PPM1D - PPM1D

PPM1D
Identifikátory
Aliasy	PPM1D, PP2C-DELTA, WIP1, protein fosfatáza, Mg2 + / Mn2 + závislý 1D, IDDGIP, JDVS
Externí ID	OMIM: 605100 MGI: 1858214 HomoloGene: 31185 Genové karty: PPM1D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	60,666,280 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	85,347,066 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein serin / threonin fosfatáza; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • kationtová vazba; • mitogenem aktivovaná vazba proteinkinázy; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita serin / threonin fosfatázy závislá na hořčíku;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• buněčná odpověď na hladovění; • buněčný cyklus; • reakce na záření; • defosforylace bílkovin; • G2 / M přechod mitotického buněčného cyklu; • reakce na bakterii; • defosforylace peptidyl-threoninu; • negativní regulace buněčné proliferace; • Methylace DNA; • umlčování chromatinu; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • fosforylace bílkovin; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8493
	53892
	ENSG00000170836
	ENSMUSG00000020525
	O15297
	Q9QZ67
	NM_003620
	NM_016910
	NP_003611
	NP_058606
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein fosfatáza 1D je enzym že u lidí je kódován PPM1D gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny PP2C Ser / Thr proteinových fosfatáz. Je známo, že členové rodiny PP2C jsou negativními regulátory drah reakce buněčného stresu. Exprese tohoto genu je indukována způsobem závislým na p53 v reakci na různé environmentální zátěže. Zatímco je vyvoláván tumor supresorový protein TP53 / p53, tato fosfatáza negativně reguluje aktivitu p38 MAP kináza (MAPK / p38), skrze které snižuje fosforylaci p53 a naopak potlačuje p53 zprostředkovanou transkripci a apoptózu. Tato fosfatáza tedy zprostředkovává regulaci zpětné vazby signalizace p38-p53, která přispívá k inhibici růstu a potlačení apoptózy vyvolané stresem. Tento gen je umístěn v chromozomální oblasti, o které je známo, že je amplifikována u rakoviny prsu. Amplifikace tohoto genu byla detekována jak v buněčné linii karcinomu prsu, tak v primárních nádorech prsu, což naznačuje roli tohoto genu ve vývoji rakoviny.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PPM1D komunikovat s CDC5L.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170836 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020525 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fiscella M, Zhang H, Fan S, Sakaguchi K, Shen S, Mercer WE, Vande Woude GF, O'Connor PM, Appella E (červenec 1997). „Wip1, nová lidská proteinová fosfatáza, která je indukována v reakci na ionizující záření způsobem závislým na p53“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (12): 6048–53. Bibcode:1997PNAS ... 94.6048F. doi:10.1073 / pnas.94.12.6048. PMC 20998. PMID 9177166.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PPM1D protein fosfatáza 1D závislá na hořčíku, delta izoforma“.
^ Ajuh, P; Kuster B; Panov K; Zomerdijk J C; Mann M; Lamond A I (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529.

