OSUD 1 - FATE1
OSUD 1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | OSUD 1, CT43, FATE, fetální a dospělý varle vyjádřený 1 | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 300450 HomoloGene: 57202 Genové karty: OSUD 1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) |
| ||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr X: 151,72 - 151,72 Mb | n / a | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [2] | n / a | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Vyjádření plodu a dospělých varlat 1, kódováno OSUD 1 gen u lidí, je protein identifikován jako antigen rakoviny varlat (CTA) u hepatocelulárních karcinomů a rakoviny žaludku a tlustého střeva.[3][4][5] Je specifický pro varlata v plod (ve věku 6-11 týdnů). U dospělých je exprimován převážně v varle a nadledviny, s určitým výrazem v plicích, srdci, ledvinách a v celém mozku.[6][7][Citace je zapotřebí ]
FATE1 je členem Miff rodina proteinů se svou C-terminální doménou, sestávající z transmembránové domény s doménou coil-coil, vykazující vysokou podobnost s mitochondriální štěpný faktor (MFF) protein, který se účastní štěpení mitochondrií a peroxisomů.[5]
Poloha genu
OSUD 1 Gen u lidí se nachází na dlouhém rameni X chromozom v regionu 28, od základní pár 150 884 502 na základní pár 150 891 617.[3][8]
Mechanismus
Předpokládala se hypotéza, že FATE1 používá k připojení svoji C-terminální transmembránovou doménu endoplazmatické retikulum (ER) membránou a jejím C-koncem svinutá cívka doména interaguje s mitochondriemi.[5]
FATE1 je lokalizován v ER membránách (MAM) asociovaných s mitochondriemi a moduluje vzdálenost ER-mitochondrií k regulaci Ca2+- a na drogách závislá apoptóza v rakovinných buňkách.[5]
Exprese FATE1 vede ke snížení Ca2+ absorpce mitochondriemi, a proto snížení fragmentace mitochondrií, spojené s mitochondriálním Ca2+ absorpce, což následně poskytuje ochranu před smrtí buněk.[9]
Vztah k rakovině
FATE1 je detekovatelný ve všech buněčných liniích odvozených od nádorů, ale je nízký nebo nedetekovatelný v imortalizovaných, nenádorotigenních fibroblastech a buňkách plicního epitelu. FATE1 se považuje za nezbytný pro přežití nádorových buněk, protože vyčerpání FATE1 vede ke snížení životaschopnosti v nastavení melanomu, prsu, prostaty a sarkomu.[10]
Upregulace FATE1 transkripčním faktorem steroidogenní faktor-1 (SF-1), podílející se na vývoji nadledvin a gonad, stejně jako na adrenokortikálním karcinomu, zvyšuje vzdálenost ER-mitochondrií a je využíván rakovinnými buňkami k funkčnímu oddělení ER a mitochondrií.[5]
Ztlumení OSUD 1 Gen senzibilizuje nemalobuněčné buněčné linie rakoviny plic na paclitaxel, chemoterapeutický lék proti mnoha různým typům rakoviny.[11]
Zjistilo se, že zvýšená hladina FATE1 je spojena s vyšší mírou úmrtnosti na kolorektální karcinomy, ale u nemalobuněčných karcinomů plic samotné zvýšení FATE1 nesnížilo šanci na přežití, ale snížilo se, pokud RNF183 výraz je také zvýšen.[10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147378 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Olesen C, Larsen NJ, Byskov AG, Harboe TL, Tommerup N (listopad 2001). „Human FATE je nový gen vázaný na X exprimovaný ve fetálních a dospělých varlatech.“ Molekulární a buněčná endokrinologie. 184 (1–2): 25–32. doi:10.1016 / S0303-7207 (01) 00666-9. PMID 11694338.
- ^ „Entrez Gene: FATE1 fetální a dospělý varle vyjádřený 1“.
- ^ A b C d E Doghman-Bouguerra M, Granatiero V, Sbiera S, Sbiera I, Lacas-Gervais S, Brau F, Fassnacht M, Rizzuto R, Lalli E (září 2016). „FATE1 antagonizuje apoptózu vyvolanou vápníkem a léčivem odpojením ER a mitochondrií“. Zprávy EMBO. 17 (9): 1264–80. doi:10.15252 / embr.201541504. PMC 5007562. PMID 27402544.
- ^ Dong XY, Su YR, Qian XP, Yang XA, Pang XW, Wu HY, Chen WF (červenec 2003). „Identifikace dvou nových CT antigenů a jejich schopnosti vyvolat protilátkovou odpověď u pacientů s hepatocelulárním karcinomem“. British Journal of Cancer. 89 (2): 291–7. doi:10.1038 / sj.bjc.6601062. PMC 2394243. PMID 12865919.
- ^ Yang XA, Dong XY, Qiao H, Wang YD, Peng JR, Li Y, Pang XW, Tian C, Chen WF (únor 2005). "Imunohistochemická analýza exprese antigenu FATE / BJ-HCC-2 v normálních a maligních tkáních". Laboratorní vyšetřování; Journal of Technical Methods and Pathology. 85 (2): 205–13. doi:10.1038 / labinvest.3700220. PMID 15580283.
- ^ Danielle Thierry-Mieg a Jean Thierry-Mieg, NCBI / NLM / NIH. „AceView: Gene: FATE1, komplexní anotace genů člověka, myši a červa s mRNA nebo ESTsAceView“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-11-09.
- ^ Szabadkai G, Simoni AM, Bianchi K, De Stefani D, Leo S, Wieckowski MR, Rizzuto R (2006-05-01). "Mitochondriální dynamika a signalizace Ca2 +". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1763 (5–6): 442–9. doi:10.1016 / j.bbamcr.2006.04.002. PMID 16750865.
- ^ A b Maxfield KE, Taus PJ, Corcoran K, Wooten J, Macion J, Zhou Y, Borromeo M, Kollipara RK, Yan J, Xie Y, Xie XJ, Whitehurst AW (listopad 2015). „Komplexní funkční charakterizace antigenů rakoviny varlat definuje povinnou účast na mnoha charakteristikách rakoviny“. Příroda komunikace. 6 (1): 8840. doi:10.1038 / ncomms9840. PMC 4660212. PMID 26567849.
- ^ Whitehurst AW, Bodemann BO, Cardenas J, Ferguson D, Girard L, Peyton M, Minna JD, Michnoff C, Hao W, Roth MG, Xie XJ, White MA (duben 2007). "Syntetická letální screeningová identifikace lokusů chemosenzibilizátoru v rakovinných buňkách". Příroda. 446 (7137): 815–9. doi:10.1038 / nature05697. PMID 17429401.
Další čtení
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Olesen C, Hansen C, Bendsen E, Byskov AG, Schwinger E, Lopez-Pajares I, Jensen PK, Kristoffersson U, Schubert R, Van Assche E, Wahlstroem J, Lespinasse J, Tommerup N (leden 2001). "Identifikace lidských kandidátských genů pro mužskou neplodnost pomocí digitálního diferenciálního zobrazení". Molekulární lidská reprodukce. 7 (1): 11–20. doi:10.1093 / mol / 7.1.11. PMID 11134355.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Olesen C, Silber J, Eiberg H, Ernst E, Petersen K, Lindenberg S, Tommerup N (srpen 2003). "Mutační analýza lidského genu FATE u 144 neplodných mužů". Genetika člověka. 113 (3): 195–201. doi:10.1007 / s00439-003-0974-9. PMID 12811541.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |