TIMMDC1 je protein že u lidí je kódován TIMMDC1 gen .[4] [5] Je to chaperonový protein podílí se na konstrukci ramene membrány mitochondriální Komplex I. .[6] A mutace posunu snímků v intron Bylo prokázáno, že tento gen způsobuje selhání prosperovat , zpomalení psychomotorického vývoje , infantilní nástup hypotonie a těžké neurologická dysfunkce .[7] Vysoký výraz tohoto genu byla spojena s migrací rakovina plic Bylo prokázáno, že vyčerpání bílkovin ovlivňuje nařízení z apoptóza , buněčný cyklus a buněčná migrace.[8]
Struktura The TIMMDC1 gen se nachází na rameni q chromozom 3 na pozici 13,33 a rozpětí 25 760 párů bází, se 7 exony.[5] Gen produkuje protein 32,2 kDa složený z 285 aminokyseliny .[9] [10] Protein TIMMDC1 má 4 transmembránové domény , s N-terminál a C-terminál rozšíření lokalizovaný v mitochondriální matice . TIMMDC1 je multipass mitochondriální vnitřní membrána Předpokládá se, že je členem 4pásmové transmembrány rodina bílkovin z TIM17 -TIM22 -TIM23 . Své topologie se předpokládá, že je analogický s TIMM23.[11]
Funkce TIMMDC1 je chaperonový protein podílející se na sestavení mitochondriálního komplexu I (NADH-ubichinon oxidoreduktáza ), podílející se na konstrukci membránového ramene komplexu I.[6]
Klinický význam A mutace posunu snímků v intron 5 z TIMMDC1 Bylo prokázáno, že gen je závažný neurologická dysfunkce , infantilní nástup hypotonie , zpomalení psychomotorického vývoje , a selhání prosperovat .[7] Navíc vysoká výraz z TIMMDC1 byl spojen s metastáza z karcinom plic buňky, s vyčerpáním proteinu inhibujícím růst a migraci 95D buněk karcinomu plic. Ukázalo se také, že vyčerpání TIMMDC1 mění expresi genů zapojených do nařízení z apoptóza , zástava buněčného cyklu a migrace buněk, včetně CCNG2 , PTEN , TIMP3 , a COL3A1 .[8]
Interakce Protein TIMMDC1 interaguje s přechodným subkomplexem 315 kDa neúplně sestaveného komplexu I a má interakce s OSUD 1 , kromě asi 60 dalších proteinů.[12] [6] TIMMDC1 se přidruží recipročně s více komponentami ECSIT -TMEM126B -ACAD9 -NDUFAF1 montážní faktor komplex (Komplex MCIA).[11]
Reference ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113845 - Ensembl , Květen 2017^ „Human PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ „Myš PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ Escarceller M, Pluvinet R, Sumoy L, Estivill X (březen 2001). „Identifikace a analýza exprese C3orf1, nového lidského genu homologního s genem Drosophila RP140-upstream“. Sekvence DNA . 11 (3–4): 335–8. doi :10.3109/10425170009033252 . PMID 11092749 . S2CID 20254976 . ^ A b „Entrez Gene: C3orf1 chromozom 3, otevřený čtecí rámec 1“ . Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména . ^ A b C „TIMMDC1 - komplex I faktoru montáže TIMMDC1, mitochondriální - Homo sapiens (člověk) - gen a protein TIMMDC1“ . www.uniprot.org . Citováno 2018-07-27 . Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména . ^ A b Kremer LS, Bader DM, Mertes C, Kopajtich R, Pichler G, Iuso A, et al. (Červen 2017). "Genetická diagnostika Mendelianových poruch pomocí sekvenování RNA" . Příroda komunikace . 8 : 15824. doi :10.1038 / ncomms15824 . PMC 5499207 . PMID 28604674 . ^ A b Wu H, Wang W, Xu H (listopad 2014). „Vyčerpání C3orf1 / TIMMDC1 inhibuje migraci a proliferaci v buňkách 95D karcinomu plic“ . International Journal of Molecular Sciences . 15 (11): 20555–71. doi :10,3390 / ijms151120555 . PMC 4264183 . PMID 25391042 . ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“ . Výzkum oběhu . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 . ^ "Komplexní montážní faktor TIMMDC1, mitochondriální" . Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB) .^ A b Guarani V, Paulo J, Zhai B, Huttlin EL, Gygi SP, Harper JW (březen 2014). „TIMMDC1 / C3orf1 funguje jako mitochondriální komplex I zabudovaný do membrány prostřednictvím asociace s komplexem MCIA“ . Molekulární a buněčná biologie . 34 (5): 847–61. doi :10.1128 / MCB.01551-13 . PMC 4023825 . PMID 24344204 . ^ Laboratoř, Mike Tyers. "TIMMDC1 (UNQ247 / PRO284) Souhrn výsledku | BioGRID" . thebiogrid.org . Citováno 2018-07-27 . externí odkazy Další čtení Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 . Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“ . Výzkum genomu . 10 (11): 1788–95. doi :10,1101 / gr. 143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 . Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“ . Výzkum genomu . 11 (3): 422–35. doi :10,1101 / gr. GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 . Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“ . Zprávy EMBO . 1 (3): 287–92. doi :10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 . Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (říjen 2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“ . Výzkum genomu . 13 (10): 2265–70. doi :10,1101 / gr. 1293003 . PMC 403697 . PMID 12975309 . Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“ . Výzkum genomu . 14 (10B): 2136–44. doi :10,1101 / gr. 2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 . Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“ . Výzkum nukleových kyselin . 34 (Problém s databází): D415–8. doi :10.1093 / nar / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .