HLA-DOB - HLA-DOB

HLA-DOB
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4I0P
Identifikátory
Aliasy	HLA-DOB, DOB, hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DO beta, HLA_DOB
Externí ID	OMIM: 600629 MGI: 95925 HomoloGene: 1602 Genové karty: HLA-DOB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,820,466 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,254,414 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita receptoru MHC třídy II; • Vazba proteinového komplexu MHC třídy II;
Buněčná složka	• lysozomální membrána; • endosomová membrána; • lysozom; • membrána; • endozom; • integrální součást membrány; • intracelulární; • MHC proteinový komplex třídy II;
Biologický proces	• negativní regulace zpracování antigenu a prezentace peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • zpracování a prezentace antigenu; • proces imunitního systému; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • imunitní odpověď; • signální transdukce; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3112
	15002
ENSG00000243496; ENSG00000241910; ENSG00000243612; ENSG00000239457; ENSG00000241386;
	ENSG00000241106
	ENSMUSG00000041538
	P13765
	n / a
	NM_002120
	NM_010389
	NP_002111
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

HLA třída II histokompatibilního antigenu, DO beta řetězec je protein že u lidí je kódován HLA-DOB gen.^[5]

HLA-DOB patří k paralogům beta řetězce HLA třídy II. Tato molekula třídy II je heterodimer skládající se z alfa (DOA) a beta řetězce (DOB), oba zakotvené v membráně. Nachází se v intracelulárních vezikulách. DO potlačuje peptidovou zátěž molekul MHC třídy II inhibicí HLA-DM. Molekuly třídy II jsou exprimovány v buňkách prezentujících antigen (APC: B lymfocyty, dendritické buňky, makrofágy). Beta řetězec má přibližně 26-28 kDa a jeho gen obsahuje 6 exonů. Exon jedna kóduje vedoucí peptid, exony 2 a 3 kódují dvě extracelulární domény, exon 4 kóduje transmembránovou doménu a exon 5 kóduje cytoplazmatický konec.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000241910, ENSG00000243612, ENSG00000239457, ENSG00000241386, ENSG00000241106 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000243496, ENSG00000241910, ENSG00000243612, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041538 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HLA-DOB hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DO beta“.

Další čtení

Beck S, Kelly A, Radley E a kol. (1992). "DNA sekvenční analýza 66 kb oblasti lidského MHC třídy II kódující shluk genů pro zpracování antigenu". J. Mol. Biol. 228 (2): 433–41. doi:10.1016/0022-2836(92)90832-5. PMID 1453454.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza zbytků v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami histokompatibilního komplexu třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Jonsson AK, Rask L (1989). "Lidské geny DNA třídy II a DOB vykazují nízkou variabilitu sekvencí". Imunogenetika. 29 (6): 411–3. doi:10.1007 / BF00375872. PMID 2499532. S2CID 5481750.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989 Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Tonnelle C, DeMars R, Long EO (1986). „DO beta: nový gen řetězce beta v HLA-D se zřetelnou regulací exprese“. EMBO J.. 4 (11): 2839–47. doi:10.1002 / j.1460-2075.1985.tb04012.x. PMC 554587. PMID 2998758.
Servenius B, Rask L, Peterson PA (1987). „Geny třídy II lidského hlavního histokompatibilního komplexu. DO gen je rozdílným členem rodiny genů beta třídy II.“ J. Biol. Chem. 262 (18): 8759–66. PMID 3036827.
Andrieu JM, Even P, Venet A (1986). „AIDS a příbuzné syndromy jako autoimunitní onemocnění imunitního systému vyvolané viry: porucha anti-MHC II. Terapeutické důsledky“. Výzkum AIDS. 2 (3): 163–74. doi:10.1089 / podpora.1.1986.2.163. PMID 3489470.
Houlgatte R, Scarmato P, el Marhomy S, et al. (1994). „Antigeny HLA třídy II a HIV obalový glykoprotein gp120 se vážou na stejnou stranu CD4“. J. Immunol. 152 (9): 4475–88. PMID 7512597.
Chirmule N, McCloskey TW, Hu R a kol. (1995). „HIV gp120 inhibuje aktivaci T buněk interferencí s expresí kostimulačních molekul ligandu CD40 a CD80 (B71)“. J. Immunol. 155 (2): 917–24. PMID 7541827.
Rowell JF, Stanhope PE, Siliciano RF (1995). „Endocytóza endogenně syntetizovaného obalového proteinu HIV-1. Mechanismus a role při zpracování pro spojení s MHC třídy II“. J. Immunol. 155 (1): 473–88. PMID 7602119.
Chen YH, Böck G, Vornhagen R a kol. (1994). „HIV-1 gp41 vázající proteiny a protilátky proti gp41 mohou inhibovat zvýšení exprese lidských Raji buněk MHC třídy I a II pomocí gp41“. Mol. Immunol. 31 (13): 977–82. doi:10.1016/0161-5890(94)90092-2. PMID 8084338.
Chirmule N, Wang XP, Hu R a kol. (1994). „Obálky glykoproteinů HIV-1 interferují s diferenciací B buněk závislou na T buňkách: role interakce CD4-MHC třídy II v efektorové fázi pomoci T buněk“. Buňka. Immunol. 155 (1): 169–82. doi:10.1006 / cimm.1994.1110. PMID 8168144.
Callahan KM, Rowell JF, Soloski MJ a kol. (1993). „Obalový protein HIV-1 je exprimován na povrchu infikovaných buněk před jeho zpracováním a prezentací na T lymfocyty omezené na třídu II“. J. Immunol. 151 (6): 2928–42. PMID 8376762.
Glynne R, Kerr LA, Mockridge I a kol. (1993). "Hlavní složka proteazomu kódovaná histokompatibilním komplexem LMP7: alternativní první exony a posttranslační zpracování". Eur. J. Immunol. 23 (4): 860–6. doi:10.1002 / eji.1830230414. PMID 8458375.
Beck S, Abdulla S, Alderton RP a kol. (1996). "Evoluční dynamika nekódujících sekvencí v oblasti třídy II lidského MHC". J. Mol. Biol. 255 (1): 1–13. doi:10.1006 / jmbi.1996.0001. PMID 8568858.
Liljedahl M, Kuwana T, Fung-Leung WP a kol. (1996). „HLA-DO je rezidentem lysozomu, který vyžaduje spojení s HLA-DM pro efektivní intracelulární transport“. EMBO J.. 15 (18): 4817–24. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00862.x. PMC 452218. PMID 8890155.
Ruff AL, Guarnieri FG, Staveley-O'Carroll K, et al. (1997). „Zvýšená imunitní reakce na produkt chimérického genu HIV gp160 / LAMP zaměřený na cestu přenosu proteinu membránového proteinu lysozomu“. J. Biol. Chem. 272 (13): 8671–8. doi:10.1074 / jbc.272.13.8671. PMID 9079699.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000241910, ENSG00000243612, ENSG00000239457, ENSG00000241386, ENSG00000241106 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000243496, ENSG00000241910, ENSG00000243612, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457, ENSG00000239457 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041538 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: HLA-DOB hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DO beta“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace