HLA-DMA - HLA-DMA

HLA-DMA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1HDM, 2BC4, 4FQX, 4 GBX
Identifikátory
Aliasy	HLA-DMA, D6S222E, DMA, HLADM, RING6, hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DM alfa
Externí ID	OMIM: 142855 MGI: 95921 HomoloGene: 4464 Genové karty: HLA-DMA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,969,094 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,139,101 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba proteinového komplexu MHC třídy II; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • povrch buňky; • endozom; • lysozom; • extracelulární exosom; • membrána pozdního endozomu; • membrána; • lysozomální membrána; • MHC proteinový komplex třídy II; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • sestava peptidového antigenu s proteinovým komplexem MHC třídy II; • zpracování a prezentace antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • imunitní odpověď; • proces imunitního systému; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3108
	14998
ENSG00000243215; ENSG00000243719; ENSG00000239463; ENSG00000204257; ENSG00000242361;
	ENSG00000241394; ENSG00000243189; ENSG00000242685
	ENSMUSG00000037649
	P28067
	P28078; Q31621
	NM_006120
	NM_010386; NM_001360530
	n / a
	NP_034516; NP_001347459
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

HLA třída II histokompatibilního antigenu, DM alfa řetězec je protein že u lidí je kódován HLA-DMA gen.^[5]^[6]

HLA-DMA patří k paralogům alfa řetězce HLA třídy II. Tato molekula třídy II je heterodimer skládající se z alfa (DMA) a beta řetězce (DMB), oba zakotvené v membráně. Nachází se v intracelulárních vezikulách. DM hraje ústřední roli v peptidovém plnění molekul MHC třídy II tím, že pomáhá uvolňovat molekulu CLIP z vazebného místa peptidu. Molekuly třídy II jsou exprimovány v buňkách prezentujících antigen (APC: B lymfocyty, dendritické buňky, makrofágy). Alfa řetězec má přibližně 33-35 kDa a jeho gen obsahuje 5 exonů. Exon jedna kóduje vedoucí peptid, exony 2 a 3 kódují dvě extracelulární domény, exon 4 kóduje transmembránovou doménu a cytoplazmatický ocas.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000243719, ENSG00000239463, ENSG00000204257, ENSG00000242361, ENSG00000241394, ENSG00000243189, ENSG00000242685 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000243215, ENSG00000243719, ENSG00000239463, ENSG00000204257, ENSG00000242361, ENSG00000241394, ENSG00000243189, ENSG00000242685 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037649 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kelly A, Powis SH, Glynne R, Radley E, Beck S, Trowsdale J (listopad 1991). „Druhý gen související s proteazomem v oblasti lidské MHC třídy II“. Příroda. 353 (6345): 667–8. Bibcode:1991 Natur.353..667K. doi:10.1038 / 353667a0. PMID 1922385. S2CID 4344064.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HLA-DMA hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DM alfa“.

Další čtení

Vogt AB, Kropshofer H (1999). „HLA-DM - endosomální a lysozomální chaperon pro imunitní systém“. Trends Biochem. Sci. 24 (4): 150–4. doi:10.1016 / S0968-0004 (99) 01364-X. PMID 10322421.
Kropshofer H, Hämmerling GJ, Vogt AB (2000). „Dopad neklasických MHC proteinů HLA-DM a HLA-DO na zatížení molekul MHC třídy II“. Immunol. Rev. 172: 267–78. doi:10.1111 / j.1600-065X.1999.tb01371.x. PMID 10631952. S2CID 22216172.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Kelly AP, Monaco JJ, Cho SG, Trowsdale J (1991). „Nový lokus související s lidskou HLA třídou II, DM“. Příroda. 353 (6344): 571–3. Bibcode:1991Natur.353..571K. doi:10.1038 / 353571a0. PMID 1922365. S2CID 3065226.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza zbytků v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989 Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Andrieu JM, Even P, Venet A (1986). „AIDS a příbuzné syndromy jako autoimunitní onemocnění imunitního systému vyvolané viry: porucha anti-MHC II. Terapeutické důsledky“. Výzkum AIDS. 2 (3): 163–74. doi:10.1089 / podpora.1.1986.2.163. PMID 3489470.
Houlgatte R, Scarmato P, el Marhomy S, et al. (1994). „Antigeny HLA třídy II a HIV obalový glykoprotein gp120 se vážou na stejnou stranu CD4“. J. Immunol. 152 (9): 4475–88. PMID 7512597.
Chirmule N, McCloskey TW, Hu R a kol. (1995). „HIV gp120 inhibuje aktivaci T buněk interferencí s expresí kostimulačních molekul ligandu CD40 a CD80 (B71)“. J. Immunol. 155 (2): 917–24. PMID 7541827.
Rowell JF, Stanhope PE, Siliciano RF (1995). „Endocytóza endogenně syntetizovaného obalového proteinu HIV-1. Mechanismus a role při zpracování pro spojení s MHC třídy II“. J. Immunol. 155 (1): 473–88. PMID 7602119.
Carrington M, Harding A (1994). "Sekvenční analýza dvou nových alel HLA-DMA". Imunogenetika. 40 (2): 165. doi:10.1007 / BF00188184. PMID 8026867. S2CID 27287261.
Radley E, Alderton RP, Kelly A a kol. (1994). "Genomická organizace HLA-DMA a HLA-DMB. Porovnání genové organizace všech šesti rodin třídy II v lidském hlavním histokompatibilním komplexu". J. Biol. Chem. 269 (29): 18834–8. PMID 8034636.
Chen YH, Böck G, Vornhagen R a kol. (1994). „HIV-1 gp41 vázající proteiny a protilátky proti gp41 mohou inhibovat zvýšení exprese lidských Raji buněk MHC třídy I a II pomocí gp41“. Mol. Immunol. 31 (13): 977–82. doi:10.1016/0161-5890(94)90092-2. PMID 8084338.
Fling SP, Arp B, Pious D (1994). „Geny HLA-DMA a -DMB jsou oba potřebné pro tvorbu komplexu MHC třídy II / peptid v buňkách prezentujících antigen“. Příroda. 368 (6471): 554–8. Bibcode:1994 Natur.368..554F. doi:10.1038 / 368554a0. PMID 8139690. S2CID 4307699.
Chirmule N, Wang XP, Hu R a kol. (1994). „Obálky glykoproteinů HIV-1 interferují s diferenciací B buněk závislou na T buňkách: role interakce CD4-MHC třídy II v efektorové fázi pomoci T buněk“. Buňka. Immunol. 155 (1): 169–82. doi:10.1006 / cimm.1994.1110. PMID 8168144.
Sanderson F, Powis SH, Kelly AP, Trowsdale J (1993). „Omezený polymorfismus v HLA-DM nezahrnuje drážku pro vázání peptidů“. Imunogenetika. 39 (1): 56–8. doi:10.1007 / bf00171797. PMID 8225438. S2CID 27369392.
Callahan KM, Rowell JF, Soloski MJ a kol. (1993). „Obalový protein HIV-1 je exprimován na povrchu infikovaných buněk před jeho zpracováním a prezentací na T lymfocyty omezené na třídu II“. J. Immunol. 151 (6): 2928–42. PMID 8376762.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000243719, ENSG00000239463, ENSG00000204257, ENSG00000242361, ENSG00000241394, ENSG00000243189, ENSG00000242685 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000243215, ENSG00000243719, ENSG00000239463, ENSG00000204257, ENSG00000242361, ENSG00000241394, ENSG00000243189, ENSG00000242685 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037649 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1922385-5] Kelly A, Powis SH, Glynne R, Radley E, Beck S, Trowsdale J (listopad 1991). „Druhý gen související s proteazomem v oblasti lidské MHC třídy II“. Příroda. 353 (6345): 667–8. Bibcode:1991 Natur.353..667K. doi:10.1038 / 353667a0. PMID 1922385. S2CID 4344064.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HLA-DMA hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DM alfa“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace