CRADD - CRADD

CRADD
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2O71, 2OF5, 3CRD
Identifikátory
Aliasy	CRADD, MRT34, RAIDD, CASP2 a RIPK1 doména obsahující adaptér s doménou smrti
Externí ID	OMIM: 603454 MGI: 1336168 HomoloGene: 2821 Genové karty: CRADD
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	93,894,840 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	95,324,133 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba proteázy; • vazba domény smrti;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• buněčná odpověď na mechanické podněty; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • pozitivní regulace apoptotické signální dráhy; • aktivace aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • vnější apoptotická signální dráha prostřednictvím receptorů domény smrti; • signální transdukce; • apoptotický proces; • regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • apoptotická signální cesta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8738
	12905
	ENSG00000169372
	ENSMUSG00000045867
	P78560; Q8IY43
	O88843
	NM_003805; NM_001320099; NM_001320100; NM_001320101; NM_001330126
	NM_009950; NM_001330138; NM_001330141; NM_001330175
NP_001307028; NP_001307029; NP_001307030; NP_001317055; NP_003796;
	NP_001307028.1
	NP_001317067; NP_001317070; NP_001317104; NP_034080
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein CRADD obsahující smrtící doménu je protein že u lidí je kódován CRADD gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je protein obsahující smrtící doménu (CARD / DD) a bylo prokázáno, že indukuje buněčnou apoptózu. Prostřednictvím své CARD domény tento protein interaguje s, a tak rekrutuje, kaspázu 2 / ICH1 do komplexu signálu signální transdukce buněčné smrti, který zahrnuje receptor 1 faktoru nekrotizující nádorový faktor (TNFR1A), RIPK1 / RIP kinázu a množství dalších proteinů obsahujících doménu CARD .^[7]

Interakce

CRADD bylo prokázáno komunikovat s RIPK1^[5]^[6] a Caspase 2.^[5]^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169372 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045867 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Duan H, Dixit VM (leden 1997). „RAIDD je nová molekula adaptéru„ smrti ““ (PDF). Příroda. 385 (6611): 86–9. doi:10.1038 / 385086a0. hdl:2027.42/62739. PMID 8985253. S2CID 4317538.
^ ^A ^b Ahmad M, Srinivasula SM, Wang L, Talanian RV, Litwack G, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (březen 1997). „CRADD, nová molekula lidského apoptotického adaptéru pro kaspázu-2 a protein RIP interagující s receptorem faktoru FasL / tumor nekrózy“. Cancer Res. 57 (4): 615–9. PMID 9044836.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CRADD CASP2 a RIPK1 doména obsahující adaptér s doménou smrti“.
^ Tinel A, Tschopp J (květen 2004). „PIDDosome, proteinový komplex zapojený do aktivace kaspázy-2 v reakci na genotoxický stres“. Věda. 304 (5672): 843–6. doi:10.1126 / science.1095432. PMID 15073321. S2CID 6583298.
^ Droin N, Beauchemin M, Solary E, Bertrand R (prosinec 2000). "Identifikace izoformy kaspázy-2, která se chová jako endogenní inhibitor kaspázové kaskády". Cancer Res. 60 (24): 7039–47. PMID 11156409.

externí odkazy

Člověk CRADD umístění genomu a CRADD stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Lennon G, Auffray C, Polymeropoulos M, Soares MB (1996). „Konsorcium I.M.A.G.E.: integrovaná molekulární analýza genomů a jejich exprese“. Genomika. 33 (1): 151–2. doi:10.1006 / geno.1996.0177. PMID 8617505.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Chou JJ, Matsuo H, Duan H, Wagner G (1998). "Struktura řešení karty RAIDD CARD a model interakce CARD / CARD při náboru kaspázy-2 a kaspázy-9". Buňka. 94 (2): 171–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81417-8. PMID 9695946. S2CID 16499945.
Horvat S, Medrano JF (1998). "500kb YAC a BAC contig zahrnující deleci s vysokým růstem v myším chromozomu 10 a identifikaci myšího genu Raidd / Cradd v kandidátské oblasti". Genomika. 54 (1): 159–64. doi:10.1006 / geno.1998.5540. PMID 9806843.
Shearwin-Whyatt LM, Harvey NL, Kumar S (2000). "Subcelulární lokalizace a CARD závislá oligomerizace smrtícího adaptéru RAIDD". Buněčná smrt se liší. 7 (2): 155–65. doi:10.1038 / sj.cdd.4400632. PMID 10713730.
Chaudhary PM, Eby MT, Jasmin A, Kumar A, Liu L, Hood L (2000). „Aktivace dráhy NF-kappaB kaspázou 8 a jejími homology“. Onkogen. 19 (39): 4451–60. doi:10.1038 / sj.onc.1203812. PMID 11002417.
Droin N, Beauchemin M, Solary E, Bertrand R (2000). "Identifikace izoformy kaspázy-2, která se chová jako endogenní inhibitor kaspázové kaskády". Cancer Res. 60 (24): 7039–47. PMID 11156409.
Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (2002). „Kaspáza-2 indukuje apoptózu uvolňováním proapoptotických proteinů z mitochondrií“. J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. doi:10,1074 / jbc.M108029200. PMID 11832478.
Tinel A, Tschopp J (2004). „PIDDosome, proteinový komplex zapojený do aktivace kaspázy-2 v reakci na genotoxický stres“. Věda. 304 (5672): 843–6. doi:10.1126 / science.1095432. PMID 15073321. S2CID 6583298.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Park HH, Wu H (2006). „Krystalová struktura domény smrti RAIDD implikuje potenciální mechanismus sestavení PIDDosome“. J. Mol. Biol. 357 (2): 358–64. doi:10.1016 / j.jmb.2005.12.082. PMC 2902980. PMID 16434054.
Vakifahmetoglu H, Olsson M, Orrenius S, Zhivotovsky B (2006). „Funkční spojení mezi p53 a kaspázou-2 je nezbytné pro apoptózu vyvolanou poškozením DNA“. Onkogen. 25 (41): 5683–92. doi:10.1038 / sj.onc.1209569. PMID 16652156.
Park HH, Wu H (2007). "Krystalizace a předběžné rentgenové krystalografické studie oligomerního komplexu smrt-doména mezi PIDD a RAIDD". Acta Crystallographica oddíl F. 63 (Pt 3): 229–32. doi:10.1107 / S1744309107007889. PMC 2330181. PMID 17329820.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169372 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045867 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8985253-5] A ^b ^C Duan H, Dixit VM (leden 1997). „RAIDD je nová molekula adaptéru„ smrti ““ (PDF). Příroda. 385 (6611): 86–9. doi:10.1038 / 385086a0. hdl:2027.42/62739. PMID 8985253. S2CID 4317538.

[pmid9044836-6] A ^b Ahmad M, Srinivasula SM, Wang L, Talanian RV, Litwack G, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (březen 1997). „CRADD, nová molekula lidského apoptotického adaptéru pro kaspázu-2 a protein RIP interagující s receptorem faktoru FasL / tumor nekrózy“. Cancer Res. 57 (4): 615–9. PMID 9044836.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CRADD CASP2 a RIPK1 doména obsahující adaptér s doménou smrti“.

[pmid15073321-8] Tinel A, Tschopp J (květen 2004). „PIDDosome, proteinový komplex zapojený do aktivace kaspázy-2 v reakci na genotoxický stres“. Věda. 304 (5672): 843–6. doi:10.1126 / science.1095432. PMID 15073321. S2CID 6583298.

[pmid11156409-9] Droin N, Beauchemin M, Solary E, Bertrand R (prosinec 2000). "Identifikace izoformy kaspázy-2, která se chová jako endogenní inhibitor kaspázové kaskády". Cancer Res. 60 (24): 7039–47. PMID 11156409.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]