Nukleoporin 153 - Nucleoporin 153
Nukleoporin 153 (Nup153) je protein, který je u lidí kódován NUP153 gen. Je nezbytnou součástí koše komplexy jaderných pórů (NPC) u obratlovců a jsou nutné pro ukotvení NPC. Funguje také jako dokovací místo importujícího karyoferinu.[5] Na cytoplazmatické straně NPC Nup358 plní obdobnou roli.
Pozadí
Komplexy jaderných pórů jsou extrémně propracované struktury, které zprostředkovávají regulovaný pohyb makromolekul mezi jádrem a cytoplazmou. Tyto komplexy jsou složeny z alespoň 100 různých polypeptidových podjednotek, z nichž mnohé patří do rodiny nukleoporinů. Nukleoporiny jsou glykoproteiny specifické pro komplex pórů charakterizované cytoplazmaticky orientovanými O vázanými zbytky N-acetylglukosaminu a četnými opakováními pentapeptidové sekvence XFXFG.
Struktura
Nucleoporin 153 má hmotnost 153 kDA (odtud jeho název). Je vláknitý a obsahuje tři odlišné domény: N-koncovou oblast, ve které byla identifikována doména zaměřená na póry, centrální oblast obsahující více zinkový prst motivy a C-koncová oblast obsahující více opakování XFXFG.[6]
Interakce
NUP153 bylo prokázáno komunikovat s SENP2[7][8] a KPNB1.[9][10][11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124789 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021374 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Moroianu J, Blobel G, Radu A (1997). „RanGTP zprostředkovaný jaderný export karyofherinu alfa zahrnuje jeho interakci s nukleoporinem Nup153“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (18): 9699–704. Bibcode:1997PNAS ... 94,9699 mil. doi:10.1073 / pnas.94.18.9699. PMC 23253. PMID 9275187.
- ^ „Entrezův gen: NUP153 nukleoporin 153 kDa“.
- ^ Hang, červen; Dasso Mary (květen 2002). „Sdružení lidské proteázy SUMO-1 SENP2 s jadernými póry“. J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. doi:10,1074 / jbc.M201799200. ISSN 0021-9258. PMID 11896061.
- ^ Zhang, Hong; Saitoh Hisato; Matunis Michael J (září 2002). „Enzymy modifikační dráhy SUMO se lokalizují na vlákna komplexu jaderných pórů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6498–508. doi:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. ISSN 0270-7306. PMC 135644. PMID 12192048.
- ^ Nakielny, S; Shaikh S; Burke B; Dreyfuss G (duben 1999). „Nup153 je mobilní nukleoporin obsahující M9 s novou Ran-vazebnou doménou“. EMBO J.. 18 (7): 1982–95. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1982. ISSN 0261-4189. PMC 1171283. PMID 10202161.
- ^ Kehlenbach, RH; Gerace L (červen 2000). „Fosforylace jaderných transportních strojů reguluje import jaderných bílkovin in vitro“. J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. doi:10,1074 / jbc.M001455200. ISSN 0021-9258. PMID 10749866.
- ^ Ben-Efraim, I; Gerace L (leden 2001). „Gradient zvyšující se afinity importinu beta k nukleoporinům na cestě jaderného importu“. J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. doi:10.1083 / jcb.152.2.411. ISSN 0021-9525. PMC 2199621. PMID 11266456.
Další čtení
- Moroianu J (2000). "Jaderné cesty pro dovoz a vývoz". J. Cell. Biochem. Suppl 32-33: 76–83. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (1999) 75: 32+ <76 :: AID-JCB10> 3.0.CO; 2-Q. PMID 10629106.
- Adam SA (2002). „Komplex jaderných pórů“. Genome Biol. 2 (9): RECENZES0007. doi:10.1186 / gb-2001-2-9-reviews0007. PMC 138961. PMID 11574060.
- McMorrow I, Bastos R, Horton H, Burke B (1994). "Sekvenční analýza cDNA kódující protein komplexního lidského jaderného póru, hnup153". Biochim. Biophys. Acta. 1217 (2): 219–23. doi:10.1016 / 0167-4781 (94) 90040-X. PMID 8110839.
- Yaseen NR, Blobel G (1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu beta3". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC 20743. PMID 9114010.
- Zolotukhin AS, Felber BK (1999). „Nukleoporiny nup98 a nup214 se účastní jaderného exportu viru lidské imunodeficience typu 1 Rev“. J. Virol. 73 (1): 120–7. doi:10.1128 / JVI.73.1.120-127.1999. PMC 103815. PMID 9847314.
- Ullman KS, Shah S, Powers MA, Forbes DJ (1999). „Nukleoporin nup153 hraje zásadní roli při různých druzích exportu jaderných zbraní“. Mol. Biol. Buňka. 10 (3): 649–64. doi:10,1091 / mbc. 10.3.649. PMC 25193. PMID 10069809.
- Nakielny S, Shaikh S, Burke B, Dreyfuss G (1999). „Nup153 je mobilní nukleoporin obsahující M9 s novou Ran-vazebnou doménou“. EMBO J.. 18 (7): 1982–95. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1982. PMC 1171283. PMID 10202161.
- Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP a kol. (2000). „C-koncová doména TAP interaguje s komplexem jaderných pórů a podporuje export specifických substrátů RNA nesoucích CTE“. RNA. 6 (1): 136–58. doi:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
- Kehlenbach RH, Gerace L (2000). „Fosforylace jaderných transportních strojů reguluje import jaderných bílkovin in vitro“. J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. doi:10,1074 / jbc.M001455200. PMID 10749866.
- Kutay U, Hartmann E, Treichel N a kol. (2001). „Identifikace dvou nových proteinů vázajících RanGTP patřících do nadrodiny beta importinu“. J. Biol. Chem. 275 (51): 40163–8. doi:10,1074 / jbc.M006242200. PMID 11024021.
- Herold A, Suyama M, Rodrigues JP a kol. (2000). „TAP (NXF1) patří do multigenní rodiny domnělých faktorů exportu RNA se zachovanou modulární architekturou“. Mol. Buňka. Biol. 20 (23): 8996–9008. doi:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553. PMID 11073998.
- Hofmann W, Reichart B, Ewald A a kol. (2001). „Požadavky na kofaktor pro jaderný export prvku Rev response element (RRE) - a retrovirových RNA obsahujících konstitutivní transportní prvek (CTE). Neočekávaná role aktinu“. J. Cell Biol. 152 (5): 895–910. doi:10.1083 / jcb.152.5.895. PMC 2198816. PMID 11238447.
- Ben-Efraim I, Gerace L (2001). „Gradient zvyšující se afinity importinu beta k nukleoporinům na cestě jaderného importu“. J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. doi:10.1083 / jcb.152.2.411. PMC 2199621. PMID 11266456.
- Dimaano C, Ball JR, Prunuske AJ, Ullman KS (2002). „Asociace RNA definuje funkčně konzervovanou doménu v proteinu jaderných pórů Nup153“. J. Biol. Chem. 276 (48): 45349–57. doi:10,1074 / jbc.M102592200. PMID 11567018.
- Walther TC, Fornerod M, Pickersgill H a kol. (2001). „Nukleoporin Nup153 je nezbytný pro tvorbu koše jaderných pórů, ukotvení komplexu jaderných pórů a import podmnožiny jaderných proteinů“. EMBO J.. 20 (20): 5703–14. doi:10.1093 / emboj / 20.20.5703. PMC 125666. PMID 11598013.
- Brownawell AM, Macara IG (2002). „Exportin-5, nový karyoferin, zprostředkovává jaderný export dvouvláknových proteinů vázajících RNA“. J. Cell Biol. 156 (1): 53–64. doi:10.1083 / jcb.200110082. PMC 2173575. PMID 11777942.
- Hang J, Dasso M (2002). „Sdružení lidské proteázy SUMO-1 SENP2 s jadernými póry“. J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. doi:10,1074 / jbc.M201799200. PMID 11896061.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
