CDKN2D - CDKN2D - Wikipedia

CDKN2D
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1BD8, 1BI8
Identifikátory
Aliasy	CDKN2D, INK4D, p19, p19-INK4D, inhibitor cyklin-dependentní kinázy 2D, inhibitor cyklin-dependentní kinázy 2D
Externí ID	OMIM: 600927 MGI: 105387 HomoloGene: 36081 Genové karty: CDKN2D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	10,569,059 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	21,291,407 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru serin / threonin kinázy závislá na cyklinu; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • komplex cyklin D2-CDK4;
Biologický proces	• Syntéza DNA zapojená do opravy DNA; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • reakce na vitamin D.; • reakce na kyselinu retinovou; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na poškození DNA; • negativní regulace buněčného růstu; • zástava buněčného cyklu; • buněčný cyklus; • negativní regulace fosforylace; • reakce na UV; • autofagická buněčná smrt; • negativní regulace buněčné proliferace; • smyslové vnímání zvuku; • negativní regulace fázového přechodu G1 / S buněčného cyklu; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • negativní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • negativní regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1032
	12581
	ENSG00000129355
	ENSMUSG00000096472
	P55273
	Q60773
	NM_079421; NM_001800
	NM_009878
	NP_001791; NP_524145
	NP_034008
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor kinázy 4 závislý na cyklinu D. je enzym že u lidí je kódován CDKN2D gen.^[5]^[6]

The protein tímto zakódováno gen je členem Rodina INK4 cyklin-dependentní kinázy inhibitory. Ukázalo se, že tento protein tvoří stabilní komplex s CDK4 nebo CDK6 a zabránit aktivaci CDK kinázy, tedy funguje jako regulátor růstu buněk, který řídí buněčný cyklus G1 postup. Bylo zjištěno, že hojnost transkriptu tohoto genu osciluje způsobem závislým na buněčném cyklu s nejnižší expresí v polovině G1 a maximální expresí během S fáze. Ukázalo se, že negativní regulace buněčného cyklu zapojeného do tohoto proteinu se podílí na represi neuronální šíření, jakož i spermatogeneze. Byly popsány dvě alternativně sestříhané varianty tohoto genu, které kódují identický protein.^[6]

Tento protein by neměl být zaměňován s p19-ARF (myší) nebo lidským ekvivalentem p14ARF, což jsou alternativní produkty CDKN2A gen.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129355 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000096472 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Okuda T, Hirai H, Valentine VA, Shurtleff SA, Kidd VJ, Lahti JM, Sherr CJ, Downing JR (březen 1996). "Molekulární klonování, vzor exprese a chromozomální lokalizace lidské CDKN2D / INK4d, inhibitoru cyklin D-závislých kináz". Genomika. 29 (3): 623–30. doi:10.1006 / geno.1995.9957. PMID 8575754.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CDKN2D inhibitor cyklin-dependentní kinázy 2D (p19, inhibuje CDK4)“.

Další čtení

Hirai H, Roussel MF, Kato JY a kol. (1995). „Nové proteiny INK4, p19 a p18, jsou specifickými inhibitory cyklin D-dependentních kináz CDK4 a CDK6“. Mol. Buňka. Biol. 15 (5): 2672–81. doi:10.1128 / MCB.15.5.2672. PMC 230497. PMID 7739547.
Chan FK, Zhang J, Cheng L a kol. (1995). "Identifikace lidského a myšího p19, nového inhibitoru CDK4 a CDK6 s homologií k p16ink4". Mol. Buňka. Biol. 15 (5): 2682–8. doi:10.1128 / MCB.15.5.2682. PMC 230498. PMID 7739548.
Guan KL, Jenkins CW, Li Y a kol. (1996). "Izolace a charakterizace p19INK4d, inhibitoru souvisejícího s p16 specifického pro CDK6 a CDK4". Mol. Biol. Buňka. 7 (1): 57–70. doi:10,1091 / mbc.7.1.57. PMC 278612. PMID 8741839.
Schwaller J, Pabst T, Koeffler HP a kol. (1997). "Exprese a regulace inhibitorů buněčného cyklu G1 (p16INK4A, p15INK4B, p18INK4C, p19INK4D) v lidské akutní myeloidní leukémii a normálních myeloidních buňkách". Leukémie. 11 (1): 54–63. doi:10.1038 / sj.leu.2400522. PMID 9001419.
Russo AA, Tong L, Lee JO a kol. (1998). "Strukturální základ pro inhibici cyklin-dependentní kinázy Cdk6 tumor supresorem p16INK4a". Příroda. 395 (6699): 237–43. doi:10.1038/26155. PMID 9751050. S2CID 204997058.
Brotherton DH, Dhanaraj V, Wick S a kol. (1998). "Krystalová struktura komplexu cyklin D-dependentní kinázy Cdk6 navázaná na inhibitor buněčného cyklu p19INK4d". Příroda. 395 (6699): 244–50. doi:10.1038/26164. PMID 9751051. S2CID 13337394.
Baumgartner R, Fernandez-Catalan C, Winoto A a kol. (1998). „Struktura inhibitoru lidské cyklin-dependentní kinázy p19INK4d: srovnání se známými strukturami obsahujícími ankyrinovou repetici a důsledky pro dysfunkci tumor supresoru p16INK4a“. Struktura. 6 (10): 1279–90. doi:10.1016 / S0969-2126 (98) 00128-2. PMID 9782052.
Schreiber M, Muller WJ, Singh G, Graham FL (1999). „Srovnání účinnosti adenovirových vektorů exprimujících inhibitory cyklinkinázy p16INK4A, p18INK4C, p19INK4D, p21 (WAF1 / CIP1) a p27KIP1 při indukci zástavy buněčného cyklu, apoptózy a inhibice tumorigenicity“. Onkogen. 18 (9): 1663–76. doi:10.1038 / sj.onc.1202466. PMID 10208428.
Newton Bishop JA, Harland M, Bennett DC a kol. (1999). „Testování mutací v rodinách melanomů: INK4A, CDK4 a INK4D“. Br. J. Cancer. 80 (1–2): 295–300. doi:10.1038 / sj.bjc.6690354. PMC 2363010. PMID 10390011.
Zindy F, Cunningham JJ, Sherr CJ a kol. (1999). „Postnatální neuronová proliferace u myší postrádajících Ink4d a Kip1 inhibitory cyklin-dependentních kináz“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (23): 13462–7. doi:10.1073 / pnas.96.23.13462. PMC 23970. PMID 10557343.
Thullberg M, Bartkova J, Khan S a kol. (2000). „Výrazné versus nadbytečné vlastnosti mezi členy rodiny INK4 inhibitorů cyklin-dependentních kináz“. FEBS Lett. 470 (2): 161–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01307-7. PMID 10734227. S2CID 45439595.
Bartkova J, Thullberg M, Rajpert-De Meyts E a kol. (2000). „Nedostatek p19INK4d v lidských testikulárních nádorech zárodečných buněk kontrastuje s vysokou expresí během normální spermatogeneze“. Onkogen. 19 (36): 4146–50. doi:10.1038 / sj.onc.1203769. PMID 10962575.
Fink JR, LeBien TW (2001). "Nová exprese inhibitorů kinázy závislé na cyklinu v prekurzorech lidských B-buněk". Exp. Hematol. 29 (4): 490–8. doi:10.1016 / S0301-472X (01) 00619-1. PMID 11301189.
Zeeb M, Rösner H, Zeslawski W a kol. (2002). "Složení proteinu a stabilita lidského CDK inhibitoru p19 (INK4d)". J. Mol. Biol. 315 (3): 447–57. doi:10.1006 / jmbi.2001.5242. PMID 11786024.
Matsuzaki Y, Miyazawa K, Yokota T a kol. (2002). "Molekulární klonování a charakterizace promotoru genu lidského p19 (INK4d)". FEBS Lett. 517 (1–3): 272–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02647-9. PMID 12062451. S2CID 82054693.
Arcellana-Panlilio MY, Egeler RM, Ujack E a kol. (2002). „Důkaz o roli rodiny INK4 inhibitorů kinázy závislé na cyklinu v nádorech z granulózních buněk vaječníků“. Geny Chromozomy Rakovina. 35 (2): 176–81. doi:10,1002 / gcc.10108. PMID 12203782. S2CID 27477191.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Komata T, Kanzawa T, Takeuchi H a kol. (2004). „Protinádorový účinek inhibitorů cyklin-dependentní kinázy (p16 (INK4A), p18 (INK4C), p19 (INK4D), p21 (WAF1 / CIP1) a p27 (KIP1)) na maligní gliomové buňky“. Br. J. Cancer. 88 (8): 1277–80. doi:10.1038 / sj.bjc.6600862. PMC 2747579. PMID 12698196.

externí odkazy

CDKN2D umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CDKN2D podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P55273 (Inhibitor D cyklin-dependentní kinázy 4) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129355 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000096472 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8575754-5] Okuda T, Hirai H, Valentine VA, Shurtleff SA, Kidd VJ, Lahti JM, Sherr CJ, Downing JR (březen 1996). "Molekulární klonování, vzor exprese a chromozomální lokalizace lidské CDKN2D / INK4d, inhibitoru cyklin D-závislých kináz". Genomika. 29 (3): 623–30. doi:10.1006 / geno.1995.9957. PMID 8575754.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CDKN2D inhibitor cyklin-dependentní kinázy 2D (p19, inhibuje CDK4)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]