TIMP3 - TIMP3

TIMP3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3CKI
Identifikátory
Aliasy	TIMP3, HSMRK222, K222, K222TA2, SFD, inhibitor metalopeptidázy TIMP 3
Externí ID	OMIM: 188826 MGI: 98754 HomoloGene: 36322 Genové karty: TIMP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	32,863,043 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	86,349,506 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru peptidázy; • GO: 0048551 aktivita inhibitoru enzymu; • vazba kovových iontů; • vazba proteázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru metaloendopeptidázy;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • bazální membrána; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • extracelulární oblast; • lumen granulí hustého granulí; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• buněčná odpověď na organickou látku; • negativní regulace aktivity peptidázy; • reakce na podnět; • pozitivní regulace TRAIL aktivované apoptotické signální dráhy; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • negativní regulace proteolýzy ektodomény membránového proteinu; • Vizuální vnímání; • degranulace krevních destiček; • reakce na organickou látku; • negativní regulace aktivity metaloendopeptidázy; • reakce na hormon; • negativní regulace aktivity endopeptidázy; • reakce na cytokiny;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7078
	21859
	ENSG00000100234
	ENSMUSG00000020044
	P35625
	P39876
	NM_000362
	NM_011595
	NP_000353
	NP_035725
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor metaloproteinázy 3 je protein že u lidí je kódován TIMP3 gen.^[5]^[6]

Tento gen patří do tkáňový inhibitor metaloproteináz genová rodina. Proteiny kódované touto genovou rodinou jsou inhibitory matricové metaloproteinázy, skupina peptidáz účastnících se degradace extracelulární matrix (ECM). Exprese tohoto genu je indukována v reakci na mitogenní stimulaci a tak dále netrin protein obsahující doménu je lokalizován na ECM. Mutace v tomto gen byly spojeny s autosomálně dominantní porucha Sorsbyho dystrofie fundusu.^[7]

Viz také

TIMP1, TIMP2, TIMP4

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100234 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020044 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Apte SS, Mattei MG, Olsen BR (červen 1994). „Klonování cDNA kódující inhibitor lidské tkáně metaloproteináz-3 (TIMP-3) a mapování genu TIMP3 na chromozom 22“. Genomika. 19 (1): 86–90. doi:10.1006 / geno.1994.1016. PMID 8188246.
^ Qi JH, Ebrahem Q, Moore N, Murphy G, Claesson-Welsh L, Bond M, Baker A, Anand-Apte B (duben 2003). „Nová funkce pro tkáňový inhibitor metaloproteináz-3 (TIMP3): inhibice angiogeneze blokováním vazby VEGF na VEGF receptor-2“. Nat Med. 9 (4): 407–15. doi:10,1038 / nm846. PMID 12652295.
^ „Entrez Gene: TIMP3 TIMP inhibitor metalopeptidázy 3 (dystrofie Sorsby fundus, pseudozánětlivá)“.

Další čtení

Li Z, Clarke MP, Barker MD, McKie N (2007). "TIMP3 mutace v Sorsbyho fundus dystrofii: molekulární vhledy". Recenze odborníků v molekulární medicíně. 7 (24): 1–15. doi:10.1017 / S1462399405010045. PMID 16259644.
Docherty AJ, Lyons A, Smith BJ a kol. (1985). "Posloupnost inhibitoru lidské tkáně metaloproteináz a jeho identita s aktivitou podporující erytroid". Příroda. 318 (6041): 66–9. Bibcode:1985 Natur.318 ... 66D. doi:10.1038 / 318066a0. PMID 3903517.
Forsius HR, Eriksson AW, Suvanto EA, Alanko HI (1983). "Pseudoinflammatory fundus dystrophy with autosomal recesive inheritance". Dopoledne. J. Ophthalmol. 94 (5): 634–49. doi:10.1016/0002-9394(82)90009-5. PMID 7148944.
Wick M, Härönen R, Mumberg D a kol. (1995). „Struktura lidského genu TIMP-3 a jeho promotor regulovaný buněčným cyklem“. Biochem. J. 311. (Pt 2) (2): 549–54. doi:10.1042 / bj3110549. PMC 1136034. PMID 7487894.
Jacobson SG, Cideciyan AV, Regunath G a kol. (1995). „Noční slepota u Sorsbyho dystrofie fundusu zvrácená vitaminem A.“. Nat. Genet. 11 (1): 27–32. doi:10.1038 / ng0995-27. PMID 7550309.
Higuchi T, Kanzaki H, Nakayama H a kol. (1995). "Indukce tkáňového inhibitoru exprese genu metaloproteinázy 3 během in vitro decidualizace lidských stromálních buněk endometria". Endokrinologie. 136 (11): 4973–81. doi:10.1210 / cs.136.11.4973. PMID 7588231.
Wilde CG, Hawkins PR, Coleman RT a kol. (1995). „Klonování a charakterizace inhibitoru metaloproteináz-3 v lidské tkáni“. DNA Cell Biol. 13 (7): 711–8. doi:10.1089 / dna.1994.13.711. PMID 7772252.
Apte SS, Olsen BR, Murphy G (1995). „Genová struktura tkáňového inhibitoru metaloproteináz (TIMP) -3 a její inhibiční aktivity definují odlišnou genovou rodinu TIMP.“. J. Biol. Chem. 270 (24): 14313–8. doi:10.1074 / jbc.270.24.14313. PMID 7782289.
Kishnani NS, Staskus PW, Yang TT a kol. (1995). "Identifikace a charakterizace lidského tkáňového inhibitoru metaloproteinázy-3 a detekce tří dalších aktivit inhibitoru metaloproteinázy v extracelulární matrici". Matrix Biol. 14 (6): 479–88. doi:10.1016 / 0945-053X (95) 90005-5. PMID 7795886.
Weber BH, Vogt G, Pruett RC a kol. (1995). „Mutace v tkáňovém inhibitoru metaloproteináz-3 (TIMP3) u pacientů s dystrofií fundu Sorsbyho“. Nat. Genet. 8 (4): 352–6. doi:10.1038 / ng1294-352. PMID 7894485.
Weber BH, Vogt G, Wolz W a kol. (1994). „Sorsbyho dystrofie fundusu je geneticky spojena s chromozomem 22q13-qter“. Nat. Genet. 7 (2): 158–61. doi:10.1038 / ng0694-158. PMID 7920634.
Jones SE, Jomary C, Neal MJ (1994). „Exprese mRNA TIMP3 je zvýšena v sítnicích postižených simplexní retinitis pigmentosa“. FEBS Lett. 352 (2): 171–4. doi:10.1016/0014-5793(94)00951-1. PMID 7925969.
Wick M, Bürger C, Brüsselbach S, et al. (1994). „Nový člen rodiny genů inhibitoru metaloproteináz (TIMP) v lidské tkáni je regulován během progrese G1, mitogenní stimulace, diferenciace a stárnutí.“ J. Biol. Chem. 269 (29): 18953–60. PMID 8034652.
Silbiger SM, Jacobsen VL, Cupples RL, Koski RA (1994). „Klonování cDNA kódujících lidský TIMP-3, nový člen tkáňového inhibitoru rodiny metaloproteináz“. Gen. 141 (2): 293–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90588-6. PMID 8163205.
Uría JA, Ferrando AA, Velasco G a kol. (1994). "Struktura a exprese v nádorech prsu lidského TIMP-3, nového člena rodiny inhibitorů metaloproteinázy". Cancer Res. 54 (8): 2091–4. PMID 8174111.
Byrne JA, Tomasetto C, Rouyer N a kol. (1996). „Tkáňový inhibitor metaloproteináz-3 genu u karcinomu prsu: identifikace více polyadenylačních míst a stromální vzor exprese“. Mol. Med. 1 (4): 418–27. doi:10.1007 / BF03401579. PMC 2229996. PMID 8521299.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Felbor U, Stöhr H, Amann T a kol. (1996). „Nová mutace Ser156Cys v tkáňovém inhibitoru metaloproteináz-3 (TIMP3) v Sorsbyho dystrofii fundusu s neobvyklými klinickými rysy“. Hučení. Mol. Genet. 4 (12): 2415–6. doi:10,1093 / hmg / 4,12,2415. PMID 8634721.
Carrero-Valenzuela RD, Klein ML, Weleber RG a kol. (1996). "Dystrofie Sorsby fundus. Rodina s mutací Ser181Cys tkáňového inhibitoru metaloproteináz 3". Oblouk. Oftalmol. 114 (6): 737–8. doi:10.1001 / archopht.1996.01100130729016. PMID 8639088.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: I35.003

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100234 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020044 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8188246-5] Apte SS, Mattei MG, Olsen BR (červen 1994). „Klonování cDNA kódující inhibitor lidské tkáně metaloproteináz-3 (TIMP-3) a mapování genu TIMP3 na chromozom 22“. Genomika. 19 (1): 86–90. doi:10.1006 / geno.1994.1016. PMID 8188246.

[pmid12652295-6] Qi JH, Ebrahem Q, Moore N, Murphy G, Claesson-Welsh L, Bond M, Baker A, Anand-Apte B (duben 2003). „Nová funkce pro tkáňový inhibitor metaloproteináz-3 (TIMP3): inhibice angiogeneze blokováním vazby VEGF na VEGF receptor-2“. Nat Med. 9 (4): 407–15. doi:10,1038 / nm846. PMID 12652295.

[7] „Entrez Gene: TIMP3 TIMP inhibitor metalopeptidázy 3 (dystrofie Sorsby fundus, pseudozánětlivá)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]