Mykobiom - Mycobiome
The mykobiom, mykobiota nebo plísně mikrobiom, je plísňový společenství v organismu a na něm.[1][2][3]
Existuje malé množství hub spojené s většinou míst lidského těla, jako je gastrointestinální trakt, kde houby obvykle tvoří pouze 0,001 - 0,1% mikrobiální komunity.[4][5] Houby však na některých místech, jako je zvukovod, tvoří významnou část mikrobiomu.[6]
Mykobiom je relevantní pro lidskou fyziologii, protože houby mohou být důležité pro udržení struktury mikrobiální komunity, metabolické funkce a imunitní aktivace.[7][8] Mutualismus mezi lidmi a houbami dosud není dobře pochopen a je zde mnoho poznatků o tom, jak houby interagují s nefungálními složkami mikrobiomu.
Lidské nemoci
Mnoho lidských nemocí, včetně hepatitida, cystická fibróza, obezita, a zánětlivé onemocnění střev byly spojeny se změnami v lidském mykobiomu[9][10]a bylo navrženo, že jakákoli plísňová kolonizace GI traktu je známkou onemocnění.[4]
Houbová biota je přítomna
![]() | Tato sekce může obsahovat nerozlišující, nadměrnýnebo irelevantní příklady.Listopad 2017) ( |
Vaginální mykobiom
- Candida (16 taxonomických jednotek)
- Ascomycota
- Saccharomycetales
- Ascomycota Davidiellaceae
- Kladosporium
- Eurotium
- Alternaria
- Basidomycota Rhodotorula
Střevní mykobiom[11]
(Kojenecký) střevní mykobiom
- Saccharomycetales (kojenec)
- Kladosporium
- Cryptococcus
- Saccharomyces cerevisiae
- Malasseziales
- Eurotiales
- Botryosphaeriales
- Filobasidiales[12]
Perorální mykobiom
- Candida
- Saccharomyces
- plísně Penicillium
- Aspergillus
- Scopulariopsis
- Genotrichum[13][14][15][16]
- Cryptococcus
- Histoplazma
- Mucor[17]
- Kladosporium
- Fusarium
- Alternaria[18]
- Malassezia
- Epicoccum
- Aureobasidium
- Irpex
- Cytospora
- Lenziles
- Sporobolomyces
- Dothioraceae
- Teratosphaeria
- Glomus[19][18]
- Pichia
Plicní mykobiom
- Aspergillus
- plísně Penicillium
- Davidiellaceae
- Candida[20]
Reference
- ^ Cui, Lijia; Morris, Alison; Ghedin, Elodie (2013). „Lidský mykobiom ve zdraví a nemoci“. Genomová medicína. 5 (7): 63. doi:10,1186 / gm467. PMC 3978422. PMID 23899327.
- ^ Ghannoum, Mahmoud (1. února 2016). „Mycobiome“. Vědec. Citováno 5. února 2016.
- ^ Suhr, M. J; Hallen-Adams, H. E (2015). „Lidský střevní mykobiom: úskalí a potenciály - perspektiva mykologů“. Mykologie. 107 (6): 1057–73. doi:10.3852/15-147. PMID 26354806. S2CID 16731371.
- ^ A b Auchtung, TA; Fofanova TY; Stewart CJ; Nash AK; Wong MC; Gesell JR; Auchtung JM; Ajami NJ; Petrosino JF (2018). "Vyšetřování kolonizace zdravého dospělého gastrointestinálního traktu houbami". mSphere. 3 (2): e00092–18. doi:10,1 128 / mSphere 00092-18. PMC 5874442. PMID 29600282.
- ^ Qin, Junjie; Li, Ruiqiang; Raes, Jeroen; Arumugam, Manimozhiyan; Burgdorf, Kristoffer Solvsten; Manichanh, Chaysavanh; Nielsen, Trine; Pons, Nicolas; Levenez, Florencie; Yamada, Takuji; Mende, Daniel R; Li, Junhua; Xu, Junming; Li, Shaochuan; Li, Dongfang; Cao, Jianjun; Wang, Bo; Liang, Huiqing; Zheng, Huisong; Xie, Yinlong; Tap, Julien; Lepage, Patricia; Bertalan, Marcelo; Batto, Jean-Michel; Hansen, Torben; Le Paslier, Denis; Linneberg, Allan; Nielsen, H. Bjørn; Pelletier, Eric; et al. (2010). „Katalog lidského střevního mikrobiálního genu vytvořený metagenomickým sekvenováním“. Příroda. 464 (7285): 59–65. Bibcode:2010Natur.464 ... 59.. doi:10.1038 / nature08821. PMC 3779803. PMID 20203603.
- ^ Oh, J; Byrd AL; Park M; Srovnávací program NISC; Kong HH; Segre JA (2016). „Časová stabilita mikrobiomu lidské kůže“. Buňka. 165 (4): 854–66. doi:10.1016 / j.cell.2016.04.008. PMC 4860256. PMID 27153496.
- ^ Seed, P. C (2014). „Lidský mykobiom“. Perspektivy Cold Spring Harbor v medicíně. 5 (5): a019810. doi:10.1101 / cshperspect.a019810. PMC 4448585. PMID 25384764.
- ^ Pflughoeft, Kathryn J; Versalovic, James (2012). „Lidský mikrobiom ve zdraví a nemocech“. Roční přehled patologie: mechanismy nemocí. 7: 99–122. doi:10.1146 / annurev-pathol-011811-132421. PMID 21910623.
- ^ Mar Rodríguez, M; Pérez, Daniel; Javier Chaves, Felipe; Esteve, Eduardo; Marin-Garcia, Pablo; Xifra, Gemma; Vendrell, Joan; Jové, Mariona; Pamplona, Reinald; Ricart, Wifredo; Portero-Otin, Manuel; Chacón, Matilde R; Fernández Real, José Manuel (2015). „Obezita mění lidský střevní mykobiom“. Vědecké zprávy. 5: 14600. Bibcode:2015NatSR ... 514600M. doi:10.1038 / srep14600. PMC 4600977. PMID 26455903.
- ^ Ackerman, A. Lenore; Underhill, David M. (2017). „Mykobiom lidských močových cest: Potenciální role hub v urologii“. Annals of Translational Medicine. 5 (2): 31. doi:10.21037 / atm.2016.12.69. PMC 5300854. PMID 28217696.
- ^ Nash, AK; Auchtung TA; Wong MC; Smith DP; Gesell JR; Ross MC; Stewart CJ; Metcalf GA; Muzny DM; Gibbs RA; Ajami NJ; Petrosino JF (2017). „Střevní mykobiom zdravé kohorty lidského mikrobiomu“. Mikrobiom. 5 (1): 153. doi:10.1186 / s40168-017-0373-4. PMC 5702186. PMID 29178920.
- ^ Latuga, Mariam Susan; Ellis, Joseph Christopher; Bavlna, Charles Michael; Goldberg, Ronald N; Wynn, James L; Jackson, Robert B; Seed, Patrick C (2011). „Beyond Bacteria: A Study of the Enteric Microbial Consortium in Extremely low pôrodní děti“. PLOS ONE. 6 (12): e27858. Bibcode:2011PLoSO ... 627858L. doi:10.1371 / journal.pone.0027858. PMC 3234235. PMID 22174751.
- ^ Williams, DW; Lewis, MAO (2008). "Orální mikrobiologie: Izolace a identifikace kandidy z ústní dutiny". Orální nemoci. 6 (1): 3–11. doi:10.1111 / j.1601-0825.2000.tb00314.x. PMID 10673781.
- ^ Schuster, G. S (1999). "Orální flóra a patogenní organismy". Kliniky infekčních nemocí v Severní Americe. 13 (4): 757–74, v. doi:10.1016 / s0891-5520 (05) 70107-0. PMID 10579107.
- ^ Salonen, J.H .; Richardson, M.D .; Gallacher, K; Issakainen, J; Helenius, H; Lehtonen, O.-P; Nikoskelainen, J (2000). „Plísňová kolonizace hematologických pacientů léčených cytotoxickou chemoterapií: Vznik rezistentní na azol Saccharomyces cerevisiae ". Journal of Hospital Infection. 45 (4): 293–301. doi:10.1053 / jhin.1999.0718. PMID 10973747.
- ^ Jabra-Rizk, M. A; Ferreira, S. M. S; Sabet, M; Falkler, W. A; Merz, W. G.; Meiller, T. F (2001). „Obnova Candida dubliniensis a dalších kvasinek z parodontálních lézí spojených s virem lidské imunodeficience“. Journal of Clinical Microbiology. 39 (12): 4520–2. doi:10.1128 / JCM.39.12.4520-4522.2001. PMC 88577. PMID 11724873.
- ^ Iatta, Roberta; Napoli, Christian; Borghi, Elisa; Montagna, Maria Teresa (2009). „Vzácné mykózy ústní dutiny: epidemiologický přehled literatury“. Orální chirurgie, orální medicína, orální patologie, orální radiologie a endodontologie. 108 (5): 647–55. doi:10.1016 / j.tripleo.2009.07.010. PMID 19836721.
- ^ A b Ghannoum, Mahmoud A; Jurevic, Richard J; Mukherjee, Pranab K; Cui, Fan; Sikaroodi, Masoumeh; Naqvi, Ammar; Gillevet, Patrick M (2010). „Charakterizace orálního plísňového mikrobiomu (mykobiomu) u zdravých jedinců“. PLOS patogeny. 6 (1): e1000713. doi:10.1371 / journal.ppat.1000713. PMC 2795202. PMID 20072605.
- ^ Dupuy, Amanda K; David, Marika S; Li, Lu; Heider, Thomas N; Peterson, Jason D; Montano, Elizabeth A; Dongari-Bagtzoglou, Anna; Diaz, Patricia I; Strausbaugh, Linda D (2014). „Předefinování lidského orálního mykobiomu pomocí vylepšených postupů v taxonomii založené na amplikonu: objev malassezie jako významného komensála“. PLOS ONE. 9 (3): e90899. Bibcode:2014PLoSO ... 990899D. doi:10,1371 / journal.pone.0090899. PMC 3948697. PMID 24614173.
- ^ Charlson, Emily S; Diamond, Joshua M; Bittinger, Kyle; Fitzgerald, Ayannah S; Yadav, Anjana; Haas, Andrew R; Bushman, Frederic D; Collman, Ronald G (2012). „Plicně obohacené organismy a aberantní bakteriální a plísňové respirační mikrobioty po transplantaci plic“. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 186 (6): 536–45. doi:10,1164 / rccm.201204-0693OC. PMC 3480531. PMID 22798321.