RIPK1 - RIPK1

RIPK1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRIPK1, RIP, RIP1, RIP-1, receptor interagující serin / threonin kináza 1, IMD57, AIEFL
Externí IDOMIM: 603453 MGI: 108212 HomoloGene: 2820 Genové karty: RIPK1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomické umístění pro RIPK1
Genomické umístění pro RIPK1
Kapela6p25.2Start3,063,991 bp[1]
Konec3,115,187 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RIPK1 209941 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

8737

19766

Ensembl

ENSG00000137275

ENSMUSG00000021408

UniProt

Q13546

Q60855

RefSeq (mRNA)

NM_009068
NM_001359997

RefSeq (protein)

NP_033094
NP_001346926

Místo (UCSC)Chr 6: 3,06 - 3,12 MbChr 13: 34 - 34,04 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Receptor -interagující serin / threonin-protein kináza 1 (RIPK1) funguje v různých buněčných drahách souvisejících s přežitím i smrtí buněk. Ve smyslu buněčná smrt, RIPK1 hraje roli v apoptóza a nekroptóza. Některé z cest buněčného přežití, kterých se RIPK1 účastní, zahrnují NF-kB, Akt a JNK.[5]

RIPK1 je enzym že u lidí je kódován RIPK1 gen, který je umístěn na chromozomu 6.[6][7][8] Tento protein patří do rodiny kináz Receptor Interacting Protein (RIP), která se skládá ze 7 členů, přičemž RIPK1 je prvním členem rodiny.[9]

Struktura

Protein RIPK1 se skládá ze 671 aminokyselin a má molekulovou hmotnost přibližně 76 kDa. Obsahuje doménu serin / threonin kinázy (KD) na 300 aa N-Terminus, smrtící doménu (DD) na 112 aa C-Terminus a centrální oblast mezi KD a DD nazvanou intermediární doména (ID).

  • The kinázová doména hraje různé role v přežití buněk a je důležité v nekroptóza indukce. RIP interaguje s TRAF2 přes kinázovou doménu. KD může také interagovat s nekrostatinem-1,[10] což je alosterický inhibitor aktivity RIPK1 kinázy. Může se aktivovat nadměrná exprese RIP bez aktivity kinázy NF-kB.
  • The doména smrti je homologní s DD jiných receptorů, jako je Fas, TRAILR2 (DR5), TNFR1 a TRAILR1 (DR4), takže se může vázat na tyto receptory stejně jako OBCHOD a FADD v signalizačním komplexu TNFR1. Nadměrná exprese RIP může vyvolat apoptóza a může aktivovat NF-kB, ale nadměrná exprese domény smrti RIP může blokovat aktivaci NF-kB pomocí TNF-R1.[11]
  • The zprostředkující doména je důležité pro aktivaci NF-kB a signalizaci závislou na (RHIM). Prostřednictvím zprostředkující domény může RIP interagovat s TRAF2, NEMO, RIPK3, ZBP1, OPTN[12] a další malé molekuly a proteiny, v závislosti na buněčném kontextu.

.

Strukturální domény RIPK1

Funkce

RIPK1 byl primárně studován v kontextu TNFR signalizace je RIPK1 také aktivován v reakci na různé podněty.[13]

Kinázová doména, i když je důležitá pro nekroptotický (programované nekrotické) funkce se jeví jako nepostradatelné pro role pro přežití. Kinázová aktivita RIPK1 je také nutná pro apoptózu závislou na RIPK1 v podmínkách vyčerpání IAP1 / 2, inhibice / vyčerpání TAK1, vyčerpání RIPK3 nebo vyčerpání MLKL.[14][15] Taky, proteolytický zpracování RIPk1, oběma kaspáza -závislé a -nezávislé mechanismy, spouští letalitu, která je závislá na generování jednoho nebo více konkrétních C-terminál produkt (y) štěpení RIPk1 při stresu.

Role v přežití buněk

Ukázalo se, že přežití buněk lze regulovat různými cestami zprostředkovanými RIPK1, které nakonec vedou k expresi NF-kB, proteinový komplex, o kterém je známo, že reguluje transkripci DNA, a tedy souvisí s procesy přežití.[16]

Receptorem zprostředkovaná signalizace

Schematický přehled cest k přežití buněk zprostředkovaných RIPK1

Nejznámější cestou aktivace NF-kB je cesta zprostředkovaná receptorem smrti TNFR1, který začíná jako v cestě nekroptosy sestavením OBCHOD, RIPK1, TRAF2 a clAP1 v lipidových raftech plazmatické membrány (tvoří se komplex I). V signalizaci přežití je potom RIPK1 polyubikvitinován, což umožňuje NEMO (Necrosis Factor - kappa - B essential modulator) pro vazbu na IkB kinázu nebo komplex IKK.[17] Aktivovat IKK, Adaptorové proteiny TAB2 a TAB3 přijímají TAK1 nebo MEKK3, které fosforylují komplex. To má za následek fosforylaci inhibitorů NF-kB aktivovaným komplexem IKK, což zase spouští jejich polyubikvitinaci a zadní degradaci v 26S proteazomu.

Výsledkem je, že NF-kB nyní může migrovat do jádra, kde bude řídit transkripci DNA tím, že se naváže na promotory konkrétních genů. Předpokládá se, že některé z těchto genů mají antiapoptotické vlastnosti a také podporují proteazomální degradaci RIPK1, což vede k samoregulačnímu cyklu.

I když je v komplexu I, bylo prokázáno, že RIPK1 hraje roli při aktivaci MAP (mitogenem aktivovaný protein ) kinázy jako JNK, ERK a p38. Zejména JNK lze nalézt jak v dráze buněčné smrti, tak v přežití, přičemž její role v procesu buněčné smrti je potlačena aktivovaným NF-kB.[18]

Signalizace přežití buněk může být také zprostředkována TLR-3 (mýtné receptory ) a TLR-4. Zde je RIPK1 přijímán na receptory, kde je fosforylován a polyubikvitinován. To má za následek nábor aktivujících proteinů komplexu IKK (TAK1, TAB1 a TAB2), takže nakonec může NF-kB příliš migrovat do jádra. RIPK2 je zapojen do této signalizace zprostředkované TLR, což naznačuje, že může existovat regulace buněčného přežití nebo smrti (dva možné výsledky) prostřednictvím vzájemné interakce mezi dvěma členy rodiny RIPK.[18][19]

Aktivace zprostředkovaná genotoxickým stresem

Po poškození DNA zprostředkuje RIPK1 další aktivační cestu NF-kB, kde dochází ke dvěma současným a výlučným procesům. Vytvoří se pro-apoptotický komplex, zatímco RIPK1 také zprostředkovává interakci mezi podjednotkami PIDD, NEMO a IKK, která nakonec vyústí v aktivaci IKK komplexu po interakci s ATM kinázou (dvouvláknový DNA rozbije stimulovaný protein). Předpokládá se, že interakce mezi RIPK1 a PIDD prostřednictvím jejich smrtících domén podporuje přežití buněk k neutralizaci tohoto proapoptotického komplexu.[19]

Ostatní

Bylo pozorováno, že RIPK1 může také interagovat s IGF-1R (inzulinový růstový faktor 1 receptor) k aktivaci JNK (c-Jun N-terminální kinázy), může to souviset s signalizací receptoru epidermálního růstového faktoru a je do značné míry v glioblastomových buňkách, což naznačuje, že RIPK1 je skutečně zapojen do procesů přežití a proliferace buněk.[18]

Role v buněčné smrti

Schematický přehled cest k apoptóze a nekróze a jejích konvergencí

Nekroptóza

Nekroptóza je naprogramovaná forma nekrózy, která začíná sestavením TNF (faktor nádorové nekrózy) ligand k jeho membránovému receptoru, TNFR (receptor faktoru nekrózy nádorů). Po aktivaci zahájí intracelulární doména TNFR nábor proteinu smrtící domény asociovaného s TNFR-1 OBCHOD, který rekrutuje RIPK1 a dvě ubikvitinové ligázy: TRAF2 a clAP1. Tento komplex se nazývá komplex TNFR-1 I.[20]

Komplex-I je poté modifikován IAP (Inhibitor proteinů apoptózy) a LUBAC (Linear Ubiquitination Assembly Complex), které generují lineární ubikvitinové vazby. Ubikvitinace komplexu I vede k aktivaci NF-kB , což zase aktivuje expresi FLICE podobného inhibičního proteinu FLIP. FLIP se pak váže na kaspáza-8, tvořící FLIP heterodimer kaspázy-8 v cytosolu, který narušuje aktivitu kaspázy-8 a zabraňuje zprostředkování kaspázy-8 apoptóza od uskutečnění.[21]

Sestavování komplexu II-b pak začíná v cytosolu. Tento nový komplex obsahuje heterodimer FLIP kaspázy-8 a také RIPK1 a RIPK3. Inhibice kaspázy v tomto komplexu umožňuje RIPK1 a RIPK3 autotransfosforylovat se navzájem a vytvořit další komplex zvaný nekrosom.[22] Nekrosom začíná rekrutovat MLKL (Mixed Kinase Domain Like protein), který je fosforylován RIPK3 a okamžitě translokuje na lipidové rafty uvnitř plazmatické membrány. To vede k tvorbě pórů v membráně, což umožňuje zvýšení přítoku sodíku - a následně osmotický tlak -, který nakonec způsobí prasknutí buněčné membrány.[22]

Apoptóza

Apoptotická vnější cesta začíná tvorbou komplexu TNFR-1, který obsahuje OBCHOD, RIPK1 a dvě ubikvitinové ligázy:TRAF2 a clAP1.[23][20]

Na rozdíl od nekroptotické dráhy tato dráha nezahrnuje inhibici kaspáza-8. V nepřítomnosti tedy NF-kB funkce FLIP se nevyrábí, a proto se aktivní kaspáza-8 sestavuje s FADD, RIPK1 a RIPK3 v cytosolu a tvoří to, co je známé jako komplex IIa.[22]

Kaspáza-8 aktivuje Bid, protein, který se váže na mitochondriální membránu a umožňuje uvolňování intermembránových mitochondriálních molekul, jako je cytochrom c. Cytochrom c se poté sestaví s Apaf 1 a ATP molekuly, tvořící komplex zvaný apoptosom. Aktivace kaspáza 3 a 9 apoptosomem začíná proteolitická kaskáda, která nakonec vede k degradaci organel a proteinů a fragmentaci DNA, což vede k apoptotické buněčné smrti.

Neurodegenerativní onemocnění

Alzheimerova choroba

Pacienti s Alzheimerova choroba, a neurodegenerativní onemocnění charakterizované zhoršením kognitivních funkcí a poruchou chování, zaznamenat chronický zánět mozku, který vede k atrofii několika oblastí mozku.[1]

Známkou tohoto zánětu je zvýšený počet mikroglií, což je typ gliové buňky nachází se v mozku a míše. Je známo, že RIPK1 se objevuje ve větších množstvích v mozku od osob postižených AD.[24] Tento enzym reguluje nejen nekroptózu, ale také zánět buněk, a jako výsledek se podílí na regulaci mikrogliálních funkcí, zejména těch, které souvisejí s výskytem a vývojem neurodegenerativních onemocnění, jako je AD.[24]

Amyotrofní laterální skleróza

Amyotrofická laterální skleróza (ALS) je charakterizována degenerací motorických neuronů, která vede k postupné ztrátě mobility. V důsledku toho pacienti nejsou schopni vykonávat žádnou fyzickou aktivitu kvůli atrofii svalů.[25]

The optineurin Je známo, že gen AL (OPTN) a jeho mutace se účastní ALS. Když organismus ztratí OPTN, dysmyelinizace začíná axony a jeho degenerace. Degeneraci axonů produkuje několik složek z Centrální nervový systém (CNS) včetně RIPK1 a jiného enzymu z rodiny proteinových kináz reagujících s receptory, RIPK3, jakož i dalších proteinů, jako je MLKL.[26]

Jakmile RIPK1, RIPK3 a MLKL přispěly k dysmyelinaci a následné degeneraci axonů, nervový impuls nemůže přejít z jednoho neuronu do druhého kvůli nedostatku myelin, což vede k následným problémům s pohyblivostí, protože nervový impuls nedorazí do svého konečného cíle.[27]


Autoinflamatory disease

Autozánětlivé onemocnění charakterizované opakujícími se horečkami a lymfadenopatií bylo spojeno s mutacemi tohoto genu.[28]

Interakce

RIPK1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137275 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021408 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Lin, Yong (2014). „Signalizační dráhy zprostředkované RIP1 při kontrole přežití a smrti buněk“. Nekrotická buněčná smrt. Springer New York. 23–43. doi:10.1007/978-1-4614-8220-8_2. ISBN  9781461482192.
  6. ^ Stanger BZ, Leder P, Lee TH, Kim E, Seed B (květen 1995). „RIP: nový protein obsahující smrtící doménu, která interaguje s Fas / APO-1 (CD95) v kvasinkách a způsobuje buněčnou smrt“. Buňka. 81 (4): 513–23. doi:10.1016/0092-8674(95)90072-1. PMID  7538908. S2CID  6525044.
  7. ^ A b C d Hsu H, Huang J, Shu HB, Baichwal V, Goeddel DV (duben 1996). „TNF-dependentní nábor proteinové kinázy RIP do signálního komplexu TNF receptor-1“. Imunita. 4 (4): 387–96. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80252-6. PMID  8612133.
  8. ^ "Entrez Gene: RIPK1 receptor (TNFRSF) interagující serin-threonin kináza 1".
  9. ^ Festjens N, Vanden Berghe T, Cornelis S, Vandenabeele P (březen 2007). „RIP1, kináza na křižovatce rozhodnutí buňky žít nebo zemřít“. Buněčná smrt a diferenciace. 14 (3): 400–10. doi:10.1038 / sj.cdd.4402085. PMID  17301840. S2CID  8846685.
  10. ^ Vandenabeele P, Grootjans S, Callewaert N, Takahashi N (únor 2013). „Nekrostatin-1 blokuje RIPK1 i IDO: důsledky pro studium buněčné smrti v experimentálních modelech nemocí. Buněčná smrt a diferenciace. 20 (2): 185–7. doi:10.1038 / cdd.2012.151. PMC  3554339. PMID  23197293.
  11. ^ Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): Receptor interagující serin / threonin kináza 1 (RIPK1) - 603453
  12. ^ Zhu G, Wu CJ, Zhao Y, Ashwell JD (srpen 2007). „Optineurin negativně reguluje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNFalfa kompeticí s NEMO o ubikvitinovaný RIP.“ Aktuální biologie. 17 (16): 1438–43. doi:10.1016 / j.cub.2007.07.041. PMID  17702576. S2CID  16248887.
  13. ^ Vanlangenakker N, Vanden Berghe T, Vandenabeele P (leden 2012). „Mnoho podnětů stiskne nekrotickou spoušť, přehled“. Buněčná smrt a diferenciace. 19 (1): 75–86. doi:10.1038 / cdd.2011.164. PMC  3252835. PMID  22075985.
  14. ^ Dondelinger Y, Aguileta MA, Goossens V, Dubuisson C, Grootjans S, Dejardin E, Vandenabeele P, Bertrand MJ (říjen 2013). „RIPK3 přispívá k TNFR1 zprostředkované RIPK1 kinázově závislé apoptóze v podmínkách vyčerpání cIAP1 / 2 nebo inhibice TAK1 kinázy“. Buněčná smrt a diferenciace. 20 (10): 1381–92. doi:10.1038 / cdd.2013.94. PMC  3770330. PMID  23892367.
  15. ^ Remijsen Q, Goossens V, Grootjans S, Van den Haute C, Vanlangenakker N, Dondelinger Y, Roelandt R, Bruggeman I, Goncalves A, Bertrand MJ, Baekelandt V, Takahashi N, Berghe TV, Vandenabeele P (leden 2014). „Vyčerpání RIPK3 nebo MLKL blokuje nekroptózu řízenou TNF a přepíná na zpožděnou apoptózu závislou na RIPK1 kinázě“. Buněčná smrt a nemoc. 5: e1004. doi:10.1038 / cddis.2013.531. PMC  4040672. PMID  24434512.
  16. ^ Christofferson DE, Li Y, Yuan J (2014). "Kontrola rozhodnutí o životě nebo smrti kinázou RIP1". Roční přehled fyziologie. 76: 129–50. doi:10,1146 / annurev-physiol-021113-170259. PMID  24079414.
