HLA-DQA2 - HLA-DQA2

HLA-DQA2
Identifikátory
Aliasy	HLA-DQA2, DX-ALPHA, HLA-DXA, HLA-DQA2 (gen), hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DQ alfa 2, DC-alfa, HLA-DCA
Externí ID	OMIM: 613503 HomoloGene: 134076 Genové karty: HLA-DQA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,747,198 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita receptoru MHC třídy II;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endocytických váčků; • membrána endocytických váčků potažená klatrinem; • endozom; • Golgiho aparát; • trans-Golgiho síťová membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • MHC proteinový komplex třídy II; • lysozomální membrána; • endoplazmatické retikulum; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • lysozom; • integrální součást lumenální strany membrány endoplazmatického retikula; • endosomová membrána;
Biologický proces	• zpracování a prezentace antigenu; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • proces imunitního systému; • zpracování antigenu a prezentace peptidového nebo polysacharidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • imunitní odpověď; • Signální dráha receptoru T buněk; • adaptivní imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3118
	n / a
ENSG00000231823; ENSG00000206301; ENSG00000257473; ENSG00000231526; ENSG00000225103;
	ENSG00000237541; ENSG00000223793; ENSG00000233192
	n / a
	P01906
	n / a
	NM_020056
	n / a
	NP_064440
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

HLA třída II histokompatibilního antigenu, DQ (6) alfa řetězec je protein že u lidí je kódován HLA-DQA2 gen. Také známý jako HLA-DXA nebo DAAP-381D23.2, je součástí lidský leukocytový antigen Systém.^[3]

The protein kódovaný tímto genem je exprimován, ale na rozdíl od HLA-DQA1, zjevně není schopen heterodimerizace s HLA třída II řetězec beta paralogy.^[4] Nízká úroveň exprese HLA-DQA2 je zjevně způsobena narušením transkripční faktor vazba na gen HLA-DQA2 promotér.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000206301, ENSG00000257473, ENSG00000231526, ENSG00000225103, ENSG00000237541, ENSG00000223793, ENSG00000233192 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000231823, ENSG00000206301, ENSG00000257473, ENSG00000231526, ENSG00000225103, ENSG00000237541, ENSG00000223793, ENSG00000233192 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: HLA-DQA2 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DQ alfa 2“.
^ Rudy GB, Lew AM (březen 1997). „Nepolymorfní izotyp MHC třídy II, HLA-DQA2, je exprimován na povrchu B lymfoblastoidních buněk“. J. Immunol. 158 (5): 2116–25. PMID 9036956.
^ Indovina P, Megiorni F, Fontemaggi G, Coni P, Mora B, Mazzilli MC (květen 2001). „Absence in vivo interakcí DNA-protein v promotorových oblastech DQA2 a DQB2“. Hučení. Immunol. 62 (5): 504–8. doi:10.1016 / S0198-8859 (01) 00236-1. PMID 11334674.

Další čtení

Marsh SG, Bodmer JG (1993). „Nukleotidové sekvence HLA třídy II, 1992“. Tkáňové antigeny. 40 (5): 229–43. doi:10.1111 / j.1399-0039.1992.tb02050.x. PMID 1362295.
Kenter M, Otting N, Anholts J a kol. (1992). "Evoluční vztahy mezi alelami Mhc-DQA1 a DQA2 primátů". Imunogenetika. 36 (2): 71–8. doi:10.1007 / BF00215282. PMID 1612647. S2CID 43642526.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F a kol. (1991). "Interakce CD4 s antigeny HLA třídy II a HIV gp120". Imunogenetika. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). „HIV-gp120 může blokovat adhezi zprostředkovanou MHC třídy II MHC“. J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). „Identifikace a strukturní analýza reziduí v oblasti V1 CD4 podílejících se na interakci s obalovým glykoproteinem gp120 viru lidské imunodeficience a hlavními molekulami komplexu histokompatibility třídy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Gyllensten UB, Erlich HA (1990). „Starověké kořeny polymorfismu na lokusu HLA-DQ alfa u primátů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (24): 9986–90. doi:10.1073 / pnas.86.24.9986. PMC 298627. PMID 2513578.
Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifikace lidských zbytků CD4 ovlivňujících MHC třídy II versus vazba HIV-1 gp120". Příroda. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989 Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T a kol. (1988). "Inhibice funkce CD4 + T buněk pomocí HIV obalového proteinu, gp120". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Jonsson AK, Hyldig-Nielsen JJ, Servenius B a kol. (1987). "Geny třídy II lidského hlavního histokompatibilního komplexu. Porovnání genů alfa a beta DQ a DX". J. Biol. Chem. 262 (18): 8767–77. PMID 3036828.
Horn GT, Bugawan TL, Long CM a kol. (1988). „Sekvenční analýza genů HLA třídy II od diabetiků závislých na inzulínu“. Hučení. Immunol. 21 (4): 249–63. doi:10.1016/0198-8859(88)90034-1. PMID 3372263.
Andrieu JM, Even P, Venet A (1986). „AIDS a příbuzné syndromy jako autoimunitní onemocnění imunitního systému vyvolané viry: porucha anti-MHC II. Terapeutické důsledky“. Výzkum AIDS. 2 (3): 163–74. doi:10.1089 / podpora.1.1986.2.163. PMID 3489470.
Auffray C, Lillie JW, Korman AJ a kol. (1987). „Struktura a exprese genů HLA-DQ alfa a -DX alfa: interallelické alternativní sestřih genu HLA-DQ alfa a funkční sestřih genu HLA-DQ alfa pomocí retrovirového vektoru“. Imunogenetika. 26 (1–2): 63–73. doi:10.1007 / bf00345456. PMID 3610256. S2CID 19758795.
Trowsdale J, Lee J, Carey J a kol. (1983). „Sekvence související s HLA-DR alfa řetězcem na lidském chromozomu 6: polymorfismus restrikčních enzymů detekován sondami DC alfa řetězce“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 80 (7): 1972–6. Bibcode:1983PNAS ... 80.1972T. doi:10.1073 / pnas.80.7.1972. PMC 393734. PMID 6300884.
Auffray C, Lillie JW, Arnot D a kol. (1984). "Izotypová a alotypová variace genů alfa-řetězce histokompatibility antigenu lidské třídy II". Příroda. 308 (5957): 327–33. Bibcode:1984Natur.308..327A. doi:10.1038 / 308327a0. PMID 6584734. S2CID 4358124.
Houlgatte R, Scarmato P, el Marhomy S, et al. (1994). „Antigeny HLA třídy II a HIV obalový glykoprotein gp120 se vážou na stejnou stranu CD4“. J. Immunol. 152 (9): 4475–88. PMID 7512597.
Chirmule N, McCloskey TW, Hu R a kol. (1995). „HIV gp120 inhibuje aktivaci T buněk interferencí s expresí kostimulačních molekul ligandu CD40 a CD80 (B71)“. J. Immunol. 155 (2): 917–24. PMID 7541827.
Rowell JF, Stanhope PE, Siliciano RF (1995). „Endocytóza endogenně syntetizovaného obalového proteinu HIV-1. Mechanismus a role při zpracování pro spojení s MHC třídy II“. J. Immunol. 155 (1): 473–88. PMID 7602119.
Rudy G, Lew AM (1994). „Omezený polymorfismus promotoru HLA-DQA2 a identifikace variantního oktameru“. Hučení. Immunol. 39 (3): 225–9. doi:10.1016 / 0198-8859 (94) 90264-X. PMID 8026991.
Chen YH, Böck G, Vornhagen R a kol. (1994). „HIV-1 gp41 vázající proteiny a protilátky proti gp41 mohou inhibovat zvýšení exprese lidských Raji buněk MHC třídy I a II pomocí gp41“. Mol. Immunol. 31 (13): 977–82. doi:10.1016/0161-5890(94)90092-2. PMID 8084338.
Chirmule N, Wang XP, Hu R a kol. (1994). „Obálky glykoproteinů HIV-1 interferují s diferenciací B buněk závislou na T buňkách: role interakce CD4-MHC třídy II v efektorové fázi pomoci T buněk“. Buňka. Immunol. 155 (1): 169–82. doi:10.1006 / cimm.1994.1110. PMID 8168144.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000206301, ENSG00000257473, ENSG00000231526, ENSG00000225103, ENSG00000237541, ENSG00000223793, ENSG00000233192 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000231823, ENSG00000206301, ENSG00000257473, ENSG00000231526, ENSG00000225103, ENSG00000237541, ENSG00000223793, ENSG00000233192 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-3] „Entrez Gene: HLA-DQA2 hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DQ alfa 2“.

[pmid9036956-4] Rudy GB, Lew AM (březen 1997). „Nepolymorfní izotyp MHC třídy II, HLA-DQA2, je exprimován na povrchu B lymfoblastoidních buněk“. J. Immunol. 158 (5): 2116–25. PMID 9036956.

[pmid11334674-5] Indovina P, Megiorni F, Fontemaggi G, Coni P, Mora B, Mazzilli MC (květen 2001). „Absence in vivo interakcí DNA-protein v promotorových oblastech DQA2 a DQB2“. Hučení. Immunol. 62 (5): 504–8. doi:10.1016 / S0198-8859 (01) 00236-1. PMID 11334674.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Hlavní komplex histokompatibility třídy
MHC třída I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC třídy II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
jiný	Lidský leukocytový antigen Drobný histokompatibilní antigen Krevní transfúze Arrestin Calgranulin Systémy lidských krevních skupin Molekuly buněčné adheze Shluk diferenciace