Pektin lyáza - Pectin lyase
| pektin lyáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 4.2.2.10 | ||||||||
| Číslo CAS | 9033-35-6 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a pektin lyáza také známý jako pektolyáza je přirozeně se vyskytující pektináza typ enzym který degraduje pektin. Vyrábí se komerčně pro potravinářský průmysl z hub a slouží ke zničení zbytků ovoce škrob, známý jako pektin, v víno a jablečný mošt. V rostlinné buněčné kultuře se používá v kombinaci s enzymem celuláza vygenerovat protoplasty degradací rostliny buněčné stěny.
Pektin lyáza je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- Eliminativní štěpení (1-> 4) -alfa-D-galakturonan methylesteru za vzniku oligosacharidů s 4-deoxy-6-0-methyl-alfa-D-galakt-4-enuronosylovými skupinami na jejich neredukujících koncích
Tento enzym patří do rodiny lyázy konkrétně ty lyázy uhlík-kyslík působící na polysacharidy.
Nomenklatura
The systematické jméno této třídy enzymů je (1-> 4) -6-0-methyl-alfa-D-galakturonan lyáza. Mezi další běžně používaná jména patří:
- endo-pektin lyáza,
- pektin methyltranselimináza,
- pektin trans-elimináza,
- pectolyase,
- PL,
- PMGL,
- PNL a
- polymethylgalakturonová transelimináza.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 3 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1IDJ, 1IDK, a 1QCX.
Biotechnologické aplikace
Pektinové lyázy jsou jediné známé pektinázy schopné degradovat vysoce esterifikované pektiny (podobné těm, které se nacházejí v ovoci) na malé molekuly prostřednictvím mechanismu eliminace β bez produkce methanolu (který je toxický), na rozdíl od kombinace PG a PE, které jsou obvykle lze nalézt v komerčních produktech. Kromě toho může být přítomnost nežádoucí enzymatické aktivity v komerčních pektinázách škodlivá pro aroma, protože jsou odpovědné za produkci nepříjemně těkavé vůně. Existuje mnoho zpráv o vyčištění ovocné šťávy pektinovými lyázami.
Alkalická pektináza není vhodná pro použití v potravinářském průmyslu kvůli kyselému pH ovocných šťáv. V textilním průmyslu však mají velmi vysokou poptávku. Používají se k máčení rostlinných vláken, jako jsou ramie, sunn konopí, juta, len a konopí. První zpráva o máčení slunečního konopí (Crotalaria juncea) pektinovou lyázou produkovanou Aspergillus flavus MTCC 7589 byl publikován v roce 2008, ale tento aspekt pektin lyáz je třeba dále důkladně prozkoumat.[1][2][3][4]
Reference
- ^ Yadav S, Yadav PK, Yadav D, Yadav KD (2008). „Čištění a charakterizace kyselé pektinové lyázy produkované kmenem Aspergillus ficuum MTCC 7591 vhodným pro čiření ovocných šťáv“. Annals of Microbiology. 58 (1): 61–65. doi:10.1007 / BF03179446. S2CID 34944691.
- ^ Yadav S, Yadav PK, Yadav D, Yadav KD (2008). "Čištění a charakterizace alkalické pektin lyázy z Aspergillus flavus". Process Biochem. 43 (5): 547–552. doi:10.1016 / j.procbio.2008.01.015.
- ^ Mantovani CF, Geimba MP, Brandelli A (2005). "Enzymatické čištění ovocných šťáv pomocí plísňové pektinové lyázy". Potravinový biotechnol. 19 (3): 173–181. doi:10.1080/08905430500316284. S2CID 83712284.
- ^ Kapoor M, Beg QK, Bhushan B, Singh K, Dadhich KS, Hoondal GS (2001). „Aplikace alkalické termostabilní polygalakturonázy z Bacillus sp. MG-ep-2 při degumování lýkových vláken ramie (Boehemeria nivea) a konopí (Crotalaria juncea)“. Process Biochem. 6: 803–807. doi:10.1016 / S0032-9592 (00) 00282-X.
Další čtení
- Albersheim P, Neukom H, Deuel H (1960). „Uber die Bildung von ungesattigten Abbauprodukten durch ein pekinabbauendes Enzym“. Helv. Chim. Acta. 43 (5): 1422–1426. doi:10,1002 / hlca.19600430525.
- Pickersgill R, Jenkins J. (1997). „Dvě krystalové struktury pektin lyázy A z Aspergillus odhalují konformační změnu řízenou pH a nápadnou divergenci v rozštěpech pektinu a pektát lyáz vázajících substrát“. Struktura. 5 (5): 677–89. doi:10.1016 / S0969-2126 (97) 00222-0. PMID 9195887.
- Kester HC, Visser J (1994). „Čištění a charakterizace pektin lyázy B, nového pektinolytického enzymu z Aspergillus niger“. FEMS Microbiol. Lett. 120 (1–2): 63–68. doi:10.1111 / j.1574-6968.1994.tb07008.x.
- Mutenda KE, Korner R, Christensen TM, Mikkelsen J, Roepstorff P (2002). "Aplikace hmotnostní spektrometrie ke stanovení aktivity a specificity pektin lyázy A". Sacharidy. Res. 337 (13): 1217–27. doi:10.1016 / S0008-6215 (02) 00127-1. PMID 12110197.
