SF3B2 - SF3B2
Faktor sestřihu 3B podjednotka 2 je protein že u lidí je kódován SF3B2 gen.[5][6]
Funkce
Tento gen kóduje podjednotku 2 proteinového komplexu sestřihu faktoru 3b. Spojovací faktor 3b, společně se spojovacím faktorem 3a a jednotkou 12S RNA, tvoří komplex U2 malý nukleární ribonukleoproteiny (U2 snRNP). Komplex sestřihu 3b / 3a váže pre-mRNA před větvovým místem intronu způsobem nezávislým na sekvenci a může ukotvit U2 snRNP k pre-mRNA. Faktor sestřihu 3b je také součástí minoritního spliceosomu typu U12. Podjednotka 2 se asociuje s pre-mRNA před místem větvení v místě kotvení. Podjednotka 2 také interaguje přímo s podjednotkou 4 komplexu spojovacího faktoru 3b. Podjednotka 2 je vysoce hydrofilní protein s prolinem bohatým N-koncem a úsekem bohatým na glutamát na C-konci.[6]
Interakce
SF3B2 bylo prokázáno komunikovat s SF3B4,[7][8] RBM7,[9] SF3B1[10][11] a CDC5L.[12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000087365 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024853 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Gozani O, Feld R, Reed R (leden 1996). „Důkaz, že pro sestavení spliceozomálního komplexu A je vyžadována vazba nezávislá na sekvenci vysoce konzervovaných proteinů U2 snRNP před místem větvení.“. Geny a vývoj. 10 (2): 233–43. doi:10.1101 / gad.10.2.233. PMID 8566756.
- ^ A b „Entrez Gene: SF3B2 spojovací faktor 3b, podjednotka 2, 145 kDa“.
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Champion-Arnaud P, Reed R (srpen 1994). „Komponenty prespliceosomu SAP 49 a SAP 145 interagují v komplexu zapojeném do tetheringu U2 snRNP na pobočku“. Geny a vývoj. 8 (16): 1974–83. doi:10.1101 / gad.8.16.1974. PMID 7958871.
- ^ Guo TB, Boros LG, Chan KC, Hikim AP, Hudson AP, Swerdloff RS, Mitchell AP, Salameh WA (2003). „Spermatogenetická exprese RNA-vazebného motivového proteinu 7, proteinu, který interaguje s sestřihovými faktory“. Journal of Andrology. 24 (2): 204–14. doi:10.1002 / j.1939-4640.2003.tb02664.x. PMID 12634307.
- ^ Das BK, Xia L, Palandjian L, Gozani O, Chyung Y, Reed R (říjen 1999). „Charakterizace proteinového komplexu obsahujícího spliceosomální proteiny SAP 49, 130, 145 a 155“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (10): 6796–802. doi:10,1128 / mcb.19.10.6796. PMC 84676. PMID 10490618.
- ^ Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). „Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box“. Časopis EMBO. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
- ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
Další čtení
- Agell N, Aligué R, Alemany V, Castro A, Jaime M, Pujol MJ, Rius E, Serratosa J, Taulés M, Bachs O (1998). "Nové jaderné funkce pro kalmodulin". Buněčný vápník. 23 (2–3): 115–21. doi:10.1016 / S0143-4160 (98) 90109-9. PMID 9601606.
- Champion-Arnaud P, Reed R (srpen 1994). „Komponenty prespliceosomu SAP 49 a SAP 145 interagují v komplexu zapojeném do tetheringu U2 snRNP na pobočku“. Geny a vývoj. 8 (16): 1974–83. doi:10.1101 / gad.8.16.1974. PMID 7958871.
- Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). „Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v databázi EST umožňuje charakterizaci komplexu víceproteinových spliceosomů“. Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
- Das BK, Xia L, Palandjian L, Gozani O, Chyung Y, Reed R (říjen 1999). „Charakterizace proteinového komplexu obsahujícího spliceosomální proteiny SAP 49, 130, 145 a 155“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (10): 6796–802. doi:10,1128 / mcb.19.10.6796. PMC 84676. PMID 10490618.
- Das R, Zhou Z, Reed R (květen 2000). "Funkční asociace U2 snRNP s ATP nezávislým spliceozomálním komplexem E". Molekulární buňka. 5 (5): 779–87. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80318-4. PMID 10882114.
- Bryant HE, Wadd SE, Lamond AI, Silverstein SJ, Clements JB (květen 2001). „Protein IE63 (ICP27) viru herpes simplex interaguje s proteinem 145 spojeným se spliceosomy a inhibuje sestřih před prvním katalytickým krokem“. Journal of Virology. 75 (9): 4376–85. doi:10.1128 / JVI.75.9.4376-4385.2001. PMC 114182. PMID 11287586.
- Značka M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (červen 2001). „Protein vázající DNA poškozený UV zářením v komplexu TFTC spojuje rozpoznávání poškození DNA s acetylací nukleosomů“. Časopis EMBO. 20 (12): 3187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3187. PMC 150203. PMID 11406595.
- Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (srpen 2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. Časopis EMBO. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (duben 2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). „Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box“. Časopis EMBO. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
- Warner DR, Roberts EA, Greene RM, Pisano MM (prosinec 2003). "Identifikace nových proteinů vázajících Smad". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 312 (4): 1185–90. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.11.049. PMID 14651998.
- Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (červen 2004). „Lidský 18S U11 / U12 snRNP obsahuje sadu nových proteinů, které nebyly nalezeny ve spliceozomu závislém na U2“. RNA. 10 (6): 929–41. doi:10,1261 / rna.7320604. PMC 1370585. PMID 15146077.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Lin KT, Lu RM, Tarn WY (říjen 2004). „Proteiny obsahující WW doménu interagují s časným spliceosomem a účastní se sestřihu pre-mRNA in vivo“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Ardon O, Zimmerman ES, Andersen JL, DeHart JL, Blackett J, Planelles V (duben 2006). „Indukce zástavy G2 a vazba na cyklofilin A jsou nezávislé fenotypy viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr“. Journal of Virology. 80 (8): 3694–700. doi:10.1128 / JVI.80.8.3694-3700.2006. PMC 1440437. PMID 16571786.