HLA-DR16 - HLA-DR16
hlavní histokompatibilní komplex, třída II, DR16 | |
Skupiny haplotypů | DRA * 01: DRB1 * 1601 DRA * 01: DRB1 * 1602 |
Struktura (Vidět HLA-DR ) | |
Identifikátory | alfa *0101 |
Symbol (y) | HLA-DRA[trvalý mrtvý odkaz ] |
EBI-HLA | DRA * 0101 |
Identifikátory | beta 1 *1601 *1602 *1604 |
Symbol (y) | HLA-DRB1[trvalý mrtvý odkaz ] |
EBI-HLA | DRB1 * 1601 |
EBI-HLA | DRB1 * 1602 |
EBI-HLA | DRB1 * 1604 |
Sdílená data | |
Místo | chr.6 6p21.31 |
HLA-DR16(DR16) je a HLA -DR sérotyp, který rozpoznává genové produkty DRB1 * 1601, * 1602 a * 1604. DR16 se nachází ve Středomoří při skromných frekvencích. DR16 je součástí staršího HLA-DR2 sérotypová skupina, která také obsahuje podobné HLA-DR15 antigeny.
Alely
DRB1 * | DR16 | DR2 | DR15 | Vzorek |
alela | % | % | % | velikost (N) |
1601 | 41 | 29 | 19 | 703 |
1602 | 47 | 30 | 16 | 239 |
1604 | >50 | 1 |
Sdružení nemocí
DR16 je spojen s Chaga kardiomyopatie,[2] revmatické srdeční choroby,[3] ektázie koronární arterie,[4] a chronický diskoidní lupus erythematodes.[5]
DRB1 * 1601 Je spojená s tuberkulóza riziko[6]
DRB1 * 1602: Mladistvý revmatoidní artritida,[7] revmatické srdeční choroby,[3] Arteritida Takayasu,[8] systémová skleróza (SSc) a anti-DNA topoizomeráza I (anti-topo I) protilátka,[9][10] melioidóza (Infekce Burkholderia pseudomallei)[11]
Rozšířené propojení
DRB1 * 1601: DQA1 * 0102: DQB1 * 0502 haplotyp je spojen s rizikem tubeculousis [6]
Genetické propojení
Haplotypy DR16 | |||
Sérotypy | DRA | DRB1 | DRB5 |
---|---|---|---|
DR16 (2) -DR51 | *0101 | *1601 | *0101 |
*0101 | *1602 | *0101 | |
*0101 | *1604 | *0101 | |
DQA1 | DQB1 | DRB1 | |
DR16 (2) -DQ5 (5,2; 1) | *0102 | *0502 | *1601 |
HLA-A | HLA-B | DRB1 | |
A2-B51 (5) -DR16 (2) | *0201 | *5101 | *1601 |
HLA-DR16 je geneticky spojen s HLA-DR51 a HLA-DQ5 sérotypy.
Reference
- ^ odvozeno od IMGT / HLA
- ^ Cruz-Robles D, Reyes P, Monteón-Padilla V, Ortiz-Muñiz A, Vargas-Alarcón G (2004). "MHC geny třídy I a třídy II u mexických pacientů s Chagasovou chorobou". Hum Immunol. 65 (1): 60–5. doi:10.1016 / j.humimm.2003.10.008. PMID 14700597.
- ^ A b C Hernández-Pacheco G, Aguilar-García J, Flores-Domínguez C, Rodríguez-Pérez J, Pérez-Hernández N, Alvarez-Leon E, Reyes P, Vargas-Alarcón G (2003). „Alely MHC třídy II u mexických pacientů s revmatickým onemocněním srdce“. Int J Cardiol. 92 (1): 49–54. doi:10.1016 / S0167-5273 (03) 00040-8. PMID 14602216.
- ^ Akdemir R, Ozhan H, Gunduz H, Erbilen E, Yazici M, Duran S, Orkunoglu F, Albayrak S, Imirzalioglu N, Uyan C (2004). „HLA-DR B1 a DQ B1 polymorfismy u pacientů s ektázií koronární arterie“. Acta Cardiol. 59 (5): 499–502. doi:10.2143 / AC.59.5.2005222. PMID 15529553.
- ^ López-Tello A, Rodríguez-Carreón AA, Jurado F a kol. (2007). „Sdružení HLA-DRB1 * 16 s chronickým diskoidním lupus erythematodes u mexických pacientů s mesticem“. Clin. Exp. Dermatol. 32 (4): 435–8. doi:10.1111 / j.1365-2230.2007.02391.x. PMID 17376212.
- ^ A b Dubaniewicz A, Moszkowska G, Szczerkowska Z (2005). „Frekvence dvoulokusových haplotypů DRB1-DQB1 u tuberkulózy: předběžná zpráva“. Tuberkulóza (Edinb). 85 (4): 259–67. doi:10.1016 / j.tube.2004.12.003. PMID 15958261.
- ^ Garavito G, Yunis E, Egea E, Ramirez L, Malagón C, Iglesias A, De La Cruz O, Uribe O, Navarro E, Martinez P, Jaraquemada D (2004). „Alely HLA-DRB1 a sdílené epitopy HLA-DRB1 jsou markery pro podskupiny juvenilní revmatoidní artritidy v kolumbijských městech.“ Hum Immunol. 65 (4): 359–65. doi:10.1016 / j.humimm.2004.01.016. PMID 15120191.
- ^ Salazar M, Varela A, Ramirez L, Uribe O, Vasquez G, Egea E, Yunis E, Iglesias-Gamarra A (2000). „Sdružení HLA-DRB1 * 1602 a DRB1 * 1001 s v kolumbijských městech jako markery indiánského původu“. Int J Cardiol. 75 Suppl 1: S113–6. PMID 10980348.
- ^ Kuwana M, Kaburaki J, Arnett F, Howard R, Medsger T, Wright T (1999). „Vliv etnického původu na klinické a sérologické rysy u pacientů se systémovou sklerózou a anti-DNA topoizomerázou I“. Artritida Rheum. 42 (3): 465–74. doi:10.1002 / 1529-0131 (199904) 42: 3 <465 :: AID-ANR11> 3.0.CO; 2-Y. PMID 10088769.
- ^ A b Tan F, Stivers D, Arnett F, Chakraborty R, Howard R, Reveille J (1999). „HLA haplotypy a mikrosatelitní polymorfismy v okolí hlavní oblasti histokompatibilního komplexu v indiánské populaci s vysokou prevalencí sklerodermie (systémová skleróza)“. Tkáňové antigeny. 53 (1): 74–80. doi:10.1034 / j.1399-0039.1999.530108.x. PMID 10082433.
- ^ Dharakul T, Vejbaesya S, Chaowagul W, Luangtrakool P, Stephens H, Songsivilai S (1998). "HLA-DR a -DQ asociace s melioidózou". Hum Immunol. 59 (9): 580–6. doi:10.1016 / S0198-8859 (98) 00052-4. PMID 9757914.
- ^ Wongsurawat T, Nakkuntod J, Charoenwongse P, Snabboon T, Sridama V, Hirankarn N (2006). "Souvislost mezi haplotypem HLA třídy II s Gravesovou chorobou v thajské populaci". Tkáňové antigeny. 67 (1): 79–83. doi:10.1111 / j.1399-0039.2005.00498.x. PMID 16451208.
- ^ Park M, Park Y, Song E, Park H, Kim T, Park D, Park K, Cho B (2005). „Sdružení genů HLA-DR a -DQ s Gravesovou chorobou u Korejců“. Hum Immunol. 66 (6): 741–7. doi:10.1016 / j.humimm.2005.03.001. PMID 15993720.
- ^ Cervantes J, Lema C, Valentina Hurtado L, Andrade R, Hurtado Gomez L, Torrico L, Zegarra L, Quiroga G, Asturizaga D, Dulon A, Prada R, Panoso W, Yashiki S, Fujiyoshi T, Sonoda S (2003). „Alela HLA-DRB1 * 1602 je pozitivně spojena s HPV cervikální infekcí u bolivijských andských žen“. Hum Immunol. 64 (9): 890–5. doi:10.1016 / S0198-8859 (03) 00163-0. PMID 12941545.
- ^ Arnett F, Howard R, Tan F, Molds J, Bias W, Durban E, Cameron H, Paxton G, Hodge T, Weathers P, Reveille J (1996). „Zvýšená prevalence systémové sklerózy u domorodého amerického kmene v Oklahomě. Sdružení s indiánským HLA haplotypem“. Artritida Rheum. 39 (8): 1362–70. doi:10,1002 / článek 1780390814. PMID 8702445.