Protilátka napodobující - Antibody mimetic

Protilátková mimetika jsou organické sloučeniny, které jako protilátky, může konkrétně vázat antigeny, ale které nejsou strukturálně příbuzné s protilátkami. Obvykle jsou umělé peptidy nebo bílkoviny s molární hmotnost asi 3 až 20kDa. (Protilátky jsou ~ 150 kDa.)

Nukleové kyseliny a malé molekuly jsou někdy také považovány za mimetika protilátek, ale ne za umělé protilátky, fragmenty protilátek a fúzní proteiny složený z nich.

Společné výhody oproti protilátkám jsou lepší rozpustnost, penetrace tkání, stabilita vůči teplu a enzymům a poměrně nízké výrobní náklady. Protilátková mimetika jsou vyvíjena jako terapeutický a diagnostický agenti.[1]

Příklady

Protilátka napodobujícíLešeníMolární hmotnostPříklad léku
Affibody molekuly[2]Z doména Protein A6 kDaABY-025
Affilins[3]Krystalin gama-B20 kDa
Ubikvitin10 kDaSPVF 2801
Affimers[4]Cystatin12–14 kDa
Affitiny[5]Sac7d (z Sulfolobus acidocaldarius)7 kDa
Abecedy[6]Trojitá šroubovice svinutá cívka10 kDaCMPX-1023
Anticaliny[7]Lipokaliny20 kDa
Avimers[8]A domén různých membránových receptorů9–18 kDa
DARPins[9]Ankyrin se opakuje motiv10–19 kDaMP0112
Fynomery[10]SH3 doména z Fyn7 kDa
Peptidy domény Kunitz[11]Kunitzovy domény různých inhibitory proteázy6 kDaEcallantid (Kalbitor)
Monobody[12]10. doména typu III z fibronektin10 kDaPegdinetanib (Angiocept)
nanoCLAMPy[13]Vazebný modul pro sacharidy 32-2 (z Clostridium perfringens NagH)16 kDa

Viz také

Reference

  1. ^ Gebauer M, Skerra A (červen 2009). „Upravené proteinové lešení jako protilátková terapeutika nové generace“. Curr Opin Chem Biol. 13 (3): 245–255. doi:10.1016 / j.cbpa.2009.04.627. PMID  19501012.
  2. ^ Nygren PA (červen 2008). „Alternativní vazebné proteiny: proteiny vázající afibody vyvinuté z malého lešení svazku se třemi spirálami“. FEBS J. 275 (11): 2668–76. doi:10.1111 / j.1742-4658.2008.06438.x. PMID  18435759.
  3. ^ Ebersbach H, Fiedler E, Scheuermann T a kol. (Září 2007). "Affilin-nové vazebné molekuly založené na lidském gama-B-krystalinu, all beta-sheet protein". J. Mol. Biol. 372 (1): 172–85. doi:10.1016 / j.jmb.2007.06.045. PMID  17628592.
  4. ^ Johnson A, Song Q, Ko Ferrigno P, Bueno PR, Davis JJ (7. srpna 2012). "Citlivý affimer a protilátky založené na impedimetrických testech bez obsahu C-reaktivního proteinu na štítku". Anální. Chem. 84 (15): 6553–60. doi:10.1021 / ac300835b. PMID  22789061.
  5. ^ Krehenbrink M, Chami M, Guilvout I, Alzari PM, Pécorari F, Pugsley AP (listopad 2008). "Umělé vazebné proteiny (affitiny) jako sondy pro konformační změny v sekretinu PulD". J. Mol. Biol. 383 (5): 1058–68. doi:10.1016 / j.jmb.2008.09.016. PMID  18822295.
  6. ^ Desmet, J .; Verstraete, K .; Bloch, Y .; Lorent, E .; Wen, Y .; Devreese, B .; Vandenbroucke, K .; Loverix, S .; Hettmann, T .; Deroo, S .; Somers, K .; Henderikx, P .; Lasters, I .; Savvides, S.N. (5. února 2014). „Strukturální základ antagonismu IL-23 proteinovým skeletem Alphabody“. Příroda komunikace. 5: 5237. doi:10.1038 / ncomms6237. PMC  4220489. PMID  25354530.
  7. ^ Skerra A (červen 2008). "Alternativní vazebné proteiny: anticaliny - využití strukturní plasticity kapsy lipokalinového ligandu k vytvoření nových vazebných aktivit". FEBS J. 275 (11): 2677–83. doi:10.1111 / j.1742-4658.2008.06439.x. PMID  18435758.
  8. ^ Silverman J, Liu Q, Lu Q a kol. (Prosinec 2005). "Multivalentní avimerové proteiny se vyvinuly exonovým mícháním rodiny lidských receptorových domén". Nat. Biotechnol. 23 (12): 1556–61. doi:10.1038 / nbt1166. PMID  16299519.
  9. ^ Stumpp MT, Binz HK, Amstutz P (srpen 2008). „DARPins: nová generace proteinových terapeutik“. Drug Discov. Dnes. 13 (15–16): 695–701. doi:10.1016 / j.drudis.2008.04.013. PMID  18621567.
  10. ^ Grabulovski D; Kaspar, M; Neri, D (2007). „Nový neimunogenní vazebný protein odvozený od Fyn SH3 s vlastnostmi vaskulárního cílení na nádor“. J Biol Chem. 282 (5): 3196–3204. doi:10,1074 / jbc.M609211200. PMID  17130124.
  11. ^ Nixon AE, Wood CR (březen 2006). "Inženýrské proteinové inhibitory proteáz". Curr Opin Drug Discov Dev. 9 (2): 261–8. PMID  16566296.
  12. ^ Koide A, Koide S (2007). "Monobody: napodobeniny protilátek na základě skeletu domény fibronektinu typu III". Methods Mol. Biol. 352: 95–109. doi:10.1385/1-59745-187-8:95. ISBN  978-1-59745-187-1. PMID  17041261.
  13. ^ Suderman RJ, Rice DA, Gibson SD, Strick EJ, Chao DM (17. dubna 2017). „Vývoj polyolových protilátkových mimetik pro jednokrokové čištění proteinů“. Exprese a čištění proteinů. 134: 114–124. doi:10.1016 / j.pep.2017.04.008. PMID  28428153.