  17. ^ Zhang J, Zhang H, Li J, Rosenberg S, Zhang EC, Zhou X, Qin F, Farabaugh M (2011). „Regulace odpovědi přežití a smrti zprostředkovaná RIP1“. Imunologický výzkum. 51 (2–3): 227–36. doi:10.1007 / s12026-011-8249-3. PMC  3244575. PMID  22038529.
  18. ^ A b C d E Lin Y (2014). „Signalizační dráhy zprostředkované RIP1 při kontrole přežití a smrti buněk“. Nekrotická buněčná smrt. Springer New York. 23–43. doi:10.1007/978-1-4614-8220-8_2. ISBN  9781461482192.
  19. ^ A b C Festjens N, Vanden Berghe T, Cornelis S, Vandenabeele P (2007). „RIP1, kináza na křižovatce rozhodnutí buňky žít nebo zemřít“. Buněčná smrt a diferenciace. 14 (3): 400–10. doi:10.1038 / sj.cdd.4402085. PMID  17301840. S2CID  8846685.
  20. ^ A b Hsu H, Huang J, Shu HB, Baichwal V, Goeddel DV (duben 1996). „TNF-dependentní nábor proteinové kinázy RIP do signálního komplexu TNF receptor-1“. Imunita. 4 (4): 387–96. doi:10.1016 / s1074-7613 (00) 80252-6. PMID  8612133.
  21. ^ A b Linkermann A, Green DR (leden 2014). "Nekroptosa". The New England Journal of Medicine. 370 (5): 455–65. doi:10.1056 / NEJMra1310050. PMC  4035222. PMID  24476434.
  22. ^ A b C Cho YS, Challa S, Moquin D, Genga R, Ray TD, Guildford M, Chan FK (červen 2009). „Sestava komplexu RIP1-RIP3 řízená fosforylací reguluje programovanou nekrózu a viry vyvolaný zánět“. Buňka. 137 (6): 1112–23. doi:10.1016 / j.cell.2009.05.037. PMC  2727676. PMID  19524513.
  23. ^ A b C d Green DR, Oberst A, Dillon CP, Weinlich R, Salvesen GS (říjen 2011). „RIPK závislá nekróza a její regulace kaspázami: záhada v pěti dějstvích“. Molekulární buňka. 44 (1): 9–16. doi:10.1016 / j.molcel.2011.09.003. PMC  3192321. PMID  21981915.
  24. ^ A b Ofengeim D, Mazzitelli S, Ito Y, DeWitt JP, Mifflin L, Zou C, Das S, Adiconis X, Chen H, Zhu H, Kelliher MA, Levin JZ, Yuan J (září 2017). „RIPK1 zprostředkovává mikrogliální reakci spojenou s onemocněním u Alzheimerovy choroby“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 114 (41): E8788 – E8797. doi:10.1073 / pnas.1714175114. PMC  5642727. PMID  28904096.
  25. ^ „Co je ALS?“. ALSA.org. Citováno 2017-10-21.
  26. ^ Ito Y, Ofengeim D, Najafov A, Das S, Saberi S, Li Y, Hitomi J, Zhu H, Chen H, Mayo L, Geng J, Amin P, DeWitt JP, Mookhtiar AK, Florez M, Ouchida AT, Fan JB Pasparakis M, Kelliher MA, Ravits J, Yuan J (srpen 2016). „RIPK1 zprostředkovává axonální degeneraci podporou zánětu a nekroptózy u ALS“. Věda. 353 (6299): 603–8. Bibcode:2016Sci ... 353..603I. doi:10.1126 / science.aaf6803. PMC  5444917. PMID  27493188.
  27. ^ „Přenos nervových impulsů“. www.cliffsnotes.com. Citováno 2017-10-21.
  28. ^ Tao P, Sun J, Wu Z, Wang S, Wang J, Li W a kol. (Prosinec 2019). "Dominantní autozánětlivé onemocnění způsobené neštěpitelnými variantami RIPK1". Příroda. 577 (7788): 109–114. doi:10.1038 / s41586-019-1830-r. PMID  31827280. S2CID  209311868.
  29. ^ A b C d Bertrand MJ, Milutinovic S, Dickson KM, Ho WC, Boudreault A, Durkin J, Gillard JW, Jaquith JB, Morris SJ, Barker PA (červen 2008). „cIAP1 a cIAP2 usnadňují přežití rakovinných buněk tím, že fungují jako E3 ligázy, které podporují ubikvitinaci RIP1“. Molekulární buňka. 30 (6): 689–700. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.014. PMID  18570872.
