NDUFAF1 - NDUFAF1
Komplex I, středně asociovaný protein 30, mitochondriální (CIA30)nebo NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 alfa subkomplexní montážní faktor 1 (NDUFAF1), je protein že u lidí je kódován NDUFAF1 nebo CIA30 gen.[5][6][7][8][9] The NDUFAF1 gen kóduje člověka homolog a Neurospora crassa protein zapojený do montáže komplex I.[7] Protein NDUFAF1 je faktorem shromáždění NADH dehydrogenáza (ubichinon) také známý jako komplex I, který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[10] Varianty NDUFAF1 gen je spojen s Hypertrofické kardiomyopatie, leukodystrofie a kardioencefalomyopatie.[11][12][13]
Struktura
NDUFAF1 se nachází na q rameno chromozomu 15 v poloze 15.1.[7] The NDUFAF1 Gen produkuje protein 37,8 kDa složený z 327 aminokyselin.[14][15] NDUFAF1 je spojen s komplexy 600 a 700 kDa.[8] Komplex I je strukturován do dvojdílné konfigurace ve tvaru L, která je tvořena obvodovým maticovým ramenem, sestávajícím z flavoproteiny a železo-sirné proteiny podílející se na přenosu elektronů a membránové rameno, sestávající z podjednotek kódovaných mtDNA zapojených do ubichinon redukce a čerpání protonů.[13] Ukázalo se, že NDUFAF1 interaguje s montážními meziprodukty a může hrát roli ve správném sestavení a kombinaci periferního ramene s kompletním ramenem membrány, jakož i ve stabilizaci a lešení těchto meziproduktů prostřednictvím těchto blízkých interakcí.[8]
Funkce
NDUFAF1 je faktor montáže, který je důležitý pro správnou montáž NADH dehydrogenáza (ubichinon). Zajišťuje správnou kombinaci komplexních meziproduktů a je nezbytný pro správnou funkci NADH dehydrogenázy (ubichinon). Specificky se NDUFAF1 váže na meziprodukt s velkým ramenem membrány a je zapojen do kombinace meziproduktů s malým a velkým ramenem membrány komplexu I. Rovněž bylo navrženo, že NDUFAF1 je zapojen do stabilizace a lešení montážních meziproduktů a že tato role může být výraznější než jeho část v prostřední kombinaci.[8]
Klinický význam
Mutace v NDUFAF1 může vést k mitochondriálním nedostatkům a souvisejícím poruchám. Porucha mitochondriální dýchací řetězec může způsobit širokou škálu klinických projevů od smrtelného novorozeneckého onemocnění po nástup dospělého neurodegenerativní poruchy. Fenotypy zahrnout makrocefalie s progresivním leukodystrofie, nespecifické encefalopatie, kardiomyopatie, myopatie, nemoc jater, Leighův syndrom, Leber dědičná optická neuropatie a některé formy Parkinsonova choroba.[16]
U pacienta s missense mutace v NDUFAF1, fatální infantilní Hypertrofické kardiomyopatie byl diagnostikován. V tomto případě vedla komplexní I demontáž k mitochondriální kardiomyopatii s výraznými laktátová acidóza.[11] U jiného pacienta, dítěte se složenou heterozygotní mutací (c.278A> G; c.247G> A) v exonu 2 v genu NDUFAF1, byla diagnostikována leukodystrofie spojená s nedostatkem mitochondriálního komplexu I. Známky a příznaky zahrnovaly regresi duševního a motorického vývoje, léze bílé hmoty, periferní neuropatie s vysokým svalovým napětím a hyperreflexie končetin a vysoké hladiny laktátu a kreatinkináza. Bylo zjištěno, že rodiče jsou heterozygotní nositelé mutace.[12] U třetího pacienta bylo zjištěno, že má mutaci v obou alely genu NDUFAF1 a byla diagnostikována kardioencefalomyopatie a snížené hladiny a aktivita komplexu I.[13]
Interakce
Kromě ko-komplexů má NDUFAF1 interakce protein-protein s PNLIPRP1,[17] TMEM97,[18] TMEM86B,[19] YIPF6,[20] SLC30A2,[21] ATIC,[22] a MAGEA11.[23]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137806 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027305 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Janssen R, Smeitink J, Smeets R, van Den Heuvel L (březen 2002). „Faktor sestavení komplexu CIA30: kandidát na nedostatek lidského komplexu I?“. Genetika člověka. 110 (3): 264–70. doi:10.1007 / s00439-001-0673-3. PMID 11935339.
- ^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (květen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Výzkum genomu. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
- ^ A b C „Entrezův gen: NDUFAF1 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 alfa subkomplex, montážní faktor 1“.
- ^ A b C d Vogel RO, Janssen RJ, Ugalde C, Grovenstein M, Huijbens RJ, Visch HJ, van den Heuvel LP, Willems PH, Zeviani M, Smeitink JA, Nijtmans LG (říjen 2005). „Sestava I lidského mitochondriálního komplexu je zprostředkována NDUFAF1“. Časopis FEBS. 272 (20): 5317–26. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.04928.x. PMID 16218961.
- ^ „NDUFAF1 - komplex I se středně asociovaným proteinem 30, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFAF1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-23.
- ^ Donald., Voet (2013). Základy biochemie: život na molekulární úrovni. Voet, Judith G., Pratt, Charlotte W. (čtvrté vydání). Hoboken, NJ: Wiley. ISBN 9780470547847. OCLC 738349533.
- ^ A b Fassone E, Taanman JW, Hargreaves IP, Sebire NJ, Cleary MA, Burch M, Rahman S (říjen 2011). „Mutace v mitochondriálním komplexu I montážního faktoru NDUFAF1 způsobují fatální infantilní hypertrofickou kardiomyopatii“. Journal of Medical Genetics. 48 (10): 691–7. doi:10.1136 / jmedgenet-2011-100340. PMID 21931170.
- ^ A b Wu L, Peng J, Ma Y, He F, Deng X, Wang G, Lifen Y, Yin F (2016). „Leukodystrofie spojená s nedostatkem mitochondriálního komplexu I v důsledku nové mutace v genu NDUFAF1“. Mitochondriální DNA část A. 27 (2): 1034–7. doi:10.3109/19401736.2014.926543. PMID 24963768.
- ^ A b C Dunning CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (červenec 2007). „Lidská CIA30 je zapojena do časného sestavení mitochondriálního komplexu I a mutací v jeho genu způsobujícím onemocnění“. Časopis EMBO. 26 (13): 3227–37. doi:10.1038 / sj.emboj.7601748. PMC 1914096. PMID 17557076.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ Yao, Daniel. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-23.
- ^ „Nedostatek mitochondriálního komplexu I“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-23.
- ^ „pnliprp1-ndufaf1-1“. IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ "tmem97-ndufaf1-1". IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ "tmem86b-ndufaf1-1". IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ „yipf6-ndufaf1-1“. IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ "slc30a2-ndufaf1-1". IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ "atic-ndufaf1". IntAct. Citováno 2018-07-23.
- ^ „magea11-ndufaf1“. IntAct. Citováno 2018-07-23.
Další čtení
- Küffner R, Rohr A, Schmiede A, Krüll C, Schulte U (říjen 1998). "Zapojení dvou nových chaperonů do sestavy mitochondriálního NADH: ubichinon oxidoreduktáza (komplex I)". Journal of Molecular Biology. 283 (2): 409–17. doi:10.1006 / jmbi.1998.2114. PMID 9769214.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
- Vogel RO, Janssen RJ, van den Brand MA, Dieteren CE, Verkaart S, Koopman WJ, Willems PH, Pluk W, van den Heuvel LP, Smeitink JA, Nijtmans LG (březen 2007). „Cytosolický signální protein Ecsit se také lokalizuje do mitochondrií, kde interaguje s chaperonem NDUFAF1 a funguje v komplexu I“. Geny a vývoj. 21 (5): 615–24. doi:10,1101 / gad.408407. PMC 1820902. PMID 17344420.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- Vogel RO, van den Brand MA, Rodenburg RJ, van den Heuvel LP, Tsuneoka M, Smeitink JA, Nijtmans LG (červen 2007). „Vyšetřování komplexu I montážních chaperonů B17.2L a NDUFAF1 v kohortě pacientů s deficitem CI“. Molekulární genetika a metabolismus. 91 (2): 176–82. doi:10.1016 / j.ymgme.2007.02.007. PMID 17383918.
- Dunning CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (červenec 2007). „Lidská CIA30 je zapojena do časného sestavení mitochondriálního komplexu I a mutací v jeho genu způsobujícím onemocnění“. Časopis EMBO. 26 (13): 3227–37. doi:10.1038 / sj.emboj.7601748. PMC 1914096. PMID 17557076.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.