UCHL3 - UCHL3 - Wikipedia

UCHL3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1UCH, 1XD3
Identifikátory
Aliasy	UCHL3, UCH-L3, ubikvitin C-terminální hydroláza L3
Externí ID	OMIM: 603090 MGI: 1355274 HomoloGene: 4377 Genové karty: UCHL3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	75,606,020 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	101,696,125 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • aktivita hydrolázy; • aktivita peptidázy; • ubikvitinová vazba; • NEDD8-specifická proteázová aktivita; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • intracelulární; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• proteinový katabolický proces; • proteolýza; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • posttranslační modifikace; • deubikvitinace bílkovin; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7347
	50933
	ENSG00000118939
	ENSMUSG00000022111
	P15374
	Q9JKB1
	NM_001270952; NM_006002
	NM_016723
	NP_001257881; NP_005993
	NP_057932
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza isozym L3 je enzym že u lidí je kódován UCHL3 gen.^[5]^[6]

Interakce

UCHL3 bylo prokázáno komunikovat s NEDD8 a tauopatie a synukleinopatie asociovaná mutovaná molekula ubikvitinu UBB + 1.^[7]^[8]

Viz také

Ubikvitin karboxy-terminální hydroláza L1 - enzym

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118939 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022111 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wilkinson KD, Lee KM, Deshpande S, Duerksen-Hughes P, Boss JM, Pohl J (prosinec 1989). „Neuronově specifický protein PGP 9.5 je ubikvitin karboxyl-terminální hydroláza“. Věda. 246 (4930): 670–3. doi:10.1126 / science.2530630. PMID 2530630.
^ "Entrez Gene: UCHL3 ubikvitin karboxyl-terminální esteráza L3 (ubikvitin thiolesteráza)".
^ Dennissen FJ, Kholod N, Hermes DJ, Kemmerling N, Steinbusch HW, Dantuma NP, van Leeuwen FW (červenec 2011). „Mutantní ubikvitin (UBB (+1)) spojený s neurodegenerativními poruchami je hydrolyzován ubikvitinovou C-terminální hydrolázou L3 (UCH-L3)“. FEBS Lett. 585 (16): 2568–74. doi:10.1016 / j.febslet.2011.06.037. PMID 21762696.
^ Wada H, Kito K, Caskey LS, Yeh ET, Kamitani T (říjen 1998). "Štěpení C-konce NEDD8 pomocí UCH-L3". Biochem. Biophys. Res. Commun. 251 (3): 688–92. doi:10.1006 / bbrc.1998.9532. PMID 9790970.

Další čtení

Johnston SC, Larsen CN, Cook WJ a kol. (1997). „Krystalová struktura deubikvitinačního enzymu (lidský UCH-L3) v rozlišení 1,8 A“. EMBO J.. 16 (13): 3787–96. doi:10.1093 / emboj / 16.13.3787. PMC 1170002. PMID 9233788.
Wilkinson KD, Laleli-Sahin E, Urbauer J a kol. (1999). „Vazebné místo pro UCH-L3 na ubikvitinu: mutageneze a NMR studie komplexu mezi ubikvitinem a UCH-L3.“ J. Mol. Biol. 291 (5): 1067–77. doi:10.1006 / jmbi.1999.3038. PMID 10518943.
Baek SH, Yoo YJ, Tanaka K, Chung CH (1999). "Molekulární klonování kuřat UCH-6, které má vysokou podobnost s lidským UCH-L3: jeho neobvyklá substrátová specificita a tkáňová distribuce". Biochem. Biophys. Res. Commun. 264 (1): 235–40. doi:10.1006 / bbrc.1999.1492. PMID 10527871.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Saito S, Iida A, Sekine A a kol. (2003). „Katalog 680 variací mezi osmi geny cytochromu p450 (CYP), devíti geny esterázy a dvěma dalšími geny v japonské populaci“. J. Hum. Genet. 48 (5): 249–70. doi:10.1007 / s10038-003-0021-7. PMID 12721789.
Nam MJ, Madoz-Gurpide J, Wang H a kol. (2004). „Molekulární profil imunitní odpovědi u rakoviny tlustého střeva pomocí proteinových mikročipů: výskyt autoprotilátek proti ubikvitinu C-terminální hydroláze L3“. Proteomika. 3 (11): 2108–15. doi:10.1002 / pmic.200300594. PMID 14595809.
Dunham A, Matthews LH, Burton J a kol. (2004). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 13“. Příroda. 428 (6982): 522–8. doi:10.1038 / nature02379. PMC 2665288. PMID 15057823.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Misaghi S, Galardy PJ, Meester WJ a kol. (2005). "Struktura ubikvitin hydrolázy UCH-L3 v komplexu se sebevražedným substrátem". J. Biol. Chem. 280 (2): 1512–20. doi:10,1074 / jbc.M410770200. PMID 15531586.
Rolén U, Kobzeva V, Gasparjan N a kol. (2006). "Profilování aktivity deubikvitinačních enzymů v biopsiích a buněčných liniích karcinomu děložního hrdla". Mol. Karcinogen. 45 (4): 260–9. doi:10.1002 / mc.20177. PMID 16402389.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118939 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022111 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2530630-5] Wilkinson KD, Lee KM, Deshpande S, Duerksen-Hughes P, Boss JM, Pohl J (prosinec 1989). „Neuronově specifický protein PGP 9.5 je ubikvitin karboxyl-terminální hydroláza“. Věda. 246 (4930): 670–3. doi:10.1126 / science.2530630. PMID 2530630.

[entrez-6] "Entrez Gene: UCHL3 ubikvitin karboxyl-terminální esteráza L3 (ubikvitin thiolesteráza)".

[pmid21762696-7] Dennissen FJ, Kholod N, Hermes DJ, Kemmerling N, Steinbusch HW, Dantuma NP, van Leeuwen FW (červenec 2011). „Mutantní ubikvitin (UBB (+1)) spojený s neurodegenerativními poruchami je hydrolyzován ubikvitinovou C-terminální hydrolázou L3 (UCH-L3)“. FEBS Lett. 585 (16): 2568–74. doi:10.1016 / j.febslet.2011.06.037. PMID 21762696.

[pmid9790970-8] Wada H, Kito K, Caskey LS, Yeh ET, Kamitani T (říjen 1998). "Štěpení C-konce NEDD8 pomocí UCH-L3". Biochem. Biophys. Res. Commun. 251 (3): 688–92. doi:10.1006 / bbrc.1998.9532. PMID 9790970.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Thioesterázy (ES 3.1.2)
Acetyl-CoA thioesterázy
Acyl-CoA thioesterázy	ACOT1 ACOT2 ACOT4 ACOT6 ACOT7 ACOT8 ACOT9 ACOT11 ACOT12 ACOT13
Formyl-CoA thioesterázy
Palmitoylprotein thioesterázy	PPT1 PPT2
Sukcinyl-CoA thioesterázy
C-koncové hydrolázy ubikvitinu	UCHL1 UCHL3 UCHL5