Další čtení

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD a kol. (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Hirano K, Ito M, Hartshorne DJ (1995). „Interakce ribozomálního proteinu, L5, s proteinovou fosfatázou typu 1“. J. Biol. Chem. 270 (34): 19786–90. doi:10.1074 / jbc.270.34.19786. PMID 7649987.
Takekawa M, Adachi M, Nakahata A a kol. (2001). „p53-indukovatelná wip1 fosfatáza zprostředkovává regulaci negativní zpětné vazby signalizace p38 MAPK-p53 v reakci na UV záření“. EMBO J.. 19 (23): 6517–26. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6517. PMC 305857. PMID 11101524.
Ajuh P, Kuster B, Panov K a kol. (2001). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
Choi J, Nannenga B, Demidov ON a kol. (2002). „Myši s nedostatkem genu pro fosfatázu indukovanou p53 divokého typu (Wip1) vykazují defekty v reprodukčních orgánech, imunitní funkci a kontrole buněčného cyklu“. Mol. Buňka. Biol. 22 (4): 1094–105. doi:10.1128 / MCB.22.4.1094-1105.2002. PMC 134641. PMID 11809801.
Li J, Yang Y, Peng Y a kol. (2002). "Onkogenní vlastnosti PPM1D lokalizované v epicentru amplifikace rakoviny prsu v 17q23". Nat. Genet. 31 (2): 133–4. doi:10.1038 / ng888. PMID 12021784. S2CID 5750250.
Bulavin DV, Demidov ON, Saito S a kol. (2002). „Amplifikace PPM1D v lidských nádorech ruší aktivitu supresoru p53.“. Nat. Genet. 31 (2): 210–5. doi:10.1038 / ng894. PMID 12021785. S2CID 30048056.
Morimoto H, Okamura H, Haneji T (2002). „Interakce delta protein fosfatázy 1 s nukleolinem v lidských osteoblastických buňkách“. J. Histochem. Cytochem. 50 (9): 1187–93. doi:10.1177/002215540205000905. PMID 12185196.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Imabayashi H, Mori T, Gojo S a kol. (2003). „Rediferenciace dediferencovaných chondrocytů a chondrogeneze lidských stromálních buněk kostní dřeně prostřednictvím tvorby chondrosféry s profilováním exprese pomocí analýzy velkého měřítka cDNA“. Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
Bernards R (2004). „Vymazání rakoviny“. Nat. Genet. 36 (4): 319–20. doi:10.1038 / ng0404-319. PMID 15054481.
Lu X, Bocangel D, Nannenga B a kol. (2004). „Onkogenní fosfatáza PPM1D indukovaná p53 interaguje s glykosylázou DNA uracilu a potlačuje opravu základní excize“. Mol. Buňka. 15 (4): 621–34. doi:10.1016 / j.molcel.2004.08.007. PMID 15327777.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yamaguchi H, Minopoli G, Demidov ON a kol. (2005). "Substrátová specificita lidského proteinu fosfatázy 2Cdelta, Wip1". Biochemie. 44 (14): 5285–94. doi:10.1021 / bi0476634. PMID 15807522.
Lu X, Nannenga B, Donehower LA (2005). „PPM1D defosforyluje Chk1 a p53 a ruší kontrolní body buněčného cyklu“. Genes Dev. 19 (10): 1162–74. doi:10.1101 / gad.1291305. PMC 1132003. PMID 15870257.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Rauta J, Alarmo EL, Kauraniemi P a kol. (2006). „Serin-threonin-protein-fosfatáza PPM1D je často aktivována amplifikací v agresivních primárních nádorech prsu“. Breast Cancer Res. Zacházet. 95 (3): 257–63. doi:10.1007 / s10549-005-9017-7. PMID 16254685. S2CID 9693018.
Fujimoto H, Onishi N, Kato N a kol. (2006). "Regulace antionkogenní Chk2 kinázy onkogenní Wip1 fosfatázou". Buněčná smrt se liší. 13 (7): 1170–80. doi:10.1038 / sj.cdd.4401801. PMID 16311512.
Mendrzyk F, Radlwimmer B, Joos S a kol. (2006). „Genomická a proteinová exprese profiluje CDK6 jako nový nezávislý prognostický marker v medulloblastomu“. J. Clin. Oncol. 23 (34): 8853–62. doi:10.1200 / JCO.2005.02.8589. PMID 16314645.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170836 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020525 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9177166-5] Fiscella M, Zhang H, Fan S, Sakaguchi K, Shen S, Mercer WE, Vande Woude GF, O'Connor PM, Appella E (červenec 1997). „Wip1, nová lidská proteinová fosfatáza, která je indukována v reakci na ionizující záření způsobem závislým na p53“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (12): 6048–53. Bibcode:1997PNAS ... 94.6048F. doi:10.1073 / pnas.94.12.6048. PMC 20998. PMID 9177166.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PPM1D protein fosfatáza 1D závislá na hořčíku, delta izoforma“.

[pmid11101529-7] Ajuh, P; Kuster B; Panov K; Zomerdijk J C; Mann M; Lamond A I (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]