  30. ^ A b Liao W, Xiao Q, Tchikov V, Fujita K, Yang W, Wincovitch S, Garfield S, Conze D, El-Deiry WS, Schütze S, Srinivasula SM (květen 2008). „CARP-2 je ubiquitinová ligáza spojená s endosomem pro RIP a reguluje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNF“. Aktuální biologie. 18 (9): 641–9. doi:10.1016 / j.cub.2008.04.017. PMC  2587165. PMID  18450452.
  31. ^ A b Chaudhary PM, Eby MT, Jasmin A, Kumar A, Liu L, Hood L (září 2000). „Aktivace dráhy NF-kappaB kaspázou 8 a jejími homology“. Onkogen. 19 (39): 4451–60. doi:10.1038 / sj.onc.1203812. PMID  11002417.
  32. ^ Oshima S, Turer EE, Callahan JA, Chai S, Advincula R, Barrera J, Shifrin N, Lee B, Benedict Yen TS, Yen B, Woo T, Malynn BA, Ma A (únor 2009). „ABIN-1 je ubikvitinový senzor, který omezuje buněčnou smrt a udržuje embryonální vývoj“. Příroda. 457 (7231): 906–9. Bibcode:2009Natur.457..906O. doi:10.1038 / nature07575. PMC  2642523. PMID  19060883.
  33. ^ Kataoka T, Budd RC, Holler N, Thome M, Martinon F, Irmler M, Burns K, Hahne M, Kennedy N, Kovacsovics M, Tschopp J (červen 2000). „Inhibitor kaspázy-8 FLIP podporuje aktivaci signálních drah NF-kappaB a Erk“. Aktuální biologie. 10 (11): 640–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00512-1. PMID  10837247. S2CID  14819939.
  34. ^ A b Duan H, Dixit VM (leden 1997). „RAIDD je nová molekula adaptéru„ smrti ““ (PDF). Příroda. 385 (6611): 86–9. Bibcode:1997 Natur.385 ... 86D. doi:10.1038 / 385086a0. hdl:2027.42/62739. PMID  8985253. S2CID  4317538.
  35. ^ Ahmad M, Srinivasula SM, Wang L, Talanian RV, Litwack G, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (únor 1997). „CRADD, nová molekula lidského apoptotického adaptéru pro kaspázu-2 a protein RIP interagující s receptorem faktoru FasL / tumor nekrózy“. Výzkum rakoviny. 57 (4): 615–9. PMID  9044836.
  36. ^ Yu PW, Huang BC, Shen M, Quast J, Chan E, Xu X, Nolan GP, ​​Payan DG, Luo Y (květen 1999). "Identifikace RIP3, kinázy podobné RIP, která aktivuje apoptózu a NFkappaB". Aktuální biologie. 9 (10): 539–42. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80239-5. PMID  10339433. S2CID  18024859.
  37. ^ Li J, McQuade T, Siemer AB, Napetschnig J, Moriwaki K, Hsiao YS, Damko E, Moquin D, Walz T, McDermott A, Chan FK, Wu H (červenec 2012). „Nekrosom RIP1 / RIP3 tvoří funkční amyloidní signalizační komplex potřebný pro programovanou nekrózu“. Buňka. 150 (2): 339–50. doi:10.1016 / j.cell.2012.06.019. PMC  3664196. PMID  22817896.
  38. ^ Shembade N, Parvatiyar K, Harhaj NS, Harhaj EW (březen 2009). „Enzym A20 upravující ubikvitin vyžaduje RNF11 k downregulaci signalizace NF-kappaB“. Časopis EMBO. 28 (5): 513–22. doi:10.1038 / emboj.2008.285. PMC  2657574. PMID  19131965.
  39. ^ Chen D, Li X, Zhai Z, Shu HB (květen 2002). „Nový protein se zinkovým prstem interaguje s proteinem interagujícím s receptorem (RIP) a inhibuje aktivaci tumor nekrotizujícího faktoru (TNF) - a IL1 indukovanou aktivaci NF-kappa B“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (18): 15985–91. doi:10,1074 / jbc.M108675200. PMID  11854271.
  40. ^ Sanz L, Sanchez P, Lallena MJ, Diaz-Meco MT, Moscat J (červen 1999). „Interakce p62 s RIP spojuje atypické PKC s aktivací NF-kappaB“. Časopis EMBO. 18 (11): 3044–53. doi:10.1093 / emboj / 18.11.3044. PMC  1171386. PMID  10356400.
  41. ^ Kim JW, Choi EJ, Joe CO (září 2000). „Aktivace signálního komplexu vyvolávajícího smrt (DISC) proapoptotickým C-koncovým fragmentem RIP“. Onkogen. 19 (39): 4491–9. doi:10.1038 / sj.onc.1203796. PMID  11002422.
  42. ^ Blankenship JW, Varfolomeev E, Goncharov T, Fedorova AV, Kirkpatrick DS, Izrael-Tomasevic A, Phu L, Arnott D, Aghajan M, Zobel K, Bazan JF, Fairbrother WJ, Deshayes K, Vucic D (leden 2009). „Vazba na ubikvitin moduluje proteazomální degradaci c-IAP1 a c-IAP2 stimulovanou antagonisty IAP“ (1). The Biochemical Journal. 417 (1): 149–60. doi:10.1042 / BJ20081885. PMID  18939944.
  43. ^ A b Newton K, Matsumoto ML, Wertz IE, Kirkpatrick DS, Lill JR, Tan J, Dugger D, Gordon N, Sidhu SS, Fellouse FA, Komuves L, French DM, Ferrando RE, Lam C, Compaan D, Yu C, Bosanac I Hymowitz SG, Kelley RF, Dixit VM (srpen 2008). „Úpravy ubikvitinového řetězce odhalené protilátkami specifickými pro polyubiquitinovou vazbu“. Buňka. 134 (4): 668–78. doi:10.1016 / j.cell.2008.07.039. PMID  18724939. S2CID  3955385.
  44. ^ A b Varfolomeev E, Goncharov T, Fedorova AV, Dynek JN, Zobel K, Deshayes K, Fairbrother WJ, Vucic D (září 2008). „c-IAP1 a c-IAP2 jsou kritickými mediátory aktivace NF-kappaB indukované faktorem nekrotizujícím nádory alfa (TNFalfa)“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (36): 24295–9. doi:10,1074 / jbc.C800128200. PMC  3259840. PMID  18621737.
  45. ^ Takeuchi M, Rothe M, Goeddel DV (srpen 1996). "Anatomie TRAF2. Zřetelné domény pro aktivaci nukleárního faktoru-kappaB a spojení se signálními proteiny faktoru nekrotizujícího nádory". The Journal of Biological Chemistry. 271 (33): 19935–42. doi:10.1074 / jbc.271.33.19935. PMID  8702708.
  46. ^ Tada K, Okazaki T, Sakon S, Kobarai T, Kurosawa K, Yamaoka S, Hashimoto H, Mak TW, Yagita H, Okumura K, Yeh WC, Nakano H (září 2001). „Kritické role TRAF2 a TRAF5 při aktivaci NF-kappa B vyvolané faktorem nekrotizujícím nádory a ochraně před smrtí buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36530–4. doi:10,1074 / jbc.M104837200. PMID  11479302.
  47. ^ Malinin NL, Boldin MP, Kovalenko AV, Wallach D (únor 1997). „Kináza související s MAP3K zapojená do indukce NF-kappaB pomocí TNF, CD95 a IL-1“. Příroda. 385 (6616): 540–4. doi:10.1038 / 385540a0. PMID  9020361. S2CID  4366355.
  48. ^ Ma Q, Zhou L, Shi H, Huo K (červen 2008). „NUMBL interaguje s TAB2 a inhibuje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNFalfa a IL-lbeta“. Mobilní signalizace. 20 (6): 1044–51. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.01.015. PMID  18299187.
  49. ^ Belizário J, Vieira-Cordeiro L, Enns S (2015). „Signalizace a provádění nekroptotické buněčné smrti: Poučení z vyřazovacích myší“. Zprostředkovatelé zánětu. 2015: 128076. doi:10.1155/2015/128076. PMC  4600508. PMID  26491219.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q13546 (Serin / threonin-protein kináza 1 interagující s receptory) na PDBe-KB.