RXNO Ontologie - RXNO Ontology
The RXNO Ontologie je formální ontologie chemické látky pojmenované reakce.[1][2]Původně byl vyvinut na Royal Society of Chemistry (RSC) a je spojen s Otevřete slévárnu biomedicínských ontologií. RXNO ontologie sjednocuje několik předchozích pokusů o systematizaci chemických reakcí, včetně Index společnosti Merck a hierarchie Carey, Laffan, Thomson a Williams.[3][4]
Kategorie hlavních reakcí
V následující tabulce je uvedeno dvanáct kategorií reakcí na nejvyšší úrovni, které navrhli Carey, Laffan, Thompson a Williams, spolu s jejich ontologickými identifikátory RXNO a případně ekvivalentními kategoriemi wikipedie.[3]
| Index | Kategorie reakce | RXNO ID | Kategorie Wikipedia |
|---|---|---|---|
| 1 | Heteroatomová alkylace a arylace | Kategorie: Reakce tvořící vazbu uhlík-heteroatom | |
| 2 | Acylace a související procesy | ||
| 3 | Tvorba vazby uhlík-uhlík | RXNO: 0000002 | Kategorie: Reakce tvořící vazbu uhlík-uhlík |
| 4 | Reakce tvořící heterocyklus | RXNO: 0000349 | Kategorie: Heterocyklické reakce |
| 5 | Ochranné reakce | RXNO: 0000078 | |
| 6 | Deprotekční reakce | RXNO: 0000203 | |
| 7 | Snížení | Kategorie: Organické redukční reakce | |
| 8 | Oxidace | Kategorie: Organické oxidační reakce | |
| 9 | Interkonverze funkční skupiny (FGI) | RXNO: 0000011 | Kategorie: Substituční reakce |
| 10 | Přidání funkční skupiny (FGA) | ||
| 11 | Reakce na řešení | ||
| 12 | Smíšený | Kategorie: Organické reakce |
Reakce na jméno
V následující tabulce jsou uvedeny identifikátory RXNO pro některé příklady reakce na jméno.
- RXNO: 0000003 Perkinova reakce
- RNXO: 0000006 Diels-Alderova reakce
- RXNO: 0000014 Grignardova reakce
- RXNO: 0000015 Wittigova reakce
- RXNO: 0000021 Sandmeyerova reakce
- RXNO: 0000024 Heck reakce
- RXNO: 0000026 Beckmann přesmyk
- RXNO: 0000028 Vyrovnejte přeskupení
- RXNO: 0000031 Baeyerova-Villigerova oxidace
- RXNO: 0000042 Snížení břízy
- RXNO: 0000043 Claisenova kondenzace
- RXNO: 0000056 Horner – Wadsworth – Emmonsova reakce
- RXNO: 0000062 Skraupova reakce
- RXNO: 0000064 Fischerova syntéza indolu
- RXNO: 0000074 Wurtzova reakce
- RXNO: 0000081 Ullmannova kondenzace
- RXNO: 0000084 Barbierova reakce
- RXNO: 0000088 Spojka Negishi
- RXNO: 0000090 Williamsonova etherová syntéza
- RXNO: 0000098 Glaserová spojka
- RXNO: 0000103 Gabriel syntéza
- RXNO: 0000106 Hunsdieckerova reakce
- RXNO: 0000140 Suzukiho reakce
- RXNO: 0000147 Emde degradace
- RXNO: 0000148 Claisenův přesmyk
- RXNO: 0000156 Lossenův přesmyk
- RXNO: 0000157 Nef reakce
- RXNO: 0000183 Perkowova reakce
- RXNO: 0000193 Hiyama spojka
- RXNO: 0000210 Fleming-Tamao oxidace
- RXNO: 0000218 Cannizzaro reakce
- RXNO: 0000288 Rosenmund – von Braunova reakce
- RXNO: 0000369 Friedel – Craftsova reakce
- RXNO: 0000444 Hranolky přesmyk
- RXNO: 0000550 Collinsova oxidace
Viz také
Reference
- ^ Schneider, Nadine; Lowe, Daniel; Sayle, Roger; Tarselli, Michael; Landrum, Gregory (2016). „Velké údaje z farmaceutických patentů: výpočetní analýza chleba a másla léčivých chemiků“. J. Med. Chem. 59 (9): 4385–4402. doi:10.1021 / acs.jmedchem.6b00153. PMID 27028220.
- ^ Schneider, Nadine; Lowe, Daniel; Sayle, Roger; Landrum, Gregory (leden 2015). „Vývoj nového otisku prstu pro chemické reakce a jeho aplikace na klasifikaci a podobnost reakcí ve velkém měřítku“. Journal of Chemical Information and Modeling. 55: 39–53. doi:10.1021 / ci5006614. PMID 25541888.
- ^ A b Carey, JS; Laffan, D; Thomson, C; Williams, MT (květen 2006). "Analýza reakcí použitých pro přípravu molekul kandidátů na léčivo". Organická a biomolekulární chemie. 4: 2337–2347. doi:10.1039 / B602413K. PMID 16763676.
- ^ Roughley, Stephen D .; Jordan, Allan M. (květen 2011). „The Medicinal Chemist's Toolbox: Analýza reakcí použitých při hledání kandidátů na léky“. Journal of Medicinal Chemistry. 54: 3451–79. doi:10.1021 / jm200187y. PMID 21504168.