Acylový nosičový protein - Acyl carrier protein
| Acyl / peptidyl nosný protein | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ACP-like_sf | ||||||||
| Pfam | PF00550 | ||||||||
| Pfam klan | CL0314 | ||||||||
| InterPro | IPR036736 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00012 | ||||||||
| KOCOUR | 1nq4 | ||||||||
| SCOP2 | 1nq4 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
The acylový protein (AKT) je v obou důležitou součástí mastné kyseliny a polyketid biosyntéza s rostoucím řetězcem vázaným během syntézy jako thiolester na distálním thiolu 4'-fosfopantethein skupina. Struktura a mechanismus AKT souvisí s peptidylové nosné proteiny (PCP) z nonribozomální peptid syntázy.
Protein je exprimován v neaktivním stavu apo formy a 4'-fosfopantetheinová část musí být posttranslačně připojena ke konzervovanému serinovému zbytku na ACP působením holo-acylový proteinový protein syntáza (ACPS), a 4'-fosfopantetheinyltransferáza. 4'-Fosfantanthein je základní protetická skupina několika acylových nosných proteinů zapojených do cest primárního a sekundárního metabolismu, včetně acylových nosných proteinů (ACP) syntázy mastných kyselin, AKT z polyketid syntázy a peptidové nosné proteiny (PCP) a arylové nosné proteiny (ArCP) z nonribozomální peptidové syntetázy (NRPS). Fosfopantethein splňuje v těchto biosyntetických drahách dva požadavky. Za prvé, meziprodukty zůstávají kovalentně spojeny s syntázami (nebo syntetázy) v energeticky bohaté vazbě. Za druhé, flexibilita a délka fosfopantetheinového řetězce (přibližně 2 nm) umožňuje kovalentně vázaným meziproduktům přístup k prostorově odlišným místům aktivním pro enzymy. To zvyšuje efektivní molaritu meziproduktu a umožňuje proces podobný montážní lince.
ACP jsou malé záporně nabité proteiny alfa-helikálního svazku s vysokým stupněm strukturní a aminokyselinové podobnosti. Struktury řady acylových nosných proteinů byly vyřešeny pomocí různých NMR a krystalografické techniky.
externí odkazy
- Acyl Carrier Protein v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)