Rostlinný mikrobiom - Plant microbiome

Část série na
Mikrobiomy
Plant microbiota.png

The rostlinný mikrobiom hraje roli ve zdraví a produktivitě rostlin a v posledních letech mu byla věnována významná pozornost.[1][2] The mikrobiom byl definován jako „charakteristické mikrobiální společenství zaujímající přiměřeně dobře definované stanoviště, které má odlišné fyzikálně-chemické vlastnosti. Termín tedy nejen odkazuje na zúčastněné mikroorganismy, ale také zahrnuje jejich divadlo činnosti“.[3][4]

Rostliny žijí ve spojení s různými mikrobiální konsorcia. Tyto mikroby, označované jako rostliny mikrobiota, žijte jak uvnitř (endosféra), tak i venku (epizoda) z rostlinné tkáně a hrají důležitou roli v ekologii a fyziologii rostlin.[5] „Předpokládá se, že jádrový rostlinný mikrobiom zahrnuje klíčové mikrobiální taxony, které jsou důležité pro kondici rostlin a jsou založeny prostřednictvím evolučních mechanismů selekce a obohacení mikrobiálních taxonů obsahujících geny základních funkcí pro kondici rostlinného holobiontu.“[6]

Mikrobiomy rostlin jsou formovány jak faktory souvisejícími se samotnou rostlinou, jako je genotyp, orgán, druh a zdravotní stav, tak faktory souvisejícími s prostředím rostliny, jako je management, využívání půdy a podnebí.[7] V některých studiích se uvádí, že zdravotní stav rostliny se odráží v mikrobiomu nebo je s ním spojen.[8][1][9][2]

Přehled

Mikrobiom v rostlinném ekosystému
Schematická rostlina a mikrobiota spojená s rostlinou kolonizující různé výklenky na rostlinné tkáni a uvnitř ní. Všechny nadzemní části rostlin dohromady, nazývané fylosféra, jsou neustále se vyvíjejícím stanovištěm v důsledku ultrafialového (UV) záření a měnících se klimatických podmínek. Je primárně složen z listů. Podzemní části rostlin, zejména kořeny, jsou obecně ovlivňovány vlastnostmi půdy. Škodlivé interakce ovlivňují růst rostlin prostřednictvím patogenních aktivit některých členů mikrobioty (levá strana). Na druhé straně příznivé mikrobiální interakce podporují růst rostlin (pravá strana).[10]

Studium asociace rostlin s mikroorganismy předchází studiu živočišných a lidských mikrobiomů, zejména rolí mikrobů při příjmu dusíku a fosforu. Nejpozoruhodnější příklady jsou kořen rostliny -arbuskulární mykorhizní (AM) a luštěninově-rhizobiální symbiózy, oba významně ovlivňují schopnost kořenů přijímat různé živiny z půdy. Některé z těchto mikrobů nemohou přežít v nepřítomnosti hostitele rostliny (povinné symbionty patří viry a některé bakterie a houby), který poskytuje mikroorganismům prostor, kyslík, bílkoviny a sacharidy. Sdružení AM hub s rostlinami je známé od roku 1842 a je s nimi spojeno přes 80% suchozemských rostlin.[11] Předpokládá se, že houby AM pomohly při domestikaci rostlin.[12][5]

V této animaci a kořenová hlíza je kolonizován arbuskulární mykorhizní houbou (AMF)

Studie interakce rostlin a mikrobů se tradičně omezují na kultivovatelné mikroby. Četné mikroby, které nebylo možné kultivovat, zůstaly nevyšetřeny, takže znalost jejich rolí je do značné míry neznámá.[5] Možnosti odhalení typů a výsledků těchto interakcí rostlin a mikrobů vyvolaly značný zájem mezi ekology, evolučními biology, rostlinnými biology a agronomy.[13][14][1] Poslední vývoj v roce 2006 multiomika a založení velkých sbírek mikroorganismů dramaticky zvýšilo znalosti o složení a rozmanitosti rostlinných mikrobiomů. The sekvenování z markerové geny celých mikrobiálních komunit, označovaných jako metagenomika, vrhá světlo na fylogenetická rozmanitost mikrobiomů rostlin. Také to zvyšuje znalosti majora biotický a abiotické faktory zodpovědný za formování rostlinného mikrobiomu komunitní shromáždění.[14][5]

Studie rostlinných mikrobiomů byly zaměřeny na modelové rostliny, jako jsou např Arabidopsis thaliana, stejně jako důležité druhy hospodářských plodin včetně ječmen (Hordeum vulgare), kukuřice (Zea mays), rýže (Oryza sativa), sója (Glycine max), pšenice (Triticum aestivum), zatímco ovocným plodinám a dřevinám byla věnována menší pozornost.[15][2]

Rostlinná mikrobiota

Různorodá mikrobiální společenství charakteristické mikrobioty jsou součástí rostlinných mikrobiomů a nacházejí se na vnějších površích a ve vnitřních tkáních hostitelské rostliny i v okolní půdě.[5]

Mikrobiom rhizosféry

Přirozeně se vytvořila mikrobiální konsorcia
na kořenech Arabidopsis thaliana
Skenování obrázků kořenového elektronového mikroskopu z přírodních A. thaliana populace ukazující komplex mikrobiální sítě vytvořené na kořenech.
a) Přehled an A. thaliana kořen (primární kořen) s mnoha kořenovými chloupky. b) Tvorba biofilmu bakterie. C) Houba nebo oomycete hyfy obklopující povrch kořene. d) Primární kořen hustě pokrytý výtrusy a protistů. e, f) Protisti, s největší pravděpodobností patřící k Bacillariophyceae třída. g) Bakterie a bakteriální vlákna. h, i) Různí bakteriální jedinci vykazující velké rozmanitosti tvarů a morfologických znaků.[16]
Viz také: Kořenový mikrobiom a Rhizosféra

The rhizosféra zahrnuje zónu 1–10 mm půdy bezprostředně obklopující kořeny která je pod vlivem rostliny prostřednictvím jejího ukládání kořenové exsudáty, sliz a mrtvé rostlinné buňky.[17] Různé druhy organismů se specializují na život v rhizosféře, včetně bakterie, houby, oomycety, hlístice, řasy, prvoky, viry, a archaea.[18]

Nejčastěji studovanými prospěšnými organismy rhizosféry jsou mycorrhizae, bakterie rhizobium, rhizobakterie podporující růst rostlin (PGPR) a biokontrolní mikroby. Předpokládá se, že jeden gram půdy může obsahovat více než jeden milion odlišných bakteriálních genomů,[19] a více než 50 000 OTU (funkční taxonomické jednotky ) byly nalezeny v rhizosféře brambor.[20] Mezi prokaryoty v rhizosféře jsou nejčastější bakterie uvnitř Acidobakterie, Proteobakterie, Planctomycetes, Aktinobakterie, Bacteroidetes, a Firmicutes.[21][22] V některých studiích nebyly hlášeny žádné významné rozdíly ve složení mikrobiální komunity mezi objemná půda (půda není připojena ke kořenu rostliny) a půda rhizosféry.[23][24] Určité bakteriální skupiny (např. Actinobacteria, Xanthomonadaceae ) jsou v rhizosféře méně hojné než v blízké sypké půdě.[21][5]

Mykorhizní houby jsou hojnými členy komunity rhizosféry a byly nalezeny u více než 200 000 druhů rostlin a odhaduje se, že se stýkají s více než 80% všech rostlin.[25] Sdružení Mycorrhizae – root hrají regulaci v pozemských ekosystémech hlubokou roli živina a uhlíkové cykly. Mykorhizy jsou nedílnou součástí zdraví rostlin, protože poskytují až 80% požadavků na dusík a fosfor. Na oplátku houby získávají sacharidy a lipidy z hostitelských rostlin.[26] Nedávné studie arbuskulárních mykorhizních hub využívajících sekvenční technologie ukazují větší mezidruhovou a mezidruhovou rozmanitost, než bylo dosud známo.[27][5]

„Experimentální důkazy podtrhují význam kořenového mikrobiomu pro zdraví rostlin a je stále jasnější, že rostlina je schopna kontrolovat složení svého mikrobiomu. Je logické, že ty rostliny, které spravují svůj mikrobiom způsobem, který je prospěšný pro jejich reprodukční úspěch bude upřednostňován během evolučního výběru. Zdá se, že takový selektivní tlak přinesl mnoho specifických interakcí mezi rostlinami a mikroby a hromadily se důkazy, že rostliny vyžadují mikrobiální pomoc v případě potřeby. “

- Berendsen et al, 2012 [28]

Phyllosphere microbiome

List od zdravého Arabidopsis rostlina (vlevo) a list z mutantní rostliny dysbiózy (vpravo)[29]
Viz také: Phyllosphere

Vzdušný povrch rostliny (stonek, list, květ, ovoce) se nazývá fylosphere a je považována za srovnatelně chudou na živiny ve srovnání s rhizosférou a endosférou. Prostředí ve fylosféře je dynamičtější než prostředí rhizosféry a endosféry. Mikrobiální kolonizátoři jsou vystaveni denním a sezónním výkyvům tepla, vlhkosti a záření. Kromě toho tyto environmentální prvky ovlivňují fyziologii rostlin (jako je fotosyntéza, dýchání, příjem vody atd.) A nepřímo ovlivňují složení mikrobiomu.[5] Déšť a vítr také způsobují časové variace mikrobiomu fylosféry.[30]

Celkově v komunitách fylosféry zůstává vysoká druhová bohatost. Houbová společenstva jsou vysoce variabilní ve fylosféře mírných oblastí a jsou rozmanitější než v tropických oblastech.[31] Na povrchu listů rostlin může být až 107 mikrobů na centimetr čtvereční a odhaduje se, že bakteriální populace fylosphere v celosvětovém měřítku je 1026 buňky.[32] Je pravděpodobné, že velikost populace houbové fylosféry bude menší.[33]

Phylosphere mikroby z různých rostlin se zdají být poněkud podobné na vysokých úrovních taxonů, ale na nižších úrovních zůstávají významné rozdíly. To naznačuje, že mikroorganismy mohou potřebovat jemně vyladěné metabolické úpravy, aby přežily v prostředí fylosféry.[31] Proteobakterie se zdá být dominantním kolonizátorem Bacteroidetes a Aktinobakterie také převládající ve fylosférách.[34] Ačkoli existují podobnosti mezi rhizosférou a půdními mikrobiálními komunitami, byla zjištěna velmi malá podobnost mezi fylosférickými společenstvími a mikroorganismy plovoucími pod širým nebem (aeroplankton ).[35][5]

Mikrobiom endosféry

Některé mikroorganismy, jako např endofyty, pronikají a zaujímají vnitřní tkáně rostlin a vytvářejí endosférický mikrobiom. AM a další endofytické houby jsou dominantními kolonizátory endosféry.[36] Bakterie a do určité míry archaea, jsou důležitými členy komunit endosféry. Některé z těchto endofytních mikrobů interagují se svým hostitelem a poskytují rostlinám zjevné výhody.[21][37][38] Na rozdíl od rhizosféry a rhizoplane jsou v endosférách vysoce specifická mikrobiální společenství. Kořenové endofytické společenství může být velmi odlišné od sousedního půdního společenství. Obecně je rozmanitost endofytické komunity nižší než rozmanitost mikrobiální komunity mimo rostlinu.[24] Identita a rozmanitost endofytického mikrobiomu nadzemních a podzemních tkání se může v rostlině také lišit.[36][5]

Reference

  1. ^ A b C Turner, Thomas R .; James, Euan K .; Poole, Philip S. (2013). "Rostlinný mikrobiom". Genome Biology. 14 (6): 209. doi:10.1186 / gb-2013-14-6-209. PMC  3706808. PMID  23805896.
  2. ^ A b C Purahong, Witoon; Orrù, Luigi; Donati, Irene; Perpetuini, Giorgia; Cellini, Antonio; Lamontanara, Antonella; Michelotti, Vania; Tacconi, Gianni; Spinelli, Francesco (2018). "Rostlinný mikrobiom a jeho vazba na zdraví rostlin: hostitelské druhy, orgány a Pseudomonas syringae pv. Actinidiae Infection formující bakteriální společenství fylosféry kiwi". Hranice ve vědě o rostlinách. 9: 1563. doi:10.3389 / fpls.2018.01563. PMC  6234494. PMID  30464766.. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  3. ^ Whipps J., Lewis K. a Cooke R. (1988) „Mycoparasitism and plant disease control“. In: Burge M (ed.) Houby v systémech biologické kontroly, Manchester University Press, strany 161–187. ISBN  9780719019791.
  4. ^ Berg, Gabriele; Daria Rybakova, Doreen Fischer, Tomislav Cernava, Marie-Christine Champomier Vergès, Trevor Charles, Xiaoyulong Chen, Luca Cocolin, Kellye Eversole, Gema Herrero Corral, Maria Kazou, Linda Kinkel, Lene Lange, Nelson Lima, Alexander Loy, James A. Macklin Emmanuelle Maguin, Tim Mauchline, Ryan McClure, Birgit Mitter, Matthew Ryan, Inga Sarand, Hauke ​​Smidt, Bettina Schelkle, Hugo Roume, G. Seghal Kiran, Joseph Selvin, Rafael Soares Correa de Souza, Leo van Overbeek, Brajesh K. Singh , Michael Wagner, Aaron Walsh, Angela Sessitsch a Michael Schloter (2020) „Znovu navštívená definice mikrobiomu: staré koncepty a nové výzvy“. Mikrobiom, 8(103): 1–22. doi:10.1186 / s40168-020-00875-0. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  5. ^ A b C d E F G h i j Dastogeer, K.M., Tumpa, F.H., Sultana, A., Akter, M.A. a Chakraborty, A. (2020) „Plant microbiome - an account of the factors that form community combination andiversity“. Aktuální biologie rostlin: 100161. doi:10.1016 / j.cpb.2020.100161. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  6. ^ Compant, S., Samad, A., Faist, H. a Sessitsch, A. (2019) „A review on the plant microbiome: Ecology, functions, and emerging trendy in microbial application“. Časopis pokročilého výzkumu, 19: 29_37.doi:10.1016 / j.jare.2019.03.004.
  7. ^ Bringel, Franã§Oise; Couã © e, Ivan (2015). „Stěžejní role fylosphere mikroorganismů na rozhraní mezi fungováním zařízení a dynamikou stopových plynů v atmosféře“. Hranice v mikrobiologii. 06: 486. doi:10.3389 / fmicb.2015.00486. PMC  4440916. PMID  26052316.
  8. ^ Berendsen, Roeland L .; Pieterse, Corné M.J .; Bakker, Peter A.H.M. (2012). "Mikrobiom rhizosféry a zdraví rostlin". Trendy ve vědě o rostlinách. 17 (8): 478–486. doi:10.1016 / j.tplantts.2012.04.001. hdl:1874/255269. PMID  22564542.
  9. ^ Berg, Gabriele; Grube, M .; Schloter, M .; Smalla, K. (2014). „Rostlinný mikrobiom a jeho význam pro zdraví rostlin a lidí“. Hranice v mikrobiologii. 5: 491. doi:10.3389 / fmicb.2014.00491. PMC  4166366. PMID  25278934.
  10. ^ Shelake, R.M., Pramanik, D. a Kim, J.Y. (2019) „Průzkum interakcí rostlin a mikrobů pro udržitelné zemědělství v době CRISPR“. Mikroorganismy, 7(8): 269. doi:10,3390 / mikroorganismy7080269. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  11. ^ Koide, Roger T .; Mosse, Barbara (2004). "Historie výzkumu arbuskulární mykorhizy". Mycorrhiza. 14 (3): 145–163. doi:10.1007 / s00572-004-0307-4. PMID  15088135. S2CID  1809402.
  12. ^ Heckman, D. S. (2001). „Molekulární důkazy pro časnou kolonizaci půdy houbami a rostlinami“. Věda. 293 (5532): 1129–1133. doi:10.1126 / science.1061457. PMID  11498589. S2CID  10127810.
  13. ^ Berendsen, Roeland L .; Pieterse, Corné M.J .; Bakker, Peter A.H.M. (2012). "Mikrobiom rhizosféry a zdraví rostlin". Trendy ve vědě o rostlinách. 17 (8): 478–486. doi:10.1016 / j.tplantts.2012.04.001. hdl:1874/255269. PMID  22564542.
  14. ^ A b Bulgarelli, Davide; Schlaeppi, Klaus; Spaepen, Stijn; Van Themaat, Emiel Ver Loren; Schulze-Lefert, Paul (2013). "Struktura a funkce bakteriální mikrobioty rostlin". Roční přehled biologie rostlin. 64: 807–838. doi:10.1146 / annurev-arplant-050312-120106. PMID  23373698.
  15. ^ Busby, Posy E .; Soman, Chinmay; Wagner, Maggie R .; Friesen, Maren L .; Kremer, James; Bennett, Alison; Morsy, Mustafa; Eisen, Jonathan A .; Leach, Jan E .; Dangl, Jeffery L. (2017). „Výzkumné priority pro využití rostlinných mikrobiomů v udržitelném zemědělství“. PLOS Biology. 15 (3): e2001793. doi:10.1371 / journal.pbio.2001793. PMC  5370116. PMID  28350798. S2CID  6434145.
  16. ^ Hassani, M.A., Durán, P. a Hacquard, S. (2018) „Mikrobiální interakce v rostlině holobiont“. Mikrobiom, 6(1): 58. doi:10.1186 / s40168-018-0445-0. CC-BY icon.svg Materiál byl zkopírován z tohoto zdroje, který je k dispozici pod a Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.
  17. ^ Hinsinger, Philippe; Bengough, A. Glyn; Vetterlein, Doris; Young, Iain M. (2009). „Rhizosféra: biofyzika, biogeochemie a ekologický význam“. Rostlina a půda. 321 (1–2): 117–152. doi:10.1007 / s11104-008-9885-9. S2CID  8997382.
  18. ^ Bonkowski, Michael; Villenave, Cécile; Griffiths, Bryan (2009). „Fauna rhizosféry: Funkční a strukturní rozmanitost intimních interakcí půdní fauny s kořeny rostlin“. Rostlina a půda. 321 (1–2): 213–233. doi:10.1007 / s11104-009-0013-2. S2CID  35701713.
  19. ^ Gans, J .; Wolinsky, M .; Dunbar, J. (2005). „Vylepšení výpočtu odhalují velkou bakteriální rozmanitost a vysokou toxicitu kovů v půdě“. Věda. 309 (5739): 1387–1390. doi:10.1126 / science.1112665. PMID  16123304. S2CID  130269020.
  20. ^ i̇Nceoğlu, Özgül; Al-Soud, Waleed Abu; Salles, Joana Falcão; Semenov, Alexander V .; Van Elsas, Jan Dirk (2011). „Srovnávací analýza bakteriálních společenství v bramborovém poli, jak je stanoveno pyrosekvenováním“. PLOS ONE. 6 (8): e23321. doi:10.1371 / journal.pone.0023321. PMC  3158761. PMID  21886785.
  21. ^ A b C Bulgarelli, Davide; Rott, Matthias; Schlaeppi, Klaus; Ver Loren Van Themaat, Emiel; Ahmadínežád, Nahal; Assenza, Federica; Rauf, Philipp; Huettel, Bruno; Reinhardt, Richard; Schmelzer, Elmon; Peplies, Joerg; Gloeckner, Frank Oliver; Amann, Rudolf; Eickhorst, Thilo; Schulze-Lefert, Paul (2012). "Odhalení struktury a montážních podnětů pro bakteriální mikrobiotu obývající kořeny Arabidopsis." Příroda. 488 (7409): 91–95. doi:10.1038 / příroda11336. PMID  22859207. S2CID  4393146.
  22. ^ Uroz, Stéphane; Buée, Marc; Murat, Claude; Frey-Klett, Pascale; Martin, Francis (2010). „Pyrosekvenování odhaluje kontrastní bakteriální rozmanitost mezi dubovou rhizosférou a okolní půdou“. Zprávy o mikrobiologii životního prostředí. 2 (2): 281–288. doi:10.1111 / j.1758-2229.2009.00117.x. PMID  23766079.
  23. ^ Lundberg, Derek S .; Lebeis, Sarah L .; Paredes, Sur Herrera; Yourstone, Scott; Gehring, Jase; Malfatti, Stephanie; Tremblay, Julien; Engelbrektson, Anna; Kunin, Victor; Rio, Tijana Glavina del; Edgar, Robert C .; Eickhorst, Thilo; Ley, Ruth E .; Hugenholtz, Philip; Tringe, Susannah Green; Dangl, Jeffery L. (2012). "Definování jádra kořenového mikrobiomu Arabidopsis thaliana". Příroda. 488 (7409): 86–90. doi:10.1038 / příroda11237. PMC  4074413. PMID  22859206.
  24. ^ A b Schlaeppi, K .; Dombrowski, N .; Oter, R. G .; Ver Loren Van Themaat, E .; Schulze-Lefert, P. (2014). „Kvantitativní divergence bakteriální kořenové mikrobioty u příbuzných Arabidopsis thaliana“. Sborník Národní akademie věd. 111 (2): 585–592. doi:10.1073 / pnas.1321597111. PMC  3896156. PMID  24379374. S2CID  13806811.
  25. ^ Van Der Heijden, Marcel G. A .; Martin, Francis M .; Selosse, Marc-André; Sanders, Ian R. (2015). „Mykorhizní ekologie a evoluce: minulost, přítomnost a budoucnost“. Nový fytolog. 205 (4): 1406–1423. doi:10.1111 / nph.13288. PMID  25639293.
  26. ^ Rich, Mélanie K .; Nouri, Eva; Courty, Pierre-Emmanuel; Reinhardt, Didier (2017). „Dieta arbuskulárních mykorhizních hub: chléb a máslo?“ (PDF). Trendy ve vědě o rostlinách. 22 (8): 652–660. doi:10.1016 / j.tplantts.2017.05.008. PMID  28622919.
  27. ^ Lee, Eun-Hwa; Eo, Ju-Kyeong; Ka, Kang-Hyeon; Eom, Ahn-Heum (2013). „Rozmanitost arbuskulárních mykorhizních hub a jejich role v ekosystémech“. Mykobiologie. 41 (3): 121–125. doi:10,5941 / MYCO.2013.41.3.121. PMC  3817225. PMID  24198665.
  28. ^ Berendsen, R.L., Pieterse, C.M. a Bakker, P.A. (2012) „Mikrobiom rhizosféry a zdraví rostlin“. Trendy ve vědě o rostlinách, 17(8): 478–486. doi:10.1016 / j.tplantts.2012.04.001.
  29. ^ On, Sheng Yang (2020) Pokud rostliny a jejich mikroby nejsou synchronizované, mohou být výsledky katastrofální Konverzace, 28. srpna 2020.
  30. ^ Lindow, Steven E. (1996). "Role imigrace a dalších procesů při určování populací epifytických bakterií". Mikrobiologie povrchových rostlin. 155–168. doi:10.1007/978-0-585-34164-4_10. ISBN  978-0-306-45382-3.
  31. ^ A b Finkel, Omri M .; Burch, Adrien Y .; Lindow, Steven E .; Post, Anton F .; Belkin, Shimshon (2011). „Geografické umístění určuje strukturu populace v mikrosférických komunitách fylosféry pouštního stromu vylučujícího sůl“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 77 (21): 7647–7655. doi:10.1128 / AEM.05565-11. PMC  3209174. PMID  21926212.
  32. ^ Vorholt, Julia A. (2012). "Mikrobiální život ve fylosféře". Příroda Recenze Mikrobiologie. 10 (12): 828–840. doi:10.1038 / nrmicro2910. PMID  23154261. S2CID  10447146.
  33. ^ Lindow, Steven E .; Brandl, Maria T. (2003). "Mikrobiologie fylosphere". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 69 (4): 1875–1883. doi:10.1128 / AEM.69.4.1875-1883.2003. PMC  154815. PMID  12676659. S2CID  2304379.
  34. ^ Bodenhausen, Natacha; Horton, Matthew W .; Bergelson, Joy (2013). „Bakteriální společenství spojená s listy a kořeny Arabidopsis thaliana“. PLOS ONE. 8 (2): e56329. doi:10.1371 / journal.pone.0056329. PMC  3574144. PMID  23457551.
  35. ^ Vokou, Despoina; Vareli, Kateřina; Zarali, Ekaterini; Karamanoli, Katerina; Constantinidou, Helen-Isis A .; Monokrousos, Nikolaos; Halley, John M .; Sainis, Ioannis (2012). „Exploring Biodiversity in the Bacterial Community of the Mediterranean Phyllosphere and its Relationship with Airborne Bacteria“. Mikrobiální ekologie. 64 (3): 714–724. doi:10.1007 / s00248-012-0053-7. PMID  22544345. S2CID  17291303.
  36. ^ A b Vokou, Despoina; Vareli, Kateřina; Zarali, Ekaterini; Karamanoli, Katerina; Constantinidou, Helen-Isis A .; Monokrousos, Nikolaos; Halley, John M .; Sainis, Ioannis (2012). „Exploring Biodiversity in the Bacterial Community of the Mediterranean Phyllosphere and its Relationship with Airborne Bacteria“. Mikrobiální ekologie. 64 (3): 714–724. doi:10.1007 / s00248-012-0053-7. PMID  22544345. S2CID  17291303.
  37. ^ Dastogeer, Khondoker M.G .; Li, Hua; Sivasithamparam, Krishnapillai; Jones, Michael G. K.; Du, Xin; Ren, Yonglin; Wylie, Stephen J. (2017). „Metabolické reakce endofytických rostlin Nicotiana benthamiana zažívajících vodní stres“. Environmentální a experimentální botanika. 143: 59–71. doi:10.1016 / j.envexpbot.2017.08.008.
  38. ^ Rodriguez, R. J .; White Jr, J. F .; Arnold, A.E .; Redman, R. S. (2009). "Houbové endofyty: rozmanitost a funkční role". Nový fytolog. 182 (2): 314–330. doi:10.1111 / j.1469-8137.2009.02773.x. PMID  19236579.

Referenční knihy