TMEM70 - TMEM70
TMEM70 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | TMEM70, MC5DN2, transmembránový protein 70 | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 612418 MGI: 1915068 HomoloGene: 9890 Genové karty: TMEM70 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 8: 73,97 - 73,98 Mb | Chr 1: 16,67 - 16,68 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Transmembránový protein 70 je protein že u lidí je kódován TMEM70 gen. Je to transmembránový protein nachází se v mitochondriální vnitřní membrána podílí se na montáži konstrukcí F1 a Fo podjednotky z ATP syntáza.[5] Mutace v tomto genu byly spojeny s novorozenec mitochondriální encefalo -kardiomyopatie kvůli nedostatku ATP syntázy (komplex V), což způsobuje širokou škálu příznaků včetně 3-methylglutakonová acidurie, laktátová acidóza, mitochondriální myopatie a kardiomyopatie.[6][7]
Struktura
The TMEM70 gen má 4 exony a je umístěn na rameni q chromozom 8 na pozici 21.11 a zabírá 6 642 párů bází.[5] Gen produkuje protein 29 kDa složený z 260 aminokyseliny.[8][9] Kódovaný protein je a víceprůchodový transmembránový protein lokalizovaný na mitochondriální vnitřní membránu.[10][11] Obsahuje dvě domnělé transmembránové oblasti a konzervovaný doména DUF1301.[12][6]
Funkce
Kódovaný protein se podílí na sestavení F1 a Fo strukturní podjednotky ATP syntázy.[5]
Klinický význam
Mutace v TMEM70 Gen genu byl spojován s neonatální mitochondriální encefalokardiomyopatií v důsledku nedostatku jaderného komplexu typu 2 (ATP syntáza).[5] Existuje celá řada možných příznaků v závislosti na mutaci, včetně 3-methylglutakonové acidurie, dysmorfické rysy, psychomotorická retardace, hypotonie, zpomalení růstu, mitochondriální myopatie a kardiomyopatie, hepatomegalie, hypoplastické ledviny a zvýšené hladiny laktátu v moči, plazma, a mozkomíšní mok.[11][7]
Nejvýznamnější je mutace c.317-2A → G v spojovací místo z intron 2 tohoto genu způsobily aberanty sestřih a ztráta TMEM70 přepis.[13] To mělo za následek nedostatek ATP syntázy symptomizovaný apneoická kouzla, Hypertrofické kardiomyopatie hluboká laktátová acidóza, hyperamonémie, psychomotorická retardace, 3-methylglutakonová acidurie, selhání prosperovat a těžká svalová hypotonie. U některých pacientů bylo také uvedeno hypospadias, zpomalení nitroděložního růstu, mikrocefalie a kryptorchismus, ale většina pacientů novorozenecké období nepřežila.[14]
Další mutace (c.366A> T) ve druhém exonu tohoto genu způsobila substituce aminokyselin (Y112X), což má za následek nedostatek mitochondriálního komplexu V jaderného typu 2 symptomizovaný laktátovou acidózou, psychomotorickou retardací, dysmorfismem obličeje, hypertrofickou kardiomyopatií a hypospadií.[15][6]
Studie mitochondrií morfologie u pacientů s mutacemi v tomto genu byla odhalena dezorganizace mitochondrií nukleoid. Mitochondrie byly neobvyklé, s whorled cristae a narušil shluky nukleoidů mtDNA. Nukleoidy a komplexy mitochondriálních dýchacích řetězců byly omezeny na vnější kroužky přeslenů.[7]
Interakce
Kódovaný protein má interakce protein-protein s RAB2A, PHC2, NDUFAF8, NDUFS5, COX6B1, ECSIT, NDUFAF4, a COA3.[16]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175606 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025940 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d „Entrez Gene: Transmembrane protein 70“. Citováno 2018-08-14.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
- ^ A b C Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): TMEM70 - 612418
- ^ A b C Cameron JM, Levandovskiy V, Mackay N, Ackerley C, Chitayat D, Raiman J a kol. (Leden 2011). "Nedostatek komplexu V TMEM70 vede k dezorganizaci mitochondriálních nukleoidů". Mitochondrie. 11 (1): 191–9. doi:10.1016 / j.mito.2010.09.008. PMID 20920610.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ „TMEM70 - transmembránový protein 70, mitochondriální“. Znalostní databáze Atlas srdečních organelárních proteinů (COPaKB).
- ^ „TMEM70 - Transmembránový protein 70, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - TMEM70 gen a protein“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-15.
Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
- ^ A b „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Cízková A, Stránecký V, Mayr JA, Tesarová M, Havlícková V, Paul J, et al. (Listopad 2008). „Mutace TMEM70 způsobují izolovaný nedostatek ATP syntázy a neonatální mitochondriální encefalokardiomyopatii“. Genetika přírody. 40 (11): 1288–90. doi:10,1038 / ng.246. PMID 18953340. S2CID 34536246.
- ^ Catteruccia M, Verrigni D, Martinelli D, Torraco A, Agovino T, Bonafé L a kol. (Březen 2014). „Trvalá plicní arteriální hypertenze u novorozenců (PPHN): častý projev pacientů s defektem TMEM70“. Molekulární genetika a metabolismus. 111 (3): 353–359. doi:10.1016 / j.ymgme.2014.01.001. PMID 24485043.
- ^ Honzík T, Tesarová M, Mayr JA, Hansíková H, Jesina P, Bodamer O, et al. (Duben 2010). „Mitochondriální encefalokardiomyopatie s časným nástupem novorozence v důsledku mutace TMEM70“. Archiv nemocí v dětství. 95 (4): 296–301. doi:10.1136 / adc.2009.168096. hdl:1854 / LU-987464. PMID 20335238. S2CID 2946094.
- ^ Spiegel R, Khayat M, Shalev SA, Horovitz Y, Mandel H, Hershkovitz E a kol. (Březen 2011). „Mutace TMEM70 jsou běžnou příčinou defektu sestavy syntázy ATP kódovaného nukleárně: další vymezení nového syndromu“. Journal of Medical Genetics. 48 (3): 177–82. doi:10.1136 / jmg.2010.084608. PMID 21147908. S2CID 8699153.
- ^ IntAct. „Interakce TMEM70“. www.ebi.ac.uk. Citováno 2018-08-16.
Další čtení
- Jonckheere AI, Huigsloot M, Lammens M, Jansen J, van den Heuvel LP, Spiekerkoetter U, von Kleist-Retzow JC, Forkink M, Koopman WJ, Szklarczyk R, Huynen MA, Fransen JA, Smeitink JA, Rodenburg RJ (listopad 2011) . „Obnova deficitu komplexu V způsobeného novou delecí v lidském genu TMEM70 normalizuje mitochondriální morfologii“. Mitochondrie. 11 (6): 954–63. doi:10.1016 / j.mito.2011.08.012. PMID 21945727.
- Atay Z, Bereket A, Turan S, Haliloglu B, Memisoglu A, Khayat M, Shalev SA, Spiegel R (únor 2013). „Nová homozygotní mutace TMEM70 má za následek vrozenou kataraktu a neonatální mitochondriální encefalokardiomyopatii.“ Gen. 515 (1): 197–9. doi:10.1016 / j.gene.2012.11.044. PMID 23235116.
- Houstek J, Kmoch S, Zeman J (květen 2009). „Protein TMEM70 - nový pomocný faktor savčí ATP syntázy“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1787 (5): 529–32. doi:10.1016 / j.bbabio.2008.11.013. PMID 19103153.
- Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C a kol. (Listopad 2009). „Genově centrické asociační signály pro lipidy a apolipoproteiny identifikované prostřednictvím HumanCVD BeadChip“. American Journal of Human Genetics. 85 (5): 628–42. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121.
- Karasik D, Hsu YH, Zhou Y, Cupples LA, Kiel DP, Demissie S (červenec 2010). „Celá genomová pleiotropie fenotypů souvisejících s osteoporózou: Framinghamova studie“. Journal of Bone and Mineral Research. 25 (7): 1555–63. doi:10,1002 / jbmr.38. PMC 3153998. PMID 20200953.
- Davila S, Froeling FE, Tan A, Bonnard C, Boland GJ, Snippe H, Hibberd ML, Seielstad M (duben 2010). „Nové genetické asociace zjištěné ve studii reakce hostitele na vakcínu proti hepatitidě B“. Geny a imunita. 11 (3): 232–8. doi:10.1038 / gen.2010.1. PMID 20237496.
- Bailey SD, Xie C, Do R, Montpetit A, Diaz R, Mohan V a kol. (Říjen 2010). „Variace na lokusu NFATC2 zvyšuje riziko edému vyvolaného thiazolidindionem ve studii Diabetes REduction Assessment ve studii Ramipril and Rosiglitazone Medication (DREAM)“. Péče o cukrovku. 33 (10): 2250–3. doi:10.2337 / dc10-0452. PMC 2945168. PMID 20628086.
- Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA a kol. (Září 2010). „Genetické varianty v jaderně kódovaných mitochondriálních genech ovlivňují progresi AIDS“. PLOS ONE. 5 (9): e12862. doi:10.1371 / journal.pone.0012862. PMC 2943476. PMID 20877624.
- Cameron JM, Levandovskiy V, Mackay N, Ackerley C, Chitayat D, Raiman J a kol. (Leden 2011). "Nedostatek komplexu V TMEM70 vede k dezorganizaci mitochondriálních nukleoidů". Mitochondrie. 11 (1): 191–9. doi:10.1016 / j.mito.2010.09.008. PMID 20920610.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.