Pseudouridylát syntáza - Pseudouridylate synthase - Wikipedia

v enzymologie, a pseudouridylát syntáza (ES 4.2.1.70 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

uracil + D-ribóza 5-fosfát ${ displaystyle rightleftharpoons}$ pseudouridin 5'-fosfát + H₂Ó

Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou uracil a D-ribóza-5-fosfát, zatímco jeho dva produkty jsou pseudouridin 5'-fosfát a H₂Ó.

Tento enzym patří do rodiny lyázy, konkrétně hydrolyázy, které štěpí vazby uhlík-kyslík. The systematické jméno této třídy enzymů je uracilhydrolyáza (přidání D-ribóza-5-fosfátu, pseudouridin-5'-fosfátu). Mezi další běžně používaná jména patří syntetáza kyseliny pseudouridylové, pseudouridinmonofosfát syntetáza, 5-ribosyluracil 5-fosfát syntetáza, pseudouridylát syntetáza, upsilonUMP syntetáza, a uracilhydrolyáza (přidání D-ribóza-5-fosfátu). Tento enzym se účastní metabolismus pyrimidinu.

Strukturální studie

Ke konci roku 2007, 22 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1DJ0, 1K8W, 1KSK, 1 KSL, 1 KSV, 1PRZ, 1QYU, 1R3E, 1R3F, 1SB7, 1 SGV, 1SI7, 1SZW, 1V9F, 1V9K, 1VIO, 1XPI, 1Z2Z, 1ZE1, 1ZE2, 1ZL3, a 2I82.

Reference

• HEINRIKSON RL, GOLDWASSER E (1964). "Studie o biosyntéze 5-ribosyluracil-5'-monofosfátu v Tetrahymena Pyriformis". J. Biol. Chem. 239: 1177–87. PMID  14165924.
• Matsushita T, Davis FF (1971). "Studie na syntetázu kyseliny pseudouridylové z různých zdrojů". Biochim. Biophys. Acta. 238 (2): 165–73. doi:10.1016/0005-2787(71)90082-7. PMID  4936431.
• Remsen JF, Matsushita T, Chirikjian JG, Davis FF (1972). "Enzymatická syntéza kyseliny deoxypseudouridylové a studium určitých jejích vlastností". Biochim. Biophys. Acta. 281 (4): 481–7. doi:10.1016/0005-2787(72)90148-7. PMID  4569284.
• Suzuki T, Hochster RM (1966). „K biosyntéze pseudouridinu a kyseliny pseudouridylové v Agrobacterium tumefaciens“. Umět. J. Biochem. 44 (2): 259–72. doi:10.1139 / o66-029. PMID  5942965.