HLA-DRB5 - HLA-DRB5

HLA-DRB5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FV1, 1H15, 1HQR, 1ZGL
Identifikátory
Aliasy	HLA-DRB5, HLA-DRB, hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DR beta 5
Externí ID	OMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 Genové karty: HLA-DRB5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,530,287 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,316,674 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba peptidového antigenu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endocytických váčků; • membrána endocytických váčků potažená klatrinem; • endozom; • Golgiho aparát; • trans-Golgiho síťová membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • membrána pozdního endozomu; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • MHC proteinový komplex třídy II; • lysozomální membrána; • endoplazmatické retikulum; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • endosomová membrána; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• zpracování a prezentace antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • proces imunitního systému; • Kostimulace T buněk; • zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • imunitní odpověď; • Signální dráha receptoru T buněk; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3127
	14969
	ENSG00000198502
	ENSMUSG00000060586
	Q30154
P04231; P04230; P18468; P18469; O78196;
	n / a
	NM_002125
	NM_010382
	NP_002116
	NP_034512
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

HLA třída II histokompatibilní antigen, beta řetězec DRB5 je protein že u lidí je kódován HLA-DRB5 gen.^[5]

Funkce

The protein kódovaný tímto genem patří do HLA třída II řetězec beta paralogy. Molekula třídy II je heterodimer skládající se z alfa (DRA) a beta řetězce (DRB), oba zakotvené v membráně. Hraje ústřední roli v imunitní systém prezentací peptidů odvozených od extracelulárních proteinů. Molekuly třídy II jsou exprimovány v buňky prezentující antigen (APC: B lymfocyty, dendritické buňky, makrofágy).^[5]

Genová struktura a polymorfismy

Beta řetězec je přibližně 26-28 kDa. Je kódován číslem 6 exony exon jeden kóduje vedoucí peptid, exony 2 a 3 kódují dva extracelulární domén, exon 4 kóduje transmembránový doména a exon 5 kóduje cytoplazmatický ocas. V molekule DR obsahuje beta řetězec vše polymorfismy specifikování peptidových vazebných specificit. Stovky DRB1 alely byly popsány a typizace pro tyto polymorfismy se běžně provádí pro transplantaci kostní dřeně a ledvin.^[5]

Genový výraz

DRB1 je vyjádřen na úrovni pětkrát vyšší než jeho paralogy DRB3, DRB4 a DRB5. DRB1 je přítomen u všech jedinců. Alelické varianty DRB1 jsou spojeny buď s žádným, nebo s jedním z genů DRB3, DRB4 a DRB5. Přítomnost DRB5 je spojena s alelickými variantami DRB1, jinak je vynechána. Existují 4 příbuzné pseudogeny: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 a DRB9.^[5]

Viz také

HLA-DR

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198502 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060586 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C ^d „Entrez Gene: HLA-DRB5 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DR beta 5“.

Další čtení

Lau M, Terasaki PI, Park MS (1995). „International Cell Exchange, 1994“. Klinické transplantace: 467–88. PMID 7547576.
Dong RP, Kimura A, Sasazuki T (1992). "Sekvenční analýza tří nových alel DRw14-DRB1". Imunogenetika. 36 (2): 130–3. doi:10.1007 / BF00215291. PMID 1612646. S2CID 32928324.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Nong Y, Kandil O, Tobin EH a kol. (1991). „Hlavní protein HIV p24 inhibuje interferonem-gama indukované zvýšení hladin mRNA těžkého řetězce HLA-DR a cytochromu b v lidské monocytové buněčné linii THP1“. Buňka. Immunol. 132 (1): 10–6. doi:10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-S. PMID 1905983.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Callahan KM, Fort MM, Obah EA a kol. (1990). „Genetická variabilita HIV-1 gp120 ovlivňuje interakce s molekulami HLA a receptorem T buněk“. J. Immunol. 144 (9): 3341–6. PMID 1970352.
Petersdorf EW, Griffith RL, Erlich HA a kol. (1990). "Unikátní sekvence pro dva geny HLA-DRB1 exprimované na odlišných haplotypech DRw6". Imunogenetika. 32 (2): 96–103. doi:10.1007 / BF00210446. PMID 1975801. S2CID 28007432.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza zbytků v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). „Alelická diverzita je generována intraexonovou výměnou sekvencí na DRB1 lokusu primátů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (9): 3686–90. Bibcode:1991PNAS ... 88.3686G. doi:10.1073 / pnas.88.9.3686. PMC 51517. PMID 2023919.
Lee KW, Johnson AH, Hurley CK (1990). „Dvě odlišné cesty evoluce vedly k vzniku haplotypů DRw13“. J. Immunol. 145 (9): 3119–25. PMID 2212675.
Gorski J (1989). „Polymorfismus beta-řetězce HLA-DR. Polymorfismus druhé domény odráží evoluční příbuznost alel a může vysvětlovat veřejné sérologické epitopy.“ J. Immunol. 143 (1): 329–33. PMID 2471740.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989 Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Hurley CK, Gregersen PK, Gorski J a kol. (1989). „Haplotyp DR3 (w18), DQw4 se liší od haplotypů DR3 (w17), DQw2 na více lokusech třídy II“. Hučení. Immunol. 25 (1): 37–50. doi:10.1016/0198-8859(89)90068-2. PMID 2565895.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Freeman SM, Saunders TL, Madden M a kol. (1987). "Srovnání alel DR beta 1 od diabetiků a normálních jedinců". Hučení. Immunol. 19 (1): 1–6. doi:10.1016/0198-8859(87)90033-4. PMID 2884201.
Lee BS, Rust NA, McMichael AJ, McDevitt HO (1987). „Podtypy HLA-DR2 tvoří další supertypickou rodinu alel DR beta“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (13): 4591–5. Bibcode:1987PNAS ... 84.4591L. doi:10.1073 / pnas.84.13.4591. PMC 305136. PMID 2885840.
Owerbach D, Rich C, Taneja K (1986). "Charakterizace tří HLA-DR beta genů izolovaných od HLA-DR 3/4 inzulín-dependentního diabetického pacienta". Imunogenetika. 24 (1): 41–6. doi:10.1007 / BF00372296. PMID 3015788. S2CID 19599710.
Wu S, Saunders TL, Bach FH (1987). „Polymorfismus lidských antigenu Ia generovaný vzájemnou intergenní výměnou mezi dvěma lokusy DR beta“. Příroda. 324 (6098): 676–9. doi:10.1038 / 324676a0. PMID 3099214. S2CID 4365990.
Liu CP, Bach FH, Wu SK (1988). „Molekulární studie vzácného haplotypu HLA třídy II DR2 / LD-5a / DQw3. Několik genetických mechanismů při generování polymorfních genů HLA třídy II“. J. Immunol. 140 (10): 3631–9. PMID 3129499.
Steimle V, Hinkkanen A, Schlesier M, Epplen JT (1988). "Nová HLA-DR beta I sekvence z haplotypu DRw11". Imunogenetika. 28 (3): 208–10. doi:10.1007 / BF00375861. PMID 3137159. S2CID 2712069.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198502 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000060586 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Entrez_Gene_3127-5] A ^b ^C ^d „Entrez Gene: HLA-DRB5 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DR beta 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace