HLA-DPB1 - HLA-DPB1

HLA-DPB1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M
Identifikátory
Aliasy	HLA-DPB1, DPB1, HLA-DP, HLA-DP1B, HLA-DPB, hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DP beta 1
Externí ID	OMIM: 142858 HomoloGene: 129927 Genové karty: HLA-DPB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	33,089,696 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba peptidového antigenu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endocytických váčků; • membrána endocytických váčků potažená klatrinem; • endozom; • Golgiho aparát; • trans-Golgiho síťová membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • MHC proteinový komplex třídy II; • povrch buňky; • lysozomální membrána; • endoplazmatické retikulum; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • endosomová membrána;
Biologický proces	• zpracování a prezentace antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • proces imunitního systému; • Kostimulace T buněk; • pozitivní regulace produkce interferonu-gama; • zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • pozitivní regulace aktivace T buněk; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • imunitní odpověď; • Signální dráha receptoru T buněk; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3115
	n / a
ENSG00000236693; ENSG00000230708; ENSG00000229295; ENSG00000226826; ENSG00000215048;
	ENSG00000223865; ENSG00000230763; ENSG00000237710
	n / a
	P04440
	n / a
	NM_002121
	n / a
	NP_002112
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

HLA třída II histokompatibilního antigenu, DP (W2) beta řetězec je protein že u lidí je kódován HLA-DPB1 gen.

HLA-DPB patří k paralogům beta řetězce HLA třídy II. Tato molekula třídy II je heterodimer skládající se z alfa (DPA) a beta řetězce (DPB), oba zakotvené v membráně. Hraje ústřední roli v imunitním systému tím, že prezentuje peptidy odvozené od extracelulárních proteinů. Molekuly třídy II jsou exprimovány v buňkách prezentujících antigen (APC: B lymfocyty, dendritické buňky, makrofágy). Beta řetězec má přibližně 26-28 kDa a jeho gen obsahuje 6 exonů. Exon jedna kóduje vedoucí peptid, exony 2 a 3 kódují dvě extracelulární domény, exon 4 kóduje transmembránovou doménu a exon 5 kóduje cytoplazmatický konec. V molekule DP obsahuje jak alfa řetězec, tak i beta řetězec polymorfismy specifikující peptidové vazebné specificity, což má za následek až 4 různé molekuly.^[3]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000230708, ENSG00000229295, ENSG00000226826, ENSG00000215048, ENSG00000223865, ENSG00000230763, ENSG00000237710 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000236693, ENSG00000230708, ENSG00000229295, ENSG00000226826, ENSG00000215048, ENSG00000223865, ENSG00000230763, ENSG00000237710 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: HLA-DPB1 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DP beta 1“.

Další čtení

Mitsunaga S, Kuwata S, Tokunaga K a kol. (1992). „Rodinná studie polymorfismu HLA-DPB1: analýza propojení s HLA-DR / DQ a dvěma„ novými “alelami. Hučení. Immunol. 34 (3): 203–11. doi:10.1016/0198-8859(92)90113-2. PMID 1358867.
Marsh SG, Bodmer JG (1993). „Nukleotidové sekvence HLA třídy II, 1992“. Tkáňové antigeny. 40 (5): 229–43. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb02050.x. PMID 1362295.
Eiermann TH, Uhl S, Fakler J, Goldmann SF (1992). „Nová sekvence HLA-DPB1, DPB1 * 2301“. Tkáňové antigeny. 40 (2): 108–10. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01969.x. PMID 1412416.
Korioth F, Hartung K, Deicher H, Frey J (1992). „Nová alela HLA-DPB1 od pacienta se systémovým lupus erythematodes“. Tkáňové antigeny. 39 (4): 216–9. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb01938.x. PMID 1529429.
de Koster HS, Kenter MJ, D'Amaro J a kol. (1991). "Pozitivní korelace mezi typizací oligonukleotidů a rozpoznáváním T-buněk molekul HLA-DP". Imunogenetika. 34 (1): 12–22. doi:10.1007 / BF00212307. PMID 1713190. S2CID 21845822.
Vanderbeeken YE, Duchateau J, Colle H a kol. (1991). „Modulace antigenu HLA třídy II na molekulární úrovni mateřským sérem mezi buňkami pupečníkové krve a nepříbuznými lymfocyty“. Oblouk. Gynecol. Obstet. 248 (4): 199–209. doi:10.1007 / BF02390359. PMID 1832848. S2CID 25184115.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza reziduí v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami komplexu histokompatibility třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Bugawan TL, Begovich AB, Erlich HA (1990). „Rychlá HLA-DPB typizace pomocí enzymaticky amplifikované DNA a neradioaktivních sekvenčně specifických oligonukleotidových sond“. Imunogenetika. 32 (4): 231–41. doi:10.1007 / BF00187094. PMID 2242906. S2CID 39873046.
Lair B, Alber C, Yu WY a kol. (1988). "Nově charakterizovaná alela beta-řetězce HLA-DP. Důkaz heterogenity DP beta v rámci specificity DPw4". J. Immunol. 141 (4): 1353–7. PMID 2456351.
Bugawan TL, Horn GT, Long CM a kol. (1988). „Analýza polymorfismu alelické sekvence HLA-DP pomocí in vitro enzymatické DNA amplifikace lokusů DP-alfa a DP-beta“. J. Immunol. 141 (11): 4024–30. PMID 2460556.
Begovich AB, Bugawan TL, Nepom BS a kol. (1990). „Specifická alela HLA-DP beta je spojena s pauciartikulární juvenilní revmatoidní artritidou, ale ne s dospělou revmatoidní artritidou“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (23): 9489–93. doi:10.1073 / pnas.86.23.9489. PMC 298522. PMID 2512583.
Scholl P, Diez A, Mourad W a kol. (1989). "Toxický šokový syndrom toxin 1 se váže na hlavní molekuly histokompatibilního komplexu třídy II". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (11): 4210–4. doi:10.1073 / pnas.86.11.4210. PMC 287420. PMID 2542966.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Lee JS, Sartoris S, Briata P a kol. (1989). "Sekvenční polymorfismus HLA-DP beta řetězců". Imunogenetika. 29 (5): 346–9. doi:10.1007 / BF00352845. PMID 2714855. S2CID 13414587.
Compagnone-Post P, Turco E, Robinson C, Trucco M (1988). „Beta-řetězce molekul DP4 z různých haplotypů jsou kódovány stejným genem“. Genomika. 2 (1): 8–13. doi:10.1016/0888-7543(88)90103-6. PMID 2838415.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Ando A, Inoko H, Kimura M a kol. (1987). „Izolace a alelický polymorfismus klonů cDNA a genomových klonů těžkých a lehkých řetězců HLA-DP“. Hučení. Immunol. 17 (3): 355–67. doi:10.1016/0198-8859(86)90286-7. PMID 2878910.
Kelly A, Trowsdale J (1985). „Kompletní nukleotidová sekvence funkčního genu HLA-DP beta a oblast mezi geny DP beta 1 a DP alfa 1: srovnání 5 'konců genů HLA třídy II“. Nucleic Acids Res. 13 (5): 1607–21. doi:10.1093 / nar / 13.5.1607. PMC 341099. PMID 2987832.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000230708, ENSG00000229295, ENSG00000226826, ENSG00000215048, ENSG00000223865, ENSG00000230763, ENSG00000237710 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000236693, ENSG00000230708, ENSG00000229295, ENSG00000226826, ENSG00000215048, ENSG00000223865, ENSG00000230763, ENSG00000237710 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Entrez Gene: HLA-DPB1 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DP beta 1“.

[1]

[2]

[3]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace