CA11 - CA11

CA11
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2W2J
Identifikátory
Aliasy	CA11, CARPX1, karboanhydráza 11, CA-RP II, CA-RP, CARP-2, CA-XI
Externí ID	OMIM: 604644 MGI: 1336193 HomoloGene: 36061 Genové karty: CA11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	48,646,187 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	45,704,682 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
	770
	12348
	ENSG00000063180
	ENSMUSG00000003273
	O75493
	O70354
	NM_001217
	NM_009800; NM_001368349
	NP_001208
	NP_033930; NP_001355278
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s karboanhydrázou 11 je enzym že u lidí je kódován CA11 gen.^[5]^[6]

Funkce

Karboanhydrázy (CA) jsou velkou skupinou metaloenzymů zinku, které katalyzují reverzibilní hydrataci oxidu uhličitého. Podílejí se na různých biologických procesech, včetně dýchání, kalcifikace, acidobazické rovnováhy, resorpce kostí a tvorby komorové vody, mozkomíšního moku, slin a žaludeční kyseliny. Vykazují rozsáhlou rozmanitost v distribuci tkání a v jejich subcelulární lokalizaci. CA XI je pravděpodobně sekretovaný protein, avšak radikální změny na zbytcích aktivního místa zcela konzervované v izozymech CA s katalytickou aktivitou znemožňují jeho aktivitu karboanhydrázou. Sdílí vlastnosti společné s dvěma dalšími akatatalytickými izoformami CA, CA VIII a CA X. CA XI je nejhojněji exprimován v mozku a může hrát obecnou roli v centrálním nervovém systému.^[6]

Interakce

CA11 bylo prokázáno komunikovat s RIPK1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063180 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003273 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lovejoy DA, Hewett-Emmett D, Porter CA, Cepoi D, Sheffield A, Vale WW, Tashian RE (prosinec 1998). „Evolučně konzervativní,„ acatalytický “protein XI související s karboanhydrázou obsahuje sekvenční motiv přítomný v neuropeptidovém sauvaginu: lidský gen CA-RP XI (CA11) je vložen mezi klastr sekrečního genu a gen DBP v 19q13.3“. Genomika. 54 (3): 484–93. doi:10.1006 / geno.1998.5585. PMID 9878252.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CA11 carbonic anhydrase XI“.
^ Liao W, Xiao Q, Tchikov V, Fujita K, Yang W, Wincovitch S, Garfield S, Conze D, El-Deiry WS, Schütze S, Srinivasula SM (květen 2008). „CARP-2 je ubiquitinová ligáza spojená s endosomy pro RIP a reguluje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNF“. Curr. Biol. 18 (9): 641–9. doi:10.1016 / j.cub.2008.04.017. PMC 2587165. PMID 18450452.

externí odkazy

Člověk CA11 umístění genomu a CA11 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Bellingham J, Gregory-Evans K, Gregory-Evans CY (1998). „Sekvence a tkáňová exprese nového proteinu souvisejícího s lidskou karboanhydrázou, CARP-2, mapování na chromozom 19q13.3“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 253 (2): 364–7. doi:10.1006 / bbrc.1998.9449. PMID 9878543.
Fujikawa-Adachi K, Nishimori I, Taguchi T, Yuri K, Onishi S (1999). „sekvence cDNA, exprese mRNA a chromozomální lokalizace proteinu souvisejícího s lidskou karboanhydrázou, CA-RP XI“. Biochim. Biophys. Acta. 1431 (2): 518–24. doi:10.1016 / S0167-4838 (99) 00067-9. PMID 10350627.
Okamoto N, Fujikawa-Adachi K, Nishimori I, Taniuchi K, Onishi S (2001). "sekvence cDNA lidského proteinu souvisejícího s karboanhydrázou, CA-RP X: mRNA exprese CA-RP X a XI v lidském mozku". Biochim. Biophys. Acta. 1518 (3): 311–6. doi:10.1016 / s0167-4781 (01) 00193-2. PMID 11311946.
Taniuchi K, Nishimori I, Takeuchi T, Fujikawa-Adachi K, Ohtsuki Y, Onishi S (2002). "Vývojová exprese proteinů VIII, X a XI souvisejících s karboanhydrázou v lidském mozku". Neurovědy. 112 (1): 93–9. doi:10.1016 / S0306-4522 (02) 00066-0. PMID 12044474. S2CID 31186391.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA, Camp DG, Monroe ME, Moore RJ, Smith RD (2006). „Analýza N-glykoproteomu lidské plazmy odečtením imunoafinity, chemií hydrazidů a hmotnostní spektrometrií“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063180 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003273 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9878252-5] Lovejoy DA, Hewett-Emmett D, Porter CA, Cepoi D, Sheffield A, Vale WW, Tashian RE (prosinec 1998). „Evolučně konzervativní,„ acatalytický “protein XI související s karboanhydrázou obsahuje sekvenční motiv přítomný v neuropeptidovém sauvaginu: lidský gen CA-RP XI (CA11) je vložen mezi klastr sekrečního genu a gen DBP v 19q13.3“. Genomika. 54 (3): 484–93. doi:10.1006 / geno.1998.5585. PMID 9878252.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CA11 carbonic anhydrase XI“.

[pmid18450452-7] Liao W, Xiao Q, Tchikov V, Fujita K, Yang W, Wincovitch S, Garfield S, Conze D, El-Deiry WS, Schütze S, Srinivasula SM (květen 2008). „CARP-2 je ubiquitinová ligáza spojená s endosomy pro RIP a reguluje aktivaci NF-kappaB indukovanou TNF“. Curr. Biol. 18 (9): 641–9. doi:10.1016 / j.cub.2008.04.017. PMC 2587165. PMID 18450452.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]