Nucleoporin 214 - Nucleoporin 214 - Wikipedia
Nucleoporin 214 (Nup2014) je protein že u lidí je kódován NUP214 gen.[5][6][7]
Funkce
The jaderný pór komplex je masivní struktura, která sahá přes jaderný obal a tvoří bránu, která reguluje tok makromolekuly mezi jádrem a cytoplazma. Nukleoporiny jsou hlavními složkami komplexu jaderných pórů v eukaryotický buňky. Tento gen je členem nukleoporinů obsahujících opakování FG. Protein kódovaný tímto genem je lokalizován na cytoplazmatickém povrchu komplexu jaderných pórů, kde je vyžadován pro správnou buněčný cyklus progrese a nukleocytoplazmatický transport. 3 'část tohoto genu tvoří fúzní gen s DEK gen na chromozomu 6 vt (6,9) přemístění spojený s Akutní myeloidní leukémie a myelodysplastický syndrom.[7]
Struktura
Struktura N-terminál doména Nup214 odhaluje sedmilistý záhyb beta-vrtule následovaný 30 zbytky C-terminál prodloužený peptidový segment (CTE). CTE se sklopí zpět na vrtule beta a váže se na spodní stranu.[8] Struktura Nup214 NTD navázaná na helikázu Ddx19 v jejím stavu vázaném na ADP odhaluje molekulární základ pro interakci mezi těmito dvěma proteiny. Ukazuje se, že konzervovaný zbytek Ddx19 je rozhodující pro tvorbu komplexu in vitro a in vivo. Je překvapivé, že interakční povrchy vykazují silně protichůdné povrchové potenciály, přičemž povrch helikázy je kladně a povrch Nup214 je záporně nabitý. Ukázalo se, že Ddx19 váže RNA pouze ve stavu vázaném na ATP a vazba RNA a Nup214 NTD se vzájemně vylučuje.[9]
Interakce
NUP214 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126883 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001855 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Kraemer D, Wozniak RW, Blobel G, Radu A (únor 1994). „Lidský protein CAN, domnělý produkt onkogenu spojený s myeloidní leukemogenezí, je protein komplexu jaderných pórů, který čelí cytoplazmě.“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (4): 1519–23. doi:10.1073 / pnas.91.4.1519. PMC 43191. PMID 8108440.
- ^ von Lindern M, Poustka A, Lerach H, Grosveld G (srpen 1990). „Translokace chromozomu (6; 9), spojená se specifickým podtypem akutní nelymfocytové leukémie, vede k aberantní transkripci cílového genu na 9q34“. Molekulární a buněčná biologie. 10 (8): 4016–26. doi:10,1128 / mcb. 10.8.4016. PMC 360912. PMID 2370860.
- ^ A b „Entrezův gen: NUP214 nukleoporin 214 kDa“.
- ^ Napetschnig J, Blobel G, Hoelz A (2007). "Krystalová struktura N-terminální domény lidského protoonkogenu Nup214 / CAN". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (6): 1783–8. doi:10.1073 / pnas.0610828104. PMC 1794303. PMID 17264208.
- ^ A b Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). „Strukturální a funkční analýza interakce mezi nukleoporinem Nup214 a DEAD-box helikázou Ddx19“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (9): 3089–94. doi:10.1073 / pnas.0813267106. PMC 2651337. PMID 19208808.
- ^ A b Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (prosinec 2000). „TAP (NXF1) patří do multigenní rodiny domnělých faktorů exportu RNA se zachovanou modulární architekturou“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (23): 8996–9008. doi:10,1128 / mcb.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553. PMID 11073998.
- ^ Schmitt I, Gerace L (listopad 2001). „In vitro analýza jaderného transportu zprostředkovaná C-koncovou kyvadlovou doménou Tap“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45): 42355–63. doi:10,1074 / jbc.M103916200. PMID 11551912.
- ^ Carman JA, Nadler SG (březen 2004). "Přímá asociace tristetraprolinu s nukleoporinem CAN / Nup214". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 315 (2): 445–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.01.080. PMID 14766228.
Další čtení
- Stoffler D, Fahrenkrog B, Aebi U (červen 1999). "Komplex jaderných pórů: od molekulární architektury k funkční dynamice". Současný názor na buněčnou biologii. 11 (3): 391–401. doi:10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6. PMID 10395558.
- von Lindern M, Fornerod M, van Baal S, Jaegle M, de Wit T, Buijs A, Grosveld G (duben 1992). „Translokace (6; 9), spojená se specifickým podtypem akutní myeloidní leukémie, má za následek fúzi dvou genů, dek a can, a expresi chimérické, leukemicky specifické dek-can mRNA.“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (4): 1687–97. doi:10.1128 / mcb.12.4.1687. PMC 369612. PMID 1549122.
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. I. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0001-KIAA0040) odvozené analýzou náhodně vzorkovaných cDNA klonů z lidské nezralé myeloidní buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 1 (1): 27–35. doi:10.1093 / dnares / 1.1.27. PMID 7584026.
- Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. I. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0001-KIAA0040) odvozené analýzou náhodně vzorkovaných cDNA klonů z lidské nezralé myeloidní buněčné linie KG-1 (doplněk)". Výzkum DNA. 1 (1): 47–56. doi:10.1093 / dnares / 1.1.47. PMID 7584028.
- Pilz A, Woodward K, Povey S, Abbott C (leden 1995). "Srovnávací mapování 50 lokusů lidského chromozomu 9 u laboratorní myši". Genomika. 25 (1): 139–49. doi:10.1016/0888-7543(95)80119-7. PMID 7774911.
- Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (prosinec 1996). „Role opakujících se domén nukleoporinových FG při exportu proteinu a RNA viru lidské imunodeficience typu 1 a RNA z jádra“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (12): 7144–50. doi:10,1128 / mcb.16.12.7144. PMC 231718. PMID 8943370.
- Fornerod M, van Deursen J, van Baal S, Reynolds A, Davis D, Murti KG, Fransen J, Grosveld G (únor 1997). „Lidský homolog kvasinek CRM1 je v dynamickém subkomplexu s CAN / Nup214 a novou složkou jaderných pórů Nup88“. Časopis EMBO. 16 (4): 807–16. doi:10.1093 / emboj / 16.4.807. PMC 1169681. PMID 9049309.
- Yaseen NR, Blobel G (duben 1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu beta3". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (9): 4451–6. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC 20743. PMID 9114010.
- Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (květen 1997). „Karyopherin beta2 zprostředkovává jaderný import proteinu vázajícího mRNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (10): 5055–60. doi:10.1073 / pnas.94.10.5055. PMC 24630. PMID 9144189.
- Bastos R, Ribas de Pouplana L, Enarson M, Bodoor K, Burke B (červen 1997). „Nup84, nový nukleoporin, který je asociován s CAN / Nup214 na cytoplazmatické ploše komplexu jaderných pórů“. The Journal of Cell Biology. 137 (5): 989–1000. doi:10.1083 / jcb.137.5.989. PMC 2136229. PMID 9166401.
- Boer J, Bonten-Surtel J, Grosveld G (březen 1998). „Nadměrná exprese nukleoporinu CAN / NUP214 indukuje zastavení růstu, poruchy transportu nukleocytů a apoptózu“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (3): 1236–47. doi:10.1128 / mcb.18.3.1236. PMC 108836. PMID 9488438.
- Bogerd HP, Echarri A, Ross TM, Cullen BR (listopad 1998). „Inhibice funkce viru lidské imunodeficience Rev a viru lidské leukémie T-buněk Rex, ale ne konstitutivní aktivita transportního prvku viru opice Mason-Pfizer, mutantním lidským nukleoporinem zaměřeným na Crm1“. Journal of Virology. 72 (11): 8627–35. doi:10.1128 / JVI.72.11.8627-8635.1998. PMC 110274. PMID 9765402.
- Zolotukhin AS, Felber BK (leden 1999). „Nukleoporiny nup98 a nup214 se podílejí na jaderném exportu viru lidské imunodeficience typu 1 Rev“. Journal of Virology. 73 (1): 120–7. doi:10.1128 / JVI.73.1.120-127.1999. PMC 103815. PMID 9847314.
- Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Panté N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Séraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (srpen 1999). „Dbp5, protein DEAD-box požadovaný pro export mRNA, je získáván do cytoplazmatických fibril komplexu jaderných pórů konzervovanou interakcí s CAN / Nup159p“. Časopis EMBO. 18 (15): 4332–47. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4332. PMC 1171509. PMID 10428971.
- Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M, Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (leden 2000). „C-koncová doména TAP interaguje s komplexem jaderných pórů a podporuje export specifických substrátů RNA nesoucích CTE“. RNA. 6 (1): 136–58. doi:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
- Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (prosinec 2000). „TAP (NXF1) patří do multigenní rodiny domnělých faktorů exportu RNA se zachovanou modulární architekturou“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (23): 8996–9008. doi:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553. PMID 11073998.
- Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (březen 2001). „Požadavky na kofaktor pro jaderný export prvku Rev response element (RRE) - a retrovirových RNA obsahujících konstitutivní transportní prvek (CTE). Neočekávaná role aktinu“. The Journal of Cell Biology. 152 (5): 895–910. doi:10.1083 / jcb.152.5.895. PMC 2198816. PMID 11238447.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
