ZFP36 - ZFP36 - Wikipedia

ZFP36
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4J8S
Identifikátory
Aliasy	ZFP36, G0S24, GOS24, NUP475, RNF162A, TIS11, TTP, zfp-36, ZFP36 protein prstového prstu
Externí ID	OMIM: 190700 MGI: 99180 HomoloGene: 2558 Genové karty: ZFP36
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	39,409,412 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Vazba chemokinů C-C; • Vazba 14-3-3 proteinů; • Vazba prvků bohatých na AU; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • jednořetězcová vazba RNA; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU; • vazba enzymu; • mRNA vazba; • vazba protein kinázy; • Vazba RNA; • vazba proteinu tepelným šokem; • Vazba RNA polymerázy; • mRNA 3'-UTR vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Stresová granule; • buněčné jádro; • RISC-loading komplex; • ribonukleoprotein; • Komplex Dcp1-Dcp2; • exosom (komplex RNázy); • P-tělo; • cytosol; • Komplex CCR4-NOT;
Biologický proces	• zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • pozitivní regulace zkrácení ocasu mRNA poly (A) transkripce nukleární energie; • mRNA katabolický proces; • regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • miRNA zprostředkovaná inhibice translace; • reakce na hladovění; • Stabilizace mRNA zprostředkovaná 3'-UTR; • negativní regulace diferenciace erytrocytů; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • pozitivní regulace jaderně transkribovaného katabolického procesu mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • pozitivní regulace odstraňování krystalů z mRNA transkripce nezávislé na deadenylaci; • regulace apoptotického procesu keratinocytů; • regulace množení keratinocytů; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • buněčná odpověď na stimul fibroblastového růstového faktoru; • buněčná odpověď na stimul faktoru stimulujícího kolonie makrofágů granulocytů; • negativní regulace virové transkripce; • regulace diferenciace keratinocytů; • reakce na zranění; • pozitivní regulace umlčování genů miRNA; • regulace stability mRNA; • Kaskáda MAPK; • buněčná odpověď na stimul glukokortikoidů; • buněčná odpověď na stimul epidermálního růstového faktoru; • pozitivní regulace intracelulární lokalizace mRNA; • kaskáda p38MAPK; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad nezávislý na deadenylaci; • umlčování genů pomocí RNA; • transport mRNA; • Destabilizace mRNA zprostředkovaná 3'-UTR; • negativní regulace aktivity polynukleotidů adenylyltransferázy; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7538
	22695
	ENSG00000128016
	ENSMUSG00000044786
	P26651
	P22893
	NM_003407
	NM_011756
	NP_003398
	NP_035886
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Tristetraprolin (TTP), také známý jako protein zinkového prstu 36 homolog (ZFP36), je a protein že u lidí, myší a potkanů je kódován ZFP36 gen.^[4]^[5] Je členem TIS11 (TPA -indukovaná sekvence) rodina, spolu s faktory reakce butyrátu 1 a 2.^[6]

TTP se váže na Prvky bohaté na AU (ARE) v 3'-nepřekládaných oblastech (UTR) mRNA některých cytokiny a podporuje jejich degradaci. Například TTP je složkou smyčky negativní zpětné vazby, která interferuje s TNF-alfa produkce destabilizací jeho mRNA.^[7] U myší s nedostatkem TTP se vyvine komplexní syndrom zánětlivých onemocnění.^[7]

Interakce

ZFP36 bylo prokázáno komunikovat s 14-3-3 bílkovin rodinní příslušníci, jako např YWHAH,^[8] a s NUP214, člen komplex jaderných pórů.^[9]

Nařízení

Post-transkripčně „TTP je regulován několika způsoby.^[6] The subcelulární lokalizace TTP je ovlivněna interakcemi s proteinovými partnery, jako je rodina proteinů 14-3-3. Tyto interakce a případně interakce s cílovými mRNA jsou ovlivněny stavem fosforylace TTP, protože protein může být posttranslačně modifikován velkým počtem proteinové kinázy.^[6] Existují určité důkazy, na které může být přepis TTP také zaměřen mikroRNA, jako miR-29a.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128016 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ DuBois RN, McLane MW, Ryder K, Lau LF, Nathans D (prosinec 1990). "Jaderný protein indukovatelný růstovým faktorem s novou sekvencí cysteinu / histidinu". J Biol Chem. 265 (31): 19185–91. PMID 1699942.
^ "Entrez Gene: ZFP36 protein se zinkovým prstem 36, typ C3H, homolog (myš)".
^ ^A ^b ^C ^d Sanduja S, Blanco FF, Dixon DA (2011). „Role TTP a BRF proteinů v regulovaném rozpadu mRNA“. Wiley Interdiscip Rev RNA. 2 (1): 42–57. doi:10,1002 / wrna.28. PMC 3030256. PMID 21278925.
^ ^A ^b Carballo E, Lai WS, Blackshear PJ (srpen 1998). „Inhibice zpětné vazby produkce alfa-faktoru nekrotizujícího faktor makrofágů tristetraprolinem“. Věda. 281 (5379): 1001–5. doi:10.1126 / science.281.5379.1001. PMID 9703499.
^ Johnson BA, Stehn JR, Yaffe MB, Blackwell TK (květen 2002). „Cytoplazmatická lokalizace tristetraprolinu zahrnuje mechanismy závislé a nezávislé na 14-3-3“. J. Biol. Chem. 277 (20): 18029–36. doi:10,1074 / jbc.M110465200. PMID 11886850.
^ Carman JA, Nadler SG (březen 2004). "Přímá asociace tristetraprolinu s nukleoporinem CAN / Nup214". Biochem. Biophys. Res. Commun. 315 (2): 445–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.01.080. PMID 14766228.

Další čtení

Blackshear PJ (2003). „Tristetraprolin a další CCCH tandemové proteiny se zinkovým prstem v regulaci obratu mRNA“. Biochem. Soc. Trans. 30 (Pt 6): 945–52. doi:10.1042 / bst0300945. PMID 12440952.
Carrick DM, Lai WS, Blackshear PJ (2005). „Tandemový CCCH zinkový prstový protein tristetraprolin a jeho význam pro obrat cytokinových mRNA a artritidu“. Výzkum a terapie artritidy. 6 (6): 248–64. doi:10.1186 / ar1441. PMC 1064869. PMID 15535838.
Taylor GA, Lai WS, Oakey RJ a kol. (1991). „Lidský TTP protein: sekvence, srovnání s příbuznými proteiny a chromozomální lokalizace myších a lidských genů“. Nucleic Acids Res. 19 (12): 3454. doi:10.1093 / nar / 19.12.3454. PMC 328350. PMID 2062660.
Lai WS, Stumpo DJ, Blackshear PJ (1990). „Rychlá inzulínem stimulovaná akumulace mRNA kódující protein bohatý na prolin“. J. Biol. Chem. 265 (27): 16556–63. PMID 2204625.
Taylor GA, Thompson MJ, Lai WS, Blackshear PJ (1995). „Fosforylace tristetraprolinu, potenciálního transkripčního faktoru zinkového prstu, stimulací mitogenů v intaktních buňkách a mitogenem aktivovanou protein kinázou in vitro“. J. Biol. Chem. 270 (22): 13341–7. doi:10.1074 / jbc.270.22.13341. PMID 7768935.
Heximer SP, Forsdyke DR (1993). "Lidský předpokládaný lymfocyt G0 / G1 přepínací gen homologní s genem hlodavce kódujícím transkripční faktor vázající na zinek". DNA Cell Biol. 12 (1): 73–88. doi:10.1089 / dna.1993.12.73. PMID 8422274.
Huebner K, Druck T, LaForgia S a kol. (1993). "Chromozomální lokalizace čtyř cDNA lidských prstů se zinkovým prstem". Hučení. Genet. 91 (3): 217–22. doi:10.1007 / BF00218259. PMID 8478004. S2CID 35926610.
Lai WS, Carballo E, Thorn JM a kol. (2000). „Interakce proteinů se zinkovým prstem CCCH s mRNA. Vazba proteinů se zinkovým prstem souvisejících s tristetraprolinem na prvky bohaté na Au a destabilizace mRNA“. J. Biol. Chem. 275 (23): 17827–37. doi:10,1074 / jbc.M001696200. PMID 10751406.
Dintilhac A, Bernués J (2002). „HMGB1 interaguje s mnoha zjevně nesouvisejícími proteiny rozpoznáním krátkých aminokyselinových sekvencí“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. doi:10,1074 / jbc.M108417200. PMID 11748221.
Lai WS, Kennington EA, Blackshear PJ (2002). „Interakce proteinů CCCH se zinkovým prstem s mRNA: nevázané mutanty tristetraprolinu mají inhibiční účinek na degradaci mRNA obsahujících prvky bohaté na AU“. J. Biol. Chem. 277 (11): 9606–13. doi:10,1074 / jbc.M110395200. PMID 11782475.
Johnson BA, Stehn JR, Yaffe MB, Blackwell TK (2002). „Cytoplazmatická lokalizace tristetraprolinu zahrnuje mechanismy závislé a nezávislé na 14-3-3“. J. Biol. Chem. 277 (20): 18029–36. doi:10,1074 / jbc.M110465200. PMID 11886850.
Brooks SA, Connolly JE, Diegel RJ a kol. (2002). "Analýza funkce, exprese a subcelulární distribuce lidského tristetraprolinu". Artritida Rheum. 46 (5): 1362–70. doi:10.1002 / čl. 12235. PMID 12115244.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Amann BT, Worthington MT, Berg JM (2003). "Cys3His doména vázající zinek z Nup475 / tristetraprolin: nová skladba se strukturou podobnou disku". Biochemie. 42 (1): 217–21. doi:10,1021 / bi026988m. PMID 12515557.
Yu H, Stasinopoulos S, Leedman P, Medcalf RL (2003). „Vrozená nestabilita mRNA inhibitoru aktivátoru plazminogenu typu 2 je regulována tristetraprolinem“. J. Biol. Chem. 278 (16): 13912–8. doi:10,1074 / jbc.M213027200. PMID 12578825.
Sawaoka H, Dixon DA, Oates JA, Boutaud O (2003). "Tristetraprolin se váže na 3'-nepřekládanou oblast cyklooxygenázy-2 mRNA. Polyadenylační variantě v buněčné linii rakoviny chybí vazebné místo". J. Biol. Chem. 278 (16): 13928–35. doi:10,1074 / jbc.M300016200. PMID 12578839.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128016 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1699942-4] DuBois RN, McLane MW, Ryder K, Lau LF, Nathans D (prosinec 1990). "Jaderný protein indukovatelný růstovým faktorem s novou sekvencí cysteinu / histidinu". J Biol Chem. 265 (31): 19185–91. PMID 1699942.

[entrez-5] "Entrez Gene: ZFP36 protein se zinkovým prstem 36, typ C3H, homolog (myš)".

[pmid21278925-6] A ^b ^C ^d Sanduja S, Blanco FF, Dixon DA (2011). „Role TTP a BRF proteinů v regulovaném rozpadu mRNA“. Wiley Interdiscip Rev RNA. 2 (1): 42–57. doi:10,1002 / wrna.28. PMC 3030256. PMID 21278925.

[pmid9703499-7] A ^b Carballo E, Lai WS, Blackshear PJ (srpen 1998). „Inhibice zpětné vazby produkce alfa-faktoru nekrotizujícího faktor makrofágů tristetraprolinem“. Věda. 281 (5379): 1001–5. doi:10.1126 / science.281.5379.1001. PMID 9703499.

[pmid11886850-8] Johnson BA, Stehn JR, Yaffe MB, Blackwell TK (květen 2002). „Cytoplazmatická lokalizace tristetraprolinu zahrnuje mechanismy závislé a nezávislé na 14-3-3“. J. Biol. Chem. 277 (20): 18029–36. doi:10,1074 / jbc.M110465200. PMID 11886850.

[pmid14766228-9] Carman JA, Nadler SG (březen 2004). "Přímá asociace tristetraprolinu s nukleoporinem CAN / Nup214". Biochem. Biophys. Res. Commun. 315 (2): 445–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.01.080. PMID 14766228.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]