RNF11 - RNF11

RNF11
Identifikátory
Aliasy	RNF11, SID1669, CGI-123, protein prstového prstu 11
Externí ID	OMIM: 612598 MGI: 1352759 HomoloGene: 32195 Genové karty: RNF11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	51,273,447 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • cytoplazma; • recyklace endosomu; • endozom; • časný endosom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro;
Biologický proces	• ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • autoubiquitination bílkovin; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26994
	29864
	ENSG00000123091
	ENSMUSG00000028557
	Q9Y3C5
	Q9QYK7
	NM_014372
	NM_013876
	NP_055187
	NP_038904
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Prstýnkový prstový protein 11 je protein že u lidí je kódován RNF11 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem obsahuje motiv prstu RING-H2, o kterém je známo, že je důležitý pro interakce protein-protein. Ukázalo se, že exprese tohoto genu je indukována mutantními RET proteiny (MEN2A / MEN2B). Je známo, že zárodečné mutace v genu RET jsou zodpovědné za vývoj mnohočetné endokrinní neoplazie (MEN).^[6]

Viz také

Prst doména prsten

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF11 komunikovat s RIPK1^[7] a STAMBP.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123091 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Seki N, Hattori A, Hayashi A, Kozuma S, Sasaki M, Suzuki Y, Sugano S, Muramatsu MA, Saito T (prosinec 1999). "Klonovací a expresní profil myších a lidských genů, Rnf11 / RNF11, kódující nový prstový protein RING-H2". Biochim. Biophys. Acta. 1489 (2–3): 421–7. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00190-6. PMID 10673045.
^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (srpen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RNF11 protein prstového proteinu 11".
^ Shembade N, Parvatiyar K, Harhaj NS, Harhaj EW (březen 2009). „Enzym A20 upravující ubikvitin vyžaduje RNF11 k downregulaci signalizace NF-kappaB“. EMBO J.. 28 (5): 513–22. doi:10.1038 / emboj.2008.285. PMC 2657574. PMID 19131965.
^ Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.

Další čtení

Burger A, Amemiya Y, Kitching R, Seth AK (2006). „Novinka RING E3 ubikvitinové ligázy u rakoviny prsu“. Neoplazie. 8 (8): 689–95. doi:10.1593 / neo.06469. PMC 1601945. PMID 16925951.
Jolliffe CN, Harvey KF, Haines BP, Parasivam G, Kumar S (2000). "Identifikace více proteinů exprimovaných v myších embryích jako vazebných partnerů pro WW domény ubikvitin-proteinové ligázy Nedd4". Biochem. J. 351 Pt 3 (3): 557–65. doi:10.1042/0264-6021:3510557. PMC 1221394. PMID 11042109.
Watanabe T, Ichihara M, Hashimoto M, Shimono K, Shimoyama Y, Nagasaka T, Murakumo Y, Murakami H, Sugiura H, Iwata H, Ishiguro N, Takahashi M (2002). "Charakterizace genové exprese indukované RET s mutací MEN2A nebo MEN2B". Dopoledne. J. Pathol. 161 (1): 249–56. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64176-4. PMC 1850689. PMID 12107109.
Kitching R, Wong MJ, Koehler D, Burger AM, Landberg G, Gish G, Seth A (2003). „RING-H2 protein RNF11 je rozdílně exprimován v nádorech prsu a interaguje s ligandy E3 typu HECT.“ Biochim. Biophys. Acta. 1639 (2): 104–12. doi:10.1016 / j.bbadis.2003.07.001. PMID 14559117.
Subramaniam V, Li H, Wong M, Kitching R, Attisano L, Wrana J, Zubovits J, Burger AM, Seth A (2003). „Protein RING-H2 RNF11 je nadměrně exprimován u rakoviny prsu a je cílem ligázy Smurf2 E3“. Br. J. Cancer. 89 (8): 1538–44. doi:10.1038 / sj.bjc.6601301. PMC 2394340. PMID 14562029.
Li H, Seth A (2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Connor MK, Azmi PB, Subramaniam V, Li H, Seth A (2005). "Molekulární charakterizace proteinu prstového prstu 11". Mol. Cancer Res. 3 (8): 453–61. doi:10.1158 / 1541-7786.MCR-04-0166. PMID 16123141.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Anderson LR, Betarbet R, Gearing M, Gulcher J, Hicks AA, Stefánsson K, Lah JJ, Levey AI (2007). „Kandidát na PARK10 RNF11 je exprimován zranitelnými neurony a lokalizuje se v Lewyho těle v mozku Parkinsonovy choroby“. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 66 (10): 955–64. doi:10.1097 / nen.0b013e3181567f17. PMID 17917589.

externí odkazy

RNF11 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123091 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10673045-4] Seki N, Hattori A, Hayashi A, Kozuma S, Sasaki M, Suzuki Y, Sugano S, Muramatsu MA, Saito T (prosinec 1999). "Klonovací a expresní profil myších a lidských genů, Rnf11 / RNF11, kódující nový prstový protein RING-H2". Biochim. Biophys. Acta. 1489 (2–3): 421–7. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00190-6. PMID 10673045.

[pmid10810093-5] Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (srpen 2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: RNF11 protein prstového proteinu 11".

[pmid19131965-7] Shembade N, Parvatiyar K, Harhaj NS, Harhaj EW (březen 2009). „Enzym A20 upravující ubikvitin vyžaduje RNF11 k downregulaci signalizace NF-kappaB“. EMBO J.. 28 (5): 513–22. doi:10.1038 / emboj.2008.285. PMC 2657574. PMID 19131965.

[pmid14755250-8] Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]