ACOT11 - ACOT11

ACOT11
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyACOT11, BFIT, STARD14, THEA, THEM1, acyl-CoA thioesteráza 11
Externí IDOMIM: 606803 MGI: 1913736 HomoloGene: 11977 Genové karty: ACOT11
Umístění genu (člověk)
Chromozom 1 (lidský)
Chr.Chromozom 1 (lidský)[1]
Chromozom 1 (lidský)
Genomické umístění pro ACOT11
Genomické umístění pro ACOT11
Kapela1p32.3Start54,542,257 bp[1]
Konec54,639,192 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ACOT11 216103 na fs.png

PBB GE ACOT11 214763 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

26027

329910

Ensembl

ENSG00000162390

ENSMUSG00000034853

UniProt

Q8WXI4

Q8VHQ9

RefSeq (mRNA)

NM_147161
NM_015547

NM_025590
NM_001347159

RefSeq (protein)

NP_056362
NP_671517

NP_001334088
NP_079866

Místo (UCSC)Chr 1: 54,54 - 54,64 MbChr 4: 106,74 - 106,8 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Acyl-koenzym A thioesteráza 11 také známý jako StAR-příbuzný lipidový přenosový protein 14 (STARD14) je enzym že u lidí je kódován ACOT11 gen.[5][6][7][8] Tento gen kóduje protein s acyl-CoA thioesteráza aktivita vůči střednímu (C12) a dlouhému řetězci (C18) mastné substráty acyl-CoA, které se spoléhají na své Doména přenosu lipidů související se StAR. Vyjádření podobného myší bílkovina v hnědé barvě tukové tkáň je indukována vystavením chladu a potlačována teplem. Exprese myšího proteinu byla spojena s obezita, s vyšší expresí nalezenou u myší rezistentních na obezitu ve srovnání s myší náchylnými k obezitě. Výsledkem alternativního sestřihu jsou dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[8]

Struktura

Gen ACOT11 je lokalizován na 1. chromozomu, přičemž jeho specifická lokalizace je 1p32.3. Obsahuje 18 exonů.[8]

Protein kódovaný tímto genem obsahuje 258 aminokyselin a tvoří homodimer s jiným řetězcem. Jeho teoretická hmotnost je 26,67 kDa.[9] Protein obsahuje a Transferová doména související se StAR, což je doména odpovědná za vazbu na lipidy. Existují 4 známé ligandy, které se vážou na tento homodimer: polyethylenglykol, chlór, glycerol a forma TCEP.[10]

Funkce

Protein kódovaný genem ACOT11 je součástí rodiny Acyl-CoA thioesterázy, které katalyzují hydrolýza různých Koenzym A estery různých molekul na volnou kyselinu plus CoA. Tyto enzymy byly v literatuře také označovány jako acyl-CoA hydrolázy, acyl-CoA thioester hydrolázy a palmitoyl-CoA hydrolázy. Reakce prováděná těmito enzymy je následující:

CoA ester + H2O → volná kyselina + koenzym A

Tyto enzymy používají totéž substráty jako acyl-CoA syntetázy s dlouhým řetězcem, ale mají jedinečný účel v tom, že generují volnou kyselinu a CoA, na rozdíl od acyl-CoA syntetáz s dlouhým řetězcem, které ligují mastné kyseliny na CoA, za vzniku esteru CoA.[11] Úloha rodiny enzymů ACOT není dobře známa; bylo však navrženo, že hrají klíčovou roli při regulaci intracelulárních hladin CoA esterů, koenzymu A a volných mastných kyselin. Nedávné studie ukázaly, že estery Acyl-CoA mají mnohem více funkcí než jen zdroj energie. Mezi tyto funkce patří alosterická regulace enzymů, jako je acetyl-CoA karboxyláza,[12] hexokináza IV,[13] a citrátový kondenzující enzym. Acyl-CoA s dlouhým řetězcem také regulují otevírání ATP-citlivé draslíkové kanály a aktivace Vápníkové ATPázy, čímž reguluje inzulín vylučování.[14] Řada dalších buněčných událostí je také zprostředkována prostřednictvím acyl-CoA, například transdukce signálu skrz protein kináza C., inhibice kyselina retinová indukovaná apoptóza a účast na pučení a fúzi endomembránový systém.[15][16][17] Acyl-CoAs také zprostředkovávají cílení proteinů na různé membrány a regulaci G protein α podjednotky, protože jsou substráty pro acylaci proteinů.[18] V mitochondrie, acyl-CoA estery se účastní acylace mitochondriálních NAD + závislých dehydrogenázy; protože tyto enzymy jsou zodpovědné za aminokyselinový katabolismus, díky této acylaci je celý proces neaktivní. Tento mechanismus může poskytovat přeslechy v metabolismu a regulovat NADH / NAD + poměr za účelem udržení optimálního mitochondrií beta oxidace mastných kyselin.[19] Role esterů CoA v metabolismus lipidů a řada dalších intracelulárních procesů je dobře definována, a proto se předpokládá, že ACOT- enzymy hrají roli v modulaci procesů, na kterých se tyto metabolity podílejí.[20]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162390 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034853 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Adams SH, Chui C, Schilbach SL, Yu XX, Goddard AD, Grimaldi JC, Lee J, Dowd P, Colman S, Lewin DA (listopad 2001). „BFIT, jedinečná thioesteráza acyl-CoA indukovaná v termogenní hnědé tukové tkáni: klonování, organizace lidského genu a hodnocení potenciální souvislosti s obezitou“. The Biochemical Journal. 360 (Pt 1): 135–42. doi:10.1042/0264-6021:3600135. PMC  1222210. PMID  11696000.
  6. ^ Hunt MC, Yamada J, Maltais LJ, Wright MW, Podesta EJ, Alexson SE (září 2005). „Revidovaná nomenklatura pro savčí acyl-CoA thioesterázy / hydrolázy“. Journal of Lipid Research. 46 (9): 2029–32. doi:10.1194 / jlr.E500003-JLR200. PMID  16103133.
  7. ^ Hunt MC, Rautanen A, Westin MA, Svensson LT, Alexson SE (září 2006). „Analýza genových shluků myší a lidské acyl-CoA thioesterázy (ACOT) ukazuje, že konvergentní, funkční evoluce má za následek snížený počet lidských peroxisomálních ACOT“. FASEB Journal. 20 (11): 1855–64. doi:10.1096 / fj.06-6042com. PMID  16940157.
  8. ^ A b C „Entrez Gene: ACOT11 acyl-CoA thioesteráza 11“.
  9. ^ „Lidská doména START acyl-koenzymu A thioesterázy 11 (ACOT11)“. Proteinová datová banka v Evropě. Citováno 19. května 2015.
  10. ^ Thorsell AG, Lee WH, Persson C, Siponen MI, Nilsson M, Busam RD, Kotenyova T, Schüler H, Lehtiö L (2011). „Srovnávací strukturní analýza START domén vázajících lipidy“. PLOS ONE. 6 (6): e19521. Bibcode:2011PLoSO ... 619521T. doi:10.1371 / journal.pone.0019521. PMC  3127847. PMID  21738568.
  11. ^ Mashek DG, Bornfeldt KE, Coleman RA, Berger J, Bernlohr DA, Black P, DiRusso CC, Farber SA, Guo W, Hashimoto N, Khodiyar V, Kuypers FA, Maltais LJ, Nebert DW, Renieri A, Schaffer JE, Stahl A Watkins PA, Vasiliou V, Yamamoto TT (říjen 2004). „Revidovaná nomenklatura pro savčí genovou rodinu acyl-CoA syntetázy s dlouhým řetězcem“. Journal of Lipid Research. 45 (10): 1958–61. doi:10.1194 / jlr.E400002-JLR200. PMID  15292367.
  12. ^ Ogiwara H, Tanabe T, Nikawa J, Numa S (srpen 1978). "Inhibice krysích jater acetyl-koenzym-A karboxylázy palmitoyl-koenzymem A. Tvorba ekvimolárního komplexu enzym-inhibitor". European Journal of Biochemistry / FEBS. 89 (1): 33–41. doi:10.1111 / j.1432-1033.1978.tb20893.x. PMID  29756.
  13. ^ Srere PA (prosinec 1965). "Palmityl-koenzym A inhibice citrát-kondenzujícího enzymu". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - lipidy a metabolismus lipidů. 106 (3): 445–55. doi:10.1016/0005-2760(65)90061-5. PMID  5881327.
  14. ^ Gribble FM, Proks P, Corkey BE, Ashcroft FM (říjen 1998). "Mechanismus aktivace klonovaného draslíkového kanálu citlivého na ATP oleoyl-CoA". The Journal of Biological Chemistry. 273 (41): 26383–7. doi:10.1074 / jbc.273.41.26383. PMID  9756869.
  15. ^ Nishizuka Y (duben 1995). "Proteinkináza C a lipidová signalizace pro trvalé buněčné odpovědi". FASEB Journal. 9 (7): 484–96. doi:10.1096 / fasebj.9.7.7737456. PMID  7737456.
  16. ^ Glick BS, Rothman JE (březen 1987). "Možná role mastného acyl-koenzymu A v intracelulárním transportu bílkovin". Příroda. 326 (6110): 309–12. Bibcode:1987 Natur.326..309G. doi:10.1038 / 326309a0. PMID  3821906.
  17. ^ Wan YJ, Cai Y, Cowan C, Magee TR (červen 2000). „Mastné acyl-CoA inhibují apoptózu vyvolanou kyselinou retinovou v buňkách Hep3B“. Dopisy o rakovině. 154 (1): 19–27. doi:10.1016 / s0304-3835 (00) 00341-4. PMID  10799735.
  18. ^ Duncan JA, Gilman AG (červen 1998). „Cytoplazmatická acylproteinová thioesteráza, která odstraňuje palmitát z alfa podjednotek G proteinu a p21 (RAS)“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (25): 15830–7. doi:10.1074 / jbc.273.25.15830. PMID  9624183.
  19. ^ Berthiaume L, Deichaite I, Peseckis S, Resh MD (březen 1994). "Regulace enzymatické aktivity aktivní mastnou acylací. Nová role pro acylaci proteinů mastnými kyselinami s dlouhým řetězcem". The Journal of Biological Chemistry. 269 (9): 6498–505. PMID  8120000.
  20. ^ Hunt MC, Alexson SE (březen 2002). „Role Acyl-CoA thioesterázy hrají při zprostředkování intracelulárního metabolismu lipidů“. Pokrok ve výzkumu lipidů. 41 (2): 99–130. doi:10.1016 / s0163-7827 (01) 00017-0. PMID  11755680.

externí odkazy

Další čtení