RNF216 - RNF216

RNF216
Identifikátory
Aliasy	RNF216, CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, protein prstového prstu 216
Externí ID	OMIM: 609948 MGI: 1344349 HomoloGene: 19442 Genové karty: RNF216
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	5,781,739 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	143,112,994 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • postsynaptická endocytická zóna; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• ubikvitinace spojená s proteinem K48; • negativní regulace produkce interferonu typu I.; • GO: virový proces 0022415; • regulace produkce interferonu-beta; • ubikvitinace bílkovin; • regulace obranné reakce na virus hostitelem; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • apoptotický proces; • proteinový katabolický proces, modulační synaptický přenos;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54476
	108086
	ENSG00000011275
	ENSMUSG00000045078
	Q9NWF9
	P58283
	NM_019011; NM_207111; NM_207116; NM_001377156
	NM_080561; NM_207110; NM_001359851
	NP_996994; NP_996999; NP_001364085
	NP_542128; NP_996993; NP_001346780
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza RNF216 je enzym že u lidí je kódován RNF216 gen.^[5]

Tento gen kóduje cytoplazmatický protein, který se specificky kolokalizuje a interaguje s proteinovou kinázou serin / threonin, protein interagující s receptorem (RIP). Domény se zinkovým prstem kódovaného proteinu jsou nutné pro jeho interakci s RIP a pro inhibici aktivačních drah NF-kappa B indukovaných TNF a IL1. Kódovaný protein může také fungovat jako ligáza E3 ubikvitin-protein, která přijímá ubikvitin z enzymů konjugujících s ubikvitinem E2 a přenáší jej na substráty. Pro tento lokus bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu, ale jsou známy celovečerní povahy pouze některých.^[5]

Viz také

Prst doména prsten

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF216 komunikovat s TLR9^[6] a RIPK1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011275 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045078 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIAD3 TRIAD3 protein“.
^ Chuang, Tsung-Hsien; Ulevitch Richard J (květen 2004). „Triad3A, ligáza ubikvitin-protein E3 regulující receptory podobné Toll“. Nat. Immunol. 5 (5): 495–502. doi:10.1038 / ni1066. ISSN 1529-2908. PMID 15107846. S2CID 39773935.
^ Chen, Danying; Li Xiaoyan; Zhai Zhonghe; Shu Hong-Bing (Květen 2002). „Nový protein se zinkovým prstem interaguje s proteinem interagujícím s receptorem (RIP) a inhibuje aktivaci tumor nekrotizujícího faktoru (TNF) - a IL1 indukovanou aktivaci NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. doi:10,1074 / jbc.M108675200. ISSN 0021-9258. PMID 11854271.

Další čtení

Lake JA, Carr J, Feng F a kol. (2003). „Role Vif během infekce HIV-1: interakce s novými hostitelskými buněčnými faktory“. J. Clin. Virol. 26 (2): 143–52. doi:10.1016 / S1386-6532 (02) 00113-0. PMID 12600646.
Matoba R, Okubo K, Hori N a kol. (1994). "Přidání 5'-kódujících informací do 3'-směrované cDNA knihovny zlepšuje analýzu genové exprese." Gen. 146 (2): 199–207. doi:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819.
van der Reijden BA, Erpelinck-Verschueren CA, Löwenberg B, Jansen JH (1999). „TRIADs: nová třída proteinů s novým podpisem bohatým na cysteiny“. Protein Sci. 8 (7): 1557–61. doi:10.1110 / ps.8.7.1557. PMC 2144383. PMID 10422847.
Wang X, Stollar BD (1999). "Imunoglobulinová VH genová exprese ve stárnutí člověka". Clin. Immunol. 93 (2): 132–42. doi:10,1006 / klima 1999,4781. PMID 10527689.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Chen D, Li X, Zhai Z, Shu HB (2002). „Nový protein se zinkovým prstem interaguje s proteinem interagujícím s receptorem (RIP) a inhibuje aktivaci tumor nekrotizujícího faktoru (TNF) - a IL1 indukovanou aktivaci NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. doi:10,1074 / jbc.M108675200. PMID 11854271.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. Bibcode:2003 Natur.424..157H. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Chuang TH, Ulevitch RJ (2004). „Triad3A, ligáza ubikvitin-protein E3 regulující receptory podobné Toll“. Nat. Immunol. 5 (5): 495–502. doi:10.1038 / ni1066. PMID 15107846. S2CID 39773935.
Feng F, Davis A, Lake JA a kol. (2004). "Prstový protein ZIN interaguje s virem lidské imunodeficience typu 1 Vif". J. Virol. 78 (19): 10574–81. doi:10.1128 / JVI.78.19.10574-10581.2004. PMC 516435. PMID 15367624.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Fearns C, Pan Q, Mathison JC, Chuang TH (2006). „Triad3A reguluje ubikvitinaci a proteazomální degradaci RIP1 po narušení vazby Hsp90“. J. Biol. Chem. 281 (45): 34592–600. doi:10,1074 / jbc.M604019200. PMID 16968706.

externí odkazy

RNF216 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011275 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045078 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: TRIAD3 TRIAD3 protein“.

[pmid15107846-6] Chuang, Tsung-Hsien; Ulevitch Richard J (květen 2004). „Triad3A, ligáza ubikvitin-protein E3 regulující receptory podobné Toll“. Nat. Immunol. 5 (5): 495–502. doi:10.1038 / ni1066. ISSN 1529-2908. PMID 15107846. S2CID 39773935.

[pmid11854271-7] Chen, Danying; Li Xiaoyan; Zhai Zhonghe; Shu Hong-Bing (Květen 2002). „Nový protein se zinkovým prstem interaguje s proteinem interagujícím s receptorem (RIP) a inhibuje aktivaci tumor nekrotizujícího faktoru (TNF) - a IL1 indukovanou aktivaci NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. doi:10,1074 / jbc.M108675200. ISSN 0021-9258. PMID 11854271.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]