doi:10.1083 / jcb.138.2.283. PMC 2138197. PMID 9230071.

[pmid11359012-8] Carroll KS, Hanna J, Simon I, Krise J, Barbero P, Pfeffer SR (květen 2001). "Úloha GTPázy Rab9 při usnadňování náboru receptorů pomocí TIP47". Věda. 292 (5520): 1373–6. doi:10.1126 / science.1056791. PMID 11359012.

[pmid20048159-9] Kloer DP, Rojas R, Ivan V, Moriyama K, van Vlijmen T, Murthy N, Ghirlando R, van der Sluijs P, Hurley JH, Bonifacino JS (březen 2010). „Sestavení biogeneze komplexu 3 organel souvisejících s lysozomy (BLOC-3) a jeho interakce s Rab9“. J. Biol. Chem. 285 (10): 7794–7804. doi:10.1074 / jbc.M109.069088. PMC 2844223. PMID 20048159.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]