SF3A1 - SF3A1
Faktor sestřihu 3 podjednotka 1 je protein že u lidí je kódován SF3A1 gen.[5][6]
Tento gen kóduje podjednotku 1 proteinového komplexu sestřihu faktoru 3a. Heterotrimer sestřihového faktoru 3a zahrnuje podjednotky 1, 2 a 3 a je nezbytný pro in vitro konverzi 15S U2 snRNP na aktivní 17S částici, která provádí sestřih pre-mRNA. Podjednotka 1 patří do rodiny proteinů SURP; pojmenované pro motivy SURP (nazývané také SWAP nebo Suppressor-of-White-Meruňka), o nichž se předpokládá, že zprostředkovávají vazbu RNA. Podjednotka 1 má ve své amino-koncové polovině tandemově opakované SURP motivy, zatímco její karboxy-koncová polovina obsahuje oblast bohatou na prolin a doménu podobnou ubikvitinu. Vazebné studie se zkrácenými deriváty podjednotky 1 prokázaly, že dva motivy SURP jsou nezbytné pro vazbu k podjednotce 3, zatímco ke kontaktu s podjednotkou 2 může dojít prostřednictvím sekvencí karboxy-terminálních k motivům SURP. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.[6]
Interakce
Bylo prokázáno, že SF3A1 komunikovat s SF3A3[7][8] a CDC5L.[9]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099995 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002129 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Kramer A; Mulhauser F; Wersig C; Groning K; Bilbe G (leden 1996). „Savčí sestřihový faktor SF3a120 představuje nového člena rodiny proteinů SURP a je homologní s podstatným sestřihovacím faktorem PRP21p Saccharomyces cerevisiae“. RNA. 1 (3): 260–72. PMC 1369079. PMID 7489498.
- ^ A b „Entrez Gene: SF3A1 sestřihový faktor 3a, podjednotka 1, 120 kDa“.
- ^ Nesic, D; Krämer A (říjen 2001). „Domény v lidských spojovacích faktorech SF3a60 a SF3a66 potřebné pro navázání na SF3a120, sestavení 17S U2 snRNP a tvorbu prespliceosomu“. Mol. Buňka. Biol. Spojené státy. 21 (19): 6406–17. doi:10.1128 / MCB.21.19.6406-6417.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99788. PMID 11533230.
- ^ Chiara, MD; Champion-Arnaud P; Buvoli M; Nadal-Ginard B; Reed R (červenec 1994). "Specifické interakce protein-protein mezi základními proteiny asociovanými se spliceosomy savců SAP 61 a SAP 114". Proc. Natl. Acad. Sci. USA SPOJENÉ STÁTY. 91 (14): 6403–7. Bibcode:1994PNAS ... 91.6403C. doi:10.1073 / pnas.91.14.6403. ISSN 0027-8424. PMC 44210. PMID 8022796.
- ^ Ajuh, P; Kuster B; Panov K; Zomerdijk J C; Mann M; Lamond A I (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. ANGLIE. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529.
Další čtení
- Chiara MD, Champion-Arnaud P, Buvoli M a kol. (1994). "Specifické interakce protein-protein mezi základními proteiny asociovanými se spliceosomy savců SAP 61 a SAP 114". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (14): 6403–7. Bibcode:1994PNAS ... 91.6403C. doi:10.1073 / pnas.91.14.6403. PMC 44210. PMID 8022796.
- Déšť JC; Tartakoff AM; Krämer A; Legrain P (1996). „Esenciální domény faktoru sestřihu PRP21 jsou zapojeny do vazby na proteiny PRP9 a PRP11 a jsou konzervovány evolucí“. RNA. 2 (6): 535–50. PMC 1369393. PMID 8718683.
- Neubauer G, král A, Rappsilber J a kol. (1998). "Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v EST databázi umožňuje charakterizaci komplexu multiproteinových spliceosomů". Nat. Genet. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529.
- „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. 1999. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
- Krämer A; Grüter P; Gröning K; Kastner B (1999). „Kombinované biochemické a elektronové mikroskopické analýzy odhalují architekturu savčího U2 snRNP“. J. Cell Biol. 145 (7): 1355–68. doi:10.1083 / jcb.145.7.1355. PMC 2133165. PMID 10385517.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Das R; Zhou Z; Reed R (2000). "Funkční asociace U2 snRNP s ATP nezávislým spliceozomálním komplexem E.". Mol. Buňka. 5 (5): 779–87. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80318-4. PMID 10882114.
- Gunther M; Laithier M; Brison O (2000). "Sada proteinů interagujících s transkripčním faktorem Sp1 identifikovaných při dvouhybridním screeningu". Mol. Buňka. Biochem. 210 (1–2): 131–42. doi:10.1023 / A: 1007177623283. PMID 10976766.
- Ajuh P, Kuster B, Panov K a kol. (2001). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. EMBO J.. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
- Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J a kol. (2001). „Identifikace a charakterizace potenciálních promotorových oblastí 1031 druhů lidských genů“. Genome Res. 11 (5): 677–84. doi:10,1101 / gr. Gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467.
- Will CL, Schneider C, MacMillan AM a kol. (2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. EMBO J.. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
- Nesic D; Krämer A (2001). „Domény v lidských spojovacích faktorech SF3a60 a SF3a66 potřebné pro navázání na SF3a120, sestavení 17S U2 snRNP a tvorbu prespliceosomu“. Mol. Buňka. Biol. 21 (19): 6406–17. doi:10.1128 / MCB.21.19.6406-6417.2001. PMC 99788. PMID 11533230.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Will CL, Urlaub H, Achsel T a kol. (2002). "Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box". EMBO J.. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Nesic D; Tanackovic G; Krämer A (2005). „Role Cajalových orgánů v závěrečných krocích biogeneze sn2NR U2“. J. Cell Sci. 117 (Pt 19): 4423–33. doi:10.1242 / jcs.01308. PMID 15316075.
- Lin KT; Lu RM; Tarn WY (2004). „Proteiny obsahující WW doménu interagují s časným spliceosomem a účastní se sestřihu pre-mRNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
externí odkazy
- SF3A1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
- SF3A1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |