RAB2A - RAB2A

RAB2A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1Z0A
Identifikátory
Aliasy	RAB2A, LHX, RAB2, člen rodiny onkogenů RAS
Externí ID	OMIM: 179509 MGI: 1928750 HomoloGene: 20628 Genové karty: RAB2A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	60,623,644 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	8,607,778 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba na HDP; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • melanosom; • Golgiho membrána; • lysozomální membrána; • endoplazmatické retikulum; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostorová membrána; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytosol; • Golgiho aparát; • intracelulární;
Biologický proces	• Golgiho organizace; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • transport bílkovin; • transport zprostředkovaný vezikuly; • posttranslační modifikace; • doprava; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5862
	59021
	ENSG00000104388
	ENSMUSG00000047187
	P61019
	P53994
	NM_002865; NM_001242644
	NM_021518
	NP_001229573; NP_002856
	NP_067493
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-2A je protein že u lidí je kódován RAB2A gen.^[5]

Funkce

Členy rodiny proteinů Rab jsou netransformující se monomerní GTP-vazebné proteiny nadrodiny Ras, které obsahují 4 vysoce konzervované oblasti zapojené do GTP vazby a hydrolýzy. Rabs jsou prenylované, na membránu vázané proteiny, které se účastní vezikulární fúze a obchodování. Savčí proteiny RAB vykazují nápadné podobnosti s proteiny YPT1 a SEC4 S. cerevisiae, proteiny vázajícími se na GTP související s Ras, které se podílejí na regulaci sekrece. [Dodává OMIM]^[5]

Interakce

RAB2A bylo prokázáno komunikovat s GOLGA2.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104388 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047187 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAB2A RAB2A, člen onkogenní rodiny RAS“.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.

Další čtení

Khosravi-Far R, Lutz RJ, Cox AD, Conroy L, Bourne JR, Sinensky M, Balch WE, Buss JE, Der CJ (červenec 1991). "Isoprenoidová modifikace rab proteinů končících v CC nebo CXC motivech". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (14): 6264–8. doi:10.1073 / pnas.88.14.6264. PMC 52063. PMID 1648736.
Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (červenec 1989). „Lidské geny Rab kódují rodinu proteinů vázajících GTP souvisejících s produkty kvasinek YPT1 a SEC4 zapojenými do sekrece.“ The Journal of Biological Chemistry. 264 (21): 12394–401. PMID 2501306.
Tachibana K, Umezawa A, Kato S, Takano T (listopad 1988). „Nukleotidová sekvence nové lidské cDNA související s YPT1, která patří do nadrodiny genů ras“. Výzkum nukleových kyselin. 16 (21): 10368. doi:10.1093 / nar / 16.21.10368. PMC 338870. PMID 3057444.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Tisdale EJ, Balch WE (listopad 1996). „Rab2 je nezbytný pro zrání předgolgiho meziproduktů“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (46): 29372–9. doi:10.1074 / jbc.271.46.29372. PMID 8910601.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
de Leeuw HP, Koster PM, Calafat J, Janssen H, van Zonneveld AJ, van Mourik JA, Voorberg J (říjen 1998). „Malé proteiny vázající GTP v lidských endoteliálních buňkách“. British Journal of Hematology. 103 (1): 15–9. doi:10.1046 / j.1365-2141.1998.00965.x. PMID 9792283. S2CID 24857520.
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (září 1999). „Obecná role inhibitoru disociace GDP 2 v membránovém uvolňování proteinů Rab: modulace jeho funkčních interakcí strukturálními modifikacemi in vitro a in vivo“. Biochemie. 38 (36): 11711–21. doi:10.1021 / bi990200r. PMID 10512627.
Caillol N, Pasqualini E, Lloubes R, Lombardo D (září 2000). „Poškození sekrece lipázy závislé na žlučové soli v lidských pankreatických nádorových buňkách SOJ-6“. Journal of Cellular Biochemistry. 79 (4): 628–47. doi:10.1002 / 1097-4644 (20001215) 79: 4 <628 :: AID-JCB120> 3.0.CO; 2-T. PMID 10996854.
Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.
Ni X, Ma Y, Cheng H, Jiang M, Guo L, Ji C, Gu S, Cao Y, Xie Y, Mao Y (2002). "Molekulární klonování a charakterizace nového lidského genu Rab (Rab2B)". Journal of Human Genetics. 47 (10): 548–51. doi:10,1007 / s100380200083. PMID 12376746.
Tisdale EJ (prosinec 2003). „Rab2 interaguje přímo s atypickou proteinkinázou C (aPKC) iota / lambda a inhibuje fosforylaci glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenázy závislou na aPKCiota / lambda“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (52): 52524–30. doi:10,1074 / jbc.M309343200. PMID 14570876.
Tisdale EJ, Kelly C, Artalejo CR (prosinec 2004). „Glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenáza interaguje s Rab2 a hraje zásadní roli v endoplazmatickém retikulu k transportu Golgi bez jeho glykolytické aktivity“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (52): 54046–52. doi:10,1074 / jbc.M409472200. PMID 15485821.
Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (Listopad 2006). "Proteomická a bioinformatická charakterizace biogeneze a funkce melanosomů". Journal of Proteome Research. 5 (11): 3135–44. doi:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.
Dong C, Wu G (listopad 2007). „Regulace anterográdního transportu adrenergních a angiotensinových II receptorů pomocí GTPáz Rab2 a Rab6“. Mobilní signalizace. 19 (11): 2388–99. doi:10.1016 / j.cellsig.2007.07.017. PMC 2072516. PMID 17716866.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104388 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047187 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RAB2A RAB2A, člen onkogenní rodiny RAS“.

[pmid16189514-6] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid11739401-7] Short B, Preisinger C, Körner R, Kopajtich R, Byron O, Barr FA (prosinec 2001). „Efektorový komplex GRASP55-rab2 spojující Golgiho strukturu s membránovým provozem“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 877–83. doi:10.1083 / jcb.20010807979. PMC 2150909. PMID 11739401.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]